Summary

13Marcaje deC-6-glucosa asociado con LC-MS: identificación de órganos primarios de plantas en la síntesis de metabolitos secundarios

Published: March 22, 2024
doi:

Summary

El método desarrollado de marcaje con 13C6-glucosa combinado con espectrometría de masas de alta resolución por cromatografía líquida es versátil y sienta las bases para futuros estudios sobre los órganos primarios y las vías implicadas en la síntesis de metabolitos secundarios en plantas medicinales, así como la utilización integral de estos metabolitos secundarios.

Abstract

En este trabajo se presenta un método novedoso y eficiente para certificar órganos primarios implicados en la síntesis de metabolitos secundarios. Como el metabolito secundario más importante en Parispolyphylla var. yunnanensis (Franch.) Mano. -Mzt. (PPY), la saponina de París (PS) tiene una variedad de actividades farmacológicas y la PPY tiene una demanda creciente. Este estudio estableció cuatro tratamientos de alimentación y no alimentación con hoja, rizoma y tallo vascular 13C6-Glucosa para certificar con precisión los órganos primarios involucrados en la síntesis de saponinas de París VII (PS VII). Mediante la combinación de cromatografía líquida-espectrometría de masas (LC-MS), se calcularon de forma rápida y precisa las proporciones 13C/12C de hoja, rizoma, tallo y raíz en diferentes tratamientos, y se encontraron cuatro tipos de proporciones de picos de iones isotópicos (M) de PS: (M+1) /M, (M+2) /M, (M+3) /M y (M+4) /M. Los resultados mostraron que la relación de 13C/12C en los rizomas de los tratamientos de alimentación con tallo-haz vascular y rizoma fue significativamente mayor que en el tratamiento sin alimentación. En comparación con el tratamiento sin alimentación, la proporción de moléculas de PS VII (M+2) /M en las hojas aumentó significativamente bajo los tratamientos de alimentación con hojas y haces vasculares del tallo. Simultáneamente, en comparación con el tratamiento sin alimentación, la proporción de moléculas de PS VII (M+2) /M en las hojas bajo tratamiento con rizoma no mostró diferencias significativas. Además, la proporción de moléculas de PS VII (M+2) /M en el tallo, la raíz y el rizoma no mostró diferencias entre los cuatro tratamientos. En comparación con el tratamiento sin alimentación, la proporción de la molécula de saponina Paris II (PS II) (M+2) /M en las hojas bajo el tratamiento de alimentación foliar no mostró diferencias significativas, y la relación (M+3) /M de las moléculas de PS II en las hojas bajo el tratamiento de alimentación foliar fue menor. Los datos confirmaron que el órgano principal para la síntesis de PS VII son las hojas. Sienta las bases para la futura identificación de los órganos primarios y las vías implicadas en la síntesis de metabolitos secundarios en las plantas medicinales.

Introduction

Las vías biosintéticas de los metabolitos secundarios en las plantas son intrincadas y diversas, e involucran órganos de acumulación altamente específicos y diversos1. En la actualidad, los sitios específicos de síntesis y los órganos responsables de los metabolitos secundarios en muchas plantas medicinales no están bien definidos. Esta ambigüedad plantea un obstáculo significativo para el avance estratégico y la implementación de métodos de cultivo diseñados para optimizar tanto el rendimiento como la calidad de los materiales medicinales.

La biología molecular, la bioquímica y las técnicas de marcaje de isótopos se emplean ampliamente para desentrañar las vías de síntesis y los sitios de metabolitos secundarios en plantas medicinales 2,3,4,5, y cada una de estas metodologías exhibe fortalezas y limitaciones únicas, como diferencias en eficiencia y precisión. Los enfoques de biología molecular, por ejemplo, ofrecen una alta precisión en la identificación de los sitios dentro de las rutas biosintéticas, pero requieren mucho tiempo. Su utilidad se ve aún más limitada para las especies que carecen de secuencias genómicas disponibles públicamente, lo que hace que estas técnicas sean menos viables para estos casos6. Por el contrario, las técnicas de marcaje de isótopos, que emplean proporciones isotópicas como 3C/12C, 2H/1H y 18O/16O, proporcionan un medio rápido y accesible para investigar los mecanismos de síntesis, transporte y almacenamiento de metabolitos secundarios 7,8. Pueden revelar la distribución espacial de compuestos orgánicos e isótopos estables en las hojas, permitiendo así la reconstrucción de las condiciones ambientales experimentadas por las hojas a lo largo de su ciclo de vida9. Además, la aplicación de marcadores isotópicos externos, como 13C6-Glucosa 10 y 13C 6-fenilalanina11, permite la generación de metabolitos secundarios marcados con carbono, lo que mejora nuestra comprensión de su producción y función.

Las técnicas tradicionales de marcaje de isótopos de carbono se enfrentan a dificultades a la hora de identificar los órganos específicos responsables de la síntesis de metabolitos secundarios debido a la naturaleza altamente específica de sus vías biosintéticas y mecanismos de transporte. La cromatografía líquida-espectrometría de masas (LC-MS) ha cobrado importancia como instrumento analítico fundamental en este campo, ya que ofrece un método sólido para el seguimiento de isótopos exógenos en la síntesis química de fármacos e investiga procesos in vivo como la absorción, distribución, metabolismo y excreción12. La sensibilidad, la sencillez y la fiabilidad superiores de la LC-MS la convierten en una opción ideal para monitorizar la producción de metabolitos secundarios en las plantas13. En los últimos tiempos, la LC-MS se ha visto cada vez más favorecida por su aplicación en técnicas de etiquetado de isótopos externos, lo que permite evaluar la eficiencia del etiquetado en diferentes muestras. Esta metodología proporciona información crítica sobre los órganos primarios involucrados en la síntesis de metabolitos secundarios en plantas medicinales, sirviendo como un complemento invaluable a los métodos biológicos para identificar los órganos de síntesis de estos compuestos14,15. En consecuencia, este enfoque no solo facilita la comparación de las eficiencias de etiquetado entre varios especímenes, sino que también arroja luz sobre los órganos clave implicados en la generación de metabolitos secundarios de las plantas, mejorando así nuestra comprensión de su biosíntesis.

Introdujimos un método novedoso que combina el marcaje de isótopos de carbono con la detección de LC-MS para identificar los órganos primarios responsables de sintetizar metabolitos secundarios en plantas medicinales. La saponina de París (PS) tiene una variedad de actividades farmacológicas como el anticancerígeno, la inmunomodulación y la antiinflamatoria16, y la PPY tiene una demanda cada vez mayor17. Por lo tanto, utilizamos plántulas PPY como sujetos de investigación y desciframos que las hojas son el órgano principal para sintetizar la saponina Paris VII (PS VII) (Figura 1B) mediante el uso del marcaje 13C6-Glucosa asociado con el método LC-MS. Nuestro enfoque incluyó cuatro tratamientos diferentes que involucraron la alimentación con 13C6-Glucosa a los haces de hojas, rizomas y troncos vasculares, así como un control sin alimentación. La elección de 13C6-Glucosa es estratégica, ya que se metaboliza rápidamente en acetil coenzima A a través de la respiración, lo que facilita la síntesis de PS. Empleando la abundancia natural de 13C, utilizamos un sistema de espectrómetro de masas de cromatografía de gases-relación de isótopos estables (GC-IRMS) para evaluar las proporciones de 13C/12C en varios órganos de la planta y para analizar las proporciones de picos de iones isotópicos en las moléculas PS VII y Paris saponinas II (PS II) (Figura 1B). Nuestra metodología, que aprovecha 13precursores de metabolitos secundarios de plantas marcados con C y técnicas de espectrometría de masas de vanguardia, ofrece una alternativa más simple y precisa a los métodos convencionales de etiquetado de isótopos de carbono. Este novedoso enfoque no solo profundiza nuestra comprensión de los órganos implicados en la síntesis de metabolitos secundarios en las plantas medicinales, sino que también sienta una base sólida para futuras exploraciones de las vías biosintéticas de estos compuestos.

Protocol

1. Preparación experimental Asegúrese de que durante el crecimiento de la planta, la humedad relativa del invernadero sea del 75%, las temperaturas día/noche sean de 20 °C/10 °C, el fotoperiodo se componga de 12 h de día y 12 h de noche, y la intensidad de la luz sea de 100 μmol·m-2·s-1. Proporcionan irradiación a través de lámparas de diodos emisores de luz (LED), manteniendo una distancia de 30 cm entre la lámpara LED y el dosel de la planta.NOTA: El fot…

Representative Results

Para confirmar que elsuministro de 13C6-glucosa en los rizomas fue exitoso, analizamos más a fondo las proporciones de isótopos de 13C/12C en los rizomas. Las proporciones de isótopos 13C/12C de los tratamientos 3 y 4 fueron mucho más altas que las del tratamiento 2 (Figura 1A). Los resultados indicaron que la 13C6-Glucosa del Tratamiento 3 y 4 ingresó a los rizomas a través de la ingestión. <p…

Discussion

La implementación exitosa de este protocolo depende de una investigación exhaustiva sobre las propiedades fisiológicas, los tejidos, los órganos y los metabolitos secundarios de las plantas. El enfoque de diseño experimental descrito en el protocolo establece una base sólida para investigar las vías biosintéticas de los metabolitos secundarios de las plantas. Los factores críticos en este experimento son (1) determinar la edad de las plántulas perennes y (2) elegir el momento correcto de detección de marcadore…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Este trabajo fue financiado por el Programa Juvenil de la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (No. 82304670).

Materials

0.1 % Formic acid water Chengdu Kelong Chemical Reagent Factory 44890
13C6-Glucose powder MERCK 110187-42-3
Acetonitrile Chengdu Kelong Chemical Reagent Factory 44890
AUTOSAMPLER VIALS Biosharp Biotechnology Company 44866
BEH C18 column Waters,Milfor,MA 1.7μm,2.1*100 mm
CNC ultrasonic cleaner Kunshan Ultrasound Instrument Co., Ltd KQ-600DE
Compound DiscovererTM  software Thermo Scientific, Fremont,CA 3
Compound DiscovererTM  software  Thermo Scientific,Fremont,CA 3
Electric constant temperature blast drying oven DHG-9146A
Electronic analytical balance Sedolis Scientific Instruments Beijing Co., Ltd SOP
Ethanol  Chengdu Kelong Chemical Reagent Factory 44955
Fully automatic sample rapid grinder Shanghai Jingxin Technology Tissuelyser-48
Gas Chromatography-Stable Isotope Ratio Mass Spectrometer Thermo Fisher Delta V Advantage
Hoagland solution Sigma-Aldrich H2295-1L
Hydroponic tank JRD 1020421
Isodat software Thermo Fisher Scientific 3
Liquid chromatography high-resolution mass spectrometry Agilent Technology  Agilent 1260 -6120 
Nitrogen manufacturing instrument PEAK SCIENTIFIC Genius SQ 24
Organic phase filter Tianjin Jinteng Experimental Equipment Co., Ltd 44890
Oxygen pump Magic Dragon MFL
Quantum sensor Highpoint UPRtek
Scalpel Handskit 11-23
Sprinkling can CHUSHI WJ-001
Xcalibur  software Thermo Fisher Scientific 4.2

Referências

  1. Erb, M., Kliebenstein, D. J. Plant secondary metabolites as defenses, regulators, and primary metabolites: The blurred functional trichotomy. Plant Physiol. 184 (1), 39-52 (2020).
  2. Li, Y., Kong, D., Fu, Y., Sussman, M. R., Wu, H. The effect of developmental and environmental factors on secondary metabolites in medicinal plants. Plant Physiol Biochem. 148, 80-89 (2020).
  3. Liu, S., et al. Genetic and molecular dissection of ginseng (panax ginseng mey.) germplasm using high-density genic snp markers, secondary metabolites, and gene expressions. Front Plant Sci. 14, 1165349 (2023).
  4. Chen, X., Wang, Y., Zhao, H., Fu, X., Fang, S. Localization and dynamic change of saponins in cyclocarya paliurus (batal.) iljinskaja. PloS One. 14 (10), e0223421 (2019).
  5. Yuan, M., et al. Ex vivo and in vivo stable isotope labelling of central carbon metabolism and related pathways with analysis by lc-ms/ms. Nat Protoc. 14 (2), 313-330 (2019).
  6. Cavalli, F. M. G., Bourgon, R., Vaquerizas, J. M., Luscombe, N. M. Specond: A method to detect condition-specific gene expression. Genome Biol. 12 (10), 101 (2011).
  7. Epron, D., et al. Pulse-labelling trees to study carbon allocation dynamics: A review of methods, current knowledge and future prospects. Tree Physiology. 32 (6), 776-798 (2012).
  8. Varman, A. M., He, L., You, L., Hollinshead, W., Tang, Y. J. Elucidation of intrinsic biosynthesis yields using 13c-based metabolism analysis. Microb Cell Fact. 13 (1), 42 (2014).
  9. Meng-Meng, G., Zhen-Yu, Z., Yu, Z., Qiu-Lin, Y., Ying, W. Systematic extraction and stable isotope determination of different biomarkers from single leaf of reticulate vein plants. Journal of Shaanxi University of Science & Technology. 41 (01), 72-79 (2023).
  10. Zhang, H., et al. A convenient lc-ms method for assessment of glucose kinetics in vivo with d-[13c6]glucose as a tracer. Clin Chem. 55 (3), 527-532 (2009).
  11. Chassy, A. W., Adams, D. O., Waterhouse, A. L. Tracing phenolic metabolism in vitis vinifera berries with 13c6-phenylalanine: Implication of an unidentified intermediate reservoir. J Agric Food Chem. 62 (11), 2321-2326 (2014).
  12. Lozac’h, F., et al. Evaluation of cams for 14c microtracer adme studies: Opportunities to change the current drug development paradigm. Bioanalysis. 10 (5), 321-339 (2018).
  13. Sulyok, M., Stadler, D., Steiner, D., Krska, R. Validation of an lc-ms/ms-based dilute-and-shoot approach for the quantification of &gt; 500 mycotoxins and other secondary metabolites in food crops: Challenges and solutions. Anal Bioanal Chem. 412 (11), 2607-2620 (2020).
  14. Serra, F., et al. Inter-laboratory comparison of elemental analysis and gas chromatography combustion isotope ratio mass spectrometry (gc-c-irms). Part i: Delta13c measurements of selected compounds for the development of an isotopic grob-test. J Mass Spectrom. 42 (3), 361-369 (2007).
  15. Jung, J. -. Y., Oh, M. -. K. Isotope labeling pattern study of central carbon metabolites using gc/ms. J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 974, 101-108 (2015).
  16. Ding, Y. G., et al. The traditional uses, phytochemistry, and pharmacological properties of paris l. (liliaceae): A review. J Ethnopharmacol. 278, 114293 (2021).
  17. Cunningham, A. B., et al. Paris in the spring: A review of the trade, conservation and opportunities in the shift from wild harvest to cultivation of paris polyphylla (trilliaceae). J Ethnopharmacol. 222, 208-216 (2018).
  18. Madikizela, L. M., Ncube, S., Chimuka, L. Uptake of pharmaceuticals by plants grown under hydroponic conditions and natural occurring plant species: A review. Sci Total Environ. 636, 477-486 (2018).
  19. Tagami, K., Uchida, S. Online stable carbon isotope ratio measurement in formic acid, acetic acid, methanol and ethanol in water by high performance liquid chromatography-isotope ratio mass spectrometry. Anal Chim Acta. 614 (2), 165-172 (2008).
  20. Li, Y., et al. The combination of red and blue light increases the biomass and steroidal saponin contents of paris polyphylla var. Yunnanensis. Ind Crops Prod. 194, 116311 (2023).
  21. Wang, G., et al. Tissue distribution, metabolism and absorption of rhizoma paridis saponins in the rats. J Ethnopharmacoly. 273, 114038 (2021).
  22. Peng, S., et al. Progress in the study of differences in the types and contents of steroidal saponins in paris. Polyphylla smith var. Chinensis (franch.) hara. Modernization of Traditional Chinese Medicine and Materia Medica-World Science and Technology. 24 (05), 2014-2025 (2022).
  23. Alami, M. M., et al. The current developments in medicinal plant genomics enabled the diversification of secondary metabolites’ biosynthesis. Int J Mol Sci. 23 (24), 15932 (2022).
  24. Wen, F., et al. The synthesis of paris saponin vii mainly occurs in leaves and is promoted by light intensity. Front Plant Sci. 14, 1199215 (2023).
  25. Siadjeu, C., Pucker, B. Medicinal plant genomics. BMC Genomics. 24 (1), 429 (2023).
  26. Tian, C., et al. Top-down phenomics of arabidopsis thaliana: Metabolic profiling by one- and two-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopy and transcriptome analysis of albino mutants. J Biol Chem. 282 (25), 18532-18541 (2007).
  27. Masakapalli, S. K., et al. Metabolic flux phenotype of tobacco hairy roots engineered for increased geraniol production. Phytochemistry. 99, 73-85 (2014).
  28. Schwender, J., Ohlrogge, J. B., Shachar-Hill, Y. A flux model of glycolysis and the oxidative pentosephosphate pathway in developing brassica napus embryos. J Biol Chem. 278 (32), 29442-29453 (2003).

Play Video

Citar este artigo
Chen, S., Chang, F., Lin, L., Wang, Y., Wen, F., Zhou, T., Pei, J. 13C6-Glucose Labeling Associated with LC-MS: Identification of Plant Primary Organs in Secondary Metabolite Synthesis. J. Vis. Exp. (205), e66578, doi:10.3791/66578 (2024).

View Video