בהירות אופטית היא יתרון משמעותי לעבודה הביולוגית והפיזיולוגית של התא בדגי זברה. מתוארות שיטות חזקות למדידת צמיחת תאים בבעלי חיים בודדים המאפשרות תובנות חדשות על האופן שבו צמיחת שרירי השלד והרקמות השכנות משולבת עם צמיחת כל הגוף.
ניתן להשתמש במספר שיטות כדי לדמיין תאים בודדים בכל הגוף של דגי זברה עובריים, זחליים או צעירים. אנו מראים כי דגים חיים עם קרומי פלזמה המסומנים בפלואורסצנטיות יכולים להיסרק במיקרוסקופ סריקת לייזר קונפוקלי על מנת לקבוע את נפח רקמת השריר ואת מספר סיבי השריר הקיימים. גישות יעילות למדידת מספר וגודל התאים בבעלי חיים חיים לאורך זמן מתוארות ומאומתות מול שיטות סגמנטציה מפרכות יותר. מתוארות שיטות המאפשרות שליטה על פעילות חשמלית השרירים, ובכך התכווצות. אובדן פעילות התכווצות שרירי השלד הפחית מאוד את צמיחת השרירים. בזחלים, מתואר פרוטוקול המאפשר הכנסה מחדש של פעילות התכווצות חשמלית מעוררת. השיטות המתוארות ממזערות את השפעת השונות הבין-אישית ויאפשרו ניתוח של השפעת גירויים חשמליים, גנטיים, תרופתיים או סביבתיים על מגוון פרמטרים של גדילה תאית ופיזיולוגית בהקשר של האורגניזם החי. לאחר מכן ניתן לבצע מעקב ארוך טווח אחר ההשפעות הנמדדות של התערבות מוגדרת בתחילת החיים על אנשים.
צמיחת רקמות מוסדרת, הכוללת גידול במספר התאים (היפרפלזיה) ו/או בגודל התא (היפרטרופיה), היא גורם מכריע בהתפתחות, התחדשות והסתגלות אקולוגית ואבולוציונית. למרות ההתקדמות העצומה בהבנה הגנטית המולקולרית של ביולוגיה תאית והתפתחותית בעשורים האחרונים, ההבנה המכניסטית של ויסות גודל הרקמות והאיברים עדיין בחיתוליה. אחת הסיבות ללקונה זו בידע היא הקושי לכמת צמיחת רקמות באורגניזמים חיים בדיוק המרחבי והזמני הדרוש.
היבטים שונים של גדילה של אורגניזמים שלמים ניתנים למדידה חוזרת ונשנית לאורך זמן, וחושפים עקומות גדילה עבור כלאדם 1,2,3,4,5. שיטות סריקה מתוחכמות יותר ויותר, כגון אבסורפטיומטריה של קרני רנטגן כפולות (DXA), טומוגרפיה ממוחשבת (CT) והדמיית תהודה מגנטית (MRI), מאפשרות מעקב אחר צמיחה של איברים שלמים ואזורי גוף אחרים (לדוגמה, שרירי שלד שזוהו על ידי יחידים) אצל אנשים בודדים, הן בבני אדם והן באורגניזמים מודל 6,7,8,9,10 . עם זאת, לשיטות אלה עדיין אין את הרזולוציה לחשוף תאים בודדים ולכן קשה היה להבחין בקשרים בין התנהגויות תאיות לצמיחה ברמת הרקמה. כדי ליצור קשרים כאלה, מחקרים מסורתיים הסתמכו לעתים קרובות על קבוצות של בעלי חיים בודדים דומים, שכמה מהם מוקרבים בנקודות זמן עוקבות ולאחר מכן מנותחים בפירוט ציטולוגי. גישות כאלה דורשות ממוצע של השינויים הנצפים בין קבוצות של פרטים (רצוי דומים, אך בכל זאת משתנים) ולכן סובלות מהיעדר רזולוציה טמפורלית ומרחבית, מה שמקשה על מציאת אירועים מתואמים ברמה התאית המרמזים על סיבה ותוצאה.
מחקרים על אורגניזמים מודל חסרי חוליות, בתחילה ב- C. elegans ו- D. melanogaster, עקפו את הבעיות הללו על ידי פיתוח מיקרוסקופיה אופטית כדי להשיג רזולוציה תאית ולמדוד במדויק צמיחה לאורך זמן אצל פרטים בודדים. מחקרים כאלה חשפו התנהגויות של שושלת תאים אינווריאנטית להפליא בגדילתם של אורגניזמי מודל קטנים אלה 11,12,13,14,15,16,17. עם זאת, לבעלי חיים רבים, כולל כל בעלי החוליות, יש שושלות תאים לא מוגדרות, והם שולטים בצמיחת רקמות על ידי תהליכי משוב מסתוריים המשמשים להפיכת תוכנית הגדילה המקודדת גנטית לאורגניזם תלת-ממדי פונקציונלי שכל הרקמות והאיברים המרכיבים אותו תואמים את גודלו. כדי להבין את תהליכי הצמיחה המורכבים האלה, רצוי לדמיין רקמות שלמות או איברים לאורך זמן אצל אנשים בודדים שניתן לתמרן אותם בניסוי על ידי התערבויות גנטיות, פרמקולוגיות או אחרות בזמן בחירה וההשפעה נותחה לאחר מכן.
לכל שרירי שלד בעלי חוליות יש גודל, צורה ותפקוד מוגדרים, ואינטראקציות מאופיינות היטב עם רקמות סמוכות, כגון עצם, גיד ועצבים. חלק מהשרירים קטנים, שוכבים ממש מתחת לעור ולכן הם מועמדים טובים למחקרי הדמיה ברזולוציה גבוהה. בדומה לרוב האיברים, כל שריר גדל במהלך החיים העובריים, לאחר הלידה והנעורים, לפני שהוא מגיע לגודל בוגר יציב. לשריר, לעומת זאת, יש גם יכולת ייחודית לשנות גודל במהלך החיים הבוגרים, תלוי בשימוש ובתזונה18, ולתכונה זו יש השפעה רבה על הכושר האורגניזמי, הביצועים הספורטיביים והחיים העצמאיים. אובדן מסת שריר ותפקוד בגיל מבוגר, סרקופניה, הוא נושא של דאגה גוברת עבור חברות המתמודדות עם אוכלוסייה מזדקנת 19,20,21.
אנחנו ואחרים התמקדנו בצמיחה של בלוקים מוגדרים של רקמת שריר השלד בגוף החוזר על עצמו באופן סגמנטלי של זחלי דגי זברה, כמערכת סגורה לכאורה המכילה כמה מאות תאים שבהם ניתן לצפות בצמיחה, תחזוקה ותיקון של רקמות ולתפעל אותן 22,23,24,25,26. בעוד שעבודה כמותית מסוימת דווחה בעבר 25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35, אין שיטה מפורטת ומאומתת למדידת צמיחת שרירים בפרטים תאיים באורגניזמים בעלי חוליות בודדים לאורך זמן. כאן מתואר פרוטוקול יעיל כיצד לבצע מדידות חוזרות כאלה, יחד עם אימות, ודוגמה לשימוש בו לניתוח שינויים בצמיחה היפרטרופית והיפרפלסטית בתגובה לפעילות חשמלית שהשתנתה.
כאן אנו מדווחים על שיטה להערכה מדויקת ויעילה של נפח השריר של זחלי דגי זברה חיים בשלבים או בגרסאות גנטיות שבהן פיגמנטציה אינה מהווה מכשול גדול להדמיה וכאשר הרדמה חולפת ו/או אימוביליזציה נסבלת היטב. בעוד שהשתמשנו במיקרוסקופיה קונפוקלית לסריקת לייזר, הגישות המתוארות ישימות למיקרוסקופיה קו?…
The authors have nothing to disclose.
המחברים חבים חוב עמוק למאמציהם של חברי המעבדה של יוז, ד”ר סיטראמיה אטילי, יאנה קות’, פרננדה בג’נקה, ויקטוריה ויליאמס, יניב היניטס, ג’ורג’יה ברגמין וולדימיר סנטקוב לפיתוח הפרוטוקולים המתוארים, ולהנרי רוהל, כריסטינה האמונד, דייוויד לנגנאו ופיטר קארי על שיתוף פלסמידים או קווי דגי זברה. SMH הוא מדען של המועצה למחקר רפואי (MRC) עם מענק תוכנית G1001029, MR/N021231/1 ו-MR/W001381/1. תואר שני החזיק בתוכנית הכשרה לדוקטורט MRC מקינגס קולג ‘בלונדון. עבודה זו נהנתה מהקלט הטריגונומטרי של דייוויד מ. רובינסון, חוקר, מנטור וחבר.
Adhesive, Blu Tack | Bostik | – | – |
Aerosol vacuum | – | – | – |
Agarose | Sigma-Aldrich | A9539 | – |
Agarose, low gelling temperature | Sigma-Aldrich | A9414 | Once melted, keep at 37oC in a block heater to remain in liquid form for repeated use. |
Block heater | Cole-Parmer | SBH130 | – |
BODIPY FL C5-ceramide | Thermo Scientific | D3521 | To be diluted in fish water and used at 5 µM for overnight incubation. |
Crocodile clips and wires | – | – | – |
Fiji/imageJ | National Institutes of Health, NIH | – | – |
Fish medium, Fish water | – | – | Circulating system water collected from the fish facility. |
Fish medium, E3 medium | – | – | E3 is described in The Zebrafish Book. http://zfin.org (5 mM NaCl, 0.17 mM KCl, 0.33 mM CaCl2, and 0.33 mM MgSO4 in distilled water). |
Fluorescence microscope | Leica | Leica MZ16F | Fluorescence microscope of other kind are also expected to be suitable. |
Glass needle | World Precision Instruments, Inc. | 1B100-6 | To be fire-polished to prevent damage of the embryos during manipulation. |
Grass stimulator | Grass Instruments | S88 | Stimulators of other kind are also expected to be suitable. |
Kimwipes, Delicate Task Wipers | Kimberly-Clark Professional | 13258179 | – |
Laser scanning microscope (LSM) | Zeiss | Zeiss LSM 5 Exciter Zeiss LSM 880 |
LSM of other kind are also expected to be suitable. |
Nunc Cell-Culture Treated, 6-well plate | Thermo Scientific | 140675 | – |
Objective, 20×/1.0W water immersion | Zeiss | – | – |
Pasteur Pipette, Graduated 1 mL | Starlab Group | E1414-0100 | – |
Pasteur Pipette, Micro Fine Tip 1 mL | Starlab Group | E1414-1100 | – |
Petri dish, 60 mm | Sigma-Aldrich | P5481 | – |
Plasmid, CMV-Cerulean | Christina L. Hammond (University of Bristol) | pCS2+_cerulean_kanR plasmid injected at 25-75 pg at one-cell stage. Citation: Bussman J, and Schulte-Merker S. (2011) Development 138:4327-4332. doi: 10.1242/dev.068080. | |
Plasmid, pCS-mCherry-CAAX | Henry Roehl (University of Sheffield) | – | For in vitro transcription using the SP6 promoter (plasmids containing other membrane labelling markers can be used); synthesised capped mRNA to be injected at 100-200 pg at one-cell stage. |
Pulse Controller | Hoefer Scientific Instruments | PC750 | – |
Soldering iron | – | – | – |
Tricaine | Sigma-Aldrich | E10521 | Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate/ MS-222; to be dissolved in fish water and used at 0.6 mM. |
Volocity | Perkin Elmer/Quorum Technologies Inc | – | – |
Watchmaker forceps, No. 5 | – | – | – |
Wire, Platinum | Goodfellow | PT005142/12 | 0.40 mm in diameter; an expensive alternative of silver. |
Wire, Silver | Acros Organics | 317730010 | 0.25 mm in diameter (a range of diameter i.e. 0.25-0.5 mm had been tested, which produced similar results). |
Zebrafish, myog:H2B-mRFP | David M. Langenau (Massachusetts General Hospital; Harvard Stem Cell Institute) | – | ZFIN official name: Tg(myog:Hsa.HIST1H2BJ-mRFP), fb121Tg. http://zfin.org/ZDB-ALT-160803-2 Citation: Tang Q, Moore JC, Ignatius MS, Tenente IM, Hayes MN, Garcia EG, Torres Yordán N, Bourque C, He S, Blackburn JS, Look AT, Houvras Y, Langenau DM. Imaging tumour cell heterogeneity following cell transplantation into optically clear immune-deficient zebrafish. Nat Commun. 2016 Jan 21;7:10358. doi: 10.1038/ncomms10358. |
Zebrafish, α-actin:mCherry-CAAX | Peter D. Currrie (ARMI, Monash University) | – | ZFIN official name: Tg(actc1b:mCherry-CAAX), pc22Tg. http://zfin.org/ZDB-ALT-150224-2 Citation: Berger J, Tarakci H, Berger S, Li M, Hall TE, Arner A, and Currie PD. Loss of Tropomodulin4 in the zebrafish mutant träge causes cytoplasmic rod formation and muscle weakness reminiscent of nemaline myopathy. Dis Model Mech. 2014 Dec;7(12):1407-15. doi: 10.1242/dmm.017376. |
Zebrafish, β-actin:HRAS-EGFP | – | – | ZFIN official name: Tg(Ola.Actb:Hsa.HRAS-EGFP), vu119Tg. http://zfin.org/ZDB-ALT-061107-2 Citation: Cooper MS, Szeto DP, Sommers-Herivel G, Topczewski J, Solnica-Krezel L, Kang HC, Johnson I, and Kimelman D. Visualizing morphogenesis in transgenic zebrafish embryos using BODIPY TR methyl ester dye as a vital counterstain for GFP. Dev Dyn. 2005 Feb;232(2):359-68. doi: 10.1002/dvdy.20252. |
ZEN software | Zeiss | – | – |