Un système d’analyse de flux pour les essais multiplexés à base de billes qui fournit une lecture à deux rapporteurs a été utilisé pour le développement de tests sérologiques et de neutralisation des anticorps multiplex qui peuvent mesurer simultanément les anticorps IgG et IgM neutralisants pour le SARS-CoV-2.
La pandémie de COVID-19 a souligné la nécessité de méthodes rapides à haut débit pour la détection sérologique sensible et spécifique de l’infection par de nouveaux agents pathogènes, tels que le SARS-CoV-2. Les tests sérologiques multiplex peuvent être particulièrement utiles car ils peuvent analyser simultanément les anticorps dirigés contre plusieurs antigènes, ce qui optimise la couverture des agents pathogènes et contrôle la variabilité de l’organisme et de la réponse individuelle de l’hôte. Nous décrivons ici un test basé sur la microsphère fluorescente 3-plex IgG 3-2 du SRAS-CoV-2 qui peut détecter à la fois les anticorps IgM et IgG dirigés contre trois antigènes majeurs du SARS-CoV-2 : la protéine spike (S), l’enzyme de conversion de l’angiotensine de pointe (ACE2) domaine de liaison aux récepteurs (RBD) et la nucléocapside (Nc). Il a été démontré que le test avait des performances comparables à celles d’un test de référence du SRAS-CoV-2 pour les IgG dans le sérum obtenu à ≥21 jours après l’apparition des symptômes, mais présentait une sensibilité plus élevée avec des échantillons prélevés à ≤5 jours après l’apparition des symptômes. De plus, en utilisant l’ACE2 soluble dans un format de test de neutralisation, l’inhibition de la liaison aux anticorps a été démontrée pour S et RBD.
La pandémie de COVID-19 a souligné l’importance de pouvoir développer et mettre en œuvre rapidement des tests sérologiques rapides, à haut débit et très performants qui peuvent être utilisés pour le diagnostic et la surveillance de nouveaux agents pathogènes tels que le SRAS-CoV-2. Les tests sérologiques multiplex peuvent être extrêmement utiles en cas de pandémie, car ils peuvent analyser simultanément les anticorps dirigés contre plusieurs antigènes, ce qui permet une large couverture des agents pathogènes et des contrôles de la variabilité de l’organisme et de la réponse de l’hôte à l’infection. Le développement d’un test multiplex à base de billes fluorescentes, le SARS-CoV-2 IgG 3Flex (3Flex), qui peut détecter les anticorps dirigés contre la protéine spike (S), le domaine de liaison aux récepteurs (RBD) de l’enzyme de conversion de l’angiotensine (ACE2) et la nucléocapside (Nc) du SARS-CoV-2 a récemment été rapporté1. Il a été démontré que 3Flex avait des performances comparables à celles d’un test de référence sars-CoV-2 IgG pour le sérum obtenu à ≥21 jours après l’apparition des symptômes, mais présentait une sensibilité plus élevée avec des échantillons prélevés à ≤5 jours après l’apparition des symptômes. De plus, l’inhibition de la liaison des anticorps a été démontrée pour les antigènes S et RBD à l’aide d’ACE2 soluble dans un format de test de neutralisation. La technologie à base de billes multiplex a été largement adoptée comme une technologie éprouvée pour les tests sérologiques multiplex et présente des avantages distincts pour le dépistage à grande échelle, notamment un court délai d’accès aux résultats, de petits échantillons et une main-d’œuvre réduite2,3,4.
Récemment, un nouvel instrument d’analyse de débit est devenu disponible qui offre la même capacité de haut niveau et à haut débit du système démontrée dans les travauxprécédents 1, mais avec l’avantage supplémentaire de deux canaux de rapporteur. La capacité de mesurer deux signaux rapporteurs fluorescents dans une seule réaction permet d’évaluer deux résultats par analyte pour chaque échantillon et est idéale pour les applications d’isotypage, qui doivent généralement être effectuées dans des puits de réaction distincts5. La capacité de double rapporteur fournit deux fois plus de données pour chaque échantillon dans deux fois moins de puits de réaction avec la moitié du volume d’échantillon requis, et présente donc un net avantage sur les systèmes de rapporteur unique. Cette étude détaille le protocole de dosage sérologique standard et décrit l’adaptation à un test de neutralisation. De plus, le présent rapport décrit la conversion du test rapporteur unique en un essai sérologique à double rapporteur et, par la suite, un essai de neutralisation à double rapporteur, afin de mesurer simultanément les anticorps neutralisants des isotypes IgG et IgM contre les antigènes SARS-CoV-2 S, RBD et Nc. Un aperçu visuel du protocole d’essai est fourni à la figure 1.
Cette étude a élargi la fonctionnalité d’un test de microsphère fluorescente multiplexe, 3Flex, qui évalue qualitativement la réponse des IgG à l’infection par le SRAS-CoV-21. Alors que de nombreux tests sérologiques pour COVID-19 détectent un seul antigène, ce test évalue simultanément les antigènes S, RBD et Nc, et comprend un contrôle interne de l’isotype d’anticorps7. De plus, l’ACE2 est utilisé comme indicateur pour détecter les titres d’anticorps neutralisants du SRAS-CoV-2.
Les tests multi-antigènes pourraient être particulièrement utiles à l’avenir pour discriminer les réponses immunitaires entre les personnes infectées et vaccinées. Avec le SARS-CoV-2, si seuls les anticorps S et RBD sont évalués, il serait impossible de discerner si cela est dû à une infection passée ou à une réponse vaccinale anticorps. Aucun des vaccins actuellement utilisés ne cible l’antigène Nc, de sorte qu’en évaluant les antigènes S/RBD et Nc, il est possible de distinguer une infection virale passée (Nc- et S/RBD-positive) d’une réponse vaccinale (S/RBD-positive uniquement; Nc-négatif).
Dans la présente étude, les essais sérologiques et de neutralisation 3Flex (sections 5 et 6) ont été transférés sur un nouvel instrument d’analyse de flux à double rapporteur (sections 7 et 8). Les protocoles d’immunodosage typiques pour les tests multiplex à base de billes sont similaires aux protocoles ELISA standard, suivant des étapes comparables pour l’incubation de l’échantillon, l’incubation des anticorps de détection / rapporteurs et l’analyse des résultats8. Des études antérieures ont également démontré comment les tests ELISA standard peuvent être transférés sur une plate-forme de multiplexage à base deperles 9.
Les protocoles d’essai pourraient être transférés de manière transparente de l’instrument de rapporteur unique prédécesseur au nouveau système de rapporteur double, comme le montrent les résultats obtenus pour les échantillons d’essai et les contrôles(figure 4 et figure 5). Dans le test sérologique, tous les échantillons sériques positifs ont démontré une diminution caractéristique du signal sensible à la dose correspondant à la fois à une dilution plus élevée de l’échantillon et à une concentration d’anticorps de détection plus faible, tandis que les signaux pour les échantillons négatifs sont restés aux niveaux de fond. De même, pour le test de neutralisation, la diminution des signaux pour S et RBD, mais pas Nc, correspondait à des concentrations croissantes du concurrent ACE2, tandis que le sérum dépouillé d’IgG était beaucoup moins affecté par l’ajout d’ACE2. La pré-incubation des billes avec ACE2 pendant 2 minutes avant l’ajout de l’échantillon de sérum (comme décrit dans les rubriques 6 et 8), a également été comparée à la combinaison des perles avec ACE2 et sérum en même temps et a produit peu de différence dans les résultats (données non montrées). Cependant, comme les résultats obtenus avec les billes plus l’étape de pré-incubation ACE2 étaient plus cohérents, c’était la procédure finale adoptée pour le protocole de test de neutralisation (sections 6 et 8).
Étant donné que le système de rapporteur double intègre un deuxième canal rapporteur fluorescent, les deux essais ont été convertis en essais d’isotypage pour mesurer simultanément les réponses IgG et IgM. La fonctionnalité de double rapporteur de l’analyseur de débit permet de présager des signaux fluorescents à partir de deux réactifs de détection de rapporteur pour chaque analyte dans le multiplex pour chaque échantillon, doublant ainsi les données générées par échantillon dans un essai. Pour le développement et l’optimisation des protocoles de test à double rapporteur, plusieurs colorants rapporteurs et anticorps de détection disponibles dans le commerce ont été évalués pour le nouveau canal RP2(figure 7 et figure 8)afin de déterminer la ou les meilleures options disponibles. L’anticorps anti-IgM conjugué avec le colorant rapporteur DL 405 n’a pas bien fonctionné dans le canal RP2 (Figure 7), de sorte que la biotine anti-IgG avec SASB a ensuite été évaluée pour détection dans le canal RP2 (Figure 8). Trois combinaisons de réactifs de détection RP1 et RP2 ont été comparées dans le test de neutralisation à double rapporteur(tableau 1 et figure 9)afin de déterminer les combinaisons les plus performantes pour la détection simultanée d’anticorps neutralisants IgG et IgM. Bien qu’il y ait eu des différences significatives dans l’intensité du signal entre le canal RP1 utilisant PE-anti IgM et le canal RP2 utilisant DL 549 anti-IgM, il n’y avait pas de différence significative dans la mesure du pourcentage d’inhibition de liaison par ACE2.
Plusieurs limites à la méthode actuelle et à la présente étude sont reconnues. Tout d’abord, les échantillons testés et utilisés dans le développement et l’optimisation de la méthode ont été limités à des ensembles de 8 à 11 échantillons. D’autres échantillons seront testés dans le cadre d’études approfondies pour vérifier que la méthode est entièrement optimisée. Deuxièmement, un nombre limité de fluorophores rapporteurs et de paires de rapporteurs ont été testés. Des tests supplémentaires de tous les rapporteurs disponibles dans toutes les combinaisons possibles détermineront quels réactifs peuvent être utilisés avec succès dans cette méthode. L’anticorps anti-IgG conjugué à la biotine était différent de l’anticorps anti-IgG conjugué au rapporteur BV 421. Ainsi, bien qu’il existe une variabilité de l’intensité du signal pour l’anti-IgG BV 421, elle pourrait être due à la spécificité de l’anticorps et non au colorant rapporteur. L’essai d’autres anticorps conjugués BV 421 disponibles peut identifier un autre anticorps qui fonctionnerait bien dans le canal RP2. Des études futures évalueront également la combinaison d’anti-IgM PE avec des IgG anti-humaines BV 421 pour la détection dans RP1 et RP2, respectivement. Enfin, même avec la capacité de double rapporteur de l’instrument, les essais sont limités à deux isotypes (deux paramètres) par réaction. Si des isotypes supplémentaires doivent être mesurés ou si un isotypage complet est souhaité, des réactions supplémentaires utilisant les deux mêmes canaux rapporteurs devront être exécutées dans des puits distincts.
La technologie de multiplexage à base de billes permet une conception de test rapide et flexible avec une mise en œuvre facile dans les flux de travail de laboratoire de routine3,4,10. Cette étude a démontré la facilité de transfert des tests sérologiques et de neutralisation 3Flex décrits précédemment pour le SARS-CoV-2 sur un système d’analyse de débit pour mesurer les IgG avec un seul rapporteur, ou avec une légère modification, mesurant simultanément les réponses IgG et IgM à l’aide de deux rapporteurs. L’option à double rapporteur présente des avantages évidents par rapport aux plates-formes de rapporteur unique, car elle peut fournir deux fois plus de données par échantillon, en utilisant la moitié du volume d’échantillon et la moitié du nombre de puits de réaction. Avec les colorants rapporteurs et les anticorps de détection appropriés, les tests d’isotypage peuvent être facilement développés et effectués sur l’instrument d’analyse de flux à double rapporteur.
The authors have nothing to disclose.
Ce rapport a été financé par Luminex Corporation (Austin, TX). Les auteurs remercient Matthew Silverman PhD (Biomedical Publishing Solutions, Delray Beach, FL) pour son aide à l’édition scientifique.
ACE2 (human) (rec.) | AdipoGen Life Sciences | AG-40B-0192-3050 | |
Biotin-SP (long spacer) AffiniPure Goat Anti-Human IgG, Fcγ fragment specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-065-098 | |
Bovine Serum Albumin | MilliporeSigma | A7888 | Sigma-Aldrich |
Branson 1800 Cleaner/water bath sonicator | Various | ||
Brilliant Violet 421 AffiniPure Donkey Anti-Human IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 709-675-149 | |
Corning 96-well Black Flat Bottom Polystyrene NBS Microplate | Corning | 3650 | |
Corning 96-well Microplate Aluminum Sealing Tape, Nonsterile | Corning | 6570 | |
DyLight 405 AffiniPure Goat Anti-Human IgM, Fc5μ fragment specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-475-043 | |
DyLight 549 AffiniPure F(ab')2 Goat Anti-Human IgM Fc5μ specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-506-129 | Discontinued but available from multiple vendors |
eBioscience Streptavidin Super Bright 436 Conjugate | ThermoFisher Scientific | 62-4317-82 | |
Fisherbrand Incubating Microplate Shaker | ThermoFisher Scientific | 02-217-757 | Fisher Scientific |
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, PE | ThermoFisher Scientific | P-2771MP | |
Luminex Magnetic Plate Separator | Luminex Corporation | CN-0269-01 | |
MagPlex beads | Luminex Corporation | MC100XX-ID | |
PE AffiniPure F(ab')2 Goat Anti-Human IgM Fc5μ specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-116-129 | |
Phosphate Buffered Saline | MilliporeSigma | P3813 | Sigma-Aldrich |
SARS Nucleocapsid Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56683 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS Nucleocapsid Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56049 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein A purified |
SARS Spike Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56047 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS Spike Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56048 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike S1 Antibody, Rabbit MAb | SinoBiological | 40150-R007 | |
Sodium Azide | MilliporeSigma | S2002 | Sigma-Aldrich |
Streptavidin, R-Phycoerythrin Conjugate (SAPE) | ThermoFisher Scientific | S21388 | premium grade |
Tube Revolver/ Rotator | ThermoFisher Scientific | 88881001 | |
TWEEN 20 | MilliporeSigma | P9416 | Sigma-Aldrich |
xMAP Antibody Couplng Kit | Luminex Corporation | 40-50016 | |
xMAP INTELLIFLEX DR-SE | Luminex Corporation | INTELLIFLEX-DRSE-RUO |