Dit manuscript beschrijft een tweestapsprotocol om patiëntspecifieke podocyten te genereren uit dermale fibroblasten via episomale herprogrammering in door de mens geïnduceerde pluripotente stamcellen (hiPSC’s) en daaropvolgende differentiatie in podocyten.
Podocyten zijn epitheelcellen die zich op de urineplaats van de glomerulaire filtratiebarrière bevinden en die bijdragen aan de selectieve filterfunctie van de glomerulus. Mutaties in podocyt-specifieke genen kunnen focale segmentale glomerulosclerose (FSGS) veroorzaken, en podocyten worden ook beïnvloed in veel andere primaire en secundaire nefropathieën. Vanwege hun gedifferentieerde aard zijn primaire celkweekmodellen beperkt voor podocyten. Daarom worden gewoonlijk voorwaardelijk vereeuwigde cellen gebruikt. Deze voorwaardelijk vereeuwigde podocyten (ciPodocyten) hebben echter verschillende beperkingen: de cellen kunnen in cultuur dedifferentiëren, vooral wanneer ze confluentie bereiken, en verschillende podocyt-specifieke markers worden slechts licht of helemaal niet uitgedrukt. Dit brengt het gebruik van ciPodocyten en hun toepasbaarheid voor fysiologisch, pathofysiologisch en klinisch bereik in twijfel. Hier beschrijven we een protocol voor het genereren van menselijke podocyten – inclusief patiëntspecifieke podocyten – uit een huidponsbiopsie door episomale herprogrammering van dermale fibroblasten in hiPSC’s en daaropvolgende differentiatie in podocyten. Deze podocyten lijken veel beter op in vivo podocyten in termen van morfologische kenmerken, zoals de ontwikkeling van voetprocessen en de expressie van de podocyt-specifieke marker. Ten slotte, maar belangrijk, houden deze cellen de mutaties van patiënten in stand, wat resulteert in een verbeterd ex vivo model om podocytenziekten en potentiële therapeutische stoffen te bestuderen in een geïndividualiseerde benadering.
Podocyten zijn gespecialiseerde, post-mitotische renale epitheelcellen die de glomerulaire filtratiebarrière van de nier vormen, samen met het glomerulaire keldermembraan (GBM), glomerulaire endotheelcellen en glycocalyx. Fenotypisch bestaan podocyten uit een cellichaam en primaire, microtubule-aangedreven membraanextensies, evenals secundaire extensies die voetprocessen 1,2 worden genoemd. De glomerulaire filtratiebarrière die urine uit het bloed filtert, is gebouwd van fenestrated endotheel, GBM en een gespecialiseerd type intercellulaire junctie die naburige podocytenvoetprocessen verbindt, het spleetmembraan van podoctyes3 genoemd. Onder gezonde omstandigheden worden eiwitten groter dan albumine vastgehouden van de filtratiebarrière vanwege hun grootte en lading4.
Mutaties in cytoskelet- of podocyt-specifieke genen, evenals circulerende factoren die podocytensignaleringsroutes beïnvloeden, zijn bekend om podocyten-effacement, loslating of apoptose te induceren, resulterend in proteïnurie en glomerulaire sclerose. Met name cytoskeletale herschikking, veranderingen in podocytenpolariteit of schade aan voetprocessen met een geassocieerd verlies van spleetverbindingen zijn cruciaal5. Vanwege hun terminaal gedifferentieerde status kunnen podocyten nauwelijks worden vervangen na het loskoppelen van de GBM. Als podocyten echter aan de GBM zijn bevestigd, kunnen ze nog steeds herstellen van uitwissen en interdigiterende voetprocessen hervormen 6,7,8. Verder begrip van de gebeurtenissen die leiden tot schade aan podocyten bij verschillende glomerulaire aandoeningen kan nieuwe therapeutische doelen bieden die zullen helpen bij het ontwikkelen van behandelingen voor deze ziekten. Podocytenschade is een kenmerk van verschillende glomerulaire ziekten, waaronder focale segmentale glomerulosclerose (FSGS), diabetische nefropathie, minimale veranderingsziekte en vliezige glomerulonefropathie, waarvoor betrouwbare podocyte ex vivo modellen nodig zijn om de pathologische mechanismen en mogelijke behandelingsbenaderingen voor deze ziekten te bestuderen 9,10. Podocyten kunnen ex vivo worden bestudeerd door klassieke primaire celkweek op basis van de isolatie van glomeruli door differentiële zeven11. Vanwege de terminaal gedifferentieerde toestand met beperkte proliferatiecapaciteit gebruiken de meeste onderzoekers echter muis- of menselijke ciPodocytencellijnen die temperatuurgevoelige varianten van het SV40 grote T-antigeen tot expressie brengen. Als alternatief worden ciPodocyten geïsoleerd uit transgene muizen met het SV40 Tag onsterfelijke gen 1,12.
CiPodocyten prolifereren bij 33 °C, maar komen tot groeistilstand en beginnen te differentiëren bij 37 °C13,14. Er moet rekening mee worden gehouden dat experimentele gegevens die met deze cellen zijn verkregen, met enige voorzichtigheid moeten worden geïnterpreteerd, omdat de cellen worden gegenereerd met behulp van een onnatuurlijke geninbrenging15. Omdat deze cellen een vereeuwigend gen herbergen, is de cellulaire fysiologie veranderd vanwege de voortdurende proliferatie12. Podocytencellijnen die door deze benadering worden gegenereerd, zijn onlangs in twijfel getrokken, omdat ciPodocyten van muizen, mensen en ratten minder dan 5% van synaptopopodie en nefrine op eiwitniveau tot expressie brengen, evenals NPHS1 en NPHS2 op mRNA-niveau in vergelijking met glomerulaire expressie16. Bovendien drukken de meeste podocytencellijnen geen nefrine17,18 uit. Chittiprol et al. beschreven ook een significant verschil in celmotiliteit en reacties op puromycine en doxorubicine in ciPodocyten16. Podocyten kunnen worden gevonden in urine na loslating van de GBM bij verschillende glomerulaire ziekten 19,20,21,22. Levensvatbare urinaire podocyten kunnen ex vivo worden gekweekt gedurende maximaal 2-3 weken, maar de meeste cellen ondergaan apoptose23,24. Interessant is dat podocyten niet alleen worden aangetroffen in de urine van patiënten met glomerulaire ziekte, maar ook in de urine van gezonde proefpersonen, hoogstwaarschijnlijk wanneer ze senescent-again zijn met een beperkt potentieel van replicatie in cultuur24. Bovendien is het van de urine afgeleide podocytenaantal beperkt en dedifferentiëren de cellen in cultuur, vertonen ze minder voetprocessen, veranderen ze van morfologie en hebben ze vooral een beperkte proliferatiecapaciteit. De expressie van podocyt-specifieke genen is afwezig, verdwijnt binnen enkele weken of varieert tussen deze celklonen. Sommige cellen die positief waren voor de podocyt-specifieke marker drukten samen de marker van tubulaire epitheelcellen of myofibroblasten en mesangiale cellen uit, wat dedifferentiatie en / of transdifferentiatie van de gekweekte urinaire podocyten suggereert24,25.
Onlangs is de generatie van ciPodocyt-cellijnen afgeleid van de urine van patiënten en gezonde vrijwilligers door transductie met een thermogevoelig SV40 groot T-antigeen en hTERT beschreven26. mRNA-expressie voor synaptopodia, nestine en CD2-geassocieerd eiwit werd gedetecteerd, maar podocine-mRNA was afwezig in alle klonen. Naast de problemen met urinaire podocyten bevatten deze cellen ook het ingebrachte onsterfelijke gen, wat resulteert in de hierboven besproken nadelen.
Daarentegen hebben door de mens geïnduceerde pluripotente stamcellen (hiPSC’s) een enorm vermogen om zichzelf te vernieuwen en te differentiëren in meerdere celtypen onder de juiste omstandigheden. Het is al eerder aangetoond dat hiPSC’s kunnen dienen als een bijna onbeperkte bron van podocyten27,28.
Hier wordt een tweestapsprotocol beschreven om patiëntspecifieke podocyten te genereren uit dermale fibroblasten van huidponsbiopten met daaropvolgende episomale herprogrammering in hiPSC’s en een laatste differentiatie in hiPSC-afgeleide podocyten (figuur 1).
Figuur 1: Protocol om patiëntspecifieke hiPSC-afgeleide podocyten te genereren. Grafisch overzicht van het protocol om patiëntspecifieke podocyten te genereren uit dermale fibroblasten van een huidbiopsie door herprogrammering in hiPSC’s en differentiatie in podocyten. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.
Als eerste stap werden somatische dermale fibroblasten ontgroeid uit een huidponsbiopsie en geherprogrammeerd tot hiPSC’s met behulp van een integratievrije methode door elektroporatie met plasmiden die de transcriptiefactoren OCT3/4, KLF4, SOX2 en c-MYC 29,30,31 tot expressie brachten. Opkomende hiPSC-kolonies werden vervolgens geselecteerd en uitgebreid. Differentiatie begon met de inductie van de mesodermale afstamming door activering van de WNT-signaleringsroute, gevolgd door de generatie van nefronvoorlopercellen die nog steeds in staat waren om zich te vermenigvuldigen. Ten slotte werden de cellen gedifferentieerd tot podocyten. In deze procedure hebben we eerder gepubliceerde protocollen voor episomale herprogrammering voor het genereren van hiPSC’s door Bang et al.32 en Okita et al.33 gewijzigd en gecombineerd, evenals een protocol voor de differentiatie van hiPSC’s in podocyten door Musah et al.28,34,35.
Inderdaad, podocyten gegenereerd door ons protocol hadden een fenotype dat dichter bij podocyten in vivo lag, met betrekking tot de ontwikkeling van een duidelijk netwerk van primaire en secundaire voetprocessen en de expressie van podocyt-specifieke markers, zoals synaptopode, podocine en nefrine. Met het gebruik van hiPSC-afgeleide podocyten wordt de genetische achtergrond van de patiënt behouden tijdens herprogrammering en differentiatie. Dit maakt patiëntspecifieke podocytenziektemodellering mogelijk en de ontdekking van potentiële therapeutische stoffen ex vivo in een bijna onbeperkt celnummer. Bovendien is dit protocol minimaal invasief, kostenefficiënt, ethisch aanvaardbaar en kan het nieuwe wegen voor de ontwikkeling van geneesmiddelen vergemakkelijken.
Dit op celcultuur gebaseerde protocol combineert de episomale herprogrammering van menselijke dermale fibroblasten in patiëntspecifieke hiPSC’s en daaropvolgende differentiatie in hiPSC-afgeleide podocyten. Dit stelt ons in staat om mutatiegerelateerde veranderingen van podocyten van patiënten met genetische glomerulaire ziekte met betrekking tot podocytenbeschadiging te bestuderen. Het protocol om dermale fibroblasten te herprogrammeren met een integratievrije methode door elektroporatie is aangepast aan het gepubliceerde werk van Bang et al.32 en Okita et al.33. Het protocol om podocyten te onderscheiden van hiPSC’s is aangepast van het gepubliceerde protocol van Musah et al.28,34,35. Er zijn al publicaties beschikbaar die de generatie van podocyten uit hiPSC’sbeschrijven 27,34,35. Het protocol dat hier wordt aangeboden, is echter geoptimaliseerd en goedkoper met betrekking tot de differentiatie van hiPSC’s in podocyten. Vergeleken met het gepubliceerde protocol van Musah et al., hebben we dit protocol getest op verschillende coatingreagentia, zoals vitronectine, laminine silk-511 en opgeloste keldermembraanmatrix. De concentraties van vitronectine en laminine zijde-511 konden worden verlaagd tot 2,5 μg/ml in plaats van 5 μg/ml 28,34,35. Bovendien was het mogelijk om de concentraties van BMP7 en activine A-twee zeer dure groeifactoren met 50% te verlagen, van 100 ng / ml tot 50 ng / ml.
Dit maakt goedkopere differentiatie mogelijk. Nefron-voorlopercellen vanaf dag 7 waren nog steeds aan het vermenigvuldigen en de mogelijkheid van bevriezing was eerder aangetoond. We breidden deze cellen uit na het ontdooien en vóór de uiteindelijke differentiatie in basismedium met Dulbecco’s gemodificeerde Eagle medium (DMEM) en B27 gedurende enkele dagen, waardoor de kosten nog verder daalden. Naast de differentiatiestappen beschrijft dit protocol de uitgroei van fibroblasten uit huidbiopten met daaropvolgende generatie patiëntspecifieke hiPSC’s via episomale herprogrammering. De combinatie van deze twee methoden maakt het genereren van patiëntspecifieke podocyten mogelijk. Daarom wordt hier een compleet stapsgewijs protocol gegeven om patiëntspecifieke hiPSC-afgeleide podocyten te genereren die niet eerder in zo’n detail zijn beschreven.
Omdat het algemene protocol verschillende celtypen bevat, is het cruciaal om de gegenereerde celtypen in verschillende stappen te karakteriseren. Cellen zijn gedurende een langere periode in cultuur, dus kwaliteitscontrole moet op verschillende passages worden uitgevoerd. Bij het werken met hiPSC’s is dagelijkse voeding en celgedrag en morfologiemonitoring noodzakelijk. De steriliteit van de differentiatiemedia moet worden gewaarborgd door filtersterilisatie door een filter van 0,2 μm. Het hele protocol, van huidbiopsie tot hiPSC-afgeleide podocyten, duurt enkele maanden, maar het is mogelijk om de cellen in verschillende stadia van het proces te bevriezen. Fibroblasten, geselecteerde hiPSC-klonen en proliferatieve nefronvoorlopercellen na 7 dagen in nefron-voorloperdifferentiatiemedium kunnen worden ingevroren en een werkende celbank kan worden gegenereerd.
Hoewel van hiPSC afgeleide gezonde podocyten een duidelijk netwerk van primaire en secundaire voetprocessen ontwikkelen (figuur 5A, B) en typische podocytspecifieke marker uitdrukken (figuur 6A-C), zijn karakteristieke spleetmembranen, zoals in vivo gezien, moeilijk na te bootsen in klassieke tweedimensionale celcultuurmodellen. Bovendien is intercellulaire communicatie met andere glomerulaire celtypen niet mogelijk in deze monocultuursetting.
Vanwege hun terminale gedifferentieerde toestand en gebrek aan proliferatiecapaciteit is het moeilijk om podocyten ex vivo te bestuderen. Met behulp van voorwaardelijk vereeuwigende primaire podocyten is het mogelijk om deze beperking te overwinnen door het inbrengen van een thermosensitieve schakelaar, resulterend in een celkweekmodel waarbij cellen prolifereren bij 33 °C en differentiëren bij 37 °C13,14. Hoewel deze ciPodocyten een hoog potentieel hebben voor podocytenonderzoek, zijn er beperkingen, zoals het ontbreken van markerexpressie, gededifferentieerde morfologie en het niet vormen van voetprocessen15,16.
De differentiatie van podocyten van van de patiënt afgeleide somatische cellen maakt het mogelijk om zieke podocyten te genereren en te vergelijken met gezonde controlecellen ex vivo. Dit stelt ons in staat om podocytenschade te bestuderen als gevolg van mutaties in podocyt-specifieke genen. Bovendien heeft het werken met hiPSC’s het potentieel voor het creëren van driedimensionale celkweekziektemodellen, of beter gezegd organoïden43,44. Co-cultuur van hiPSC-afgeleide podocyten met andere glomerulaire cellen, zoals glomerulaire endotheelcellen of mesangiale cellen, kan leiden tot nieuwe inzichten met betrekking tot intercellulaire communicatie in gezondheid en glomerulaire ziekte.
Bovendien kan de karakterisering en behandeling van de patiëntspecifieke podocyten ex vivo worden uitgevoerd in high-throughput analyse. De geïndividualiseerde aanpak opent de mogelijkheid om nieuwe therapeutische doelen voor specifieke mutaties te onderzoeken en in de toekomst geïndividualiseerde geneeskunde uit te voeren.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd gefinancierd door het Interdisciplinair Centrum voor Klinisch Onderzoek (IZKF) van de Friedrich-Alexander Universiteit Erlangen-Nürnberg met het subsidienummer M4-IZKF-F009 gegeven aan Janina Müller-Deile, en door Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) onder de projectnaam STOP-FSGS-Speed Translation-Oriented Progress to Treat FSGS, subsidienummer 01GM2202D gegeven aan Janina Müller-Deile. We bedanken Annalena Kraus voor de steun bij het maken van SEM-beelden.
0.2 µm sterile filter | Rotilab | P668.1 | for sterilization of differentiation medium |
all-trans retinoic acid | Stem Cell Technologies | 72262 | supplement for differentiation |
B27 supplement (50 x), serum free | Gibco | 17504044 | supplement for serum-free differentiation medium |
BG iMatrix-511 Silk | biogems | RL511S | additional option of extracellular matrix reagent used in coating solution to coat cell culture plastics suitable for hiPSC culture |
Bovine serum albumin (BSA) | Roth | 8076.4 | |
CELLSTAR Filter Cap Cell Culture Flasks, T75, 250 mL | Greiner bio-one | 82050-856 | cell culture plastics suitable for fibroblast culture |
CHIR99021 (5 mg) | Sigma-Aldrich | 252917-06-9 | supplement for differentiation |
Corning Matrigel hESC qualified matrix | Corning | 354277 | additional option of extracellular matrix reagent used in coating solution to coat cell culture plastics suitable for hiPSC culture (solubilized basement membrane matrix) |
countess Cell Counting Chamber Slides | Invitrogen | C10283 | to count cells |
countess II FL Automated Cell Counter | Invitrogen | to count cells | |
cryoPure tubes, 2 ml, QuickSeal screw cap, white | Sarstedt | 72380 | cryovials for freezing of cells |
dimethyl sulfoxide (DMSO) | Roth | A994.1 | for fibroblast freezing medium |
DMEM/F12 (1:1) (1 x) | Gibco | 11320074 | basic medium for differentiation |
DMEM/F12 + Glutamax | Gibco | 10565018 | basic medium for fibroblast medium |
EVOS M5000 Imaging System | Thermo Fisher Scientific | AMF5000 | phase contrast microscope |
fetal bovine serum premium, inactivated (FCS) | PAN Biotech | P301902 | serum for fibroblast medium, fibroblast freezing medium and podocyte maintenance medium |
fisherbrand Electroporation Cuvettes Plus, 4 mm gap, 800 µL capacity, sterile | Fisherbrand | FB104 | cuvette used for electroporation/episomal reprogramming of fibroblasts (4mm gap) |
fluoromount-G Mounting Medium, with DAPI | Invitrogen | 00-4959-52 | mounting medium containing dapi |
gauge needle (0.6 x 30 mm) | BD Microlance3 | 300700 | for separation of hiPSC colonies into small pieces |
human Recombinant Activin A Protein | 78001.1 | Stem cell technologies | supplement for differentiation |
human recombinant bone morphogenetic protein 7 (BMP7) | Peprotech | 120-03P | supplement for differentiation |
human VEGF-165 Recombinant Protein | Thermo Scientific | PHC9394 | supplement for differentiation |
insulin-transferrin-selenium (ITS -G) (100 x) | Gibco | 41400045 | supplement for podocyte maintenance medium |
LB medium | Roth | X964.1 | for sterility test of hiPSC culture |
lookOut Mycoplasma PCR Detection Kit | Sigma Aldrich | MP0035-1KT | commercial mycoplasma detection kit |
microscope slides | Diagonal GmbH & Co.KG | 21,102 | |
microtube 1.5 mL | Sarstedt | 72706400 | |
mTeSR1 Complete Kit | Stem Cell Technologies | 85850 | basic medium for serum-free hiPSC culture medium |
nalgene freezing container Mr.Frosty | Roth | AC96.1 | to ensure optimal freezing conditions |
normal goat serum | abcam | ab 7481 | for preincubation solution and antibody diluent |
nunc 24 well plates | Thermo Scientific | 142485 | cell culture plastics suitable for hiPSC culture |
nunc 48 well plates | Thermo Scientific | 152640 | cell culture plastics suitable for hiPSC culture |
nunc 6 well plates | Thermo Scientific | 140685 | cell culture plastics suitable for hiPSC culture |
nunc EasYDish Dishes 100 mm | Thermo Scientific | 150466 | cell culture plastics suitable for hiPSC culture |
nunc MicroWell 96-Well, Nunclon Delta-Treated, Flat-Bottom Microplate | Thermo Scientific | 167008 | cell culture plastics suitable for hiPSC culture |
nutriFreez D10 Cryopreservation Medium | Sartorius | 05-713-1E | serum-free cryopreservation medium for cryopreservation of hiPSC and nephron progenitor cells |
Opti-MEM | Gibco | 11058021 | electroporation medium |
pCXLE-hMLN | Addgene | #27079 | plasmid for episomal reprogramming |
pCXLE-hOCT3/4 plasmid | Addgene | #27077 | plasmid for episomal reprogramming |
pCXLE-hSK plasmid | Addgene | #27078 | plasmid for episomal reprogramming |
penicillin-streptomycin | Sigma-Aldrich | P4333-100ML | to avoid bacterial contamination |
plastic coverslips | Sarstedt | 83.1840.002 | for immunofluorescent stainings of hiPSCs and hiPSC-derived podocytes |
ROTI Histofix | Roth | P087.3 | commercial paraformaldehyde (4 %) for fixation of cells |
RPMI 1640 + L-Glutamine | Gibco | 21875034 | basic medium for podocyte maintenance medium |
staining chamber StainTray Black lid | Roth | HA51.1 | |
stemPro Accutase Cell Dissociation Reagent | Gibco | A1110501 | enzymatic cell detachment solution used for dissociation of hiPSCs |
sterile phosphate buffered saline (PBS) (1 x) | Gibco | 14190094 | used for washing and coating |
sterile water | Roth | T1432 | |
syringe without needle 20 mL | BD Plastipak | 300629 | to filter sterilize differentiation medium |
TC dish 100 mm | Sarstedt | 8,33,902 | sterile cell culture plastics used for cutting the skin biopsy and fibroblast culture |
TC dish 35 mm | Sarstedt | 8,33,900 | sterile cell culture plastics used for outgrowing fibroblasts from skin biopsy |
triton X 100 | Roth | 3051.3 | for preincubation solution |
trypan Blue Stain (0.4 %) for use with the Countess Automated Cell Counter | Invitrogen | T10282 | to count cells |
trypsin-EDTA (10 x) | Biowest | X0930-100 | dissociation reagent used for fibroblasts and nephron progenitor cells |
tube 15 mL | Greiner bio-one | 188271-N | |
tube 50 mL | Greiner bio-one | 227261 | |
vitronectin ACF | Sartorius | 05-754-0002 | extracellular matrix reagent used in coating solution to coat cell culture plastics suitable for hiPSC culture |
Y-27632 dihydrochloride (10 mg) | Tocris | 1254 | to avoid apoptosis of hiPSCs during splitting |
Primary antibodies | |||
OCT4 | Stem Cell Technologies | 60093.1 | pluripotency marker, dilution 1:200 |
SSEA-4 | Stem Cell Technologies | 60062FI.1 | pluripotency marker, dilution 1:100 |
Ki67 | Abcam | ab15580 | proliferation marker, dilution 1:300 |
synaptopodin | Proteintech | 21064-1-AP | podocyte-specific marker, dilution 1:200 |
nephrin | Progen | GP-N2 | podocyte-specific marker, dilution 1:25 |
podocin | proteintech | 20384-1-AP | podocyte-specific marker, dilution 1:100 |
Secondary antibodies | |||
goat anti-Guinea Pig IgG (H+L) Highly Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A21435 | secondary anditbody, dilution 1:1000 |
alexa Fluor 647 Goat Anti-Rabbit SFX Kit, highly cross-adsorbed | Invitrogen | A31634 | secondary anditbody, dilution 1:1000 |
donkey anti-Rabbit IgG (H+L) Highly Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21206 | secondary anditbody, dilution 1:1000 |
goat anti-Mouse IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 555 | Invitrogen | A21422 | secondary anditbody, dilution 1:1000 |
goat anti-Mouse IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11001 | secondary anditbody, dilution 1:1000 |