يصف البروتوكول الحالي مقايسات العدوى لاستجواب الالتزام بالشيغيلا والغزو والتكاثر داخل الخلايا باستخدام خطوط الخلايا الظهارية في المختبر .
يسبب العامل الممرض البكتيري المعوي المتكيف مع الإنسان Shigella ملايين الإصابات كل عام ، ويخلق تأثيرات نمو طويلة الأجل بين مرضى الأطفال ، وهو سبب رئيسي لوفيات الإسهال في جميع أنحاء العالم. تسبب العدوى الإسهال المائي أو الدموي نتيجة لعبور العامل الممرض للجهاز الهضمي وإصابة الخلايا الظهارية المبطنة للقولون. مع الزيادات المذهلة في مقاومة المضادات الحيوية والنقص الحالي في اللقاحات المعتمدة ، تعد بروتوكولات البحث الموحدة ضرورية لدراسة هذا العامل الممرض الهائل. هنا ، يتم تقديم منهجيات لفحص التسبب الجزيئي للشيغيلا باستخدام التحليلات المختبرية للالتصاق البكتيري والغزو والتكاثر داخل الخلايا في الخلايا الظهارية القولونية. قبل تحليلات العدوى ، تم التحقق من النمط الظاهري للضراوة لمستعمرات الشيغيلا من خلال امتصاص صبغة الكونغو الحمراء على ألواح الآجار. يمكن أيضا اعتبار الوسائط المختبرية المكملة أثناء الزراعة البكتيرية لتقليد الظروف في الجسم الحي . ثم تستخدم الخلايا البكتيرية في بروتوكول موحد لإصابة الخلايا الظهارية القولونية في لوحات زراعة الأنسجة في تعدد ثابت من العدوى مع التكيفات لتحليل كل مرحلة من مراحل العدوى. لمقايسات الالتصاق ، يتم تحضين خلايا الشيغيلا بمستويات وسائط منخفضة لتعزيز الاتصال البكتيري بالخلايا الظهارية. لكل من مقايسات الغزو والتكرار داخل الخلايا ، يتم تطبيق الجنتاميسين لفترات زمنية مختلفة للقضاء على البكتيريا خارج الخلية وتمكين تقييم الغزو و / أو القياس الكمي لمعدلات النسخ المتماثل داخل الخلايا. تعدد جميع بروتوكولات العدوى البكتيريا الملتصقة و / أو الغازية و / أو داخل الخلايا عن طريق التخفيف المتسلسل لمحللات الخلايا الظهارية المصابة وطلاء وحدات تشكيل المستعمرة البكتيرية المتعلقة بإصابة التتر على ألواح أجار الكونغو الحمراء. تتيح هذه البروتوكولات معا توصيفا ومقارنات مستقلة لكل مرحلة من مراحل عدوى الشيغيلة للخلايا الظهارية لدراسة هذا العامل الممرض بنجاح.
تشكل أمراض الإسهال التي تسببها مسببات الأمراض البكتيرية المعوية عبئا صحيا عالميا كبيرا. في عام 2016 ، كانت أمراض الإسهال مسؤولة عن 1.3 مليون حالة وفاة في جميع أنحاء العالم وكانت السبب الرئيسي الرابع للوفاة بين الأطفال الذين تقل أعمارهم عن خمس سنوات من سن 1,2. الممرض البكتيري المعوي سلبي الجرام Shigella هو العامل المسبب لداء الشيغيلات ، وهو سبب رئيسي لوفيات الإسهال في جميع أنحاء العالم3. يسبب داء الشيغيلات معدلات اعتلال ووفيات كبيرة كل عام لدى الأطفال من البلدان المنخفضة والمتوسطة الدخل 4,5 ، بينما ترتبط العدوى في البلدان المرتفعة الدخل بمراكز الرعاية النهارية ، والأمراض المنقولة بالأغذية ، والفاشيات المنقولة بالمياه6،7،8،9. أدى تطوير لقاحغير فعال 10 وارتفاع معدلات مقاومة مضادات الميكروبات (AMR)11,12 إلى تعقيد إدارة فاشيات الشيغيلا على نطاق واسع. تظهر بيانات مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها الحديثة أن ما يقرب من 46٪ من إصابات الشيغيلا في الولايات المتحدة أظهرت مقاومة للأدوية في عام 202013,14 ، بينما أعلنت منظمة الصحة العالمية أن الشيغيلة من مسببات الأمراض ذات الأولوية في مقاومة مضادات الميكروبات والتي تحتاج إلى علاجات جديدةبشكل عاجل 15.
تنتقل عدوى الشيغيلا بسهولة عن طريق البراز الفموي عند تناول طعام أو ماء ملوث ، أو من خلال الاتصال البشري المباشر. تطورت الشيغيلا لتصبح ممرضة فعالة ومتكيفة مع الإنسان ، مع جرعة معدية من 10-100 بكتيريا كافية للتسبب في المرض16. أثناء العبور المعوي الصغير ، تتعرض الشيغيلة لإشارات بيئية ، مثل ارتفاع درجة الحرارة والصفراء17. يؤدي اكتشاف هذه الإشارات إلى تغييرات نسخية للتعبير عن عوامل الفوعة التي تعزز قدرة البكتيريا على إصابة القولون البشري17،18،19. لا تغزو الشيغيلة ظهارة القولون من السطح القمي ، بل تنتقل عبر الطبقة الظهارية بعد الامتصاص إلى خلايا ميكروطية متخصصة تقدم المستضد (خلايا M) داخل الظهارة المرتبطة بالجريب20،21،22. بعد انتقال الخلايا ، يتم البلعمة خلايا الشيغيلة بواسطة الضامة المقيمة. تهرب الشيغيلة بسرعة من البلعمة وتؤدي إلى موت خلايا البلاعم ، مما يؤدي إلى إطلاق السيتوكينات المؤيدة للالتهابات5،23،24. ثم تغزو الشيغيلة الخلايا الظهارية القولونية من الجانب القاعدي ، وتحلل الفجوة العصارية الكبيرة ، وتنشئ مكانا متماثلا في السيتوبلازم 5,25. تقوم السيتوكينات المؤيدة للالتهابات ، وخاصة إنترلوكين -8 (IL-8) ، بتجنيد كريات الدم البيضاء متعددة الأشكال النووية (PMNs) إلى موقع العدوى ، مما يضعف الوصلات الضيقة الظهارية ، ويمكن من تسلل البكتيريا للبطانة الظهارية إلى تفاقم العدوى القاعدية5. تدمر PMNs البطانة الظهارية المصابة لاحتواء العدوى ، مما يؤدي إلى الأعراض المميزة للزحار العصوي (الدموي)5. على الرغم من أن آليات الغزو والتكاثر داخل الخلايا قد تم توصيفها بدقة ، إلا أن الأبحاث الجديدة تظهر مفاهيم جديدة مهمة في عدوى الشيغيلا ، بما في ذلك تنظيم الفوعة أثناء عبور الجهاز الهضمي (GI)17 ، والالتزام19 ، وتحسين الوصول القاعدي الجانبي من خلال نفاذية الحاجز26 ، والنقل بدون أعراض في الأطفال الذين يعانون من سوء التغذية27.
تقتصر قدرة الشيغيلة على التسبب في مرض الإسهال على البشر والرئيسيات غير البشرية (NHP)28. تم تطوير نماذج عدوى الشيغيلا المعوية لسمك الزرد29 والفئران30 وخنازير غينيا31 والأرانب21،32،33 والخنازير34،35. ومع ذلك ، لا يمكن لأي من هذه الأنظمة النموذجية تكرار خصائص المرض التي لوحظت أثناء العدوى البشريةبدقة 36. على الرغم من إنشاء نماذج NHP لداء الشيغيلات لدراسة التسبب في الشيغيلة ، إلا أن هذه الأنظمة النموذجية مكلفة في التنفيذ وتتطلب جرعات معدية عالية بشكل مصطنع ، تصل إلى تسعة أوامر من حيث الحجم أعلى من الجرعة المعدية للبشر37،38،39،40،41،42. وبالتالي ، فإن التكيف الملحوظ للشيغيلا لعدوى المضيفين البشريين يستلزم استخدام مزارع الخلايا المشتقة من الإنسان لإعادة إنشاء نماذج ذات صلة من الناحية الفسيولوجية للاستجواب الدقيق لتسبب الشيغيلا.
هنا ، يتم وصف الإجراءات التفصيلية لقياس معدلات الالتزام بالشيغيلة وغزوها وتكرارها داخل الخلايا الظهارية القولونية HT-29. باستخدام هذه البروتوكولات الموحدة ، يمكن استجواب الآليات الجزيئية التي تؤثر بها جينات الفوعة البكتيرية والإشارات البيئية على كل خطوة من خطوات عدوى الشيغيلا لفهم علاقة التفاعل الديناميكية بين المضيف والممرض بشكل أفضل.
يصف هذا البروتوكول مجموعة من ثلاثة مقايسات موحدة لدراسة التصاق الشيغيلة وغزوها وتكرارها داخل الخلايا للخلايا الظهارية المعوية. على الرغم من أن هذه الطرق هي مجرد نسخ معدلة من مقايسات الجنتاميسين الكلاسيكية المستخدمة لدراسة الغزو والتكاثر داخل الخلايا لمختلف مسببات الأمراض البكتير?…
The authors have nothing to disclose.
يشمل دعم المؤلفين قسم طب الأطفال في مستشفى ماساتشوستس العام ، وجائزة اللجنة التنفيذية لتمويل الدعم المؤقت للأبحاث (ISF) 2022A009041 ، ومنحة المعهد الوطني للحساسية والأمراض المعدية R21AI146405 ، والمعهد الوطني للسكري وأمراض الجهاز الهضمي والكلى منحة مركز أبحاث السمنة الغذائية في جامعة هارفارد (NORCH) 2P30DK040561-26. لم يكن للممولين أي دور في تصميم الدراسة أو جمع البيانات وتحليلها أو قرار النشر أو إعداد المخطوطة.
0.22 μm PES filter | Millipore-Sigma | SCGP00525 | Sterile, polyethersulfone filter for sterilizing up to 50 mL media |
14 mL culture tubes | Corning | 352059 | 17 mm x 100 mm polypropylene test tubes with cap |
50 mL conical tubes | Corning | 430829 | 50 mL clear polypropylene conical bottom centrifuge tubes with leak-proof cap |
6-well tissue culture plates | Corning | 3516 | Plates are treated for optimal cell attachment |
Bile salts | Sigma-Aldrich | B8756 | 1:1 ratio of cholate to deoxycholate |
Congo red dye | Sigma-Aldrich | C6277 | A benzidine-based anionic diazo dye, >85% purity |
Countess cell counting chamber slide | Invitrogen | C10283 | To be used with the Countess Automated Cell Counter |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D8418 | A a highly polar organic reagent |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | 10569-010 | DMEM is supplemented with high glucose, sodium pyruvate, GlutaMAX, and Phenol Red |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Sigma-Aldrich | F4135 | Heat-inactivated, sterile |
Gentamicin | Sigma-Aldrich | G3632 | Stock concentration is 50 mg/mL |
HT-29 cell line | ATCC | HTB-38 | Adenocarcinoma cell line; colorectal in origin |
Paraffin film | Bemis | PM999 | Laboratory sealing film |
Petri dishes | Thermo Fisher Scientific | FB0875713 | 100 mm x 15 mm Petri dishes for solid media |
Phosphate-buffered saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010049 | 1x concentration; pH 7.4 |
Select agar | Invitrogen | 30391023 | A mixture of polysaccharides extracted from red seaweed cell walls to make bacterial plating media |
T75 flasks | Corning | 430641U | Tissue culture flasks |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | A common non-ionic surfactant and emulsifier |
Trypan blue stain | Invitrogen | T10282 | A dye to detect dead tissue culture cells; only live cells can exclude the dye |
Trypsin-EDTA | Gibco | 25200-056 | Reagent for cell dissociation for cell line maintenance and passaging |
Tryptic Soy Broth (TSB) | Sigma-Aldrich | T8907 | Bacterial growth media |