טומגוגרפיה מיקרו-ממוחשבת עם שרף כפול מאפשרת הדמיה, דיגיטציה וסגמנטציה של שתי מערכות צינוריות בו זמנית כדי להקל על ניתוח תלת-ממדי של ארכיטקטורת איברים. DUCT משלב הזרקת ex vivo של שני שרפים radiopaque ואחריו סריקת טומוגרפיה מיקרו ממוחשבת פילוח של הנתונים טומוגרפיים.
הכבד הוא האיבר הפנימי הגדול ביותר בבני אדם ועכברים, ופלואורסצנטיות אוטומטית גבוהה מהווה אתגר משמעותי להערכת הארכיטקטורה התלת ממדית (3D) של האיבר ברמת האיברים המלאים. ארכיטקטורת הכבד מאופיינת במספר מבנים מסועפים, אשר ניתן למלא שרף, כולל עצי כלי דם ומרה, יצירת דפוס סטריאוטיפי מאוד בפרנצ’ימה עשירה בהפטוציט אחרת. פרוטוקול זה מתאר את הצינור לביצוע טומוגרפיה מיקרו-ממוחשבת של יציקת שרף כפול, או “DUCT”. DUCT כרוך בהזרקת וריד הפורטל וצינור המרה המשותף עם שני שרפים סינתטיים רדיופאק שונים, ואחריו קיבוע רקמות. בקרת איכות על ידי ניקוי אונה אחת, או הכבד כולו, עם חומר ניקוי אופטי, מאפשר הקרנה מראש של דגימות מוזרקות כראוי. בחלק השני של צינור DUCT, אונה או הכבד כולו יכול לשמש לסריקת טומוגרפיה מיקרו-ממוחשבת (microCT), (חצי) פילוח אוטומטי ועיבוד תלת-ממדי של רשתות ורידים ומרה. MicroCT תוצאות 3D לתאם נתונים עבור שני השרפים המאפשרים ניתוח איכותי כמו גם כמותי של שתי המערכות ואת היחסים המרחביים שלהם. צינור ניתן להחיל על כבד עכבר לאחר ה לידה ומבוגר והוא יכול להיות מורחב עוד יותר לרשתות צינוריות אחרות, למשל, רשתות כלי דם ודמתי הנשימה בריאות.
יציקת שרף איברים היא טכניקה שתחילתה במאה ה –171. אחת הדוגמאות הראשונות של יציקת שרף מודרני בוצעה על הכבד האנושי מנתיחה שלאחר המוות. צינורות מרה תוך-הפטיים היו מלאים בסוכן ניגודיות מעורבב עם ג’לטין, ואחריו הדמיה עם סריקת CT רנטגן2. מטרת טכניקת DUCT היא לדמיין, להפוך את הדיגיטציה ולנתח שתי רשתות יצוקות שרף צינוריות, בד בבד, בתלת-ממד.
DUCT מבוסס על הידע הקיים הנרחב של יציקת שרף כבד חד-מערכתית3,4,5,6,7,8 וממשיך להדמיה וניתוח תלת-ממדיים בו זמנית של שתי מערכות9. DUCT מתקדם יציקת שרף יחיד יציקת שרף כפול על ידי ערבוב שני שרפים radiopaque של ניגודיות שונה והזרקת שרפים אלה לשתי רשתות שונות, במיוחד צינור המרה המשותף וריד הפורטל. צינור ניתן להחיל על עכברים צעירים לאחר ההולכה עם תוצאות לשחזור כבר ביום שלאחר ההולכה 15 (P15). בהשוואה לטכניקות הדמיה מבוססות מיקרוסקופיה, היתרון העיקרי הוא ש- DUCT מהיר יותר, נטול נוגדנים, ואוטפלואורסצנטיות של רקמת כבד אינה מפריעה להדמיה. יתר על כן, DUCT מספק נתונים כמותיים המתארים מצב לומן, קוטר פנימי, קישוריות רשת וחדירה. הבחנה בין נוכחות של תאים יוצרי לומן שלהם מורפוגנזה דה פקטו לתוך צינורות חיונית לניתוח איברים שבהם תאים צינוריים נוכחים אך אינם יוצרים צינורות, כפי שניתן במקרה בתסמונת Alagille10. החיסרון העיקרי של DUCT הוא החדירה המוגבלת של השרף, שהוא צמיג ואינו נכנס צינורות עם קליבר קטן (<5 מיקרומטר). צינור ניתן להחיל על כל מבנה צינורי לאחר קביעת נקודת הכניסה הזרקה, כגון מערכות הדם עורקים ורידים, דרכי הנשימה, צינור מרה חוץ-היפאטי, או כלי הלימפה. זה יכול להקל על ניתוח ארכיטקטורת איברים שלמה של רקמות אחרות כגון ריאות ולבלב.
ניתן לעבד תמונות מפולח MicroCT באמצעות תוכנת הדמיה זמינה מסחרית, כגון ImageJ, או צינורות שנכתבו בהתאמה אישית (למשל, MATLAB). ניתן לנתח את הכבד המוזרק בשרף באופן איכותי להרחבת הרשת ולקישוריות או כמותית לנפח, אורך, הסתעפות, טורטואוזיות של מערכת אחת, והאינטראקציה בין שתי מערכות כגון המרחק בין שתי מערכות, או תלות בסניפים (האם מערכת 1 מסתעפת בסמיכות למערכת 2 מסתעפת?). צינור DUCT הכולל הזרקת שרף, סריקת מיקרו-CT ופילוח נתוני CT, בשילוב עם ניתוח כמותי מפורט של מנגנונים אדריכליים של שתי מערכות צינוריות, יכול לספק תקן לניתוח כבד שלם במודלים של בעלי חיים.
מספר שלבים קריטיים קובעים הצלחה DUCT, מהכנה לדוגמה לפרמטרים של התקן CT. כדי להשיג את התוצאות הטובות ביותר, יש להשתמש בשרף מנוגד היטב, מוזרק היטב וללא בועות כדי לאפשר עיבוד דיגיטלי פשוט עם סף אוטומטי כדי להשיג נתונים תלת-ממדיים, תמונות וסרטים. עם אימון ועקבות פרוטוקול זה, 90% של זריקות מוצלחות וכתוצאה מכך נתונים לשחזור. חשוב להשתמש שרף צהוב טרי כדי להשיג את הניגוד הטוב ביותר בין שתי מערכות מוזרק. לשרף הצהוב יש רדיו-תחלואה חזקה מאוד, בעוד שלשרף הכחול יש רדיו-תחלואה בלתי ניתנת לגילוי. התוצאות המובילות מושגות בשלושת החודשים הראשונים לאחר פתיחת בקבוק שרף צהוב חדש. עם הזמן, שרף מזרז, ולאחר אחסון ארוך יותר (>6 חודשים), את השרף הצהוב והירוק כבר לא יהיה להבחין בסריקות CT. תמונות עם ניגודיות לקויה מחייבות מעקב ידני נרחב וגוזל זמן רב וסגמנטציה של שתי המערכות. הבא, צינורות מתוחים היטב הוא הכרחי כדי להתאים לתוך צינור המרה המשותף של עכברים בוגרים צינור מרה משותף וריד פורטל של עכברים לאחר ה לידתי. נקודת הכניסה של הזריקה חייבת להיווצר בזהירות. אם צינור המרה המשותף נחתך לרוחב, סביר להניח שהוא יתנתק מהרקמה שמסביב, ולמנוע כניסה מוצלחת של הצינורות. שלב זה עדין במיוחד לעכברים לאחר הלידה שבה צינור המרה המשותף נסוג ו”מתכרבל “אם הוא התנתק מהרקמה הסובבת אותו, מה שהופך את החדרת הצינורות למאתגרת ביותר. הכניסה הנפוצה צינור המרה והזרקה עשוי לדרוש קצת תרגול. בעת הכנת הצינורות עם שרף ולאורך כל ההזרקה, הימנע היווצרות בועה כמו בועות ייצרו מרחב שלילי בתמונות CT ודורשים זמן רב תיקון ידני. חשוב לעסות בעדינות את הכבד על ידי גלגול על פני השטח שלו עם צמר גפן רטוב במהלך ואחרי הליך ההזרקה כמו זה מקל אפילו שרף מתפשט. לאחר השלמת הזרקה והסרת הצינורות, יש להדק את קשר תפר המשי במהירות ובזהירות, כך שהשרף אינו זורם מהכבד לפני שהוא מתמלא לחלוטין. עבור הדמיית microCT מוצלחת, המדגם חייב להיות קבוע כראוי במקום עם agarose ו מותאם תרמית כדי לחסל ממצאי תנועה בנתוני CT. הגדרות הרכישה הן גם בעלי חשיבות מרכזית, אשר צריך להיות אופטימיזציה כדי להגיע לפתרון מרחבי הולם כדי לפתור מבנים בסדר.
שינויים טכניים בהליך ההזרקה ניתן לבצע כדי להשיג הזרקה בעכברים צעירים. נכון לעכשיו, יציקת שרף של כבדי עכבר צעירים מוגבלת על ידי הזמינות של צינורות דקים מספיק, עם PE10 להיות הצינורות המסחריים הזמינים הקטן ביותר. Tanimizu ואח ‘ הזריק בהצלחה דיו פחמן לתוך יום עוברי 17 (E17) צינור מרה משותף באמצעות נימי זכוכית11. בדיקה עתידית אם שרף יכול להיות מועבר באמצעות נימי זכוכית ולכן יהיה עניין. DUCT הותאם עוד יותר להזרקת מערכות צינוריות אחרות כגון דרכי הנשימה ו vasculature עורק הריאות של הריאות9. הזרקת שרף כפול יכול גם להיות שונה כדי לשמש עם צפים אחרים זמינים מסחרית, או פרוטוקול זה יכול לשמש עבור זריקות עם דיו פחמן.
אחד הגורמים המגבילים העיקריים של צינור צינור הוא צמיגות שרף. צינור יכול לשמש רק עבור יציקת שרף של מבנים צינוריים מעל קוטר של 5 מיקרומטר. בערכת נתונים זו, השרף יכול לחדור צינורות עם הקוטר הקטן ביותר של 5μm9. מגבלת גודל זו מונעת ניתוח של ductules בסדר נימים קטנים. כדי לקדם עוד יותר את צינור DUCT לכלי קליבר קטנים יותר, שרפים אחרים הזמינים מסחרית צריכים להיבדק, או פיתוח של סוכני רדיו-צמיגות נמוכה חדשים עשוי לשפר את חדירת לומן.
ב Hankeova et al.9, DUCT הושווה לשתי טכניקות נפוצות אחרות, זריקות דיו פחמן כפול ואחריו ניקוי רקמות וצילום סטנדרטי, ו- iDISCO + עם כתמים של כלי הדם עם אקטין תא שריר חלק אלפא צינורות מרה עם ציטוקרטין 7, ואחריו הדמיה 3D9. DUCT השיג ביצועים טובים יותר משתי השיטות האחרות במונחים של ניתוח כפול (שהיה מאתגר עבור iDISCO+ עקב אוטופלואורסצנטיות כבד גבוהה), הדמיה תלת-ממדית וכימות (לא אפשרי עם הזרקת דיו פחמן), ולומניזציה (DUCT מספק נתונים עבור ארכיטקטורת לומן הפנימית זלוף המערכת). כפי שהוזכר לעיל, המגבלה העיקרית של DUCT היא גודל לומן המינימלי שניתן להזריק וניתוח (מגבלת 5 מיקרומטר), פרמטר שבו הן הזרקת דיו פחמן ו- iDISCO + ביצעו טוב יותר. DUCT עדיף על יציקת שרף מערכת אחת3,5,6 מכיוון שהוא מאפשר ניתוח של כל מערכת מוזרקת בנפרד וגם מאפשר חקירה תלת-ממדית כפולה כדי לחקור את היחסים האדריכליים בין שתי המערכות.
צינור ניתן להחיל כדי ללמוד כל שתי רשתות צינוריות בתלת-ממד. כהוכחה לעיקרון, DUCT שימש כדי לדמיין את מערכות ורידי המרה הכבד ואת עורק הריאות vasculature ודרכי הנשימה בריאות9. צינורות המרה התוך-היפים מתפתחים בסמוך לווריד הפורטל, וריד הפורטל מספק תבנית מבנית ומרכז איתות המסדיר את הצמיחה וההבחנה של עץ המרה12. ב Hankeova ואח ‘9, DUCT חקר התחדשות מרה במודל עכבר עבור מחלת הילדים האנושית תסמונת Alagille. DUCT חשף מנגנונים אדריכליים שלא דווחו בעבר שמערכת המרה השתמשה בהם כדי להשיג נפח דמוי סוג פראי9. עכברי תסמונת אלג’יל השתמשו בשתי אסטרטגיות שונות: (1) באזורים הילאר והמרכזיים של הכבד, מערכת המרה הגדילה את הסתעפותה, ו -(2) בפריפריה הכבדית, צינורות המרה שנוצרו על ידי דה נובו היו עינויים מאוד. שני גורמים אלה יחד כדי להניב נפח מערכת מרה כמעט נורמלי, למרות הארכיטקטורה החריגה. יתר על כן, DUCT זיהה הסתעפות צינור מרה חריג שהתרחש ללא תלות של הסתעפות וריד הפורטל צינורות מרה להרכיב גשרים מחברים בין שני ורידים פורטל9. פנוטיפים אלה יהיה בלתי אפשרי לזהות יציקת שרף יחיד יכול להתפרש לא נכון בחלקים היסתולוגיים 2D כמו התפשטות צינור המרה. כך מספק DUCT נתונים המתארים את הארכיטקטורה התלת-ממדית של שתי רשתות צינוריות בכל רמת האיבר או האונה עם אפשרות לניתוח כמותי איכותי ומעמיק. DUCT יכול להיות תקן חדש להתפתחות כבד לאחר הולדתי ניתוחי התחדשות הכבד במודלים שונים של בעלי חיים.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים לקארי הופרט וסטייסי הופרט על המומחיות והעזרה שלהם בנוגע לצינורות המרה והאירוח במעבדה שלהם. אנו מודים גם לנדיה שולץ ושרלוט ל. מאטסון על עזרתן בצינור צינור המרה המשותף.
אנו מודים לסוכנויות הענק הבאות על תמיכתן:
לעבודה במעבדת ERA: Karolinska Institutet (2-560/2015-280), שטוקהולם לאנס לנדסטינג (CIMED (2-538/2014-29)), רגנאר סודרברגס סטיפלסה (מענק ההתחלה של הקרן השבדית), האגודה האירופית לחקר הכבד (פרס דניאל אלגיל), קרן הלב-לונג השבדית (20170723) ו-Vetenskapsrådet (2019-01350).
לעבודה במעבדת JK: אנו מכירים בתשתית המחקר CzechNanoLab הנתמכת על ידי MEYS CR (LM2018110). J.K. הודות לתמיכתו של מענק FSI-S-20-6353.
1.5 mL SafeSeal micro tubes | Sarstedt | 72.706 | |
23 G butterfly needle with tubing | BD bioscience | 367283 | |
25 G needle | BD bioscience | 305122 | |
30 G needle | BD bioscience | 305106 | |
Agarose | Top-Bio | P045 | |
Benzyl alcohol | Sigma Aldrich | 108006 | |
Benzyl benzoate | Sigma Aldrich | B6630 | |
Corning 50 mL tubes | Sigma Aldrich | CLS430829-500EA | polypropylene |
Cotton swabs | Medicarier | 60406 | |
Dissection Microscope | Leica Camera AG | Leica M60 | |
Dulbecco's phosphate-buffered saline | ThermoFisher Scientific | 14190144 | |
Ethanol 70% | VWR | 83801.41 | |
Falcon tube 15 mL | Verkon | 331.850.084.006 | |
Forceps curved | Fine Science Tools | 11051-10 | Fine Graefe 10 cm curved |
Forceps straight | Fine Science Tools | 11050-10 | Fine Graefe 10 cm straight |
Formaldehyde solution | Sigma Aldrich | F8775 | |
GE Phoenix v|tome|x L 240 | Waygate Technologoies | micro computed tomography scanner | |
Hanks' Balanced Salt Solution | ThermoFisher Scientific | 14025092 | |
Heparin | Leo Pharma | B01AB01 | 5000 IE/mL |
Isolfurane | Baxter | FDG9623 | |
Methanol | ThermoFisher Scientific | 11413413 | |
MICROFIL | Flowtech | MV-122 | synthetic resin yellow |
MICROFIL | Flowtech | MV-120 | synthetic resin blue |
MICROFIL | Flowtech | MV-diluent | clear resin diluent |
Pasteur pipette | Verkon | 130.690.424.503 | |
Peristaltic pump | AgnThos | 010.6131.M20 | |
phoenix datos|x 2.0 software | Baker Hughes | CT data reconstruction software | |
Rocker | VWR | 444-0142 | |
Silk suture | AgnThos | 14757 | Black silk, 4-0, sterile, 100 m |
Skin scissor | Fine Science Tools | 14058-09 | Iris straight tip 9 cm |
Spring scissor | Fine Science Tools | 15000-03 | Vannas micro, straight tip 2 mm |
Syringe 1 mL Luer | BD bioscience | 303172 | |
Tubing PE10 | BD bioscience | 427401 | |
Tubing PE50 | BD bioscience | 427411 | |
VG Studio MAX 3.3 software | Volume Graphics GmbH | CT data processing and analysis software |