Il protocollo presenta l’utilizzo dell’approccio chimico biopsia seguito da un’analisi metabolomica e lippidomica completa per la valutazione della qualità degli innesti renali assegnati per il trapianto.
Il trapianto di rene è un trattamento salvavita per un gran numero di persone con disfunzione renale in fase finale in tutto il mondo. La procedura è associata ad un aumento del tasso di sopravvivenza e a una maggiore qualità della vita del paziente rispetto alla dialisi convenzionale. Purtroppo, la trapiantologia soffre di una mancanza di metodi affidabili per la valutazione della qualità degli organi. Le tecniche diagnostiche standard sono limitate all’ispezione macroscopica dell’aspetto o alla biopsia dei tessuti invasiva, che non forniscono informazioni complete sull’innesto. Il protocollo proposto mira a introdurre la microestrazione a fase solida (SPME) come metodo analitico ideale per metabolomica completa e analisi lipidomica di tutti i composti molecolari bassi presenti nei reni allocati per il trapianto. Le piccole dimensioni della sonda SPME consentono le prestazioni di una biopsia chimica, che consente l’estrazione di metaboliti direttamente dall’organo senza alcuna raccolta di tessuti. La minima invasività del metodo consente l’esecuzione di più analisi nel tempo: direttamente dopo la raccolta degli organi, durante la sua conservazione, e subito dopo la revascolazione nel corpo del destinatario. Si ipotizza che la combinazione di questo nuovo metodo di campionamento con uno spettrometro di massa ad alta risoluzione consentirà la discriminazione di una serie di composti caratteristici che potrebbero servire come marcatori biologici della qualità dell’innesto e indicatori di possibile sviluppo della disfunzione dell’organo.
Secondo la rete statunitense per l’approvvigionamento e i trapianti di organi, nel 2019 erano 94.756 i pazienti in attesa di trapianto di rene negli Stati Uniti; mentre in Europa nel 2018, tale numero era 10.791. Ogni dieci minuti, qualcuno viene aggiunto alla lista d’attesa nazionale per i trapianti negli Stati Uniti, e si stima che ogni giorno 20 persone muoia in attesa di untrapianto 1,2. Il trapianto di rene è un trattamento salvavita per un gran numero di persone che soffrono di disfunzione renale in fase finale in tutto il mondo. La procedura è associata ad un aumento del tasso di sopravvivenza e a una maggiore qualità della vita rispetto alla dialisi convenzionale.
Tuttavia, il trapianto deve affrontare molti problemi seri, come la carenza di organi o la mancanza di strumenti efficaci per la valutazione della qualità degli organi. I protocolli standard sono limitati all’ispezione macroscopica dell’aspetto o alla biopsia invasiva dei tessuti, che non forniscono informazioni complete sulla qualità dell’innesto. Mentre una valutazione visiva consente l’identificazione dei tumori visibili all’occhio, anomalie anatomiche o danni estesi agli innesti, questo approccio è molto soggettivo, varia nella sua efficacia a seconda dell’esperienza degli osservatori. La biopsia, d’altra parte, può fornire informazioni preziose sui disturbi renali preesistenti, ed è quindi considerata un metodo di valore oggettivo e evidenziato nel determinare i risultati dell’innesto. Tuttavia, la procedura di biopsia non è es free di difetti; c’è il rischio di potenziali complicazioni come sanguinamento ed è necessaria un ulteriore 4-5 ore di preparazione del campione, che prolunga significativamente il tempo ischemico freddo. Pertanto, soprattutto in Europa, l’uso dell’analisi diretta dei tessuti è limitato ai donatori di criteri espansi (ECD) e ai donatori dopo la morte circolatoria (DCD)3,4.
La metabolomica e la lippidomica sono state recentemente riconosciute come approcci promettenti per raggiungere una migliore comprensione dei cambiamenti nei percorsi biochimici che si verificano durante la conservazione degli organi. La profilazione metabolomica e lipidomica consente di monitorare le risposte immediate del sistema a improvvisi cambiamenti ambientali legati alla rimozione degli organi con conseguenze successive: ischemia, stress ossidativo o risposte infiammatorie5,6,7,8. Il rene è un organo che è in gran parte associato con i processi metabolici, quindi le misurazioni delle concentrazioni di metaboliti e lipidi possono consentire l’identificazione di potenziali biomarcatori di qualità dell’organo e consentire migliori previsioni dell’esito dell’innesto.
Date le complicazioni e le limitazioni di cui sopra associate agli attuali metodi di valutazione della qualità degli organi, è necessaria una soluzione diagnostica meno invasiva per una valutazione rapida e complessa della qualità degli organi. La microetrazione di fase solida (SPME) è conforme a questi requisiti come metodo analitico minimamente invasivo che consente la copertura di un ampio spettro di metaboliti e lipidi. La tecnica si basa sull’inserimento di una sonda in lega in titanio-nickel sottile e sottile ricoperta per un breve periodo di tempo con una fase di estrazione selettiva nell’organo esaminato. Va sottolineato che SPME impedisce l’estrazione di proteine, e quindi consente l’inibizione del metabolismo già nella fase di raccolta del campione, che è un vantaggio significativo rispetto ai metodi alternativi. Inoltre, la miniaturizzazione del dispositivo consente l’esecuzione di analisi ripetitive e simultanee di poche strutture dell’organo9,10,11.
La valutazione della qualità degli organi rimane una grande sfida per i medici, che devono prendere decisioni rapide e informate in merito alla possibilità di un determinato organo per il trapianto o se debba essere scartato. Fattori multipli, come l’età del donatore, la durata dell’ischemia e le infezioni e i processi infiammatori, possono influenzare l’esito dell’innesto a lungo termine. Mentre sono stati sviluppati metodi diversi fino ad oggi per diagnosticare la funzione dell’allotrapianto renale, l’ispezione istopatologica rimane lo standard d’oro in quellamateria 3,4,12. Anche se la procedura di biopsia può produrre informazioni significative per quanto riguarda la malattia del donatore preesistente e i cambiamenti vascolari, non è esigante di difetti. Gli errori di campionamento associati alla variabilità del server interob e al campionamento di glomeruli insufficienti per informazioni complete sulla funzione degli organi rimangono preoccupazioni tipiche a questo proposito. Inoltre, la preparazione del campione comporta alcune questioni come una valutazione incompleta dell’innesto in caso di sezioni congelate e l’estensione del tempo di procedura per il sezionamento della paraffina. Tuttavia, l’aumento del rischio di emorragia, che può apparire acutamente come ematuria microscopica o grossolana, è la principale complicazione pericolosa per la vita associata alla procedura di biopsia. Per questo motivo, il numero di biopsie abili è strettamente limitato nelle procedure di trapianto, un fattore che ostacola la cattura dei cambiamenti dinamici e delle analisi delle serie a tempo attraverso questometodo 12,13,14. I benefici di un’analisi irologica devono essere confrontati con i rischi associati alla metodologia. Il valore delle scoperte istologiche è indiscutibile, ma non spiegano i meccanismi molecolari delle aberrazioni.
La metabolomica e la lippidomica sono i domini più giovani della famiglia scientifica “-omica”. Il set completo di metaboliti e lipidi umani a bassa capacità molecolare (<1,200 Da) collegati all'interno di una rete metabolica è definito come un metaboloma umano. Il genoma rimane relativamente costante per tutta la sua vita, con lievi modifiche causate da mutazioni che si verificano raramente. Il metaboloma è il prodotto dell'espressione genica, che è altamente sensibile ai cambiamenti in tutti i processi biologici e ai fattori ambientali. La natura dinamica di metaboliti e lipidi li rende indicatori perfettidell’attualecondizione dell’organo 7,8,15,16. Il metodo SPME proposto nel suddo metodo consente di rilevare i cambiamenti che si verificano nell’organo durante la sua conservazione, a partire dalla rimozione degli organi dal corpo del donatore fino alla revascolarizzazione presso il destinatario. Il piccolo diametro della sonda (200 m) fornisce una minima invasività e consente diversi campionamenti dallo stesso organo senza causare alcun danno al tessuto. Condurre studi utilizzando il rene, come organo trapiantato più frequentemente, consente una migliore comprensione e un’ulteriore caratterizzazione delle vie metaboliche responsabili del declino della qualità e della funzione degli innesti. La possibilità di monitorare le modifiche nel tempo è certamente un importante vantaggio della tecnica rispetto ai metodi invasivi convenzionali come la biopsia. L’analisi attualmente presentata ha identificato concentrazioni alterate di vari gruppi di lipidi e metaboliti, in particolare di aminoacidi essenziali, purine, nucleosides purina e glicerophospholipids. Questi risultati sono coerenti con i precedenti rapporti di analisidei tessuti 5,6,17,18,19,20. Ad oggi, la maggior parte delle relazioni scientifiche che utilizzano metabolomica o lippidomica per spiegare i processi che inducono complicazioni dopo il trapianto o i fenomeni di lesione ischemia/reperfusione (IRI) si sono limitati all’analisi dei biofluidi21,22,23.
Ogni applicazione clinica richiede l’ottimizzazione del protocollo di campionamento per garantire che le prestazioni del metodo analitico soddisfino i criteri previsti. A questo proposito, il vantaggio dell’utilizzo di SPME è la possibilità di adeguare le condizioni per vari progetti sperimentali. La varietà delle fasi di estrazione accessibili fornisce un ampio spettro di metaboliti estratti con polarità diversificate. Allo stesso tempo, questo potrebbe essere considerato come una limitazione del metodo a causa del fatto che ogni sorbent fornisce selettività verso caratteristiche specifiche e non estrae tutti i composti presenti nella matrice campione. Va notato che i rivestimenti SPME estraggono solo tramite molecole libere e semplicemente non interagiscono con una frazione legata dell’alyte. La biocompatibilità dei rivestimenti non introduce tossicità nel tessuto, limitando al contempo l’estrazione di molecole di grandi dimensioni come le proteine; di conseguenza, i processi enzimatici sono inibiti già nella fase di raccolta dei campioni e la presenza di manufatti è ridotta al minimo, il che è un grande vantaggio rispetto ai metodi di campionamento alternativi. La lunghezza del rivestimento influenza l’efficienza dell’estrazione (cioè, la lunghezza del rivestimento indica la superficie e il volume della fase di estrazione); così, rivestimenti più lunghi producono recuperi più elevati. D’altra parte, i rivestimenti più corti consentono una risoluzione spaziale più elevata. Per risultati affidabili, è fondamentale immergere la sonda alla stessa profondità della corteccia renale. L’inserimento troppo profondo causa il rischio di entrare nella medulla renale. Il tempo di estrazione è anche proporzionale all’efficienza di estrazione. Pertanto, la selezione del tempo di estrazione ottimale è uno dei passaggi più critici nello sviluppo del metodo SPME. L’accuratezza della misurazione del tempo fornisce la massima ripetibilità. Nelle applicazioni biologiche come quella discussa, c’è sempre un compromesso tra la sensibilità e la ripetibilità del protocollo analitico e le restrizioni della procedura medica. Mentre l’estrazione dell’equilibrio fornisce la massima sensibilità, per motivi di sicurezza, le condizioni di pre-equilibrio sono spesso utilizzate in tali applicazioni, poiché il tempo di estrazione non dovrebbe influenzare la durata totale dell’intervento chirurgico. L’efficienza della desorption è determinata dal momento del processo e dalla composizione del solvente di disorption, che dovrebbe essere compatibile con la fase mobile utilizzata per la separazione cromatografica9,10,11.
Uno dei principali requisiti per la strumentazione diagnostica utilizzata per le valutazioni intra-chirurgiche è il tempo di analisi. Si sta cercando di sviluppare uno strumento rapido per l’estrazione SPME in vivo accoppiato direttamente a uno spettrometro di massa tramite microfluidico open interface (MOI)24 o spray a lama rivestita (CBS)25. Tali approcci consentirebbero la divulgazione di risultati analitici in tempo reale o quasi in tempo reale. L’uso di tali metodi per l’analisi pre-intervento dei profili metabolici e lipidomici potrebbe migliorare il processo decisionale durante le procedure di trapianto, consentendo il miglior approccio personalizzato possibile e una risposta rapida in caso di insufficienza d’organo.
Come sintesi, si ipotizza che il protocollo proposto consentirà il raggiungimento di profili metabolici e lippidomici completi degli innesti renali, che a loro volta fornirebbe una valutazione completa della qualità dell’organo e della caratterizzazione dei processi responsabili della lesione ischemia-reperfusione. La novità del progetto include l’utilizzo della microetrazione in fase solida (SPME), che offre un campionamento invasivo basso dei sistemi viventi, in combinazione con una delle tecnologie più innovative disponibili per l’analisi dei metabolomi e dei lipicomi (ad esempio, lo spettrometro di massa ad alta risoluzione Orbitrap). SPME combina la raccolta dei campioni, l’estrazione e l’appiccamento di metaboliti in un unico passaggio, rendendolo quindi uno strumento perfetto per un’analisi rapida. Si prevede che questo protocollo aiuterà a rispondere alle domande relative a quali condizioni pre-trapianto del rene sono responsabili della funzione dell’organo ritardato o delle sue disfunzioni dopo il trapianto, nonché a come il protocollo di conservazione dell’innesto influenza la biochimica dell’organo. Tali conoscenze non solo avrebbero un impatto significativo sulla prevenzione di possibili complicazioni legate al trapianto, ma potrebbero contribuire a migliorare gli attuali protocolli di conservazione dell’innesto, riducendo al minimo la perdita di tessuto da trapianto vitale e la perdita di vite umane. La soluzione proposta aprirà la porta a ulteriori indagini in questo campo, tra cui la convalida di specifici potenziali biomarcatori e il miglioramento degli esiti terapeutici nella trapiantologia.
The authors have nothing to disclose.
Lo studio è stato sostenuto dalla sovvenzione Opus UMO-2017/27/B/N’5/01013 del National Science Centre. Gli autori vorrebbero riconoscere MilliporeSigma, un’azienda di Merck KGaA, Darmstadt, Germania per la fornitura di dispositivi SPME. Il business delle scienze della vita di Merck opera come MilliporeSigma negli Stati Uniti e in Canada. Inoltre, gli autori vogliono ringraziare Thermo Fisher Scientific per l’accesso allo spettrometro di massa orbitarap Q-Exactive Focus. Gli autori ringraziano la Dott.ssa Aleksandra Woderska-Jasi’ska e il personale del Dipartimento di Trapiantologia e Chirurgia Generale di Bydgoszcz per la loro gentile assistenza nel progetto. BB vuole ringraziare la prof.ssa Janusz Pawliszyn per l’opportunità di raccolta dei campioni al Toronto General Hospital durante il suo soggiorno all’Università di Waterloo.
Acetic acid | Merck | 5330010050 | Mobile phase additive |
Acetonitrile | Alchem | 696-34967-4X2.5L | HPLC solvent |
Ammonium acetate | Merck | 5330040050 | Mobile phase additive |
BENCHMIXER XL MULTI-TUBE VORTEXER | Benchmark Scientific | BV1010 | Vortex mixer |
Caps | Perlan Technologies | 5183-2076 | Blue scrw tp, pre-slit PTFE/Si spta, 100PK |
Chloroform | Merck | 1024441000 | |
Discovery HS F5 Supelguard Cartridge, 3 μm, L × I.D. 2 cm × 2.1 mm | Merck | 567570-U | HPLC guard column |
Discovery HS F5, 2.1 mm x 100 mm, 3 μm | Merck | 567502-U | HPLC column |
Formic acid | Alchem | 497-94318-50ML | Mobile phase additive |
Glass vials | Perlan Technologies | 5182-0714 | |
HILIC Luna 3 μm, 200A, 100 x 2.0 mm | Shim-Pol | PHX-00D-4449-B0 | HPLC column |
HILIC SecurityGuard Cartridge, 3 μm, 4 x 2.0 mm | Shim-Pol | PHX-AJ0-8328 | HPLC guard column |
Isopropanol | Alchem | 231-AL03262500 | HPLC solvent |
Methanol | Alchem | 696-34966-4X2.5L | HPLC solvent |
Nano-pure water | Merck | 1037281002 | HPLC solvent |
Q Exactive Focus hybrid quadrupole-Orbitrap MS | Thermo Scientific | Q Exactive Focus | Mass Spectrometer |
SeQuant ZIC-cHILIC 3µm,100Å 100 x 2.1 mm | Merck | 1506570001 | HPLC column |
SeQuant ZIC-HILIC Guard Kit 20 x 2.1 mm | Merck | 1504360001 | HPLC guard column |
SPME LC fiber probes, mixed mode | Supelco | prototype fibers | |
UltiMate 3000 HPLC systems | Thermo Scientific | UltiMate 3000 | HPLC system |
Vial inserts (deactivated) | Perlan Technologies | 5181-8872 | |
XSelect CSH C18 3.5μm 2.1x75mm | Waters | 186005644 | HPLC column |
XSelect CSH C18 VanGuard Cartridge 3.5μm, 2.1x5mm | Waters | 186007811 | HPLC guard column |