מחקר זה מציג שיטה לניתוח המורפולוגיה של המיטוכונדריה בהתבסס על אימונוסטיין וניתוח תמונה ברקמת מוח עכבר באתרה. הוא גם מתאר כיצד זה מאפשר לזהות שינויים במורפולוגיה המיטוכונדריאלית הנגרמים על ידי צבירת חלבונים במודלים של מחלת פרקינסון.
מיטוכונדריה ממלאים תפקיד מרכזי בחילוף החומרים האנרגטי של תאים, ותפקודם חשוב במיוחד עבור תאי עצב בשל דרישת האנרגיה הגבוהה שלהם. לכן, תפקוד לקוי של המיטוכונדריה הוא סימן היכר פתולוגי של הפרעות נוירולוגיות שונות, כולל מחלת פרקינסון. הצורה והארגון של הרשת המיטוכונדריאלית הם פלסטיים מאוד, מה שמאפשר לתא להגיב לרמזים ולצרכים סביבתיים, וגם מבנה המיטוכונדריה קשור קשר הדוק לבריאותם. כאן, אנו מציגים פרוטוקול לחקר מורפולוגיה מיטוכונדריאלית באתרה המבוסס על אימונוסטיין של החלבון המיטוכונדריאלי VDAC1 וניתוח תמונה לאחר מכן. כלי זה יכול להיות שימושי במיוחד לחקר הפרעות נוירודגנרטיביות מכיוון שהוא יכול לזהות הבדלים עדינים בספירות מיטוכונדריאליות ובצורה הנגרמת על ידי צברים של α-סינוקלאין, חלבון נוטה לצבירה המעורב במידה רבה בפתולוגיה של מחלת פרקינסון. שיטה זו מאפשרת לדווח כי נוירונים דופמינרגיים בעלי נגעי pS129 מראים פיצול מיטוכונדריאלי (כפי שהוצע על ידי יחס גובה-רוחב מופחת שלהם, AR) בהשוואה לנוירונים שכנים בריאים שלהם במודל פרקינסון הזרקת פיבריל תוך גולגולתי שנוצר מראש.
למערכת העצבים המרכזית יש ביקוש אינטנסיבי ל-ATP: תאי עצב משתמשים ב-ATP כדי לתמוך בשיפועים יוניים, סינתזת מוליכים עצביים, ניוד שלפוחית סינפטית, שחרור ומיחזור, וכדי לאפשר תרגום ופירוק מקומי של חלבונים. יותר מ-95% מה-ATP המשמש את המוח מיוצר על-ידי המיטוכונדריה1. לכן, אין זה מפתיע שתפקוד לקוי של המיטוכונדריה מזיק במיוחד לנוירונים. למעשה, ליקויים בתפקוד המיטוכונדריה ממלאים תפקיד חשוב במספר מחלות נוירולוגיות, כולל מחלות נוירודגנרטיביות, כגון מחלת פרקינסון (PD) ואלצהיימר (AD)2,3.
גנים מרובים קשורים באופן חד משמעי לחלבונים מקודדי PD הרלוונטיים לתפקוד המיטוכונדריה ולהומאוסטזיס, כגון פרקין 4,5,6, קינאז המושרה על ידי PTEN 1 (PINK1)7,8 ו- DJ-19. ראיות נוספות לתפקוד לקוי של המיטוכונדריה בפרקינסון הן שטיפולים במעכבי קומפלקס I של שרשרת הובלת האלקטרונים במיטוכונדריה (כגון רוטנון ו-MPTP) משחזרים מספר היבטים של פרקינסון במבחנה ו-in vivo10. עם זאת, חשוב לציין כי תהליכים פתולוגיים רבים עשויים לגרום לאובדן עצבי בפרקינסון, יחד עם ליקויים מיטוכונדריאליים: עקה חמצונית, שינוי הומאוסטזיס סידן, כישלון של יוביקוויטין-פרוטאזום ושל מערכות אוטופגיה-ליזוזומליות, וצבירת חלבונים הם בין הנחקרים ביותר (נסקרו ב 11,12,13 ו).
מיטוכונדריה הם הטרוגניים בצורתם: בנוסף ליחידות בודדות, הם נמצאים בדרך כלל כרשתות רשתית וצינורית מורחבות. המבנה והמיקום התאי של המיטוכונדריה קריטיים לתפקודם14; למעשה, רשתות מיטוכונדריאליות הן דינמיות ביותר, ועוברות תהליכים תכופים של ביקוע, איחוי ומיטופגיה על מנת לענות על צרכי התאים ולהגיב לרמזים סביבתיים15,16. בנוסף, המורפולוגיה של המיטוכונדריה קשורה קשר הדוק למצב הבריאותי שלהם. לדוגמה, באטרופיה אופטית אנושית, מוטציות גנטיות המפחיתות את פעילות המיטוכונדריה מובילות למיטוכונדריה חריגה, דקה והיפר-פיוזית17. מצד שני, מגוון מחלות אנושיות מציגות מורפולוגיה מיטוכונדריאלית חריגה, כולל פיצול מיטוכונדריאלי או איחוי מיטוכונדריאלי מוגזם, שיש להם השפעות מזיקות על תפקוד המיטוכונדריה (נסקר ב-18). בהקשר של פרקינסון, אנו ואחרים הראינו בעבר כי צורה מיטוכונדריאלית חריגה נמצאת בקורלציה עם תפקוד לקוי בתגובה לצברי α-סינוקלאין19. בעוד שמורפולוגיה מיטוכונדריאלית נחקרה בהרחבה במבחנה הן בהקשר של פרקינסון והן בהקשר של מחלות אחרות 20,21,22, חסרים פרוטוקולים להערכת מורפולוגיה מיטוכונדריאלית מקטעי in vivo. זה הופך את המחקר in vivo של מיטוכונדריה בהקשר של מחלות כגון PD תלוי מאוד בבעלי חיים טרנסגניים23 או הערכה של תמציות המוח התיכון שאינם יכולים לספק פתרון תאי.
כאן, מוצג פרוטוקול לחקר המורפולוגיה המיטוכונדריאלית באתרה כאינדיקטור למצבם התפקודי ובריאותם, בהתבסס על אימונוסטיין של החלבון המיטוכונדריאלי VDAC124 ואחריו ניתוח תמונה בקטעי רקמה משובצים פרפין. אנו גם מראים את התוצאות של פרוטוקול זה במודלים של PD in vitro ו-in vivo : תאי נוירובלסטומה בעלי ביטוי יתר של SNCA (Synuclein Alpha) ורקמת מוח מעכברים שנחשפו להזרקה תוך-גולגולתית של α-synuclein Pre-Formed Fibrils (PFFs). Co-immunostaining עם נוגדן נגד α-synuclein (בתאים) או phosphoSer129- α-synuclein pS129 (במוחות עכברים) אפשרה לנו לזהות תאים עם פתולוגיה מצטברת של חלבונים (ביטוי יתר של סיבי α-synuclein ו-α-synuclein, בהתאמה) בדגימות, בעוד שתאים שליליים שימשו כבקרה לא פתולוגית בתוך אותן דגימות. באמצעות ניתוח זה והנתונים המתוארים כאן, נצפה יחס גובה-רוחב מופחת, המצביע על פיצול מיטוכונדריה בתאים המבטאים יתר על המידה SNCA או מציגים נגעי pS129.
בסך הכל, מחקר זה מראה כי immunostaining בשילוב עם ניתוח תמונה היא שיטה אמינה לניתוח מורפולוגיה מיטוכונדריאלית. למעשה, הוא מאפשר לכמת את מספר המיטוכונדריה, כמו גם כמה פרמטרים מורפולוגיים כגון יחס גובה-רוחב הן בתרבית התא והן ברקמה. מספר המיטוכונדריה קשור ישירות למצב התפקודי של מנגנוני הביקוע והאיחוי של הדגימות, בעוד שערך AR מסתמך על התארכות האברון. שיטה זו עשויה להיות בעלת ערך רב במיוחד להערכה מהירה של הפרעות מיטוכונדריאליות במודלים של פרקינסון שבהם שינויים במורפולוגיה, דינמיקה ותפקודים של המיטוכונדריה הם מנגנונים פתולוגיים ידועים28,29. α-סינוקלאין ממלא תפקיד רלוונטי גם בפרקינסון: אכן, α-סינוקלאין הוא אחד המרכיבים של גופי לוי, אגרגטים ציטופלסמטיים פיברילריים המשמשים לאבחון לאחר המוות של חולי פרקינסון30. יתר על כן, מוטציות בגן SNCA נמצאו בחולים עם פרקינסון מוכר וספורדי כאחד (נסקר ב-31). זרחן של α-סינוקלאין ב-Ser129 הוכח בהרחבה כפתולוגיה דמוית גוף לוי, המתגלה לאחר עלבון PFF ומעוררת השפעות רעילות שונות32,26.
באמצעות הכלי שהוצג כאן, הצלחנו לזהות ירידה במספר המיטוכונדריה ובערכי AR בנוכחות α-סינוקלאין (תאים עם צביעה α-סינוקלאין ותאי עצב הנושאים נגעים חיוביים ל-phosphoSer129α-synuclein, בהתאמה) בהשוואה לתאים חסרי נגעים כאלה (תאים שליליים α-synuclein ו-phosphoS129α-synuclein). תוצאות אלה תואמות דיווחים קודמים המראים כיצד אינטראקציות ישירות של α-סינוקלאין-מיטוכונדריה מייצרות השפעות רעילות על תפקוד המיטוכונדריה והומאוסטזיס במחלת פרקינסון26,33 34. ואכן, דווח כי עכברים עם מוטציות α-סינוקלאין מפגינים נזק מוגבר לדנ”א מיטוכונדריאלי35 ומיטופגיה36,37. יתר על כן, תואר כי רמות מוגברות של α-סינוקלאין מקדמות ביקוע/פיצול מיטוכונדריאלי, גורמות למיני חמצן תגובתי במיטוכונדריה, ומווסתות את ביטוי החלבונים המיטוכונדריאליים בשורות תאים ובמודלים של עכברים המבטאים יתר על המידה α-סינוקלאין 26,38,39.
חשוב להדגיש כי כלי זה תלוי מאוד בנוגדנים המשמשים למחקר; הערכה מורפולוגית זהירה של כתם הנוגדנים המשמש היא הכרחית כדי לזהות את התא התת-תאי המתאים. מכיוון שטכניקה זו מבוססת על חתכים של 5 מיקרומטר ולכן דורשת מישורי מוקד בודדים לניתוח המבנים המיטוכונדריאליים, היעדר פנוטיפ לא ישלול את קיומו של פנוטיפ, שכן ייתכן שהבדלים עדינים במורפולוגיה המיטוכונדריאלית לא יתגלו בשיטה זו.
בעוד שעבודה זו ואחרות השתמשו בעבר בגישות דומות להערכת מורפולוגיה מיטוכונדריאלית in vivo40, יש צורך בפרוטוקול מפורט שיהיה נגיש לקהילת המחקר לצורך הערכה זו. משמעות מחקר זה היא שניתן ליישם שיטה זו על מודלים שונים של מחלות in vivo כדי להעריך הפרעות מורפולוגיות מיטוכונדריאליות ולזהות פתולוגיה פוטנציאלית, אשר עשויה בסופו של דבר להקל על סינון תרכובות עופרת לטיפול בהפרעות כאלה. בעוד ניתוח זה מוגבל כיום לרקמה משובצת פרפין, היתרון של השיטה הוא שניתן ליישם אותה על כל מודל מחלה לאחר איסוף רקמות סופניות, מה שהופך אותה לכלי רב-תכליתי מאוד.
The authors have nothing to disclose.
ברצוננו להודות למממני מחקר זה, במיוחד Ikerbasque, משרד המדע והחדשנות הספרדי, קרן מייקל ג’יי פוקס, IBRO והמרכז הבאסקי אצ’וקרו למדעי המוח.
32 G Hamilton syringe | Hamilton | 7632-01 | |
4',6-diamidino-2-fenilindol, dihidrocloruro (DAPI) | Invitrogen | D1306 | |
4/0 USP 45 cm suture | SSa90 pga | 32345n-36u | |
Alexa fluor 488/594-Donkey anti-Mouse | Invitrogen | A21202; A21203 | green/red dye-Donkey anti-Mouse |
Alexa fluor 594/647-Donkey anti-Rabbit | Invitrogen | A21207 A31573 | red/far red dye-Donkey anti-Rabbit |
AlexaFluor 488-Donkey anti-Chicken | Jackson ImmunoResearch | 703-545-155 | green dye-Donkey anti-Chicken |
Anti-PSer129 α-synuclein EP1536Y (Rabbit) antibody | Abcam | ab51253 | |
Anti-TOM 20 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-17764 | |
Anti-Tyrosine Hydroxylase (Chicken) antibody | Abcam | ab76442 | |
Anti-VDAC1 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-390996 | |
Anti-α-synuclein antibody MJFR1 (Rabbit) | Abcam | ab138501 | |
Citrate buffer 100X stock: 120mM citrate buffer, 5% Tween in water (pH 6) | Home-made | ||
Disposable base mold for tissue embedding | Fisher | 22-363-553 | Plastic embedding boxes |
D-MEM F12 | Gibco | A321331020 | |
EVOS M7000 Imaging System | ThermoFisher Scientific | High-content automated fluorescence microscope | |
Fetal Bovine Serum | Gibco | 10270106 | |
Flat optical bottom 96 well plates | Greiner | 675090 | |
FluorSave Reagent | Millipore | 345789-20ML | Mounting reagent |
Glutamine 200 mM | Gibco | 25030-024 | |
ImmEdge Hydrophobic Barrier Pen | Vector Laboratories | H-4000 | PAP-pen |
Lipofectamine and Plus Reagent | Invitrogen | 11668-019; 11514-015 | Transfection reagent and transfection adjuvant |
Matrigel | Corning | 354230 | Coating matrix |
Microtome | ThermoFisher Scientific | ||
Normal Donkey Serum | Gibco | PCN5000 | |
Opti-MEM | Gibco | 31985070 | Transfection medium |
PCDNA4 plasmid (backbone) | Addgene | 41036 | |
Penicillin/Streptomycin solution | Gibco | 15140-122 | |
SH-SY5Y cells/well | ATCC | HTB-11 | |
Xylene substitute | Labbox | 22L36504 | |
Zeiss Axio Imager Apotome 2 | Carl Zeiss | Structured illumination fluorescence imaging system | |
α-synuclein peptide | rpeptide | S-1010-2 |