מודל במבחנה של נישה וסקולרית של מח העצם נקבע על ידי זריעת תאים מזנכימליים ואנדותל על הידרוג’ל PEG תלת-ממדי יצוק מראש. רשתות האנדותל, רכיבי ECM ופעילות ALP של הנישות משתנים בהתאם לגורם הגדילה בו נעשה שימוש. הפלטפורמה יכולה לשמש למודלים מתקדמים של סרטן.
מח העצם ומח העצם הם איברים מאוד וסקולריים ומורכבים מבחינה מבנית, והם אתרים להיווצרות סרטן וגרורות. מודלים במבחנה המשחזרים תפקודים ספציפיים לעצם ולמח העצם, כולל וסקולריזציה, התואמים לבדיקת תרופות הם רצויים מאוד. מודלים כאלה יכולים לגשר על הפער בין מודלים דו-ממדיים (2D) במבחנה פשטניים ולא רלוונטיים מבחינה מבנית לבין מודלים יקרים יותר ומאתגרים מבחינה אתית in vivo . מאמר זה מתאר בדיקת תרבית משותפת תלת-ממדית (תלת-ממדית) הניתנת לשליטה המבוססת על מטריצות פולי(אתילן גליקול) (PEG) מהונדסות, ליצירת גומחות מח-עצם אוסטאוגניות וסקולריות. תכנון מטריצת PEG מאפשר פיתוח תרביות תאים תלת-ממדיות באמצעות שלב פשוט של זריעת תאים שאינו דורש אנקפסולציה, ובכך מאפשר פיתוח מערכות תרבית משותפת מורכבות. יתר על כן, המטריצות שקופות ונוצקות מראש על לוחות הדמיה בעלי תחתית זכוכית של 96 בארות, מה שהופך את המערכת למתאימה למיקרוסקופיה. עבור הבדיקה המתוארת כאן, תאי סטרומה מזנכימליים שמקורם במח עצם אנושי (hBM-MSCs) מתורבתים תחילה עד ליצירת רשת תאים תלת-ממדית מפותחת מספיק. לאחר מכן מתווספים תאי אנדותל של ורידים טבוריים אנושיים המבטאים GFP (HUVECs). התפתחות התרבית מלווה במיקרוסקופ שדה בהיר ופלואורסצנטי. נוכחותה של רשת hBM-MSC תומכת בהיווצרות מבנים דמויי כלי דם שאחרת לא היו נוצרים ונשארים יציבים לפחות 7 ימים. ניתן לכמת בקלות את היקף היווצרות הרשת דמוית כלי הדם. ניתן לכוונן מודל זה לנישה אוסטאוגנית של מח עצם על ידי השלמת מדיום התרבית עם חלבון מורפוגנטי עצם 2 (BMP-2), אשר מקדם את ההתמיינות האוסטאוגנית של hBM-MSCs, כפי שהוערך על ידי פעילות מוגברת של פוספטאז אלקליין (ALP) ביום 4 וביום 7 של תרבית משותפת. מודל תאי זה יכול לשמש כפלטפורמה לגידול תאים סרטניים שונים ולחקור כיצד הם מתקשרים עם נישות כלי דם ספציפיות לעצם ולמח עצם. יתר על כן, הוא מתאים לאוטומציה ולניתוחים בעלי תוכן גבוה, כלומר הוא יאפשר בדיקת תרופות לסרטן בתנאי תרבית הניתנים לשחזור גבוה.
עצם ומח עצם הם איברים מורכבים מבחינה מבנית ותפקודית מרכזיים לבריאות האדם. זה בא לידי ביטוי על ידי קיומן של נישות נפרדות המסדירות hematopoiesis ותחזוקת עצם1. כיום מקובל כי במוח עצם בריא, התחזוקה וההרחבה של תאי גזע המטופויטיים ושלדיים, כמו גם צאצאיהם, נשלטים על ידי נישות נפרדות. גומחות אלה מורכבות מסוגי תאים שונים, כולל תאי אוסטאו-שושלת, תאי גזע מזנכימליים, תאי אנדותל ופרי-וסקולריים, תאי עצב וגלייה, אדיפוציטים, אוסטאוקלסטים, מקרופאגים ונויטרופילים2. שלא במפתיע, נישות אלה, הקשורות בעיקר לכלי דם, מעורבות גם בהתפתחות סוגים שונים של לוקמיה3 והן אתר של גרורות לסוגי סרטן שונים4. בשל תפקידיו הספציפיים ביצירת עצם, עיצוב מחדש ותחזוקת עצם (מח), לכלי הדם הקשורים לעצם יש מבנים מיוחדים שונים מכלי הדם הנמצאים במקומות אחרים בגוף 5,6,7. לפיכך, תרופות אנטי אנגיוגניות או מווסתות כלי דם המיושמות באופן מערכתי עשויות להיות השפעות שונות בסביבות מיוחדות אלה8. לכן, רצוי מאוד שמודלים לחקר המנגנונים המולקולריים המעורבים בשמירה על התכונות הפיזיולוגיות של מח העצם ומח העצם, התחדשות מח העצם ומח העצם ותגובות לטיפולים טיפוליים.
תרביות רקמה דו-ממדיות קלאסיות (2D) וחקירות in vivo באמצעות מודלים של בעלי חיים סיפקו תובנה שלא תסולא בפז לגבי תפקידיהם של תאים שונים ושחקנים מולקולריים המעורבים בהתפתחות מח עצםומח עצם 9,10. מודלים המאפשרים ניסויים בתפוקה גבוהה עם תאים אנושיים רלוונטיים יכולים לשפר את הבנתנו כיצד לווסת פרמטרים נבחרים במערכות מורכבות מאוד אלה.
בעשור האחרון נעשה שימוש בעקרונות הנגזרים מהנדסת רקמות כדי ליצור מודלים תלת-ממדיים של רקמות11,12. אלה הסתמכו בעיקר על אנקפסולציה של תאים רלוונטיים לרקמות לביו-חומרים כדי ליצור תרביות מונו-ממדיות או קו-תרביות13. בין הביו-חומרים הנפוצים ביותר הם פיברין 14, קולגן 15 ומטריג’ל16,17, שכולם בעלי תאימות ביולוגית גבוהה ומספקים תנאים מתאימים לגדילה של סוגי תאים רבים. לביו-חומרים אלה יש את היכולת ליצור מודלים במבחנה המשחזרים היבטים מרכזיים של נישות כלי הדם השונות שנמצאות in vivo18. יתר על כן, השימוש בהתקנים מיקרופלואידים ליצירת מודלים של עצמות וכלי דם ומח עצם מחוררים תרם ליצירת מודלים במבחנה בעלי מורכבות גבוהה יותר 19,20,21,22.
הקושי לשלוט בהרכב ולהנדס את התכונות של ביו-חומרים טבעיים נתן השראה לפיתוח אנלוגים סינתטיים שניתן לתכנן באופן רציונלי עם תכונות פיזיקליות, כימיות וביולוגיות צפויות23,24. פיתחנו הידרוג’לים מבוססי פולי (אתילן גליקול) (PEG) סינתטיים לחלוטין (FXIII), אשר מתפקדים עם פפטידים RGD ואתרי מחשוף מטריצה metalloprotease (MMP) כדי להקל על חיבור תאים ושיפוץ25,26. העיצוב המודולרי של ביו-חומרים אלה שימש בהצלחה כדי לייעל את התנאים להיווצרות מודלים תלת-ממדיים של מח עצם ומח עצם27,28.
לבדיקה של מספר גדול יותר של תנאי תרבות שונים וטיפולים חדשים, נדרשים מודלים עם יכולת תפוקה גבוהה יותר. לאחרונה הראינו כי ניתן לשלוט בקישור הצולב FXIII של הידרוג’ל ה- PEG שלנו באמצעות תהליך אלקטרוכימי כך שנוצר שיפוע קשיחות הידרוג’ל מעמיק29. כאשר מוסיפים תאים על גבי הידרוג’לים כאלה, הם נודדים לכיוון הפנים ומתפתחים בהדרגה לרשתות סלולריות תלת-ממדיות מקושרות מאוד30. ביטול הצורך לתמצת תאים לתוך הידרוג’ל, אשר נמצא בדרך כלל עם פיגומים 3D אחרים, לא רק מפשט את התכנון הניסויי, אלא גם מאפשר תוספת רציפה של סוגי תאים שונים בנקודות זמן שונות כדי ליצור מערכות מורכבות של תרבית משותפת. הידרוג’לים אלה זמינים מראש על לוחות הדמיה של 96 בארות עם תחתית זכוכית, ובכך הופכים את הקמת התרביות התלת-ממדיות להשגה באמצעות פרוטוקולי זריעת תאים ידניים ואוטומטיים. השקיפות האופטית של הידרוג’ל PEG הופכת את הפלטפורמה לתואמת למיקרוסקופיה.
כאן, אנו מציגים שיטה פשוטה ליצירה ואפיון של נישות אוסטאוגניות וסקולריות בתוך פלטפורמת plug-and-play סינתטית מוכנה לשימוש. אנו מראים כי ניתן לגרות את התפתחותן של רשתות כלי דם באמצעות גורם גדילה המשמש בדרך כלל לגרימת אוסטאוגנזה במבחנה, חלבון מורפוגנטי עצם-2 (BMP-2), בעוד שניתן למנוע התמיינות אוסטאוגנית על ידי תוספת של גורם גדילה פיברובלסטי 2 (FGF-2)27,31. הרשתות שנוצרו שונות בהשוואה לרשתות מעוררות FGF-2 מבחינת המראה הכללי, כמו גם התפלגות התא וה- ECM. יתר על כן, עקבנו אחר האינדוקציה האוסטאוגנית באמצעות פוספטאז אלקליין כסמן. אנו מדגימים את הביטוי המוגבר של סמן זה לאורך זמן ומשווים את הביטוי לזה ברשתות מגורות FGF-2 בשיטות איכותיות וכמותיות. לבסוף, אנו מדגימים את התאמת הנישות שנוצרו של מודל זה לשני יישומים פוטנציאליים. ראשית, ביצענו בדיקת רגישות לתרופות הוכחת היתכנות על ידי הוספת bevacizumab לנישות מוכנות מראש ומעקב אחר השפלת רשתות כלי הדם בנוכחותו. שנית, הוספנו את סרטן השד MDA-MB-231 ואת תאי אוסטאוסרקומה U2OS לנישות אוסטאוגניות שנוצרו מראש, והראינו כי ניתן להשתמש בגומחות אלה כדי לחקור אינטראקציות בין תאים סרטניים לסביבתם.
במאמר זה אנו מתארים פרוטוקול להקמת מודל במבחנה של גומחות עצם ומח עצם וסקולריות מאוד במטריצה תלת-ממדית מבוססת PEG סינתטית לחלוטין וניתנת לשליטה, שיש לה מגוון יישומים במחקר ביולוגי של מח עצם ומח עצם, הנדסת רקמות וחקר הסרטן. מודל זה מתבסס על הידרוג’ל סינתטי מבוסס PEG המתפקד עם פפטידים RGD ואתרי מחשוף MMP ונוצק עם שיפוע צפיפות מעמיק על לוחות הדמיה 96 בארות תחתית זכוכית30. פלטפורמת plug-and-play זו הוכחה כמאפשרת הקמת רשתות סלולריות תלת-ממדיות מקושרות מאוד ללא צורך לעטוף תאים לתוך ההידרוג’ל. בדומה לפרוטוקול אנקפסולציית התא שתואר קודם לכן, בעבודה זו, אנו מראים את העיצוב מחדש של המצע על ידי ECM28 הטבוע בתא כדי ליצור מיקרו-סביבה ספציפית לסוג התא. לכן, בשיטה זו, ניתן לבצע בקלות בדיקות סינון סמים וניתוחי תוכן גבוה בתנאי תרבית תלת-ממד אורגנוטיפיים הניתנים לשחזור. לוחות 96 הקידוחים בעלי תחתית הזכוכית וההידרוג’לים השקופים אופטית הופכים את הפלטפורמה לתואמת לאוטומציית טיפול בנוזלים ולמיקרוסקופ בתפוקה גבוהה.
הצעד הראשון ביצירת נישת מח עצם וסקולרית אוסטאוגנית הוא תרבית טרום של hBM-MSCs על הידרוג’ל PEG למשך 3 ימים לפחות. במהלך תקופה זו, הם נצמדים להידרוג’ל, חודרים אליו, ומתחילים ליצור מגעים בין תאים ושקיעת ECM. לפני זריעת hBM-MSCs, יש להסיר את מאגר האחסון. מכיוון שההידרוג’ל ממוקם בתוך באר פנימית בתוך הבאר הסטנדרטית של צלחת הדמיה של 96 בארות, בטוח להכניס את קצה השאיפה לאורך דופן הבאר עד שהוא נוגע בטבעת הבאר הפנימית. משאבת ואקום יכולה לשמש לשאיפה אם היא מוגדרת בכוח היניקה הנמוך ביותר האפשרי. לחלופין, ניתן להשתמש במכונת כביסה אוטומטית עם גובה הזרבובית המותאם לפחות ל-0.8 מ”מ מעל טבעת הבאר הפנימית כדי לשאוף את החיץ מצלחת ההידרוג’ל. שימוש באוטומציה לטיפול בנוזלים יכול למזער את הנזק למשטח ההידרוג’ל ולהוביל לשחזור גבוה יותר של התרביות המתקבלות. פגמים קטנים על פני השטח של ההידרוג’ל הופכים גלויים ברגע שהתאים מתיישבים על ההידרוג’ל ומופיעים במישור מיקוד נמוך יותר באזורי הידרוג’ל פגומים. לכן, רכישת תמונות ייחוס ביום 0 משמשת כבקרת איכות טובה להומוגניות זריעת התא ולשלמות פני השטח של הידרוג’ל. בעוד פגמים קטנים בפני השטח של הידרוג’ל אינם מונעים שימוש נוסף בבאר, התאים נוטים להתקבץ על האזורים הפגומים ועשויים לגדול לדפוסים לא מייצגים או להגיע מהר יותר לזכוכית התחתונה, שם הם גדלים לשכבה אחת. יש לציין ממצאים אלה בעת שימוש/הערכה של בארות אלה. שיקולים דומים חלים על כל שינוי בינוני שיבוצע במהלך כל תקופת הבדיקה.
השלב השני של הפרוטוקול כולל תוספת של GFP-HUVECs למונוקולטורה hBM-MSC שנוצרה מראש (יום 0 של תרבות משותפת). ה- ECM שהופקד על ידי hBM-MSC מספק פיגום נהדר לצמיחת תאי אנדותל, אשר בעבודה זו, אפילו בנוכחות מדיום מותנה hBM-MSC, יכול היה ליצור רק צבירי תאים עגולים על ההידרוג’לים (לא מוצגים). עם הזריעה על תרביות hBM-MSC, HUVECs משתלבים ויוצרים מבנים דמויי מיקרו-כלי דומים לאלה שנצפו בתרביות משותפות שנוצרו על ידי אנקפסולציה של תאים27,28. בדרך כלל, רשתות מיקרו-וסקולריות תלת-ממדיות מפותחות היטב נוצרות תוך 4 ימים מהתרבית המשותפת, וניתן לנטר זאת לאורך זמן על ידי שימוש ב-HUVECs המסומנים ב-GFP. מבנים אלה יכולים להישמר לפחות 7 ימים בתרבית, כלומר יש מספיק זמן לעקוב אחר שינויים בארגון רשת כלי הדם בתגובה לטיפולים, כגון עבור הקרנה של תרופות אנטי אנגיוגניות. ניתן לכמת את המרכיבים המורפולוגיים של רשת האנדותל במצב אצווה על ידי פילוח תמונות GFP באמצעות כלים מבוססים, כגון תוסף Angiogenesis Analyzer של ImageJ33, וניתן להשתמש בפרמטרים שלהם כדי להעריך, למשל, יעילות תרופות ופרמקודינמיקה.
יתרון משמעותי אחד של המודל הסלולרי המתואר עבור יישומים פוטנציאליים רבים הוא הפלסטיות שלו. פשוט להשלים את מדיום התרבות עם גורמי צמיחה שונים יכול לשנות את המראה של התרבות המשותפת. לדוגמה, נוכחותו של BMP-2 לאורך תקופת המונו והתרבות המשותפת יוצרת נישה וסקולרית אוסטאוגנית, המראה פעילות ALP מוגברת, שקיעת סידן חוץ-תאית, כמו גם הרכבה ותצהיר ECM. להיפך, בנוכחות FGF-2, הסמנים האוסטאוגניים נעדרים, והתרבית המשותפת יוצרת פחות אסוציאציות תאים רוחביות אך מראה צמיחה בולטת יותר של תאים תלת-ממדיים. העובדה ש-FGF-2 מדכא את פעילות ה-ALP בעוד BMP-2 מדכא פעילות ALP חזקה יותר בהשוואה ללא טיפול בגורם גדילה עולה בקנה אחד עם תצפיות קודמות27. עם זאת, למרות הבדלים גדולים אלה ברכיב הסטרומה hBM-MSC, היקף הרשת המיקרו-וסקולרית היה דומה מאוד עבור שני התנאים שטופלו בגורמי גדילה בעבודה זו. בתרביות הבקרה נוצרו רק כמה רשתות כלי דם קצרות, המייצגות אולי נישה גרועה של מח עצם. זה מצביע על כך שפשוט על ידי שינוי הסוג, הריכוז והתזמון של גורמי הגדילה שנוספו למדיום התרבית, ניתן לייצר מגוון של גומחות מח עצם מוגדרות היטב, כפי שיידרש למחקרים השוואתיים. עם זאת, כדי להבטיח תוצאות הניתנות לשחזור, חשוב לציין כי התקדמות התרבית והמורפולוגיה עשויות להשתנות בהתאם להיסטוריה של התאים בהם נעשה שימוש (למשל, מספר המעבר ושיטת הניתוק המשמשים במהלך תחזוקת תרבית שגרתית), ורצוי לשלוט בגורמים אלה במהלך תכנון הבדיקה.
כאן, כיישום ראשון של מודל זה, אנו מדגימים את הרגישות של רשתות כלי הדם המהונדסות לטיפול עם bevacizumab 10 מיקרוגרם/מ”ל. יש לציין כי חשוב לאשר כי האלגוריתם המשמש יכול לזהות במדויק את רשת האנדותל, כמו חפצים נוצרים לעתים קרובות בתמונות עם רשתות מפותחות גרוע. אם זה המקרה, יש לכוונן את הפרמטרים המשמשים לעיבוד תמונה (לפני ובמהלך הסגמנטציה), לעתים קרובות על בסיס ניסוי וטעייה.
כיישום שני, אנו מציגים מודל תרבית משותפת מתקדם שנוצר על ידי זריעה רציפה של תאים מזנכימליים, אנדותל וסרטן. מודל זה מאפשר לחקור את יחסי הגומלין בין תאים סרטניים, סטרומה וכלי הדם של מח העצם, אשר עשויים להיות גורמים חשובים במהלך גרורות. בנוסף, מודל זה יכול לשמש ליישומי סינון תרופות ובדיקת תרכובות עם מטרות מעבר לאנגיוגנזה.
בתרביות דו-ממדיות, תאים אינם מקבלים אותות מיקרו-סביבתיים פיזיולוגיים, אינם רוכשים מורפולוגיות תאים טבעיות, וכתוצאה מכך מתמיינים באופן שונה בהשוואה לתאים בסביבות תלת-ממדיות טבעיות35. כאשר הם גדלים בהידרוג’לים תלת-ממדיים מהונדסים, התאים מפקידים ECM מובנה בשלב מוקדם, המספק אתרי הידבקות וניתן לשפץ אותם באופן פעיל28,36. כאן, כדי להקים מודל תלת ממדי פשוט ליישומי הקרנה, תאים יוצרי כלי דם נזרעו על פני השטח של הידרוג’לים מהונדסים והורשו להקים רשתות כלי דם בהיעדר זילוח. ההערכות מבוססות הדמיה נערכו על תחזיות דו-ממדיות של תאי אנדותל התורמים למבני כלי הדם. עם זאת, רק תמונות קונפוקליות חשפו את הצמיחה הפחות בולטת של רשתות כלי הדם התלת-ממדיות בדגימות BMP-2 מגורות בהשוואה לדגימות FGF-2 מגורה. זה מצביע על כך שאורך מבני כלי הדם שנוצרו הוערך בחסר, בעוד שהקישוריות שלהם הוערכה יתר על המידה. בנוסף, אינטראקציות בין תאים פריווסקולריים ותאי אנדותל והיווצרות לומן וסקולרי לא נחקרו. היבטים אלה, במיוחד במונחים של תגובות לטיפול תרופתי, ידרשו תשומת לב נוספת. לבסוף, פרוטוקולים מעודנים כדי לבסס תחילה רשתות כלי דם תלת-ממדיות נרחבות ורק לאחר מכן לגרום להתמיינות האוסטאוגנית שלהם יהיו רצויים כדי ליצור מודלים פיזיולוגיים יותר של עצמות ומח עצם.
בסך הכל, המודל המוצג כאן הוא רב-תכליתי ביותר וניתן להתאים אותו בקלות ליישומים ספציפיים. לדוגמה, תאים מזנכימליים ואנדותל ממקורות שונים יכולים לשמש. ידוע כי MSCs מרקמת השומן ו- MSCs של חבל הטבור מבטאים גורמים אנגיוגניים שונים בהשוואה ל- BM-MSCs, וניתן להחליף אותם בקלות כרכיב סטרומה חלופי37. תאי אנדותל שבודדו מנישות מח עצם שכבר הוגדרו יכולים לשמש במקום HUVECs. אפשר גם לבסס את התרבית המשותפת עם תאי מח עצם מזנכימליים ותאי אנדותל שמקורם במטופל עבור יישומי רפואה מותאמת אישית, כפי שהוצע לאחרונה עבור תרביות שרירים משותפות של כלי דם38. בנוסף, העיצוב של צלחת ההידרוג’ל מאפשר ניטור אורכי של התרבית הן באמצעות מיקרוסקופ שדה בהיר והן במיקרוסקופ פלואורסצנטי, ובכך מציע למשתמש את האפשרות לקצר או להאריך את זמן התרבית בהתאם ליישום. לחלופין, ניתן להתאים את צפיפות התאים המשמשת לזריעה בהתאם כדי להאיץ או לעכב את היווצרות הרשת התאית אם נדרשים זמני תצפית קצרים או ארוכים יותר מאלה שבפרוטוקול זה. בכל מקרה, נדרשת זהירות כדי למנוע צמיחת יתר של תאים למבנים דמויי יריעות, מה שעלול להוביל להתכווצות ההידרוג’ל ובסופו של דבר לניתוק התא.
לבסוף, ניתן לבצע מגוון רחב של בדיקות באמצעות מודל זה. בנוסף לאימונופלואורסנציה ולמיקרוסקופיה המבוצעת בתרביות חיות או קבועות, התרביות התלת-ממדיות עשויות להיות מעוכלות אנזימטית, וניתן לאחזר את התאים ולחשוף אותם לכל סוג של בדיקה ביוכימית. כאן, אנו מדגימים את קביעת פעילות ALP וכימות תוכן DNA בליזטים של תאים באמצעות בדיקות קולורימטריות/פלואורומטריות, אך המערכת תואמת לטכניקות רבות אחרות, כולל PCR, RNAseq ופרוטאומיקה. אם הרגישות של הבדיקה הרצויה אינה גבוהה במיוחד, ניתן לאסוף דגימות מיותר מבאר אחת כדי להגדיל את כמות הדגימה הזמינה לבדיקה. אם היישום הרצוי דורש המסת ג’ל מהירה יותר, ניתן ליישם ניעור אורביטלי של הצלחת בשילוב עם נפחים קטנים יותר של תמיסת העיכול כדי להבטיח היווצרות מערבולות בבארות, בהנחה שכל הבארות על הצלחת ישמשו באופן זה (תרבויות חיות רגישות לטיפול קשה כזה). לסיכום, אנו מציגים כאן פרוטוקול אשר, אם משתמשים בו כמתואר, מבטיח את יצירתו של מודל במבחנה המשחזר את ההיבטים העיקריים של נישות כלי דם אוסטאוגניות, אך הוא גם ורסטילי מספיק כדי להיות שונה עבור יישומים מותאמים אישית.
The authors have nothing to disclose.
המחברים רוצים להודות לריקרדו אורבנט על הסיוע הטכני עם מכשירי הטיפול בנוזלים ולרודי אודבסי על התמיכה במיקרוסקופ האפיפלואורסצנטי. עבודה זו מומנה על ידי הקרן הלאומית השוויצרית למדע (מספרי מענקים 310030E_202429 ו- 205321_204318) ו- Ectica Technologies AG.
0.25% Trypsin-EDTA | Gibco | 25200-072 | |
2 mL microtubes | Eppendorf | 30120094 | |
2-Amino-2-methyl-1-propanol | Sigma | A9199 | |
3DProSeed hydrogel well plate | Ectica Technologies | ECT.PS1.001.096 | |
4-Nitrophenyl phosphate disodium salt hexahydrate | Sigma | 71768 | |
Alizarin Red S | Sigma | A5533 | |
Anti-Collagen IV antibody | Abcam | ab6311 | |
Anti-Laminin 1+2 antibody | Abcam | ab7463 | |
Automated plate washer | Agilent Biotek | ELχ50 | |
Automated washer/dispenser | Agilent Biotek | MULTIFLO FX equipped with a peristaltic pump 5uL cassette | |
Bevacizumab | Evidentic | ID PS-E07-2019-00119 A009 | |
BMP-2 | Peprotech | 120-02C | |
BSA | AppliChem | A1391 | |
Centrifuge | Eppendorf | 5415 R | To centrifuge 2 mL tubes at 16100 x g during ALP analysis |
Confocal laser scanning microscope | Leica | Stellaris 5 | |
Conical 50 mL centrifuge tubes | TPP | 91050 | |
DAPI | Sigma | D9542 | |
DyLight 649 Donkey anti-rabbit IgG (minimal x-reactivity) Antibody | Biolegend | 406406 | |
DyLight 649 Goat anti-mouse IgG (minimal x-reactivity) Antibody | Biolegend | 405312 | |
EGM-2 | Lonza | CC-3162 | |
Epifluorescence microscope | Leica | DMI6000B | |
FBS | Gibco | 10500-064 | |
FGF-2 | Peprotech | 100-18B | |
Fibronectin (IST-9) | Santa Cruz | sc-59826 | |
GFP-HUVECs | PELOBiotech | PB-CAP-0001GFP | |
hBM-MSCs | – | – | Isolated at University Hospital Basel; Papadimitropoulos A, Piccinini E, Brachat S, et al. Expansion of human mesenchymal stromal cells from fresh bone marrow in a 3D scaffold-based system under direct perfusion. PLoS One. 2014;9(7):e102359 |
Inverted microscope | Zeiss | 200M | |
Magnesium chloride | Sigma | M8266 | |
MDA-MB-231 breast cancer cell line | – | Kindly obtained from J Massagué at the Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | |
MEMα | Gibco | 22571-038 | |
Multimode imaging reader | Agilent Biotek | Cytation 1 | For automated imaging |
Multimode imaging reader – fluorescence and absorbance | Agilent Biotek | Cytation 5 | For measuring absorbance and fluorescence intensity duing ALP analysis |
Paraformaldehyde | Artechemis | US 040 | |
PBS | Gibco | 10010-015 | |
Penicillin/Streptomycin | Gibco | 15140-122 | |
Phalloidin-rhodamine | Invitrogen | R415 | |
Picro-Sirius Red Solution | Abcam | ab246832 | |
Quant-iT PicoGreen dsDNA Assay kit | ThermoFisher Scientific | P7589 | |
Recombinant Anti-Collagen I antibody | Abcam | ab260043 | |
SIGMAFAST BCIP/NBT | Sigma | B5655-25TAB | |
Sodium hydroxide | Sigma | 1064981000 | |
Sodium phosphate dibasic, anhydrous | Sigma | S-0876 | |
Sodium phosphate monobasic, monohydrate | Merck | 1.06346 | |
Triton X-100 | Sigma | T8787 | |
Tween20 | AppliChem | A4974 | |
U2OS osteosarcoma cell line | – | Kindly obtained from J Snedeker at the Institute for Biomechanics, Zurich | |
α-trehalose dihydrate | Sigma | 90208 |