Este es un método comúnmente utilizado para la disección de gónadas de C. elegans seguida de grieta por congelación, que produce muestras de línea germinal para inmunofluorescencia a través de tinción de anticuerpos, o para tinción DAPI simple para visualizar el ADN. Este protocolo ha sido exitoso para los estudiantes universitarios en un laboratorio de investigación y en una experiencia de investigación de pregrado basada en cursos.
La línea germinal de C. elegans es un excelente modelo para estudiar la meiosis, en parte debido a la facilidad de realizar análisis citológicos en animales disecados. Las preparaciones de montaje enteras preservan la estructura de los núcleos meióticos y, lo que es más importante, cada brazo de la gónada contiene todas las etapas de la meiosis, organizadas en una progresión temporal-espacial que facilita la identificación de los núcleos en diferentes etapas. Los hermafroditas adultos tienen dos brazos de gónada, cada uno organizado como un tubo cerrado con células madre de línea germinal proliferantes en el extremo cerrado distal y ovocitos celularizados en el extremo abierto proximal, que se unen en el centro en el útero. La disección libera uno o ambos brazos de la gónada de la cavidad corporal, lo que permite visualizar la totalidad de la meiosis. Aquí, se presenta un protocolo común para la inmunofluorescencia contra una proteína de interés, seguido de la tinción DAPI para marcar todos los cromosomas. Los adultos jóvenes son inmovilizados en levamisol y diseccionados rápidamente usando dos agujas de jeringa. Después de la extrusión de la línea germinal, la muestra se fija antes de someterse a una grieta por congelación en nitrógeno líquido, lo que ayuda a permeabilizar la cutícula y otros tejidos. La muestra puede entonces ser deshidratada en etanol, rehidratada e incubada con anticuerpos primarios y secundarios. DAPI se agrega a la muestra en el medio de montaje, lo que permite una visualización confiable del ADN y facilita la búsqueda de animales para obtener imágenes bajo un microscopio fluorescente. Esta técnica es fácilmente adoptada por aquellos familiarizados con el manejo de C. elegans después de unas horas dedicadas a practicar el método de disección en sí. Este protocolo se ha enseñado a estudiantes de secundaria y estudiantes universitarios que trabajan en un laboratorio de investigación y se ha incorporado a una experiencia de investigación de pregrado basada en cursos en una universidad de artes liberales.
La meiosis es la división celular especializada utilizada para crear gametos (óvulos y espermatozoides/polen) en todos los organismos que se reproducen sexualmente 1,2. La recombinación cruzada es el intercambio recíproco de ADN entre cromosomas homólogos; Es esencial para la meiosis, ya que proporciona una fuente importante de diversidad genética y promueve la estabilidad del genoma a través de generaciones. Los cromosomas que no logran formar al menos un cruce durante la meiosis se segregarán aleatoriamente, lo que puede resultar en la no disyunción cromosómica, creando gametos con el número incorrecto de cromosomas, una condición que generalmente es fatal para la progenie resultante3. Durante la meiosis, los cruces son inducidos por roturas programadas de ADN de doble cadena4. Un subconjunto de estas roturas se reparará como cruces que proporcionan enlaces físicos de ADN, llamados quiasmas, que ayudan a orientar los cromosomas homólogos en preparación para la división celular5. Las etapas meióticas están altamente conservadas en todos los eucariotas, y su conformación cromosómica permite identificarlas fácilmente.
Como concepto fundamental en biología, la meiosis es un tema que los estudiantes encuentran varias veces en diferentes cursos de biología. A menudo se les presenta la mecánica de la segregación cromosómica meiótica en la escuela secundaria, mientras que los cursos de nivel universitario se centran en la biología celular de la segregación y el impacto genético de la recombinación cruzada. Sin embargo, la meiosis es un concepto notoriamente complicado para muchos estudiantes1. La falta de comprensión de la relación entre genes, ADN, cromosomas y meiosis puede generar conceptos erróneos de los estudiantes y lagunas en la comprensión que impiden una comprensión completa de la herencia genética 6,7. Una forma de mejorar la comprensión de los estudiantes de los temas abstractos es proporcionar actividades concretas y prácticas. Por ejemplo, al enseñar meiosis, los instructores pueden elegir entre actividades que emulan el análisis molecular8, modelos 3D que permiten a los estudiantes manipular moléculas9, o juegos de roles donde los propios estudiantes representan la coreografía molecular1. Incorporar la investigación con resultados desconocidos es una forma particularmente efectiva de mejorar la comprensión de los estudiantes. Esta práctica se conoce como una experiencia de investigación de pregrado basada en cursos (CURE) y tiene el beneficio adicional de fortalecer las actitudes y la agencia de los estudiantes, especialmente para aquellos que pertenecen a grupos que permanecen subrepresentados en STEM10,11. El gusano nematodo Caenorhabditis elegans es particularmente susceptible para estudios en el aula de comportamiento, fertilidad y cruces genéticos, y es un modelo eficaz para introducir a los estudiantes a la investigación biológica12.
C. elegans es un poderoso organismo modelo para la biología celular al combinar la genética molecular con el análisis citológico simple. También es particularmente adecuado para su uso en un aula de biología 13,14,15. Son fáciles y económicos de mantener en un laboratorio, produciendo cientos de descendientes cada 3 días, tanto a temperatura ambiente estándar como a 20 °C, la temperatura de incubación más común. Es importante destacar que pueden congelarse como existencias de glicerol y mantenerse en un congelador de -80 ° C, lo que significa que cualquier error de manejo cometido por investigadores novatos puede corregirse fácilmente16. Además, su genoma bien anotado permite técnicas genéticas directas e inversas17,18, lo que permite que C. elegans se utilice para abordar cuestiones biológicas que van desde lo molecular hasta lo evolutivo. Finalmente, los investigadores de C. elegans han creado una comunidad de apoyo que a menudo está dispuesta a proporcionar ayuda y asesoramiento a los científicos en ciernes19. Estas ventajas han llevado a que C. elegans se incorpore a una serie de CURE en varios tipos de instituciones 12,19,20,21,22,23.
Además de sus beneficios para la investigación y la enseñanza, C. elegans se ha convertido en un modelo popular para los estudios de la meiosis y el desarrollo de la línea germinal24,25,26. La claridad óptica de estos animales simplifica los enfoques citológicos27, y en los adultos, las gónadas representan casi la mitad del animal, proporcionando cientos de células meióticas para estudiar. En las gónadas, los núcleos de la línea germinal meiótica están dispuestos como una línea de ensamblaje (Figura 1); La replicación mitótica ocurre en la punta distal de la gónada, con núcleos que progresan a través de etapas meióticas a medida que migran hacia el extremo proximal de la gónada, donde los embriones fertilizados emergen de la vulva. Debido a que la organización espacial estereotipada también representa una progresión temporal a través de la meiosis, se pueden identificar fácilmente diferentes etapas en función de su organización cromosómica y ubicación en la gónada. Finalmente, los procesos que interrumpen la meiosis y causan aneuploidía crean fenotipos que son fáciles de caracterizar, incluso para los principiantes: esterilidad, letalidad embrionaria o una alta incidencia de hombres (fenotipo Him)28.
Este es un protocolo simple para visualizar cromosomas meióticos en C. elegans. El montaje, la disección, la fijación y la tinción de anticuerpos se realizan en el mismo portaobjetos de microscopio, lo que simplifica el protocolo y permite una recuperación de muestras casi perfecta. Este método funciona para la tinción DAPI simple para visualizar cromosomas y se puede usar para la inmunofluorescencia para visualizar la localización de proteínas en la gónada. Los estudiantes diseccionan gónadas usando microscopios de disección básicos, generan preparaciones de montaje completo para la visualización de ADN o inmunofluorescencia, y las visualizan en un microscopio fluorescente compuesto. Este protocolo ha sido enseñado a estudiantes de secundaria y estudiantes universitarios que trabajan en un laboratorio de investigación de C. elegans e incorporado a un CURE en una universidad de artes liberales12. Aunque el CURE tenía un tamaño de clase relativamente pequeño, este protocolo sería susceptible de clases en una variedad de instituciones debido al costo relativamente bajo de las cepas de gusanos y reactivos. Los instructores solo estarían limitados por el número de microscopios de disección disponibles para su uso. La implementación anterior tenía estudiantes trabajando en grupos de tres para compartir un solo microscopio y tuvo lugar en tres sesiones de 90 minutos: la primera para practicar la disección, la segunda para implementar la disección y la tinción DAPI, y la tercera para obtener imágenes de diapositivas en un microscopio de fluorescencia de campo amplio. La participación en la investigación de pregrado proporciona muchos beneficios para los estudiantes11,29, tanto académicos como personales. La incorporación de la investigación en los cursos a través de CURE permite a los estudiantes participar en la investigación durante el tiempo normal de clase11,30,31, lo que hace que la exposición a estos beneficios sea más accesible y equitativa.
La reproducción sexual requiere la creación de gametos haploides, que se producen a través de la división celular especializada de la meiosis. C. elegans se ha convertido en un modelo popular para el estudio citológico de la meiosis debido a su transparencia óptica, anatomía conveniente de la línea germinal y poderosa genética28. Los experimentos microbianos simples que evalúan la fertilidad y la letalidad embrionaria se pueden combinar con la genética molecular para abordar muchas preguntas en el laboratorio o en el aula. Por ejemplo, debido a que los cruces son esenciales para la segregación cromosómica adecuada, los procesos que interrumpen su formación o resolución generarán gametos aneuploides. A su vez, la aneuploidía conduce a una progenie inviable, que puede evaluarse fácilmente contando la progenie, o mediante el método ligeramente más complicado de determinar la letalidad embrionaria. Citológicamente, la falta de cruces afectará el número de cuerpos de tinción DAPI observados durante la diacinesis. La robustez de la tinción DAPI y la facilidad de puntuación hacen de este un experimento ideal para enseñar técnicas citológicas. La disposición temporal-espacial de los núcleos en la línea germinal hermafrodita proporciona una instantánea de cada etapa de la meiosis en un solo momento en el tiempo. Los núcleos tardan aproximadamente 54 horas en proceder desde el extremo mitótico distal de la línea germinal hasta el extremo proximal (para ejemplos, ver Jaramillo-Lambert et al.33, Stamper et al.34 y Libuda et al.35). Este momento bien establecido del progreso meiótico permite el etiquetado de pulsos o experimentos que dañan el ADN.
Debido a que la tinción DAPI casi siempre funciona, sirve como un control técnico útil para la microscopía de fluorescencia (y puede proporcionar satisfacción para los microscopistas en formación). La tinción de anticuerpos puede ser más variable y es una buena medida de reproducibilidad entre réplicas. Las gónadas de C.elegans pueden ser difíciles de arreglar de manera consistente, ya que este paso requiere un equilibrio entre preservar la estructura cromosómica y al mismo tiempo permitir una difusión suficiente de anticuerpos. La fijación con formaldehído preserva mejor la morfología cromosómica, y la preparación de formaldehído fresco de ampollas de paraformaldehído ha proporcionado los resultados más reproducibles. También es posible utilizar formaldehído preparado a partir de formalina (37% de formaldehído acuoso y metanol). Es posible que sea necesario determinar empíricamente la fuerza de fijación y el momento de cada anticuerpo. Los métodos alternativos implican omitir la fijación de formaldehído en el paso 2.4 y, después de la congelación-crack, la inmersión en etanol al 100% a -20 °C, o la inmersión en metanol al 100% durante 10 minutos seguida de la inmersión en acetona al 100% durante 10 min a -20 °C. Estas condiciones fijas permiten una mejor penetración de anticuerpos, pero afectarán negativamente la morfología del tejido (los cromosomas se verán quemados y más sofocantes).
El tiempo es muy importante para los pasos de disección y corrección descritos en el paso 2. Debido a que el volumen de la solución de disección es tan pequeño, la evaporación puede afectar la concentración de fijación final, lo que causará tinción variable de anticuerpos. Un manejador experimentado de C. elegans puede preparar una diapositiva en menos de 2 minutos desde el principio (paso 2.3) para arreglarla (paso 2.4). El principal obstáculo técnico es la capacidad de recoger animales en la gota de la solución de disección y diseccionarlos rápidamente. Puede ser más fácil aprender a diseccionar en volúmenes más grandes. Los nuevos aprendices comienzan recogiendo animales en 50-200 μL de solución de disección en un plato de tinción de embriones de vidrio (Figura 2D); La superficie más ancha proporciona más espacio para maniobrar al identificar una posición de aguja ideal para buenas extrusiones de gónadas, mientras que el mayor volumen de líquido hace que la evaporación sea un problema menor. Una vez que se sienten cómodos con los movimientos de disección, los aprendices comienzan a diseccionar usando solo 50 μL en el plato, luego cambian a la disección en 20 μL en un portaobjetos. Una vez que diseccionan en portaobjetos, los aprendices pueden comenzar rápidamente a reducir la cantidad de solución hasta que sean lo suficientemente rápidos para trabajar en 4 μL para que la evaporación sea insignificante.
Si el momento de la disección sigue siendo un problema, los alumnos pueden diseccionar 8 μL de la solución de disección durante el paso 2.3. Luego, durante el paso 2.4, pueden agregar 8 μL de la solución fija, pipeteando suavemente para mezclar bien (observando de cerca para asegurarse de que las canales no se interrumpan o pipeteen) y retirando 8 μL de la solución mezclada. Este enfoque alternativo dará como resultado el mismo volumen final de 8 μL y la misma concentración fija final; Este volumen es importante para garantizar que las carcasas entren en contacto tanto con el cubreobjetos como con la superficie de la corredera durante la grieta por congelación en el paso 2.5. Si el momento de preparación de cada portaobjetos sigue siendo un problema incluso en volúmenes de disección más grandes, Gervaise y Arur26 describen un método de suspensión para el protocolo de inmunofluorescencia de la línea germinal.
La principal limitación del uso de la inmunofluorescencia para visualizar proteínas in situ es la disponibilidad de anticuerpos primarios dirigidos a una proteína particular de interés. Sin embargo, si se ha diseñado una versión marcada de la proteína, este protocolo se puede adaptar para visualizar la etiqueta de proteína. Los anticuerpos dirigidos a etiquetas comunes, como FLAG, HA o GFP, están comúnmente disponibles. Las etiquetas fluorescentes como GFP a menudo se pueden apagar mediante pasos de fijación, por lo que se recomienda usar un anticuerpo primario dirigido a GFP, en lugar de confiar en la señal de fluorescencia nativa en sí. Otra limitación de este protocolo es que captura la línea germinal dentro de un solo marco de tiempo (aunque todas las etapas de la ovogénesis estarán representadas dentro de la línea germinal). Por lo tanto, esta técnica puede pasar por alto los cambios dinámicos que pueden ocurrir a medida que un ovocito progresa a través de la ovogénesis. Sin embargo, el momento de la gametogénesis ha sido bien estudiado en C. elegans; En un adulto joven de tipo salvaje, un ovocito tarda aproximadamente 60 h en progresar desde la punta distal de la línea germinal (la zona mitótica) hasta la diacinesia33. Por lo tanto, una persecución de pulso o una intervención específica como la irradiación seguida de un curso temporal permitiría la observación de los efectos en diferentes etapas de la meiosis.
En conclusión, este protocolo describe la disección de gónadas de C. elegans seguida de DAPI y tinción de anticuerpos para microscopía de fluorescencia. La disección y fijación (paso 2) toma 60-90 minutos, dependiendo del número de diapositivas generadas. La tinción de anticuerpos (paso 3) es en su mayoría de manos libres y puede variar de 7 h como mínimo a 1,5 días, dependiendo de los tiempos de incubación de anticuerpos. El montaje (pasos 4.1-4.7) dura unos 15 minutos. Este enfoque general para visualizar los cromosomas de la línea germinal y la gónada se puede utilizar para estudios citológicos de cualquier proteína si existe un anticuerpo o reactivo de etiqueta fluorescente. En su forma más simple, la tinción DAPI de los núcleos de diacinesis se puede utilizar para detectar factores que afectan la recombinación meiótica. Cuando se combina con análisis de organismos del número de descendientes, la incidencia de machos (fenotipo Him) y la letalidad embrionaria, este enfoque citológico proporciona un contrapunto unicelular a los análisis basados en la población.
The authors have nothing to disclose.
El trabajo en el laboratorio Lee fue apoyado por el Instituto Nacional de Ciencias Médicas Generales bajo el número de premio 1R15GM144861 y el Instituto Nacional para el Desarrollo Infantil y Humano bajo el número de premio 1R15HD104115, ambos de los Institutos Nacionales de Salud. DA fue apoyado por el programa UML Kennedy College of Sciences Science Scholars. NW fue apoyado por una beca UML Honors College y una beca UMLSAMP (financiada por la National Science Foundation bajo el número de subvención HRD-1712771). Agradecemos a A. Gartner por el anticuerpo RAD-51. Todas las cepas de C. elegans fueron proporcionadas por el Centro de Genética Caenorhabditis , que está financiado por la Oficina de Programas de Infraestructura de Investigación de los Institutos Nacionales de Salud bajo el número de adjudicación P40 OD010440.
Alexa Fluor 488 Donkey Anti-Rabbit IgG Secondary Antibody | Molecular Probes | 711-545-152 | |
Aluminum heating/cooling block | Millipore Sigma | Z743497 | |
Bacto Peptone | Gibco | DF0118 17 0 | |
Borosilicate Glass Pasteur Pipets, Disposable, 5.75 inches | Fisherbrand | 13 678 20B | Used to make worm picks |
BSA, Bovine Serum Albumin | VWR | 97061 420 | |
C. elegans wild type (ancestral) | Caenorhabditis Genetics Center | N2 (ancestral) | |
C. elegans kle-2 (ok1151) mutants | Caenorhabditis Genetics Center | VC768 | The full genotype of this strain is: kle-2(ok1151) III/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). It has kle-2 balanced with a balancer chromosome marked with pharangeal GFP. Pick non-green animals to identify homozygous kle-2 mutants. |
C. elegans spo-11 (me44) mutants | Caenorhabditis Genetics Center | TY4342 | The full genotype of this strains is: spo-11(me44) IV / nT1[qIs51] (IV:V). It has spo-11 balanced with a balancer chromosome marked with pharangeal GFP. Pick non-green animals to identify homozygous spo-11 mutants. |
Calcium Chloride Anhydrous | VWR | 97062 590 | |
Cholesterol | Sigma Aldrich | 501848300 | |
DAPI | Life Technologies | D1306 | |
EDTA, Disodium Dihydrate Salt | Apex Bioresearch Products | 20 147 | |
Embryo Dish, glass, 30mm cavity | Electron Microscopy Services | 100492-980 | Used to practice dissecting; glass is preferred because dissected animals can stick to plastic |
Escherichia coli | Caenorhabditis Genetics Center | OP50 | |
Food storage container, plastic | various | n/a | Plastic containers with (1) relatively flat bottoms, to allow slides to rest level; (2) lids that are air-tight, but can still be easily removed without disturbing contents of container, and (3) are about 9 inches long by 6 inches wide are preferred |
Glass Coplin Jar | DWK Life Sciences Wheaton | 08-813E | |
Hydrophobic Barrier PAP Pen | ImmEdge | NC9545623 | |
Kimwipes | Kimtech Science | 06 666A | |
Levamisole Hydrochloride | Sigma Aldrich | L0380000 | |
Magnesium Sulfate Anhydrous | Fisher Chemical | M65 500 | |
Needles, Single-use, 25 G | BD PrecisionGlide | 14 821 13D | blue, 1 inch |
NGM Agar, Granulated | Apex Bioresearch Products | 20 249NGM | |
Parafilm | Bemis | 16 101 | |
Paraformaldehyde (16% w/v) Aqueous Solution | Electron Microscopy Sciences | 50 980 487 | |
PBS, Phosphate Buffered Saline (10x Solution) | Fisher BioReagents | BP399500 | |
Petri Dishes, 60-mm | Tritech Research | NC9321999 | Non-vented, sharp edge |
Platinum wire (90% platinum, 10% iridium) | Tritech Research | PT 9010 | Used to make worm picks |
Potassium Chloride | Fisher | BP366-500 | |
Potassium Phosphate Dibasic | VWR BDH Chemicals | BDH9266 500G | |
Potassium Phosphate Monobasic | VWR BDH Chemicals | BDH9268 500G | |
Premium Cover Glasses 18 mm x 18 mm | Fisherbrand | 12-548-AP | 0.13–0.17 mm thickness |
Razor Blades, Single Edge | VWR | 55411 055 | |
SlowFade Gold Antifade Mountant | Molecular Probes | S36937 | Alternatives: VectaShield Antifade Mounting Medium (Vector Laboratories, H-1000-10) or ProLong Diamond Antifade (Thermo Fisher Scientific, P36970). If using ProLong Diamond, no nail polish is required for sealing, but slides must cure for 24 hours before imaging. |
Sodium Azide | Fisher BioReagents | BP922I 500 | |
Sodium Chloride | Fisher Chemical | S271 500 | |
Sodium Phosphate Dibasic Anhydrous | Sigma Aldrich | 7558 79 4 | |
Sodium Phosphate Dibasic Heptahydrate | Sigma Aldrich | S9390 | |
Styrofoam box | various | n/a | Approximate dimensions of interior: 12 inches long, 9 inches wide, 8 inches deep |
Superfrost Plus Microscope Slides | Fisherbrand | 22 037 246 | |
Triton X-100 | Fisher BioReagents | BP151 500 | |
Tryptone | Apex Bioresearch Products | 20 251 | |
Tween 20 | Fisher Chemical | BP337 500 | |
Yeast Extract | Apex Bioresearch Products | 20 254 |