We beschrijven een methode om primaire culturen van kegelfotoreceptoren te verkrijgen van het netvlies van kippenembryo’s en het gebruik ervan voor screening met een hoog gehalte.
Menselijk dagzicht is afhankelijk van de functie van kegelfotoreceptoren in het midden van het netvlies, de fovea. Patiënten die lijden aan de meest voorkomende vorm van erfelijke retinale degeneratie, retinitis pigmentosa, verliezen nachtzicht als gevolg van mutatie gedreven verlies van staaffotoreceptoren, een fenomeen gevolgd door een progressief verlies van functie en de dood van kegeltjes die leiden tot blindheid. Genetici hebben veel genen geïdentificeerd met mutaties die deze ziekte veroorzaken, maar de eerste geïdentificeerde mutaties zetten vraagtekens bij de mechanismen van secundaire kegeldegeneratie en hoe een dominante mutatie in het rhodopsine-gen dat codeert voor het visuele pigment dat uitsluitend in staafjes wordt uitgedrukt, kegeldegeneratie kan veroorzaken.
Dit resultaat van transplantaties in een genetisch model van de ziekte leidde tot het concept van celinteracties tussen staven en kegels en van niet-cel autonome degeneratie van kegels in alle genetische vormen van retinitis pigmentosa.
Kegels bestaan uit 5% van alle fotoreceptoren bij mensen en slechts 3% bij de muis, dus hun studie is moeilijk bij deze soorten, maar kegels overtreffen hengels in vogelsoorten. We hebben 96-put platen aangepast aan kweek retinale precursoren van het netvlies van kippenembryo’s in stadium 29 van hun ontwikkeling. In deze primaire culturen vertegenwoordigen kegels 80% van de cellen na in vitro differentiatie. De cellen degenereren gedurende een periode van een week bij afwezigheid van serum. Hier beschrijven we de methoden en de standaardisatie ervan.
Dit met kegel verrijkte kweeksysteem werd gebruikt om de epitheel-afgeleide kegel levensvatbaarheidsfactor (EdCVF) te identificeren door middel van hoge inhoud screening van een rat retinaal gepigmenteerd epitheel genormaliseerde cDNA bibliotheek. Recombinant EdCVF voorkomt de degeneratie van de kegels.
Het netvlies van gewervelde soorten is dubbel, met staaffotoreceptoren voor dimlichtzicht en kegelfotoreceptoren voor daglicht, kleur en scherptezicht. Primaten gezichtsscherpte is afhankelijk van een gebied in het midden van het netvlies, de fovea genoemd, dat is verrijkt met kegeltjes, maar over het algemeen vertegenwoordigen kegeltjes slechts 5% van alle fotoreceptoren. Bijgevolg is de analyse van de kegeltjes in het netvlies van primaten en vooral de cultuur van kegeltjes technisch moeilijk. Alle andere zoogdiersoorten hebben geen fovea en het percentage kegeltjes is laag voor knaagdieren die het meest worden gebruikt in retinaal onderzoek. Dit is niet het geval voor vogelsoorten, waarvoor kegeltjes het netvlies van deze goedziende vogelsoorten domineren. Dinosaurussen, die het ecosysteem domineerden toen de zoogdieren voor het eerst verschenen tijdens de evolutie, bevinden zich aan de fylogenetische oorsprong van vogels1. Als gevolg van dergelijke concurrentie tussen dinosaurussen en vroege zoogdieren, zijn de zoogdieren meestal nachtelijk met netvlies gedomineerd door staven. Pas later tijdens de evolutie werd de dagvisie van sommige zoogdiersoorten, waaronder primaten behoren, een evolutionair voordeel. Niettemin blijft de voorouderlijke periode een atavisme van het nachtelijke knelpunt in de evolutie van zoogdiervisie2,3.
Tijdens het bestuderen van retinale celdifferentiatie toonden Adler en Hatlee aan dat fotoreceptoren ongeveer 70% van de retinale gedifferentieerde cellen vertegenwoordigen in culturen die zijn afgeleid van kip op de embryonale dag (ED) 6 of stadium 294. Vanwege de prevalentie van kegeltjes in het netvlies van de kip, zijn culturen van netvliescellen van ED6-kippenembryo’s ontwikkeld als kegelverrijkte culturen5.
Het belang van kegelgemedieerde gezichtsscherpte voor de mens is een truïsme. Mensen die getroffen zijn door genetische of verouderingsziekten die de kegelfunctie veranderen, zijn sterk gehandicapt. Dit heeft een zeer grote reeks studies naar erfelijke netvliesdegeneraties (IRD) bevorderd met als doel behandelingen voor deze verblindende ziekten te vinden6,7. Het eerste succes, verkregen met behulp van een recombinante adeno-geassocieerde vector (AAV) voor de therapie van een ernstige vorm van IRD Leber congenitale amaurosis (LCA), is een proof of concept voor gentherapie8. De identificatie van de genen waarvan de mutaties IRD veroorzaken, opent de mogelijkheid om deze ziekten te genezen met behulp van gentherapie. Niettemin zijn deze ziekten het gevolg van mutaties in meer dan 200 verschillende genen9. Zelfs in het geval van autosomaal recessieve vormen van IRD, wanneer de herintroductie van de normale kopie van het morbide gen de visuele functie zou kunnen herstellen, begunstigen de economische kosten van elke individuele ontwikkeling de meest voorkomende ten nadele van de minder voorkomende en ten nadele van degenen waarvoor de genetische oorsprong onbekend blijft. Dit feit bracht onderzoekers aan het denken over meer algemene therapieën. Apoptotische celdood verscheen als een gemeenschappelijk pad, en een therapeutisch doelwit van deze ziekten die vorderen door de degeneratie van fotoreceptoren, waaronder voor autosomaal dominante vormen10,11. De successen van een dergelijke aanpak ontbreken echter. Voor de meest voorkomende vorm van IRD, retinitis pigmentosa (RP), is de gemeenschappelijke route het secundaire functieverlies dat uiteindelijk wordt gevolgd door de degeneratie van kegels12,13. Het voorkomen van het verlies van kegelfunctie zal het centrale zicht van de fovea onafhankelijk van de oorzakelijke mutaties behouden14.
In het vroege stadium van RP veroorzaakt het verlies van staven een vermindering van de expressie van staaf-afgeleide kegel levensvatbaarheidsfactor (RdCVF), gecodeerd door het nucleoredoxine-achtige 1 (NXNL1) gen, dat de metabolische en redox signalering tussen staven en kegelsonderbreekt 15. De toediening van een recombinant AAV die codeert voor de twee producten van het NXNL1-gen, de trofische factor RdCVF en het thioredoxine-enzym RdCVFL, zou theoretisch kegelzichtverlies in alle genetische vormen van RP16kunnen voorkomen . We hebben aangetoond dat het NXNL1-genproduct, RdCVFL, wordt uitgedrukt in met kippenkegel verrijkte culturen17 en waar het een beschermende rol speelt18. RdCVF en het NXNL1-gen werden geïdentificeerd door een hoog gehalte screening van een retinale cDNA-bibliotheek met behulp van de overleving van cellen uit een met kegels verrijkte cultuur als uitlezing19. We hebben het equivalent van 210.000 individuele klonen van de bibliotheek gescreend met behulp van 8 parallelle tests voor elke kloon. Dit vertegenwoordigt een zeer groot aantal tests die gemakkelijke toegang tot het biologische materiaal vereisen, het netvlies van kippenembryo’s. We ontdekten dat het relatief eenvoudig was om wekelijks embryonale kippeneieren te verkrijgen, omdat ze op grote schaal worden geproduceerd voor de agro-industrie voor legkippen en vleesproducerende kippen. Na zorgvuldige standaardisatie van de met kegels verrijkte culturen biedt het systeem een eenvoudige, robuuste en reproduceerbare manier om duizenden moleculen te testen op hun vermogen om de levensvatbaarheid van de kegel te behouden. Deze cellen zijn ook vatbaar voor genetische manipulaties20 die baat hebben bij de studie van signaaltransductie en voor biochemische analyses21,22,23.
Retinale onderzoekers hebben alternatieve methoden ontwikkeld als het gebruik van de kegelcellijn 661W24,25,26. Niettemin blijft de identiteit van deze cellijn controversieel27,28. De 661W cellen werden gekloond uit retinale tumoren van een transgene muislijn die het SV40 grote T-antigeen uitdrukt onder controle van de menselijke interfotoreceptor retinol-bindende eiwitpromotor. SV40 groot T-antigeen bemiddelt cellulaire transformatie en onsterfelijkheid. Als gevolg hiervan moet de signaleringsroute die is geïdentificeerd met behulp van 661W-cellen worden gerapporteerd in de context van een getransformeerde en vereeuwigde cellijn die in veel opzichten verschilt van kegels in situ. In dat opzicht bestaat het met kegel verrijkte kweeksysteem uit primaire neuronen, de kegels die fysiologisch relevanter zijn.
Hoewel het mogelijk is om een zuivere cultuur van fotoreceptoren te verkrijgen met behulp van vibratoomsecties van het netvlies van de muis, maakt het zeer lage percentage kegeltjes in het buitenste netvlies van knaagdieren deze aanpak ongeschikt voor het produceren van kegelverrijkte culturen29. Het varkensvlies bevat geen fovea, maar heeft een gebied genaamd area centralis dat zeer verrijkt is met kegeltjes30. Het hoge percentage kegeltjes in het netvlies van knaagdieren, zoals Arvicanthis ansorgei pt Psammomys obsesus31,32, biedt een mogelijke oplossing, maar vereist het fokken van dergelijke exotische soorten. Volwassen varkensogen, verzameld bij lokale slachthuizen, kunnen worden gebruikt om een gemengde cultuur van staven en kegels te produceren die zijn gebruikt om de overleving van fotoreceptor tebestuderen 33. Een elegante oplossing is om kegeltjes van het netvlies van het varken voor te zuiveren met behulp van panning met pinda agglutinine (PNA) lectine, die selectief bindt aan kegeltjes34. Toch is deze methode moeilijk op grote schaal te implementeren vanwege de complexiteit ervan.
Door de mens geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPS) biedt de meest veelbelovende aanpak om een kegelfotoreceptorcelpopulatie te verkrijgen die kan worden gebruikt voor retinaletransplantatie,maar die ook kan worden aangepast aan kegelverrijkte cultuur35,36. Aangezien de transcriptiefactor NRL vereist is voor staaf-fotoreceptoren37, heeft de Nrl-/- muis een netvlies dat wordt gedomineerd door korte golfkegels (S-kegeltjes). De inactivatie zou kunnen worden gebruikt om met S-kegel verrijkt preparaat te produceren door differentiatie van de mens van iPS38,39. Een andere mogelijke aanpak is het bevorderen van kegeldifferentiatie met behulp van schildklierhormoonsignalering40. Terwijl nieuwe methoden voor het produceren van kegelverrijkte culturen uit menselijke iPS in opkomst zijn, bieden kippenembryo’s een huidige bewezen methode19.
De kegel-verrijkte cultuur was instrumenteel in de identificatie van RdCVF door uitdrukking het klonen19. Dit systeem werd ook met succes gebruikt om aan te tonen dat RdCVF de glucoseopname en het metabolisme ervan stimuleert door aerobe glycolyse22. Verder werd kegelverrijkte cultuur gebruikt om de beschermende rol van RdCVFL, het tweede product van het NXNL1-gen 23, te valideren. Meer recent werd dit systeem gebruikt om het bestaan aan te tonen van het beschermen van moleculen die worden afgescheiden door retinale gepigmenteerde epitheelcellen die worden getransduceerd met OTX241.
Onder de vele parameters die de productie van een met kegels verrijkte cultuur uit kippenembryo’s kunnen beperken, is de eerste kritieke stap om het stadium van ontwikkeling van de embryo’s in de uitgebroede eieren nauwkeurig te identificeren. Er is waargenomen dat de cultuur van cellen uit het netvlies van embryo’s in ED8 (34e stadium) slechts 35% fotoreceptoren produceert, terwijl de resterende 65% zijn gemaakt van andere neuronen4. Wat de logistiek ook is om de uitgebroede eieren te krijgen, het is noodzakelijk om de temperatuur en de incubatietijd te verfijnen en de embryo’s zorgvuldig te onderzoeken in vergelijking met de referentiefoto’s van alle stadia van ontwikkeling42,45.
Oorspronkelijk werd het met kegel verrijkte kweeksysteem ontwikkeld met behulp van de White Leghorn-stam4. De witte kleur van de eieren van die soort wordt niet bijzonder gewaardeerd in Frankrijk, dus gebruikten we een soort kip die bruine eieren produceert. We maakten gebruik van de I 657 stam, die wordt gemaakt door het kruisen van I 66 hanen met JA57 kippen5. We waren in staat om de kenmerken van de oorspronkelijke culturen te reproduceren. Dit toont aan dat de genetische achtergrond van de kip niet cruciaal is om kegelverrijkte culturen te verkrijgen.
We hebben het effect van individuele verwijdering van de supplementen in het kweekmedium niet getest, maar hebben waargenomen dat insuline een cruciale rol speelt in overeenstemming met het effect van insuline op de overleving van kegeltjes in de rd1-muis, een model van autosomaal recessieve RP46. Triiodothyronine (T3) kan ook deelnemen aan de differentiatie van retinale precursorcellen van het kippenembryo in kegeltjes volgens de rol van schildklierhormoonreceptor in het lot van netvliescellen tijdens ontwikkeling40. Bijgevolg kan het met kegels verrijkte kweeksysteem niet worden gebruikt om insuline te identificeren door middel van expressiekloon46.
Het met kegels verrijkte kweeksysteem is gebaseerd op de cultuur van primaire neuronen en is veel geschikter dan methoden die gebaseerd zijn op het gebruik van vereeuwigde cellen als de cellijn 661W24,25,26.
De hier beschreven methode kan worden gewijzigd door een voorafgaande elektroporatie uit te voeren met plasmide DNA20. Voordat de netvliescelsuspensie wordt voorbereid, wordt het hele netvlies in de kamer van een op maat gemaakte elektroporator geplaatst met 120 μL van 0,5 μg/μL plasmide-DNA in 10 mM Tris-HCl pH 8,0, 1 mM EDTA. Vijf pulsen van 15 V voor elk 50 ms worden toegepast, gescheiden door 950 ms interval22. Pogingen om storend RNA (RNAi) te leveren met behulp van de replicatie competente aviaire splice (RCAS) retrovirussen in met kegels verrijkte culturen waren niet succesvol47. Dit is zeker te wijten aan het feit dat bij afwezigheid van serum en in culturen met een lage dichtheid, retinale precursorcellen niet repliceerbaar zijn, een vereiste voor de voortplanting van retrovirussen.
We ontwikkelden het met kegels verrijkte kweeksysteem om trofische factoren te identificeren die de overleving van kegels bevorderen met behulp van expressiekloon19. Om het haalbaar te maken, hebben we een eerste stap van screening met hoge inhoud uitgevoerd met behulp van geconditioneerd medium uit pools van 100 klonen. Zelfs als de cDNA’s uit de bibliotheek worden uitgedrukt onder de controle van een sterke CMV-promotor na transfectie van COS-1-cellen, biedt het geen garantie dat alle eiwitten gecodeerd door individuele cDNA’s een concentratie bereiken die voldoende is om positief te worden gescoord door de levensvatbaarheidstest. Dit is een belangrijke beperking. In die zin is elke screening niet echt uitputtend. Bovendien, zelfs als vliezeneiwitten niet uit het geconditioneerde medium werden verwijderd, is de configuratie van de test ongunstig voor de identificatie van niet-diffusieve factoren. Een alternatief zou zijn om individuele klonen te screenen nadat ze de volgorde van de cDNA’s hebben verkregen om duplicaties bij het analyseren van vele malen hetzelfde kandidaat-eiwit te voorkomen. Dit werd geïnitieerd door de retinale cDNA-bibliotheken te sequentiëren die we43gebruikten. Hoewel rationeel, heeft deze aanpak ook zijn beperkingen. De bioinformatische analyse van de cDNA-sequenties zal onweerstaanbaar, naast de vermindering van de redundantie, de prioritering van het screenen van bepaalde klonen op basis van kennis opleggen. Dit zal niet nadelig zijn als uiteindelijk de hele bibliotheek zou worden gescreend, zelfs als de tijd die nodig is om dit te doen aanzienlijk wordt verlengd. Maar steevast zal de identiteit van de reeks onze manier van kijken naar de resultaten beïnvloeden. Dit zal niet neutraal zijn, aangezien de interpretatie van de reeks uiteraard in concurrentie zal staan met de experimentele gegevens.
De identificatie van EdCVF toont ook aan dat screening met een hoog gehalte technische beperkingen met zich meebrengt. Uit de eerste screeningsronde hebben we twee pools met een hoge activiteit geïdentificeerd (aanvullend figuur 1). De pool 0073 leidde tot de succesvolle identificatie van EdCVF, terwijl pool 0080 zich niet aan een dergelijke bevinding gedraagt. We hebben het probleem dat kan voortvloeien uit het verlies van de actieve kloon tijdens de voorbereiding van subpools niet opgelost. Als alternatief is het niet uitgesloten, zelfs als het niet statistisch gunstig is, dat van de cDNA’s van pool 0080 twee eiwitten synergetisch handelden en hun activiteit niet kon worden waargenomen als individuele klonen.
De identificatie van moleculen die kegels beschermen door kleine moleculen te screenen, is een toekomstige toepassing van het met kegel verrijkte kweeksysteem. Dergelijke moleculen zullen van onschatbare waarde zijn voor de behandeling van retinale pathologieën waarvoor gentherapie niet de meest geschikte aanpak is als leeftijdsgebonden maculadegeneratie.
The authors have nothing to disclose.
De auteurs danken Jacques Bellalou, Lorelei Fournier, Emmanuelle Clérin, Frédéric Blond en de entreprise agricole à responsabilité limitée (EARL Morizeau Dangers, Frankrijk) voor hun onschatbare hulp. Dit werk werd ondersteund door Inserm, Sorbonne University, de Agence Nationale pour la Recherche (ANR, Labex Lifesenses), Foundation Fighting Blindness (USA) en IHU FOReSIGHT [ANR-18-IAHU-0001] ondersteund door Franse staatsfondsen beheerd door de ANR binnen het Investissements d’Avenir-programma.
96 black plates (Clear Button with lid Tissue culture treated) | Corning | 3603 | |
Calcein AM | Thermo-Fisher scientific | C1430 | |
CCD Camera | Photometrics | CoolSnap FX HQ | |
CDPC (Cytidine 5′-diphosphocholine sodium salt dihydrate) | Sigma-Aldrich | C0256 | |
CO2 Independant | Thermo-Fisher scientific | 18045-054 | |
Curved forceps | Dutscher | 005093 | |
DMEM Media | Thermo-Fisher scientific | 41966-029 | |
DNAse | Sigma-Aldrich | D4263 | |
Eggs incubator | FarmLine | M08 01 3100 | |
Ethidium Homodimer | Thermo-Fisher scientific | E1169 | |
Fœtal bovine serum | Thermo-Fisher scientific | 10270-098 | |
Gentamycin | Thermo-Fisher scientific | 15710-049 | |
Hydrocortisone | Sigma-Aldrich | H0880 | |
ITS (insulin Transferine selenium) | Sigma-Aldrich | I1884 | |
large straight pliers | Dutscher | 005074 | |
Linoleic acid | Sigma-Aldrich | L8384 | |
M199 medium | Thermo-Fisher scientific | 31150-022 | |
Metamorph software | Metamorph | ||
Microscope | NIKON | Eclipse TE2000 | |
Motorized stage | Martzauzer | Mutlicontrol 2000 | |
Optical filter switch | Shutter Instrument company | Lambda 10-2 | |
PBS 1X | Thermo-Fisher scientific | 14190-086 | |
Poly-L-lysine | Sigma-Aldrich | P6282 | |
Progesterone | Sigma-Aldrich | P7556 | |
Pursept A express | Fisher scientific | 11814110 | |
Putriscine | Sigma-Aldrich | P5780 | |
Sodium pyruvate | Sigma-Aldrich | S8636 | |
straight forceps | Dutscher | 005092 | |
Taurine | Sigma-Aldrich | T8691 | |
Triiodothyronine | Sigma-Aldrich | T6397 | |
Trypan blue | Thermo-Fisher scientific | 15250-061 | |
Trypsine 0.25 % | Thermo-Fisher scientific | 25200-056 |