В протоколе представлена мышиная модель вагинальной колонизации анаэробно культивируемыми вагинальными бактериями человека. Мы фокусируемся на Gardnerella vaginalis, включая предложения для Prevotella bivia и Fusobacterium nucleatum. Этот протокол также может быть использован в качестве руководства для вагинальных прививок и жизнеспособного восстановления других анаэробно выращенных бактерий.
Влагалище млекопитающих может быть колонизировано многими бактериальными таксонами. В микробиоме влагалища человека часто доминируют виды Lactobacillus , но каждая четвертая женщина испытывает бактериальный вагиноз, при котором низкий уровень лактобактерий сопровождается чрезмерным ростом разнообразных анаэробных бактерий. Это состояние было связано со многими осложнениями со здоровьем, включая риски для репродуктивного и сексуального здоровья. Хотя появляется все больше доказательств, свидетельствующих о сложной природе микробных взаимодействий в здоровье влагалища человека, индивидуальные роли этих различных анаэробных бактерий не полностью поняты. Это осложняется отсутствием адекватных моделей для изучения анаэробно выращенных вагинальных бактерий. Мышиные модели позволяют исследовать биологию и вирулентность этих организмов in vivo. Ранее были описаны другие мышиные модели вагинальной бактериальной инокуляции. Здесь мы описываем методы инокуляции анаэробно выращенных бактерий и их жизнеспособного восстановления у традиционно выращенных мышей C57Bl/6. Также описан новый, менее стрессовый процедурный метод вагинальной прививки и промывания. Подробно описаны инокуляция и жизнеспособное восстановление Gardnerella , а также обсуждаются стратегии для дополнительных анаэробов, таких как Prevotella bivia и Fusobacterium nucleatum .
У млекопитающих влагалище является домом для консорциума видов бактерий. Микробиом влагалища человека уникален среди млекопитающих обилием представителей рода Lactobacillus и соответствующим низким рН влагалища (3,8-4,5)1,2,3,4. Нарушение этого доминирования Lactobacillus связано с различными негативными последствиями для здоровья.
При бактериальном вагинозе (БВ) меньше лактобактерий и повышенное обилие разнообразных анаэробных бактерий, таких как Gardnerella vaginalis и Prevotella bivia 5,6. Женщины с БВ подвергаются повышенному риску инфекций, передающихся половым путем 7,8,9, бесплодия10, потерь беременности11, преждевременных родов 12,13,14, внутриутробных инфекций15, инфекций шейки матки 16 и рака 16,17,18 . BV также связан с более высокой вероятностью вагинальной колонизации потенциально патогенными бактериями, такими как Fusobacterium nucleatum 1,19,20, распространенный изолят от инфекций амниотической жидкости21.
Из-за важности анаэробных бактерий в здоровье влагалища человека существует потребность в животных моделях, которые могут быть использованы для исследования биологии и патогенеза этих организмов. Здесь мы описываем методы вагинальной прививки и жизнеспособного восстановления Gardnerella vaginalis у эстрогенизированных мышей и предлагаем дополнительные стратегии для Prevotella bivia и Fusobacterium nucleatum. Другие модели вагинальной колонизации мышей были ранее описаны, но они были сосредоточены на инокуляции и восстановлении факультативных анаэробных бактерий, таких как Streptococcus22 группы B и Neisseria gonorrhoeae23 , которые культивировались аэробно. Инокуляция и восстановление облигатных анаэробов могут быть успешно выполнены с помощью соответствующих экспериментальных стратегий. Мы обсуждаем подходы к жизнеспособному восстановлению нескольких бактериальных таксонов и предлагаем эмпирическую оценку условий жизнеспособности дополнительных видов/штаммов, представляющих интерес.
Классическим методом оценки колонизации живыми бактериями является восстановление колониеобразующих единиц (КОЕ). У традиционно выращенных мышей с собственной эндогенной микробиотой это требует восстановления на агаровой среде, которая выбирает против членов эндогенной вагинальной микробиоты, в то же время позволяя инокулированному штамму бактерий расти. Здесь мы используем устойчивый к стрептомицину изолят G. vaginalis24 , который может быть избирательно восстановлен на стрептомицинсодержащей агаровой среде. Чтобы среда была достаточно селективной и, наоборот, чтобы в эндогенном микробиоме отсутствовали устойчивые к стрептомицину бактерии, вагинальные лаважи, собранные непосредственно перед инокуляцией, должны быть покрыты селективным (стрептомицинсодержащим) агаром.
Лучший способ приготовления инокулята может варьироваться в зависимости от вида и штаммов бактерий. До начала экспериментов на мышах следует провести предварительную работу по определению предпочтительных условий для питательной среды, конечной точки роста и приготовления инокулята, а также восприимчивости к кислороду и жизнеспособности в ПБС. В случае более чувствительных к кислороду бактерий можно рассмотреть альтернативные препараты инокулята (например, в анаэробной питательной среде с соответствующей контрольной группой транспортного средства)25,26.
Наиболее существенным отличием описанной здесь модели от ранее опубликованных моделей вагинальной прививки является использование анаэробно культивируемых бактерий, которые требуют особых соображений для получения жизнеспособного инокулята и восстановления бактерий у мышей. Конкретные шаги в приведенном выше протоколе могут незначительно варьироваться в зависимости от вида/штамма используемых бактерий, как предложено в Дополнительном файле 1. Кроме того, в этой рукописи описывается новый процедурный метод введения бактерий и вагинальных промывок, который требует меньше опыта со стороны исследователя и меньшей сдержанности для мышей. Если экспериментатора не устраивает форма сдерживания, описанная в шаге 3.2. и на этапе 3.3., мышей можно вместо этого зажимать, какописано ранее 34 , с анестезией или без нее в соответствии с экспериментальным дизайном и институциональными руководящими принципами IACUC.
Важным предостережением к использованию анаэробно культивируемых бактерий в мышиных моделях является то, что определенные шаги (например, с участием живых животных) должны выполняться за пределами анаэробной камеры. Поэтому наиболее важными шагами в этом протоколе являются те, в которых интересующие бактерии будут подвергаться воздействию аэробной среды, например, во время прививки мышей. Использование любого нового анаэроба в этой модели потребует предварительного изучения его способности сохранять жизнеспособность при воздействии кислорода (например, сравнение коЕ до и после инокуляции, как описано на этапе 2.5 и этапе 3.4.). В зависимости от степени чувствительности организма к кислороду и ПБС следует рассматривать различные способы получения инокулята (Дополнительный файл 1, этап 2.4.5.). Для прививок с использованием G. vaginalis JCP8151B мы обнаружили, что одна трубка инокулята может быть приготовлена в PBS и использована для заражения всех мышей. Если используется другая анаэробная бактерия, более чувствительная к кислороду, инокулятив может быть приготовлен в отдельных пробирках для каждой мыши, так что повторное открытие/ закрытие трубки не требуется. Аналогичным образом, если интересующий вид бактерий более привередлив / менее способен выживать в PBS , чем G. vaginalis, вместо этого можно приготовить прививку в питательных средах. Если используемая среда содержит восстановители, такие как анаэробная среда CDC, используемая для культивирования Prevotella bivia (Дополнительный файл 1, шаг 2.1. и шаг 2.2.), то бактерии также будут иметь повышенную защиту от воздействия кислорода.
Также могут быть рассмотрены альтернативные способы гомогенизации, такие как бисерное биение22,35, которое делается с закрытой крышкой трубки и, следовательно, может вводить меньше кислорода, чем ручной гомогенизатор. Кроме того, более чувствительным к кислороду организмам может потребоваться более длительное время равновесия для сред. Индикатор кислорода, такой как ресазурин, может быть использован для проверки того, что анаэробные условия были достигнуты (шаг 2.1.). Альтернативные методы, такие как анаэробные банки, могут влиять на результаты и должны быть проверены на жизнеспособность бактерий перед использованием.
Чувствительность к кислороду и привередливость экспериментального организма могут также играть роль в успешном восстановлении жизнеспособных бактерий у мыши во время промывания/гомогенизации (Дополнительный файл 1, этап 3.2. и этап 5.1.). Для высокочувствительных организмов время между приемом и покрытием лаважа может привести к потере жизнеспособности и вызвать искусственно заниженную оценку бактериальной вагинальной колонизации. Чтобы смягчить этот эффект, собранные промывания можно сразу же разбавить в свежие анаэробные питательные среды (с восстановителем). Аналогичным образом, гомогенизация органов может быть выполнена в свежих питательных средах, а не в PBS для повышения жизнеспособности бактерий, а также может быть выполнена в самой анаэробной камере, чтобы свести к минимуму воздействие кислорода.
В зависимости от цели данного эксперимента экспериментатор должен обращать внимание на контрольные группы. Чтобы проверить гипотезы, базовые показатели неинфицированных контрольных мышей, которые искусственно обрабатываются только транспортным средством, помогут установить, есть ли индукция хемокинов / цитокинов или других конкретных исходов инфекции. Используемое контрольное транспортное средство должно быть таким же, как и транспортное средство, используемое для инокуляции, поэтому, если бактерии инокулируются в питательных средах, то в качестве контроля должны использоваться неинокализованные питательные среды (Дополнительный файл 1, этап 2.4.5.).
Методы, описанные в этом протоколе, также могут быть применены к факультативным бактериям, способным расти анаэробно, но которые традиционно изучаются с использованием аэробных условий культивирования (таких как Escherichia coli или стрептококк группы B). Это может быть особенно актуально для инфекций этими организмами в участках тела, которые, как полагают, содержат низкий уровень кислорода, таких как шейка матки. Может случиться так, что факультативный организм более успешно заражает участки с меньшим количеством кислорода, когда инокулятив готовится анаэробно по сравнению с аэробным. В таком эксперименте восстановление жизнеспособных бактерий для перечисления КОЕ может не требовать анаэробных состояний.
The authors have nothing to disclose.
Мы выражаем признательность Линн Фостер за техническую помощь в разработке этих моделей. Мы ценим стартовые средства от Департамента молекулярной микробиологии и Центра исследований инфекционных заболеваний женщин (для AL), а также March of Dimes (награда Бэзила О’Коннора для AL), которые помогли поддержать эксперименты на ранней стадии. Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний (R01 AI114635) также поддержал разработку этих моделей.
β-estradiol 17-valerate | Sigma | E1631 | estrogenization of mice |
0.22 µm, 50 mL Steriflip vacuum filter | Fisher | SCGP00525 | sterile filtering sesame oil |
14 mL tube | Falcon | 352059 | estrogenization of mice |
190-proof ethanol | Koptec | V1105M | dissection, tissue homogenization, CDC and Columbia media |
1x PBS | Fisher | MT21040CM | vaginal lavage, G. vaginlalis inoculum prep, tissue collection and homogenization |
25 G × 5/8 -in needle | BD | 305122 | estrogenization of mice |
5 mL tube | Falcon | 352063 | Tissue collection and homogenization |
Anaerobic chamber | Coy | 7200000 | Growth of anaerobic bacteria |
Bacto agar | Fisher | DF0140074 | G. vaginalis, F. nucleatum, and P. bivia agar plates |
Bacto peptone | Fisher | DF0118170 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Columbia broth | Fisher | DF0944170 | Columbia media for F. nucleatum growth |
Defibrinated sheep blood | Hemostat | DSB500 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Forceps | Fine Science Tools | 11008-13 | mouse/tissue dissection |
Glucose | Sigma | G7528 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Handheld homogenizer | ISC Bio | 3305500 | Tissue homogenization |
Hemin | Sigma | 51280 | CDC anaerobic media for P. bivia growth, Columbia media for F. nucleatum growth |
HEPES | Cellgro | 25-060-Cl | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Horse serum | Hemostat | SHS500 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Hydrogen gas mix (5% hydrogen, 10% CO2, 85% nitrogen) | Matheson | Gas for anaerobic chamber | |
Isofluorane | VetOne | 502017 | mouse anaethesia at sacrifice |
L-cysteine | Sigma | C1276 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
L-glutamate | Sigma | G1626 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Milli-Q Water Purifier | Millipore | IQ-7000 | for making media and homogenization |
NaCl | Sigma | S3014 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
NaOH tablets | Sigma | S5881 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Nitrogen gas | Airgas | Gas for anaerobic chamber | |
p-200 filter tips | ISC Bio | P-1237-200 | vaginal lavages and bacterial inoculations |
pancreatic digest of casein | Sigma | 70169 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Proteose peptone #3 | Fisher | DF-122-17-4 | NYCIII media for G. vaginalis growth |
Scissors | Fine Science Tools | 14084-08 | mouse/tissue dissection |
Sesame oil | Fisher | ICN15662191 | estrogenization of mice |
Single edge surgical carbon steel razor blades | VWR | 55411-050 | tissue dissection |
Sodium chloride | Sigma | S3014 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Spectrophotometer | BioChrom | 80-3000-45 | measuring bacterial OD600 |
Streptomycin | Gibco | 11860038 | add to agar media to make selective plates |
Tuberculin slip tip 1ml syringe | BD | 309659 | estrogenization of mice |
Vitaim K3 | Sigma | M5625 | Columbia media for F. nucleatum growth |
Vitamin K1 | Sigma | 95271 | CDC anaerobic media for P. bivia growth |
Yeast extract | Fisher | DF0127-17-9 | NYCIII media for G. vaginalis growth |