Un sistema di analisi di flusso per saggi multiplexati basati su perle che fornisce una lettura a due reporter è stato utilizzato per lo sviluppo di saggi sierologici multiplex e di neutralizzazione degli anticorpi in grado di misurare contemporaneamente gli anticorpi IgG e IgM neutralizzanti per SARS-CoV-2.
La pandemia di COVID-19 ha sottolineato la necessità di metodi rapidi ad alto rendimento per il rilevamento sierologico sensibile e specifico dell’infezione da nuovi agenti patogeni, come SARS-CoV-2. Il test sierologico multiplex può essere particolarmente utile perché può analizzare contemporaneamente gli anticorpi contro più antigeni che ottimizzano la copertura dei patogeni e controlla la variabilità nell’organismo e la risposta individuale dell’ospite. Qui descriviamo un test basato su microsfera fluorescente SARS-CoV-2 IgG 3-plex in grado di rilevare sia gli anticorpi IgM che IgG a tre principali antigeni SARS-CoV-2: la proteina spike (S), il dominio di legame del recettore (RBD) dell’enzima di conversione dell’angiotensina spike (ACE2) e il nucleocapside (Nc). Il test ha dimostrato di avere prestazioni comparabili a un test di riferimento SARS-CoV-2 per IgG nel siero ottenuto a ≥21 giorni dall’insorgenza dei sintomi, ma aveva una maggiore sensibilità con campioni raccolti a ≤5 giorni dall’insorgenza dei sintomi. Inoltre, utilizzando ACE2 solubile in un formato di test di neutralizzazione, è stata dimostrata l’inibizione del legame anticorpale per S e RBD.
La pandemia di COVID-19 ha sottolineato l’importanza di essere in grado di sviluppare e implementare rapidamente test sierologici rapidi, ad alto rendimento e ad alte prestazioni che possono essere utilizzati per la diagnosi e la sorveglianza di nuovi agenti patogeni come SARS-CoV-2. I test sierologici multiplex possono essere estremamente utili in una pandemia, in quanto possono analizzare contemporaneamente gli anticorpi contro più antigeni, il che fornisce un’ampia copertura patogena e controlli per la variabilità nell’organismo e la risposta dell’ospite all’infezione. Lo sviluppo di un test multiplo basato su perle fluorescenti, il SARS-CoV-2 IgG 3Flex (3Flex), in grado di rilevare anticorpi contro la proteina spike (S), il dominio di legame del recettore (RBD) dell’enzima di conversione dell’angiotensina spike (ACE2) e il nucleocapside (Nc) di SARS-CoV-2 è stato recentemente riportato1. 3Flex ha dimostrato di avere prestazioni comparabili a un test di riferimento SARS-CoV-2 IgG per siero ottenuto a ≥21 giorni dall’insorgenza dei sintomi, ma ha avuto una sensibilità più elevata con campioni raccolti a ≤5 giorni dall’insorgenza dei sintomi. Inoltre, è stata dimostrata l’inibizione del legame anticorpale per gli antigeni S e RBD utilizzando ACE2 solubile in un formato di test di neutralizzazione. La tecnologia basata su perle multiplex è stata ampiamente adottata come tecnologia collaudata per i test sierologici multiplex e presenta vantaggi distinti per lo screening su larga scala, tra cui tempi brevi per i risultati, requisiti di piccoli campioni e manodopera ridotta2,3,4.
Recentemente, è diventato disponibile un nuovo strumento di analisi del flusso che fornisce la stessa capacità high-plex e ad alto throughput del sistema dimostrata nel precedente lavoro1, ma con l’ulteriore vantaggio di due canali reporter. La capacità di misurare due segnali reporter fluorescenti in una singola reazione consente la valutazione di due risultati per analita per ciascun campione ed è ideale per applicazioni di isotipizzazione, che in genere devono essere eseguite in pozzetti di reazione separati5. La capacità dual reporter fornisce il doppio dei dati per ciascun campione nella metà dei pozzi di reazione con la metà dei requisiti di volume del campione, e quindi ha un chiaro vantaggio rispetto ai sistemi a singolo reporter. Questo studio descrive in dettaglio il protocollo di test sierologico standard e descrive l’adattamento a un test di neutralizzazione. Inoltre, questo rapporto descrive la conversione del test del singolo reporter in un test sierologico a doppio reporter e, successivamente, un test di neutralizzazione del doppio reporter, per misurare simultaneamente gli anticorpi neutralizzanti degli isotipi IgG e IgM contro gli antigeni SARS-CoV-2 S, RBD e Nc. Una panoramica visiva del protocollo di analisi è fornita nella Figura 1.
Questo studio ha ampliato la funzionalità di un test multisplo di microsfere fluorescenti, 3Flex, che valuta qualitativamente la risposta IgG all’infezione da SARS-CoV-21. Mentre molti test sierologici per COVID-19 rilevano un singolo antigene, questo test valuta contemporaneamente gli antigeni S, RBD e Nc e include un controllo interno dell’isotipo anticorpale7. Inoltre, ACE2 viene utilizzato come indicatore per rilevare i titoli anticorpali neutralizzanti a SARS-CoV-2.
I saggi multigenici possono essere particolarmente utili in futuro per discriminare le risposte immunitarie tra persone infette e vaccinate. Con SARS-CoV-2, se vengono valutati solo gli anticorpi S e RBD, sarebbe impossibile discernere se ciò fosse dovuto a un’infezione passata o a una risposta anticorpale vaccinale. Nessuno dei vaccini attualmente in uso ha come bersaglio l’antigene Nc, quindi valutando gli antigeni S/RBD e Nc, è possibile distinguere l’infezione virale passata (Nc- e S/RBD-positiva) da una risposta vaccinale (solo S/RBD-positiva; Nc-negativo).
Nel presente studio, i saggi sierologici e di neutralizzazione 3Flex (sezioni 5 e 6) sono stati trasferiti su un nuovo strumento di analisi del flusso a doppio reporter (sezioni 7 e 8). I protocolli di immunosaggio tipici per i saggi multiplex basati su perle sono simili ai protocolli ELISA standard, seguendo passaggi comparabili per l’incubazione del campione, l’incubazione di anticorpi / reporter di rilevamento e l’analisi dei risultati8. Studi precedenti hanno anche dimostrato come i saggi ELISA standard possono essere trasferiti su una piattaforma di multiplexing basata su perle9.
I protocolli di analisi potrebbero essere trasferiti senza soluzione di continuità dal precedente strumento a singolo reporter al nuovo sistema a doppio reporter, come dimostrano i risultati ottenuti per i campioni e i controlli di prova (Figura 4 e Figura 5). Nel test sierologico, tutti i campioni di siero positivi hanno dimostrato una caratteristica diminuzione del segnale dose-responsiva corrispondente sia a una maggiore diluizione del campione che a una minore concentrazione di anticorpi di rilevamento, mentre i segnali per i campioni negativi sono rimasti a livelli di fondo. Allo stesso modo, per il test di neutralizzazione, i segnali decrescenti per S e RBD, ma non Nc, corrispondevano a concentrazioni crescenti del concorrente ACE2, mentre il siero spogliato di IgG era molto meno influenzato dall’aggiunta di ACE2. La pre-incubazione delle perle con ACE2 per 2 minuti prima dell’aggiunta del campione di siero (come descritto nei paragrafi 6 e 8), è stata anche confrontata con la combinazione delle perle con ACE2 e siero allo stesso tempo e ha prodotto una piccola differenza nei risultati (dati non mostrati). Tuttavia, poiché i risultati ottenuti con le perle più la fase di pre-incubazione ACE2 erano più coerenti, è stata la procedura finale adottata per il protocollo di test di neutralizzazione (sezioni 6 e 8).
Poiché il sistema dual reporter incorpora un secondo canale reporter fluorescente, entrambi i saggi sono stati convertiti in saggi di isotipizzazione per misurare contemporaneamente le risposte IgG e IgM. La funzionalità dual reporter dell’analizzatore di flusso consente la raccolta di segnali fluorescenti da due reagenti di rilevamento reporter per ciascun analita nel multiplex per ciascun campione, raddoppiando efficacemente i dati generati per campione in un test. Per lo sviluppo e l’ottimizzazione dei protocolli di analisi dual reporter, sono stati valutati diversi coloranti reporter disponibili in commercio e anticorpi di rilevamento per il nuovo canale RP2 (Figura 7 e Figura 8) per determinare le migliori opzioni disponibili. L’anticorpo anti-IgM coniugato con il colorante reporter DL 405 non ha funzionato bene nel canale RP2 (Figura 7), quindi la biotina anti-IgG con SASB è stata successivamente valutata per il rilevamento nel canale RP2 (Figura 8). Tre combinazioni di reagenti di rilevamento RP1 e RP2 sono state confrontate nel test di neutralizzazione a doppio reporter (Tabella 1 e Figura 9) per determinare le combinazioni più performanti per il rilevamento simultaneo di anticorpi neutralizzanti IgG e IgM. Mentre c’erano differenze significative nell’intensità del segnale tra il canale RP1 che utilizzaVA PE-anti IgM e il canale RP2 che utilizzava DL 549 anti-IgM, non vi era alcuna differenza significativa nella misurazione dell’inibizione percentuale del legame da parte di ACE2.
Diverse limitazioni al metodo attuale e questo studio sono riconosciuti. In primo luogo, i campioni testati e utilizzati nello sviluppo e nell’ottimizzazione del metodo erano limitati a serie di 8-11 campioni. Altri campioni saranno testati in studi ampliati per verificare che il metodo sia completamente ottimizzato. In secondo luogo, è stato testato un numero limitato di fluorofori reporter e coppie di reporter. Ulteriori test di tutti i reporter disponibili in tutte le possibili combinazioni determineranno quali reagenti possono essere utilizzati con successo in questo metodo. L’anticorpo anti-IgG coniugato alla biotina era diverso dall’anticorpo anti-IgG coniugato al reporter BV 421. Quindi, sebbene esistesse variabilità nell’intensità del segnale per l’anti-IgG BV 421, potrebbe essere dovuta alla specificità dell’anticorpo e non correlata al colorante reporter. Il test di altri anticorpi coniugati BV 421 disponibili può identificare un altro anticorpo che funzionerebbe bene nel canale RP2. Studi futuri valuteranno anche la combinazione di PE anti-IgM con BV 421 anti-human IgG per il rilevamento in RP1 e RP2, rispettivamente. Infine, anche con la capacità di doppio reporter dello strumento, i saggi sono limitati a due isotipi (due parametri) per reazione. Se devono essere misurati isotipi aggiuntivi o si desidera un isotipizzazione completa, allora ulteriori reazioni utilizzando gli stessi due canali reporter dovrebbero essere eseguite in pozzi separati.
La tecnologia di multiplexing basata su perle consente una progettazione rapida e flessibile del saggio con una facile implementazione nei flussi di lavoro di laboratorio di routine3,4,10. Questo studio ha dimostrato la facilità nel trasferire i saggi sierologici e di neutralizzazione 3Flex precedentemente descritti per SARS-CoV-2 su un sistema di analisi del flusso per misurare IgG con un singolo reporter, o con lievi modifiche, misurando contemporaneamente sia le risposte IgG che IgM utilizzando due reporter. L’opzione dual reporter ha chiari vantaggi rispetto alle piattaforme a singolo reporter perché può fornire il doppio dei dati per campione, utilizzando metà del volume del campione e metà del numero di pozzi di reazione. Con i coloranti reporter appropriati e gli anticorpi di rilevamento, i saggi di isotipizzazione possono essere facilmente sviluppati ed eseguiti sullo strumento di analisi del flusso a doppio reporter.
The authors have nothing to disclose.
Questo rapporto è stato finanziato da Luminex Corporation (Austin, TX). Gli autori ringraziano Matthew Silverman PhD (Biomedical Publishing Solutions, Delray Beach, FL) per l’assistenza all’editing scientifico.
ACE2 (human) (rec.) | AdipoGen Life Sciences | AG-40B-0192-3050 | |
Biotin-SP (long spacer) AffiniPure Goat Anti-Human IgG, Fcγ fragment specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-065-098 | |
Bovine Serum Albumin | MilliporeSigma | A7888 | Sigma-Aldrich |
Branson 1800 Cleaner/water bath sonicator | Various | ||
Brilliant Violet 421 AffiniPure Donkey Anti-Human IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 709-675-149 | |
Corning 96-well Black Flat Bottom Polystyrene NBS Microplate | Corning | 3650 | |
Corning 96-well Microplate Aluminum Sealing Tape, Nonsterile | Corning | 6570 | |
DyLight 405 AffiniPure Goat Anti-Human IgM, Fc5μ fragment specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-475-043 | |
DyLight 549 AffiniPure F(ab')2 Goat Anti-Human IgM Fc5μ specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-506-129 | Discontinued but available from multiple vendors |
eBioscience Streptavidin Super Bright 436 Conjugate | ThermoFisher Scientific | 62-4317-82 | |
Fisherbrand Incubating Microplate Shaker | ThermoFisher Scientific | 02-217-757 | Fisher Scientific |
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, PE | ThermoFisher Scientific | P-2771MP | |
Luminex Magnetic Plate Separator | Luminex Corporation | CN-0269-01 | |
MagPlex beads | Luminex Corporation | MC100XX-ID | |
PE AffiniPure F(ab')2 Goat Anti-Human IgM Fc5μ specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-116-129 | |
Phosphate Buffered Saline | MilliporeSigma | P3813 | Sigma-Aldrich |
SARS Nucleocapsid Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56683 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS Nucleocapsid Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56049 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein A purified |
SARS Spike Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56047 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS Spike Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56048 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike S1 Antibody, Rabbit MAb | SinoBiological | 40150-R007 | |
Sodium Azide | MilliporeSigma | S2002 | Sigma-Aldrich |
Streptavidin, R-Phycoerythrin Conjugate (SAPE) | ThermoFisher Scientific | S21388 | premium grade |
Tube Revolver/ Rotator | ThermoFisher Scientific | 88881001 | |
TWEEN 20 | MilliporeSigma | P9416 | Sigma-Aldrich |
xMAP Antibody Couplng Kit | Luminex Corporation | 40-50016 | |
xMAP INTELLIFLEX DR-SE | Luminex Corporation | INTELLIFLEX-DRSE-RUO |