Dit artikel beschrijft een handige methode voor het gelijktijdig monitoren van dynamische veranderingen in antilichaamtiters voor twee immunoglobuline-isotypen (IgA, IgM of IgG) als gevolg van een immuunrespons op SARS-CoV-2-infectie of vaccinatie. Dit ‘Multianalyte Covid-19 Immune Response Panel’ maakt gebruik van drie indirecte immunoassays gebouwd op gecodeerde microsferen die worden gelezen met behulp van een flow-gebaseerde multiplexlezer met ‘dual-channel’ mogelijkheid.
Multiplextechnologieën voor het gezamenlijk ondervragen van meerdere biomarkers bestaan al tientallen jaren; methoden om meerdere epitopen op dezelfde analyt te evalueren blijven echter beperkt. Dit rapport beschrijft de ontwikkeling en optimalisatie van een multiplexed immunobead assay voor serologisch testen van gemeenschappelijke immunoglobuline isotypes (bijv. IgA, IgM en IgG) geassocieerd met een immuunrespons op SARS-CoV-2 infectie of vaccinatie. Assays werden uitgevoerd met behulp van een flow-gebaseerde, multiplex fluorescerende lezer met dual-channel mogelijkheden. Optimalisaties gericht op de opnametijd van analyten, de concentratie van detectieantilichamen en de incubatietijd van detectieantilichamen. Analytische prestatiekenmerken van de test (bv. testbereik (inclusief onder- en bovengrenzen van kwantificering); en intra- en intertestprecisie) werden vastgesteld voor IgG/IgM of IgA/IgM serotype combinatie in tandem met behulp van de “dual channel” modus. Analytopnametijden van 30 minuten voor IgG, 60 minuten voor IgM en 120 minuten voor IgA waren geschikt voor de meeste toepassingen, waardoor een balans tussen testprestaties en doorvoer werd geboden. Optimale detectie antilichaam incubaties bij 4 μg /ml gedurende 30 minuten werd waargenomen en worden aanbevolen voor algemene toepassingen, gezien de algehele uitstekende precisie (procentuele variantiecoëfficiënt (% CV) ≤ 20%) en waargenomen gevoeligheidswaarden. Het dynamisch bereik voor het IgG-isotype besloeg verschillende ordes van grootte voor elke test (Spike S1, Nucleocapsid en Membrane glycoproteins), die robuuste titerevaluaties ondersteunt bij een verdunningsfactor van 1:500 voor klinische toepassingen. Ten slotte werd het geoptimaliseerde protocol toegepast op het monitoren van Spike S1-seroconversie voor proefpersonen (n = 4) die een SARS-CoV-2-vaccinregime voltooiden. Binnen dit cohort werden Spike S1 IgG-niveaus waargenomen om maximale titers te bereiken 14 dagen na toediening van de tweede dosis, bij een veel hogere (~ 40-voudige) signaalintensiteit dan IgM- of IgA-isotypen. Interessant is dat we zeer variabele Spike S1 IgG-titervervalsnelheden waarnamen die grotendeels afhankelijk waren van de proefpersoon, wat het onderwerp zal zijn van toekomstige studies.
Gelijktijdige meting van meerdere ziektegerelateerde biomarkers in biologische monsters maakt beschrijvende en voorspellende inzichten in pathologische processen mogelijk. Hoewel conventionele immunologische procedures met één analyt, zoals enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA’s), de hoeksteen zijn geweest van kwantitatieve analyses in zowel klinische als onderzoeksomgevingen, kunnen deze technieken aanzienlijke beperkingen hebben met betrekking tot de doorvoer, de hoeveelheid specimen die nodig is voor elke meting en de kosteneffectiviteit die de studie van meerdere biologische elementen die vaak met elkaar verweven zijn gedurende het ziekteverloop sterk beperken1 . Microsphere-gebaseerde multiplexing-technologie is een onmisbaar platform geworden voor zowel diagnostische als onderzoeksfaciliteiten vanwege de mogelijkheid om assays te combineren om de laboratoriumdoorvoer te verbeteren, monsterschaarste te verminderen en repetitieve tests te verminderen om kostenbesparingen te maximaliseren 1,2,3,4. Onlangs is een verdere uitbreiding van deze multiplexing-kracht geïntroduceerd met instrumenten die over dual-reporter-mogelijkheden beschikken. De dual-reporter-functie implementeert twee fluorescerende kanalen voor detectie, waardoor een andere dimensie van multiplexing wordt geleverd, waardoor de detectie van meerdere epitopen op dezelfde analyt mogelijk is.
Ernstig acuut respiratoir syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is de ziekteverwekker die verantwoordelijk is voor de huidige coronavirusziekte 2019 (COVID-19) pandemie5. Hoewel RT-PCR-testen cruciaal zijn voor infectiebevestiging aan het begin van het ziekteverloop, zijn serologische onderzoeken van antilichaamtiters noodzakelijk gebleken voor de nauwkeurige en volledige kritiek van individuen met betrekking tot een eerdere blootstelling of herstel; een reactie op immunisatie; en/of een evaluatie van de werkzaamheid van de Covid-19-vaccinatie 6,7.
Dit rapport schetst methoden voor het meten van seroconversie voor meerdere SARS-CoV-2 virale antigenen die gebruik maken van een flow-based, multiplex reader dual-reporting systeem. In het bijzonder wordt gelijktijdige detectie van twee antilichaamsubtypen (geconfigureerd als IgG / IgM of IgA / IgM) voor een 3-plex SARS-CoV-2-antigenenpaneel dat assays bevat voor Spike S1, Nucleocapsid en Membrane (aka Matrix) glycoproteïnen, beschreven. Deze aanpak biedt een ideale onderneming voor het vastleggen van longitudinale seroconversie en draagt bij aan een waardevol hulpmiddel in het arsenaal tegen de Covid-19-pandemie.
De waardering van een immuunrespons op SARS-CoV-2-blootstelling, in combinatie met RT-PCR-gebaseerde surveillance van de infectiestatus, is goed beschreven als een recept om het verloop van herstel van Covid-19 te verduidelijken, om te dienen als een middel om herstellend plasma met potentiële therapeutische waarde te identificeren, en om infectiepercentages op populatieschaal te onderzoeken10,11. Verschillende voorbeelden van het begrijpen van seroconversie bij menselijke proefpersonen zijn eiwit (antigeen) arrays12, immunoblots13, snelle immunochromatografische constructen14 en enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA’s)15,16,17. Elk van deze bovengenoemde technieken kan meerdere immunoglobuline-isotypen afzonderlijk beoordelen met kleine wijzigingen. Deze procedures kunnen echter niet praktisch worden hergebruikt om parallelle analyse van meerdere isotypen mogelijk te maken, zoals gepresenteerd in dit manuscript, waarbij kosten- en doorvoerfactoren worden weergegeven als beperkingen voor hun administratie op een populatiegebaseerde teststrategie. Verschillende van deze toepassingen bieden ook de mogelijkheid om niveaus van meerdere antigenen parallel te concomteren, hetzij zoals gepresenteerd of in gewijzigde formaten, zoals een multiplex ELISA18,19. Ten slotte biedt het immunobead-platform de mogelijkheid om niveaus van meerdere antigenen parallel20,21 te evalueren, maar is beperkt tot een enkel epitoop (d.w.z. immunoglobuline-isotype) per test, tenzij echter het recente instrument met ‘dual-channel’ testmogelijkheden wordt gebruikt.
In dit rapport worden protocollen opgesomd die de betrouwbare meting van meerdere epitopen in een immunokraantest vaststellen met behulp van het instrument in de ‘dual-channel’ modus in een casestudy van seroconversie van Covid-19-gevaccineerde personen. De methode toonde een uitstekende precisie (%CV-waarden meestal <20%) met behulp van handmatige testontwerpen die kunnen worden verbeterd met de integratie van geautomatiseerde laboratoriumsystemen. Testgevoeligheid en dynamisch bereik voor alle geselecteerde analyten en epitopen waren geschikt voor routine-evaluaties. Hoewel het ontbreken van in de handel verkrijgbare anti-antigeen IgA- en IgM-immunoreagentia de kwantificering tot het IgG-isotype beperkte, sluit een dergelijke beperking niet uit dat semikwantitatieve beoordelingen of beoordelingen met betrekking tot een specifiek specimen als kalibrant22,23 kunnen worden aangeboden.
De gevalideerde immunokraantest werd toegewezen om seroconversie te onderzoeken in een cohort van personen die zijn geïmmuniseerd met het Covid-19-vaccin. In tegenstelling tot andere vergelijkbare platforms, maakt de familie van instrumentatie de prospectie van seroconversie mogelijk bij honderden personen per dag in een handmatige workflow en duizenden per dag in een geautomatiseerd schema. Over het algemeen bevestigen deze bevindingen dat de ‘dual-channel’-benadering voldoende gevoeligheid heeft voor de beschrijving van meerdere epitopen parallel voor de identieke assay en levensvatbaar is in een multianalytische context. Een verschil in gevoeligheden voor kanaal 1 en kanaal 2, zoals uitgevoerd met respectievelijk fycoerythrin en Super Bright 436 fluoroforen, kan het ontwerp van een specifiek experiment rechtvaardigen om ervoor te zorgen dat levensvatbare analytische resultaten worden verkregen voor een bepaald experiment. Dat wil zeggen, de reservering van kanaal 1 voor epitopen of analyten met een lagere prevalentie kan nodig zijn om een dynamisch bereik van de test te behouden dat de waargenomen waarden van onbekenden omvat. Afgezien van deze overweging was het ontwerp van de test duidelijk en zou het gemakkelijk toegankelijk moeten zijn voor laboratoria met beperkte analytische mogelijkheden. Zeker, deze overweging moet worden gewogen bij het overwegen van kanaal 1 tot kanaal 2 interferentie, zoals we opmerkten voor figuur 5, waarbij interferentie van isotypen met een hogere abundantie misleidende analytische fouten kan veroorzaken voor degenen in een veel lagere abundantie wanneer gemeten in een dual-channel formaat. Dit potentieel voor interferentie met situaties met zeer verschillende analytconcentraties kan een aanzienlijke beperking van de aanpak vormen als het niet correct wordt behandeld in de ontwerpfase van de test.
Tot slot werd een methode gepresenteerd om snel antilichaamtiters te meten van de belangrijkste immunoglobuline-isotypen geassocieerd met een immuunrespons op Covid-19-infectie of vaccinatie. Het toepassen van deze aanpak op een longitudinale manier om seroconversie te beoordelen, kan inzichten opleveren die beter kunnen worden gebruikt om het verloop van de ziekte te beheren en / of te volgen of, afwisselend, toekomstige Covid-19-boostervaccinprogramma’s te begeleiden.
The authors have nothing to disclose.
De auteurs willen de Rush Biomarker Development Core bedanken voor het gebruik van hun faciliteiten, de Rush Biorepository voor onderwerpinschrijving en biospecimenverwerking, en de Walder Foundation’s Chicago Coronavirus Assessment Network (Chicago CAN) Initiative subsidienummers SCI16 (J.R.S. en J.A.B.) en 21-00147 (J.R.S. en J.A.B.) en een prijs van de Swim Across America Foundation (J.A.B.).
384-well black side polystyrene microtiter plates | Thermo Fisher | 12-565-346 | |
Activation buffer (0.1 M NaH2PO4, pH 6.2) | Prepared in house | ||
Assay buffer (PBS, 1% Bovine Serum Albumin, 0.01% Polysorbate-20) | Prepared in house | ||
Bovine Serum Albumin, heat shock fraction | MilliporeSigma | A-7888-50G | |
Coupling buffer (50 mM MES, pH 5.0) | Prepared in house | ||
COVID 19 M Coronavirus Recombinant Matrix Protein (6xHis tag) | MyBioSource | MBS8574735 | |
Disposable pipette tips | |||
EDC (1-Ethyl-3-[3-dimethylaminopropyl]carbodiimide hydrochloride) | Thermo Fisher | PIA35391 | |
Goat Albumin, Fraction V Powder | MilliporeSigma | A2514-1G | |
IgA Goat anti-Human, R-PE, Polyclonal | Thermo Fisher | OB205009 | |
IgG Goat anti-Human, R-PE, Polyclonal | Thermo Fisher | OB204009 | |
IgG Goat anti-Rabbit, R-PE, Polyclonal | Thermo Fisher | OB403009 | |
IgM Goat anti-Human, R-PE, Polyclonal | Thermo Fisher | OB202009 | |
IgM Mouse anti-Human, SB 436, Clone SA-DA4 | Thermo Fisher | 62999842 | |
Instrument Analyzer | Luminex Corp. | INTELLIFLEX-RUO | |
Low-Bind microcentrifuge tubes (1.5 mL) | Thermo Fisher | 13-698-794 | |
MagPlex-C Microspheres, Region XXX | Luminex Corp. | MC10XXX-01 | |
MES hydrate (2-(N-Morpholino) ethane sulfonic acid hydrate) | MilliporeSigma | M2933 | |
Microplate aluminum sealing tape | Thermo Fisher | 07-200-683 | |
Polysorbate-20 | Thermo Fisher | BP337-500 | |
Quality Biological Inc. PBS, pH 7.2 | Thermo Fisher | 50-751-7328 | |
Quench buffer (PBS, 1% Goat Serum Albumin, 0.01% Polysorbate-20) | Prepared in house | ||
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Nucleocapsid Protein (His tag) | Sino Biologicals | 40588-V08B | |
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike Protein (S1 Subunit, His tag) | Sino Biologicals | 40591-V08H | |
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike RBD Antibody, Rabbit pAb | Sino Biologicals | 40592-T62 | |
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Nucleocapsid Antibody, Rabbit mAb | Sino Biologicals | 40588-R0004 | |
SARS-CoV-2 (COVID-19) Membrane Antibody (IN), Rabbit pAb | ProSci | 10-516 | |
Sulfo-NHS (N-hydroxysulfosuccinimide) | Thermo Fisher | PIA39269 | |
Wash Buffer (PBS, 0.01% Polysorbate-20) | Prepared in house | ||
Water, LC/MS grade | Thermo Fisher | W-64 |