Summary

Gecombineerde mechanische en enzymatische dissociatie van hippocampusweefsel van muizenhersenen

Published: October 21, 2021
doi:

Summary

Dit neurale celdissociatieprotocol is bedoeld voor monsters met een lage hoeveelheid uitgangsmateriaal en levert een zeer levensvatbare eencellige suspensie op voor downstream-analyse, met optionele fixatie- en kleuringsstappen.

Abstract

Dit neurale dissociatieprotocol (een aanpassing van het protocol bij een commerciële hersendissociatiekit voor volwassenen) optimaliseert weefselverwerking ter voorbereiding op gedetailleerde downstream-analyse zoals flowcytometrie of eencellige sequencing. Neurale dissociatie kan worden uitgevoerd via mechanische dissociatie (zoals het gebruik van filters, haktechnieken of pipettrituratie), enzymatische spijsvertering of een combinatie daarvan. De delicate aard van neuronale cellen kan de inspanningen bemoeilijken om de zeer levensvatbare, echte eencellige suspensie te verkrijgen met minimaal cellulair puin dat nodig is voor eencellige analyse. De gegevens tonen aan dat deze combinatie van geautomatiseerde mechanische dissociatie en enzymatische spijsvertering consequent een zeer levensvatbare (>90%) eencellige suspensie oplevert, waarmee de bovengenoemde problemen worden overwonnen. Hoewel een paar van de stappen handmatige behendigheid vereisen, verminderen deze stappen de verwerking van monsters en mogelijk celverlies. Dit manuscript beschrijft elke stap van het proces om andere laboratoria uit te rusten om met succes kleine hoeveelheden neuraal weefsel te dissociëren ter voorbereiding op downstream-analyse.

Introduction

De hippocampus werd voor het eerst beschreven door een Bolognese anatoom, Giulio Cesare Aranzio, in de jaren 15001. Bij het benoemen van deze nieuw ontdekte structuur werd Aranzio waarschijnlijk geïnspireerd door de griezelige gelijkenis met het zeepaardje van het geslacht Hippocampus1. De hippocampus is betrokken bij stressreacties, maar staat algemeen bekend om zijn rol in leren en geheugen. Meer specifiek is de hippocampus verantwoordelijk voor het coderen en ophalen van declaratief en ruimtelijk geheugen1.

De hippocampus, of eigenlijke hippocampus, is verdeeld in de SUBVELDEN CA1 (cornu ammonis), CA2 en CA3. In vergelijking met de rest van het zenuwstelsel heeft de hippocampus verschillende unieke bepalende kenmerken, waaronder de plasticiteit en het potentieel voor voortdurende neurogenese2. Neurogenese is het proces van de proliferatie en differentiatie van neurale stamcellen, gevolgd door hun integratie in het reeds bestaande neuronale netwerk. Neurogenese is beperkt tot de subgranulaire zone van de gyrus dentate en de subventriculaire zone van de laterale ventrikels (en de olfactorische bollen)3. Hoewel neurogenese overvloedig aanwezig is in embryogenese, is het een levenslang proces 3,4. Als zodanig zal deze discussie zich richten op volwassen neurogenese in de hippocampus.

De subventriculaire en subgranulaire zones zijn neurogene niches die ependymale en vasculaire cellen bevatten, evenals onrijpe en volwassen afstammingslijnen van neurale stamcellen5. Microglia dragen bij aan deze niches als immuuncellen om neurogenese te reguleren6. Neurale voorlopercellen zijn niet-stamcelprogenieën van neurale stamcellen7. Drie soorten neurale voorlopers zijn aanwezig in de subventriculaire zone: radiale glia-achtige type B-cellen, type C transit-versterkende voorlopers en type A neuroblasten 3,8. De langzaam delende type B neurale voorlopercellen in de subventriculaire zone kunnen differentiëren in snel delende type C-cellen8. Vervolgens differentiëren type C-cellen in type A-cellen8. Deze neuroblasten migreren door de rostrale migratiestroom naar de bulbus olfactorius voordat ze differentiëren in interneuronen of oligodendrocyten9. Deze olfactorische bolintercurnen zijn de sleutel tot olfactorisch kortetermijngeheugen en associatief leren, terwijl de oligodendrocyten myelinaat axonen van het corpus callosum9. De meerderheid van de volwassen neurogenese vindt plaats in de subgranulaire zone van de gyrus dentate, waar radiale type 1 en niet-radiale type 2 neurale voorlopers worden gevonden3. De meeste neurale voorlopercellen zijn voorbestemd om dentate granulaatneuronen en astrocyten10 te worden. Verbonden door gap junctions, vormen astrocyten netwerken om plasticiteit, synaptische activiteit en neuronale prikkelbaarheid te moduleren5. Als het primaire exciterende neuron van de gyrus dentate leveren korrelcellen input van de entorhinale cortex naar het CA3-gebied11.

Neurale stamcelpopulaties kunnen worden geïsoleerd met behulp van immunomagnetische of immunofluorescente isolatiestrategieën12,13. Neuraal weefsel is bijzonder moeilijk te dissociëren; pogingen om dit te doen resulteren vaak in monsters met een slechte levensvatbaarheid van de cel en/ of het niet produceren van de noodzakelijke eencellige suspensie voor downstream-analyse. Neurale dissociatie kan worden uitgevoerd via mechanische dissociatie (zoals het gebruik van filters, haktechnieken of pipettrituratie), enzymatische spijsvertering of een combinatie van technieken14,15. In een studie die neurale dissociatiemethoden evalueerde, werden de levensvatbaarheid en kwaliteit van handmatige mechanische dissociatie door pipettrituratie versus combinaties van pipettrituratie en spijsvertering met verschillende enzymen vergeleken15. De kwaliteit werd beoordeeld op basis van de hoeveelheid celklonten en DNA of subcellulair puin in de bereide suspensie15. Suspensies van gliale tumoren onderworpen aan handmatige mechanische dissociatie alleen hadden een significant lagere cel levensvatbaarheid dan behandelingen met dispase of een combinatie van DNase, collagenase en hyaluronidase15. Volovitz et al. erkenden de variatie in levensvatbaarheid en kwaliteit tussen de verschillende methoden en benadrukten dat onvoldoende dissociatie de nauwkeurigheid van downstream-analyse kan verminderen15.

In een afzonderlijke studie vergeleken de auteurs meer dan 60 verschillende methoden en combinaties van dissociatie van gekweekte neuronale cellen14. Deze methoden omvatten acht verschillende variaties van handmatige mechanische dissociatie door pipettrituratie, een vergelijking van incubatie met vijf individuele enzymen met drie verschillende intervallen en verschillende combinaties van mechanische dissociatie met enzymatische spijsvertering of de combinatie van twee enzymen14. Geen van de mechanische methoden leverde een eencellige suspensieop 14. Vier van de enkelvoudige enzymbehandelingen, tien van de combinatie-enzymatische behandelingen en vier van de combinaties van mechanische dissociatie met enzymatische vertering leverden een eencellige suspensie op14. Enzymatische vertering met TrypLE gevolgd door Trypsine-EDTA meest effectief gedissocieerde monsters14. Overigens hadden monsters behandeld met TrypLE en/of Trypsine-EDTA de neiging gelatineuze klontente vormen 14. Hoewel deze studie werd uitgevoerd op gekweekte cellen, spreekt het over de tekortkomingen van pipettrituratie of enzymatische spijsvertering alleen.

Zij-aan-zij vergelijkingen van handmatige versus geautomatiseerde mechanische dissociatie ontbreken. Eén groep voerde echter flowcytometrie uit om handmatige en semi-geautomatiseerde mechanische dissociatie van hele muizenhersenen te vergelijken in combinatie met commerciële papaïne- of trypsine-enzymatische dissociatiekits16. Verwerking met de dissociator leverde consistenter levensvatbare cellen op16. Na dissociatie isoleerden de auteurs ook Prominine-1-cellen, neuronale voorlopercellen en microglia16. Voor twee van de drie geïsoleerde celpopulaties was de zuiverheid van de geïsoleerde cellen iets hoger wanneer monsters werden verwerkt met de dissociator, in vergelijking met handmatig16. Reiß et al. merkten op dat person-to-person variabiliteit in pipetteertechniek de reproduceerbaarheid van levensvatbare celpopulatieopbrengst in weefseldissociatie belemmert16. De auteurs concludeerden dat geautomatiseerde mechanische dissociatie de monsterverwerking standaardiseert16.

De methode van dissociatie die in dit manuscript wordt beschreven, is een combinatie van volledig geautomatiseerde mechanische dissociatie en enzymatische spijsvertering, met behulp van oplossingen die gepaard gaan met een commerciële hersendissociatiekit voor volwassenen17. In tegenstelling tot standaardprotocollen vermindert dit geoptimaliseerde protocol monstermanipulatie, levert het een zeer levensvatbare eencellige suspensie op en is het bedoeld voor het verwerken van minimale hoeveelheden startweefsel.

Protocol

Experimenten werden uitgevoerd in overeenstemming met de ethische normen die zijn goedgekeurd door de Institutional Animal Care and Use Committee van UAMS. 6 maanden oude vrouwelijke C57Bl6 / J wild-type muizen werden gekocht en gehuisvest (4 muizen per kooi) onder een constante 12 uur licht / donker cyclus. 1. Bereiding van reagentia Bereid een oplosbare oplossing voor levende/dode vlekken. Reconstitueer de fluorescerende vlek met 20 μL dimethylsulfoxide (DMSO). Wikkel de…

Representative Results

Monsters werden verwerkt met een flowcytometer in een kernfaciliteit en de resulterende gegevens werden geëvalueerd met een softwarepakket voor stroomanalyse. Voorheen werden compensatiecontroles geanalyseerd – de levende / dode vlek en negatieve controle. Als meerdere fluorochchromen worden gebruikt, moeten fluorescentie minus één (FMO) controles en single-stain controles worden voorbereid voor elk antilichaam. Compensatie voor spectrale overlap voor de experimentele monsters werd berekend op basis van de geanalyseer…

Discussion

Verschillende stappen in dit neurale dissociatieprotocol vereisen bekwame techniek en behendigheid – perfusie, supernatantaspiratie en myelineverwijdering. Tijdens het perfusieproces moeten de inwendige organen intact blijven (afgezien van het verwijderen van het diafragma en het knippen van het hart); dit omvat het vermijden van de bovenste kamers van het hart met de vlindernaald. Hoewel de hoeveelheid zoutoplossing met heparine die nodig is varieert, geeft transparante vloeistof die uit het hart stroomt aan dat het pro…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We bedanken Aimee Rogers voor het bieden van hands-on training en voortdurende productondersteuning. We bedanken Dr. Amanda Burke voor het voortdurend oplossen van problemen en het verduidelijken van discussies. We bedanken Meredith Joheim en de UAMS Science Communication Group voor de grammaticale redactie en opmaak van dit manuscript. Deze studie werd ondersteund door NIH R25GM083247 en NIH 1R01CA258673 (A.R.A).

Materials

1.5 mL Microcentrifuge Tubes Fisher Scientific 02-682-003 Basix, assorted color
15 mL Falcon Tubes Becton Dickinson Labware Europe 352009 Polystyrene
25 mL Serological Pipets Fisher Scientific 14-955-235
5 mL Round Bottom Polystyrene Test Tube Falcon 352052
500 mL Vacuum Filter/ Storage Bottle System Corning 431097
70 μm cell strainer Fisher Scientific 08-771-2
Adult Brain Dissociation Kit Miltenyi Biotec  130-107-677 Contains Enzyme P, Buffer Z, Buffer Y, Enzyme A, Buffer A, Debris Removal Solution
Aluminum Foil Fisher Scientific 01-213-105
Anti-ACSA-2-PE-Vio770, mouse, clone REA969 Miltenyi Biotec 130-116-246
Anti-Myelin Basic Protein Sigma-Aldrich M3821-100UG
Anti-PSA-NCAM-PE, human, mouse and rat, Clone 2-2B Miltenyi Biotec 130-117-394
BD LSRFortessa BD
BSA Sigma-Aldrich A7906-50G
CD11b-VioBlue, mouse, Clone REA592 Miltenyi Biotec 130-113-810
CD31 Antibody Miltenyi Biotec 130-111-541
Ceramic Hot Plate Stirrer Fisher Scientific 11-100-100SH
Dimethyl Sulfoxide Fisher Scientific BP231-100
Ethanol Pharmco by Greenfield Global 111000200
Falcon 50 mL Conical Centrifuge Tubes Fisher Scientific 14-432-22
Fine Scissors – Sharp Fine Science Tools 14060-09 Perfusion
FlowJo BD (v10.7.0)
gentleMACS C Tubes Miltenyi Biotec 130-093-237
gentleMACS Octo Dissociator with Heaters Miltenyi Biotec 130-096-427
Gibco DPBS (1X) ThermoFisher Scientific 14190144
Glass Beaker Fisher Scientific 02-555-25A
Heparin sodium Fresenius Kabi 504011
LIVE/DEAD Fixable Aqua Dead Cell Stain Kit ThermoFisher L34965
Magnetic Stir Bar Fisher Scientific 14-513-51
Noyes Spring Scissors Fine Science Tools 15012-12 Dissection
Paraformaldehyde Sigma-Aldrich 441244-3KG Prilled, 95%
Pipette tips GP LTS 20 µL 960A/10 Rainin 30389270
Pipette Tips GP LTS 250 µL 960A/10 Rainin 30389277
Pipette tips RT LTS 1000 µL FL 768A/8 Rainin 30389213
Rainin Pipet-Lite XLS (2, 20, 200, 1000 μL) Rainin 30386597
RBXMO FITC XADS Fisher Scientific A16167
Round Ice Bucket with Lid Fisher Scientific 07-210-129
Round-Bottom Tubes with Cell Strainer Cap Falcon 100-0087
S1 Pipet Fillers ThermoFisher Scientific 9541
Spatula & Probe Fine Science Tools 10090-13 Dissection & Perfusion
Surflo Winged Infusion Set 23 G x 3/4" Termuno SV-23BLK Butterfly needle
Test Tube Rack Fisher Scientific 14-809-37
Thermo Scientific Legend XTR Centrifuge ThermoFisher discontinued Or other standard table top centrifuge
Variable-Flow Peristaltic Pump Fisher Scientific 13-876-2 Low-flow model
VetFlo Starter Kit for Mice Kent Scientific VetFlo-MSEKIT Anesthesia mask, tubing, induction chamber, charcoal canisters
VetFlo Vaporizer Single Channel Anesthesia System Kent Scientific VetFlo-1210S 0.2–4 LPM
Vi-CELL XR Cell Viability Analyzer Beckman Coulter Life Sciences 731196 Cell Counting
Vi-CELL XR 4 Bags of Sample Vials Beckman Coulter Life Sciences 383721 Cell Counting

Referências

  1. Andersen, P., Morris, R., Amaral, D., Bliss, T., O’Keefe, J. . The Hippocampus Book. , (2007).
  2. Kempermann, G., Kuhn, H. G., Gage, F. H. Genetic influence on neurogenesis in the dentate gyrus of adult mice. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 94, 10409-10414 (1997).
  3. Zhao, C., Deng, W., Gage, F. H. Mechanisms and Functional Implications of Adult Neurogenesis. Cell. 132, 645-660 (2008).
  4. Kempermann, G., Song, H., Gage, F. H. Neurogenesis in the adult hippocampus. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 7, 018812 (2015).
  5. Bond, A. M., Ming, G. L., Song, H. Adult mammalian neural stem cells and neurogenesis: Five decades later. Cell Stem Cell. 17, 385-395 (2015).
  6. Sato, K. Effects of microglia on neurogenesis. Glia. 63, 1394-1405 (2015).
  7. Mu, Y., Lee, S. W., Gage, F. H. Signaling in adult neurogenesis. Current Opinion in Neurobiology. 20, 416-423 (2010).
  8. Fares, J., Diab, Z. B., Nabha, S., Fares, Y. Neurogenesis in the adult hippocampus: history, regulation, and prospective roles. International Journal of Neuroscience. 129, 598-611 (2018).
  9. Tosun, M., Semerci, F., Maletic-Savatic, M. Heterogeneity of stem cells in the hippocampus. Advances in Experimental Medicine and Biology. 1169, 31-53 (2019).
  10. Abbott, L. C., Nigussie, F. Adult neurogenesis in the mammalian dentate gyrus. Journal of Veterinary Medicine Series C: Anatomia Histologia Embryologia. 49, 3-16 (2020).
  11. Rodrigues, G. M., Fernandes, T. G., Rodrigues, C. A., Cabral, J. M., Diogo, M. M. Purification of human induced pluripotent stem cell-derived neural precursors using magnetic activated cell sorting. Methods in Molecular Biology. 1283, 137-145 (2015).
  12. Ko, I. K., Kato, K., Iwata, H. Parallel analysis of multiple surface markers expressed on rat neural stem cells using antibody microarrays. Biomaterials. 26, 4882-4891 (2005).
  13. Jager, L. D., et al. Effect of enzymatic and mechanical methods of dissociation on neural progenitor cells derived from induced pluripotent stem cells. Advances in Medical Sciences. 61 (1), 78-84 (2017).
  14. Volovitz, I., et al. A non-aggressive, highly efficient, enzymatic method for dissociation of human brain-tumors and brain-tissues to viable single-cells. BMC Neuroscience. 17, 1-10 (2016).
  15. Adult brain dissociation kit: mouse and rat. Miltenyi Biotec Available from: https://www.miltenyibiotec.com/upload/assets/IM0011920.pdf (2020)
  16. Cell surface flow cytometry staining protocol. Miltenyi Biotec Available from: https://www.miltenyibiotec.com/US-en/applications/all-protocols/cell-surface-flow-cytometry-straining-protocol-pbs-bsa-1-50.html (2021)
  17. Finak, G., Jiang, W., Gottardo, R. CytoML for cross-platform cytometry data sharing. Cytometry Part A: The Journal of the International Society for Analytical Cytology. 93, 1189-1196 (2018).
  18. Turaç, G., et al. Combined flow cytometric analysis of surface and intracellular antigens reveals surface molecule markers of human neuropoiesis. PLoS One. 8, 1-14 (2013).
  19. Schwarz, J. M. Using fluorescence activated cell sorting to examine cell-type-specific gene expression in rat brain tissue. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (99), e52537 (2015).
  20. Brummelman, J. application and computational analysis of high-dimensional fluorescent antibody panels for single-cell flow cytometry. Nature Protocols. 14, 1946-1969 (2019).
  21. Recommended controls for flow cytometry. Abcam Available from: https://www.abam.com/protocols/recommended-conntrols-for-flow-cytometry (2021)
  22. . Fixing cells with paraformaldehyde (PFA) for flow cytometry Available from: https://flowcytometry.utoronto.ca/wp-content/uploads/2016/02/FixingCells_PFA.pdf (2021)
  23. Stewart, J. C., Villasmil, M. L., Frampton, M. W. Changes in fluorescence intensity of selected leukocyte surface markers following fixation. Cytometry Part A: The Journal of the International Society for Analytical Cytology. 71, 379-385 (2007).
  24. Armand, E. J., Li, J., Xie, F., Luo, C., Mukamel, E. A. Single-cell sequencing of brain cell transcriptomes and epigenomes. Neuron. 109, 11-26 (2021).
  25. Ho, H., et al. A guide to single-cell transcriptomics in adult rodent brain: The medium spiny neuron transcriptome revisited. Frontiers in Cellular Neuroscience. 12, 1-16 (2018).
  26. Li, L., et al. Novel technologies in studying brain immune response. Oxidative Medicine and Cellular Longevity. 2021, 6694566 (2021).
  27. Liu, H., et al. DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution. bioRxiv. , (2020).
  28. Mattei, D., et al. Enzymatic dissociation induces transcriptional and proteotype bias in brain cell populations. International Journal of Molecular Sciences. 21, 1-20 (2020).
  29. Liu, L., et al. Dissociation of microdissected mouse brain tissue for artifact free single-cell RNA sequencing. STAR Protocols. 2 (2), 100590 (2021).
  30. Delmonte, O. M., Fleisher, T. A. Flow cytometry: Surface markers and beyond. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 143, 528-537 (2019).
  31. O’Connor, J. E., et al. The relevance of flow cytometry for biochemical analysis. IUBMB Life. 51, 231-239 (2001).
  32. Menon, V., Thomas, R., Ghale, A. R., Reinhard, C., Pruszak, J. Flow cytometry protocols for surface and intracellular antigen analyses of neural cell types. Journal of Visualized. Experiments. (94), e52241 (2014).
check_url/pt/63007?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Trujillo, M., McElroy, T., Brown, T., Simmons, P., Ntagwabira, F., Allen, A. R. Combined Mechanical and Enzymatic Dissociation of Mouse Brain Hippocampal Tissue. J. Vis. Exp. (176), e63007, doi:10.3791/63007 (2021).

View Video