Nous décrivons une méthode pour obtenir des cultures primaires des photorécepteurs de cône de la rétine des embryons de poulet et son utilisation pour le criblage de contenu élevé.
La vision diurne humaine repose sur la fonction des photorécepteurs cononiques au centre de la rétine, la fovéa. Les patients souffrant de la forme la plus répandue de dégénérescence rétinienne héréditaire, la rétinite pigmentaire, perdent la vision nocturne en raison de la perte de photorécepteurs à tiges induite par mutation, un phénomène suivi d’une perte progressive de fonction et de la mort des cônes conduisant à la cécité. Les généticiens ont identifié de nombreux gènes avec des mutations causant cette maladie, mais les premières mutations identifiées ont remis en question les mécanismes de la dégénérescence du cône secondaire et comment une mutation dominante dans le gène de la rhodopsine codant pour le pigment visuel exprimé exclusivement en bâtonnets peut déclencher la dégénérescence du cône.
Ce résultat des transplantations dans un modèle génétique de la maladie a conduit au concept d’interactions cellulaires entre les tiges et les cônes et de dégénérescence autonome non cellulaire des cônes dans toutes les formes génétiques de la rétinite pigmentaire.
Les cônes représentent 5% de tous les photorécepteurs chez l’homme et seulement 3% chez la souris, de sorte que leur étude est difficile chez ces espèces, mais les cônes sont plus nombreux que les tiges chez les espèces d’oiseaux. Nous avons adapté des plaques de 96 puits pour la culture de précurseurs rétiniennes de la rétine d’embryons de poulet au stade 29 de leur développement. Dans ces cultures primaires, les cônes représentent 80% des cellules après différenciation in vitro. Les cellules dégénèrent sur une période d’une semaine en l’absence de sérum. Ici, nous décrivons les méthodes et leur normalisation.
Ce système cône-enrichi de culture a été employé pour identifier le facteur épithélium-dérivé de viabilité de cône (EdCVF) par le criblage de contenu élevé d’une bibliothèque normalisée d’ADNc pigmentée pigmentée rétinienne de rat. L’EdCVF recombinant empêche la dégénérescence des cônes.
La rétine des espèces de vertébrés est double, avec des photorécepteurs de tige pour la vision de la lumière tamisée et des photorécepteurs de cône pour la lumière du jour, la couleur et la vision de l’acuité. L’acuité visuelle des primates repose sur une région au centre de la rétine, appelée fovéa, qui est enrichie en cônes, mais dans l’ensemble, les cônes ne représentent que 5% de tous les photorécepteurs. Par conséquent, l’analyse des cônes dans la rétine des primates et en particulier la culture des cônes sont techniquement difficiles. Toutes les autres espèces de mammifères n’ont pas de fovéa et le pourcentage de cônes est faible pour les rongeurs qui sont le plus couramment utilisés dans la recherche sur la rétine. Ce n’est pas le cas pour les espèces aviaires, pour lesquelles les cônes dominent la rétine de ces espèces d’oiseaux bien voyantes. Les dinosaures, qui ont dominé l’écosystème lorsque les mammifères sont apparus pour la première fois au cours de l’évolution, sont à l’origine phylogénétique des oiseaux1. En conséquence d’une telle compétition entre les dinosaures et les premiers mammifères, les mammifères sont pour la plupart nocturnes avec des rétines dominées par des bâtonnets. Ce n’est que plus tard au cours de l’évolution que la vision diurne de certaines espèces de mammifères, parmi lesquelles appartiennent les primates, est devenue un avantage évolutif. Néanmoins, la période ancestrale reste comme un atavisme du goulot d’étranglement nocturne dans l’évolution de la vision des mammifères2,3.
En étudiant la différenciation cellulaire rétinienne, Adler et Hatlee ont montré que les photorécepteurs représentent environ 70% des cellules différenciées rétiniennes dans les cultures dérivées du poulet au jour embryonnaire (DE) 6 ou au stade 294. En raison de la prévalence des cônes dans la rétine du poulet, des cultures de cellules rétiniennes à partir d’embryons de poulet ED6 ont été développées en tant que cultures enrichies encônes 5.
L’importance de l’acuité visuelle cône-négociée pour l’homme est un truisme. Les personnes touchées par des maladies génétiques ou vieillissantes qui modifient la fonction du cône sont grandement handicapées. Cela a favorisé un très grand nombre d’études sur les dégénérescences rétiniennes héréditaires (IRD) dans le but de trouver des traitements pour ces maladies aveuglantes6,7. Le premier succès, obtenu à l’aide d’un vecteur adéno-associé recombinant (VAA) pour le traitement d’une forme sévère d’amaurose congénitale (ACV) IRD Leber, est une preuve de concept pour la thérapiegénique 8. L’identification des gènes dont les mutations déclenchent l’IRD ouvre la possibilité de guérir ces maladies par thérapie génique. Néanmoins, ces maladies résultent de mutations dans plus de 200 gènes distincts9. Même dans le cas des formes autosomiques récessives d’IRD, lorsque la réintroduction de la copie normale du gène morbide pourrait restaurer la fonction visuelle, le coût économique de chaque développement individuel favorise les plus répandus au détriment des moins communs et de ceux dont l’origine génétique reste inconnue. Ce fait a amené les chercheurs à réfléchir à des thérapies plus générales. La mort cellulaire apoptotique est apparue comme une voie commune, et une cible thérapeutique de ces maladies qui progressent par la dégénérescence des photorécepteurs, notamment pour les formes autosomiques dominantes10,11. Cependant, les succès d’une telle approche sont absents. Pour la forme la plus courante d’IRD, la rétinite pigmentaire (RP), la voie commune est la perte secondaire de fonction finalement suivie de la dégénérescence des cônes12,13. La prévention de la perte de la fonction conique préservera la vision centrale de la fovéa indépendamment des mutations causales14.
Au stade précoce de la RP, la perte de tiges déclenche une réduction de l’expression du facteur de viabilité du cône dérivé de la tige (RdCVF), codé par le gène nucléoréo-comme 1(NXNL1),qui interrompt la signalisation métabolique et redox entre les tiges et les cônes15. L’administration d’un AAV recombinant codant pour les deux produits du gène NXNL1, le facteur trophique RdCVF et l’enzyme thiorédoxine RdCVFL, pourrait théoriquement prévenir la perte de vision conique sous toutes les formes génétiques de RP16. Nous avons montré que le produit du gène NXNL1, RdCVFL, s’exprime dans les cultures enrichies en cônes de poulet17 et où il joue un rôle protecteur18. RdCVF et le gène NXNL1 ont été identifiés par le criblage à haute teneur d’une bibliothèque rétinienne d’ADNc utilisant la survie des cellules d’une culture cône-enrichie comme lecture19. Nous avons examiné l’équivalent de 210 000 clones individuels de la bibliothèque à l’aide de 8 tests parallèles pour chaque clone. Cela représente un très grand nombre de tests nécessitant un accès facile au matériel biologique, aux rétines des embryons de poulet. Nous avons constaté qu’il était relativement facile d’obtenir des œufs de poule embryonnaires sur une base hebdomadaire parce qu’ils sont largement produits pour l’agro-industrie pour les poules pondeuses et les poulets producteurs de viande. Après une normalisation minutieuse des cultures enrichies en cônes, le système fournit un moyen facile, robuste et reproductible de tester des milliers de molécules pour leur capacité à préserver la viabilité du cône. Ces cellules se présentent également à des manipulations génétiques20 qui bénéficient à l’étude de la transduction du signal et aux analyses biochimiques21,22,23.
Les chercheurs rétiniennes ont développé des méthodes alternatives comme l’utilisation de la lignée cellulaire cononique 661W24,25,26. Néanmoins, l’identité de cette lignée cellulaire reste controversée27,28. Les cellules 661W ont été clonées des tumeurs rétiniennes d’une ligne transgénique de souris qui exprime le grand antigène SV40 de T sous le contrôle de l’promoteur rétinol-contraignant humain de protéine d’interphotoreceptor. Sv40 grand antigène de T négocie la transformation cellulaire et l’immortalisation. En conséquence, la voie de signalisation identifiée à l’aide de cellules 661W doit être rapportée dans le contexte d’une lignée cellulaire transformée et immortalisée qui est distincte à bien des égards des cônes in situ. À cet égard, le système de culture enrichi en cônes est composé de neurones primaires, les cônes qui sont plus physiologiquement pertinents.
Bien qu’il soit possible d’obtenir une culture pure de photorécepteurs en utilisant le sectionnement vibratome de la rétine de souris, le très faible pourcentage de cônes dans la rétine externe des rongeurs rend cette approche inadaptée à la production de cultures enrichies encônes 29. La rétine porcine ne contient pas de fovéa mais a une région appelée zone centralis qui est très enrichie en cônes30. La forte proportion de cônes dans les rongeurs diurnes de la rétine, comme Arvicanthis ansorgei et Psammomys obsesus31,32, offre une solution possible mais nécessite la reproduction de telles espèces exotiques. Les yeux de porc adultes, recueillis dans les abattoirs locaux, peuvent être utilisés pour produire une culture mixte de tiges et de cônes qui ont été utilisés pour étudier la survie des photorécepteurs33. Une solution élégante consiste à pré-purifier les cônes de la rétine porcine en utilisant un panoramique avec de la lectine d’agglutinine d’arachide (PNA), qui se lie sélectivement aux cônes34. Néanmoins, cette méthode est difficile à mettre en œuvre à grande échelle en raison de sa complexité.
Les cellules souches pluripotentes induites par l’homme (iPS) offrent l’approche la plus prometteuse pour obtenir une population de cellules photoréceptrices coniques qui peut être utilisée pour la transplantation rétinienne mais qui peut également être adaptée à la culture enrichie en cône35,36. Étant donné que le facteur de transcription NRL est requis pour les photorécepteurs à tige37,la souris Nrl-/- possède une rétine dominée par des cônes à ondes courtes (cônes S). L’inactivation pourrait être utilisée pour produire une préparation enrichie en côneS en S par différenciation de l’homme par rapport à iPS38,39. Une autre approche possible consiste à promouvoir la différenciation du cône à l’aide de la signalisation de l’hormone thyroïdienne40. Alors que de nouvelles méthodes de production de cultures enrichies en cônes à partir d’iPS humains émergent, les embryons de poulet fournissent une méthode éprouvée actuelle19.
La culture enrichie en cône a joué un rôle déterminant dans l’identification du RdCVF par clonage d’expression19. Ce système a également été utilisé avec succès pour démontrer que le RdCVF stimule l’absorption du glucose et son métabolisme par glycolyse aérobie22. En outre, une culture enrichie en cônes a été utilisée pour valider le rôle protecteur de RdCVFL, le deuxième produit du gène NXNL1 23. Plus récemment, ce système a été utilisé pour démontrer l’existence de molécules protectrices sécrétées par des cellules épithéliales pigmentées rétiniennes transduites avec OTX241.
Parmi les nombreux paramètres qui pourraient limiter la production d’une culture enrichie en cônes à partir d’embryons de poulet, la première étape critique consiste à identifier avec précision le stade de développement des embryons dans les œufs éclos. Il a été observé que la culture de cellules à partir des rétines d’embryons à ED8 (34e stade) ne produit que 35% de photorécepteurs, les 65% restants provenant d’autres neurones4. Quelle que soit la logistique appliquée pour obtenir les œufs éclos, il est nécessaire d’affiner la température et le temps d’incubation, et d’examiner attentivement les embryons par rapport aux images de référence de tous les stades de développement42,45.
À l’origine, le système de culture enrichi en cônes a été développé en utilisant la souche White Leghorn4. La couleur blanche des œufs de cette souche n’est pas particulièrement appréciée en France, nous avons donc utilisé une souche de poulet qui produit des œufs bruns. Nous avons utilisé la souche I 657, qui est faite en croisant I 66 coqs avec des poules JA575. Nous avons pu reproduire les caractéristiques des cultures originales. Cela montre que le fond génétique du poulet n’est pas essentiel pour obtenir des cultures enrichies en cônes.
Nous n’avons pas testé l’effet de l’élimination individuelle des suppléments dans le milieu de culture, mais avons observé que l’insuline joue un rôle critique conformément à l’effet de l’insuline sur la survie des cônes chez la souris rd1, un modèle de RP récessif autosomal46. La triiodothyronine (T3) peut également participer à la différenciation des cellules précurseurs rétiniennes de l’embryon de poulet en cônes en fonction du rôle du récepteur de l’hormone thyroïdienne dans le devenir des cellules rétiniennes au cours du développement40. Par conséquent, le système de culture enrichi en cône ne peut pas être utilisé pour identifier l’insuline par clonage d’expression46.
Le système de culture enrichi en cônes repose sur la culture de neurones primaires et est beaucoup plus approprié tha méthodes s’appuyant sur l’utilisation de cellules immortalisées comme la lignée cellulaire 661W24,25,26.
Le procédé décrit ici peut être modifié en effectuant une électroporation préalable avec de l’ADN plasmidique20. Avant de préparer la suspension cellulaire rétinienne, toute la rétine est placée dans la chambre d’un électroporateur sur mesure avec 120 μL de 0,5 μg/μL d’ADN plasmidique dans 10 mM Tris-HCl pH 8,0, 1 mM d’EDTA. Cinq impulsions de 15 V pour 50 ms chacune sont appliquées séparées par un intervalle de 950 ms22. Les tentatives d’administration d’ARN interférent (ARNi) à l’aide des rétrovirus d’épissage aviaire (RCAS) compétents en réplication dans des cultures enrichies en cônes ont été infructueuses47. Cela est certainement dû au fait qu’en l’absence de sérum et dans les cultures de faible densité, les cellules précurseurs rétiniennes ne sont pas réplicatives, une condition préalable à la propagation des rétrovirus.
Nous avons développé le système de culture enrichi en cônes pour identifier les facteurs trophiques qui favorisent la survie du cône à l’aide du clonage d’expression19. Afin de le rendre possible, nous avons effectué une première étape de criblage à haute teneur en utilisant un milieu conditionné provenant de pools de 100 clones. Même si les ADNc de la bibliothèque sont exprimés sous le contrôle d’un promoteur cmv fort après transfection des cellules COS-1, il n’offre pas une garantie que toutes les protéines codées par les ADNc individuels atteignent une concentration suffisante pour être marqué positif par le test de viabilité. Il s’agit d’une limitation majeure. En ce sens, tout dépistage n’est pas vraiment exhaustif. De plus, même si les protéines membraneuses n’ont pas été retirées du milieu conditionné, la configuration du dosage est défavorable à l’identification de facteurs non diffusifs. Une alternative serait de cribler les clones individuels après avoir obtenu la séquence des ADNc afin d’éviter les duplications dans le dosage plusieurs fois la même protéine candidate. Ceci a été initié par le séquençage des bibliothèques d’ADNc rétiniennes que nous avons utilisées43. Bien que rationnelle, cette approche a aussi ses limites. L’analyse bioinformatique des séquences d’ADNc imposera irrésistiblement, outre la réduction de la redondance, la priorisation du criblage de certains clones sur la base des connaissances. Cela ne nuira pas si finalement, toute la bibliothèque serait projetée même si le temps nécessaire pour le faire sera considérablement allongé. Mais invariablement, l’identité de la séquence influencera notre façon de voir les résultats. Cela ne sera pas neutre puisque l’interprétation de la séquence sera naturellement en concurrence avec les données expérimentales.
L’identification de l’EdCVF montre également que le dépistage à haut contenu implique des limitations techniques. Dès la première ronde de dépistage, nous avons identifié deux bassins à forte activité(figure supplémentaire 1). Le pool 0073 a permis d’identifier avec succès l’EdCVF, tandis que le pool 0080 n’a pas abouti à une telle constatation. Nous n’avons pas résolu le problème qui pourrait résulter de la perte du clone actif lors de la préparation des sous-pools. Alternativement, il n’est pas exclu, même si ce n’est pas statistiquement favorable, que parmi les ADNc du pool 0080, deux protéines agissaient en synergie et leur activité n’a pas pu être observée en tant que clones individuels.
L’identification de molécules protégeant les cônes en criblant les petites molécules est une application future du système de culture enrichi en cônes. De telles molécules seront inestimables pour le traitement des pathologies rétiniennes pour lesquelles la thérapie génique n’est pas l’approche la plus appropriée en tant que dégénérescence maculaire liée à l’âge.
The authors have nothing to disclose.
Les auteurs remercient Jacques Bellalou, Lorelei Fournier, Emmanuelle Clérin, Frédéric Blond et l’entreprise agricole à responsabilité limitée (EARL Morizeau Dangers, France) pour leur aide précieuse. Ces travaux ont été soutenus par l’Inserm, l’Université de la Sorbonne, l’Agence Nationale pour la Recherche (ANR, Labex Lifesenses), la Fondation Fighting Blindness (USA) et l’IHU FOReSIGHT [ANR-18-IAHU-0001] soutenus par Français fonds publics gérés par l’ANR dans le cadre du programme Investissements d’Avenir.
96 black plates (Clear Button with lid Tissue culture treated) | Corning | 3603 | |
Calcein AM | Thermo-Fisher scientific | C1430 | |
CCD Camera | Photometrics | CoolSnap FX HQ | |
CDPC (Cytidine 5′-diphosphocholine sodium salt dihydrate) | Sigma-Aldrich | C0256 | |
CO2 Independant | Thermo-Fisher scientific | 18045-054 | |
Curved forceps | Dutscher | 005093 | |
DMEM Media | Thermo-Fisher scientific | 41966-029 | |
DNAse | Sigma-Aldrich | D4263 | |
Eggs incubator | FarmLine | M08 01 3100 | |
Ethidium Homodimer | Thermo-Fisher scientific | E1169 | |
Fœtal bovine serum | Thermo-Fisher scientific | 10270-098 | |
Gentamycin | Thermo-Fisher scientific | 15710-049 | |
Hydrocortisone | Sigma-Aldrich | H0880 | |
ITS (insulin Transferine selenium) | Sigma-Aldrich | I1884 | |
large straight pliers | Dutscher | 005074 | |
Linoleic acid | Sigma-Aldrich | L8384 | |
M199 medium | Thermo-Fisher scientific | 31150-022 | |
Metamorph software | Metamorph | ||
Microscope | NIKON | Eclipse TE2000 | |
Motorized stage | Martzauzer | Mutlicontrol 2000 | |
Optical filter switch | Shutter Instrument company | Lambda 10-2 | |
PBS 1X | Thermo-Fisher scientific | 14190-086 | |
Poly-L-lysine | Sigma-Aldrich | P6282 | |
Progesterone | Sigma-Aldrich | P7556 | |
Pursept A express | Fisher scientific | 11814110 | |
Putriscine | Sigma-Aldrich | P5780 | |
Sodium pyruvate | Sigma-Aldrich | S8636 | |
straight forceps | Dutscher | 005092 | |
Taurine | Sigma-Aldrich | T8691 | |
Triiodothyronine | Sigma-Aldrich | T6397 | |
Trypan blue | Thermo-Fisher scientific | 15250-061 | |
Trypsine 0.25 % | Thermo-Fisher scientific | 25200-056 |