Bewertung von immunologisch relevanten dynamischen tertiären strukturellen Merkmale der HIV-1 V3-Loop Crown R2 Sequence durch Ab initio Folding
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September 15, 2010
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Die Krone Region unterschiedliche V3-Loop-Sequenzen von der Oberfläche Hüllglycoprotein (gp120) des HIV-1 kann strukturell in vielen Fällen gekennzeichnet durch in silico Faltung von Positionen 10 bis 22 der Schleife mit einer state-of-the-art<em> Ab initio</em> Falt-Algorithmus. Hier zeigen wir die Faltung und Auswertung dieser Region des V3-Loops von der R2-Stamm HIV-1, ein einzigartig Neutralisation sensiblen Stamm mit rätselhaften funktionellen Eigenschaften.
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Almond, D., Cardozo, T. Assessment of Immunologically Relevant Dynamic Tertiary Structural Features of the HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence by ab initio Folding. J. Vis. Exp. (43), e2118, doi:10.3791/2118 (2010).
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