Summary

Production de lots de vecteurs associés à l’adénographie à haut rendement à l’aide de cellules en suspension HEK293

Published: April 26, 2024
doi:

Summary

Ici, un protocole de production d’AAV à base de cellules HEK293 en suspension est présenté, ce qui permet de réduire le temps et la main-d’œuvre nécessaires à la production de vecteurs à l’aide de composants disponibles à des fins de recherche auprès de fournisseurs commerciaux.

Abstract

Les vecteurs viraux adéno-associés (AAV) sont un outil remarquable pour étudier le système nerveux central (SNC). Capsides innovantes, telles que l’AAV. PHP.eB, démontrent une transduction étendue du SNC par injection intraveineuse chez la souris. Pour obtenir une transduction comparable, un titre 100 fois plus élevé (au moins 1 x 1011 copies du génome/souris) est nécessaire par rapport à l’injection directe dans le parenchyme du SNC. Dans notre groupe, la production d’AAV, y compris l’AAV. PHP.eB s’appuie sur des cellules HEK293T adhérentes et la méthode de triple transfection. L’obtention de rendements élevés d’AAV avec des cellules adhérentes implique un processus à forte intensité de main-d’œuvre et de matériel. Cette contrainte a incité le développement d’un protocole de culture cellulaire en suspension dans des tubes coniques. Les AAV générés dans les cellules adhérentes ont été comparés à la méthode de production en suspension. Culture en suspension à l’aide de réactifs de transfection Polyéthylénimine ou TransIt ont été comparées. Les vecteurs AAV ont été purifiés par ultracentrifugation par gradient d’iodixanol suivie d’un échange de tampon et d’une concentration à l’aide d’un filtre centrifuge. Avec la méthode adhérente, nous avons obtenu une moyenne de 2,6 x 1012 copies du génome (GC) au total, tandis que la méthode en suspension et la polyéthylénimine ont donné 7,7 x 1012 GC au total, et TransIt a donné 2,4 x 1013 GC au total. Il n’y a pas de différence dans l’efficacité de la transduction in vivo entre les vecteurs produits avec des adhérents et ceux du système de cellules en suspension. En résumé, un protocole de production d’AAV à base de cellules HEK293 en suspension est introduit, ce qui permet de réduire le temps et la main-d’œuvre nécessaires à la production de vecteurs tout en obtenant des rendements 3 à 9 fois plus élevés en utilisant des composants disponibles auprès de fournisseurs commerciaux à des fins de recherche.

Introduction

Le virus adéno-associé (AAV) a été découvert en 1965 et a depuis été utilisé dans une myriade d’applications1. Les AAV ont été utilisés dans la recherche en neurosciences pour étudier les gènes et la fonction neuronale, cartographier les neurocircuits ou produire des modèles animaux pour la maladie2. Traditionnellement, cela se fait en injectant directement sur le site d’intérêt, car la plupart des sérotypes naturels ne traversent pas la barrière hémato-encéphalique ou n’ont pas besoin d’une dose élevée pour le faire 1,2,3.

Avec la découverte de l’AAV. PHP.B4 et les capsides de nouvelle génération telles que l’AAV. PHP.eB5 et AAV. CAP-B106, il est possible de cibler le système nerveux central (SNC) par une simple injection systémique. La cartographie spatiale révèle les cellules ciblées par AAV. PHP.eB au niveau cellulaire 6,7. En combinaison avec des promoteurs/amplificateurs spécifiques, ces capsides offrent de nombreuses possibilités aux neuroscientifiques d’étudier les gènes et la fonction cérébrale par administration non invasive d’AAV 4,8.

Alors qu’une dose plus faible est nécessaire pour l’AAV. PHP.eB (généralement 1 à 5 x 1011 copies du génome (GC)/souris) par rapport à AAV9 (4 x 1012 GC/souris)7, il faut produire encore plus de vecteurs par rapport aux stratégies d’injection directe (généralement 1 x 109 GC/μL injection). La plupart des sérotypes naturels peuvent être produits en utilisant le système classique de culture cellulaire adhérente en combinaison avec la purification à l’iodixanol 9,10,11,12. Pour AAV. PHP.eB : cela implique un processus laborieux de culture et de transfection des cellules afin d’obtenir suffisamment de vecteurs pour une expérience8. Par conséquent, la production d’AAV en culture cellulaire en suspension dans des tubes coniques a été développée. Les tubes coniques, d’une capacité allant jusqu’à 300 ml, sont compacts, ce qui permet d’économiser à la fois de l’espace dans l’incubateur et des plastiques. Les cellules en suspension sont beaucoup plus faciles à cultiver et à manipuler en grande quantité que les cellules adhérentes sur des plaques de 15 cm. Les composants de transfection du protocole restent les mêmes. Par conséquent, les plasmides précédemment utilisés avec le système adhérent peuvent facilement être utilisés dans ce protocole basé sur la production dans des cellules en suspension. Le protocole a été transféré avec succès à d’autres chercheurs du laboratoire et utilisé avec succès pour diverses capsides et constructions.

Protocol

Toutes les procédures expérimentales ont été approuvées par le comité institutionnel de soin et d’utilisation des animaux de l’Académie royale des sciences des Pays-Bas (KNAW) et étaient conformes à la loi néerlandaise sur l’expérimentation animale dans le cadre du projet numéro AVD8010020199126. La figure 1 présente un aperçu schématique de l’ensemble du protocole. De l’ensemencement des cellules à la purification des AAV, le protocole prend 6 jours. <p class="…

Representative Results

La plupart des laboratoires universitaires utilisent des cellules HEK293T adhérentes pour la production d’AAV 8,9. Bien que cela fonctionne relativement bien lorsque de petites quantités d’AAV sont nécessaires pour l’injection directe, un titre 100 fois plus élevé (au minimum 1 x 1011 GC/souris) est nécessaire pour obtenir une transduction similaire avec des capsides systémiques telles que l’AAV. PHP.eB. Dans …

Discussion

L’administration systémique d’AAV est un outil puissant pour le transfert de gènes vers le SNC ; cependant, la production d’AAV est un processus coûteux et laborieux. En utilisant des cellules en suspension, la main-d’œuvre et les plastiques sont réduits par rapport à la culture adhérente de HEK293T sur des plaques de 15 cm2 . De plus, les tubes coniques mis en œuvre ici sont faciles à manipuler et maximisent l’utilisation de l’espace de laboratoire. Le protocole a été mis en place par d…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Ce travail a été soutenu par une subvention du fonds de recherche de l’Académie royale des arts et des sciences des Pays-Bas (KNAW) et une subvention de Start2Cure (0-TI-01). Nous remercions Leisha Kopp pour sa contribution et ses conseils dans la mise en place du protocole. Les figurines ont été créées à l’aide de Biorender.

Materials

39 mL, Quick-Seal Round-Top Polypropylene Tube, 25 x 89 mm – 50Pk Beckman Coulter 342414
Adapter 600 mL conical tubes, for rotor S-4×1000,  eppendorf 5920701002
Adapter Plate fits 16 bioreactors of 600 ml Infors HT/ TPP 587633
Aerosol-tight caps, for 750 mL round buckets eppendorf 5820747005
Centrifuge 5920 R G, 230 V, 50-60 Hz, incl. rotor S-4×1000, round buckets and adapter 15 mL/50 mL conical tubes eppendorf 5948000315
Distilled Water Gibco 15230147
DNase I recombinant, RNase-free Roche 4716728001
DNase I recombinant, RNase-free Roche 4716728001
DPBS, calcium, magnesium Gibco 14040091
DPBS, no calcium, no magnesium Gibco 14190144
Fisherbrand Disposable PES Filter Units 0,2 Fisher FB12566504
Fisherbrand Disposable PES Filter Units 0,45 Fisher FB12566505
Holder for 50 ml culture tubes also fits falcon tube Infors HT/ TPP 31362
Holder for 600 ml cell culture tube Infors HT/ TPP 66129
Incubator Minitron 50 mm Infors HT 500043
LV-MAX Production Medium Gibco A3583401
N-Tray Universal Infors HT/ TPP 31321
OptiPrep – Iodixanol Serumwerk bernburg 1893
PEI MAX – Transfection Grade Linear Polyethylenimine Hydrochloride (MW 40,000) Poly-sciences 24765-100
Phenol red solution  Sigma-Aldrich 72420100
Poly(ethylene glycol) 8000 Sigma-Aldrich 89510
TransIT-VirusGEN Mirus Mir 6706
Trypan Blue Solution, 0.4% Gibco 5250061
TubeSpin Bioreactors-50ml TTP 87050
TubeSpin Bioreactors-600ml TTP 87600
Viral Production Cells Gibco A35347
Vivaspin 20 MWCO 100 000 Cytvia 28932363

Referências

  1. Zhou, K., Han, J., Wang, Y., Zhang, Y., Zhu, C. Routes of administration for adeno-associated viruses carrying gene therapies for brain diseases. Front Mol Neurosci. 15, 988914 (2022).
  2. Pietersz, K. L., et al. PhP.B Enhanced adeno-associated virus mediated-expression following systemic delivery or direct brain administration. Front Bioeng Biotechnol. 9, 679483 (2021).
  3. Zhang, H., et al. Several rAAV vectors efficiently cross the blood–brain barrier and transduce neurons and astrocytes in the neonatal mouse central nervous system. MolTher. 19 (8), 1440-1448 (2011).
  4. Deverman, B. E., et al. Cre-dependent selection yields AAV variants for widespread gene transfer to the adult brain. Nat Biotechnol. 34 (2), 204-209 (2016).
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Citar este artigo
Pietersz, K. L., Nijhuis, P. J., Klunder, M. H., van den Herik, J., Hobo, B., de Winter, F., Verhaagen, J. Production of High-Yield Adeno Associated Vector Batches Using HEK293 Suspension Cells. J. Vis. Exp. (206), e66532, doi:10.3791/66532 (2024).

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