Summary

Time-lapse Live Imaging og kvantifisering av fast dendrittiske Branch Dynamics i utvikling Drosophila neurons

Published: September 25, 2019
doi:

Summary

Her beskriver vi metoden vi brukte for å avbilde svært aktive dendrittiske filopodia i en live forberedelse av Drosophila larvestadiet hjernen, og protokollen vi utviklet for å kvantifisere tidsforløp 3D bildedata sett for kvantitative vurderinger av dendrit dynamikk i å utvikle neurons.

Abstract

Svært aktive dendrittiske filopodia er allment tilstede i neurons på tidlige utviklingsmessige stadier. Disse undersøkende dynamiske grener prøve det omkringliggende miljøet og initiere kontakter med potensielle Synaptic partnere. Selv om forbindelsen mellom dendrittiske gren dynamikk og synaptogenesis er godt etablert, hvordan utviklingsmessige og aktivitet-avhengige prosesser regulere dendrittiske grenen dynamikk er ikke godt forstått. Dette skyldes delvis tekniske problemer knyttet til live Imaging og kvantitative analyser av disse fine strukturene ved hjelp av et in vivo-system. Vi etablerte en metode for å studere dendrit dynamikk ved hjelp av Drosophila larvestadiet ventrale lateral neurons (LNvs), som kan være individuelt merket ved hjelp av genetiske tilnærminger og er tilgjengelig for Live Imaging. Utnytter dette systemet, utviklet vi protokoller for å fange grenen dynamikk av hele dendrittiske Arbor av en enkelt merket LNv gjennom time-lapse Live Imaging. Vi deretter utførte etterbehandling for å forbedre bildekvaliteten gjennom drift korreksjon og deconvolution, etterfulgt av analysere gren dynamikk på single-grenen nivå ved å kommentere romlige posisjoner på alle gren terminaler. Til slutt utviklet vi R-skript (tilleggsfil) og spesifikke parametre for å kvantifisere gren dynamikk ved hjelp av koordinat informasjonen som genereres av Terminal sporingen. Kollektivt, denne protokollen tillater oss å oppnå en detaljert kvantitativ beskrivelse av grenen dynamikk av neuronal dendrittiske Arbor med høy Temporal og romlig oppløsning. Metodene vi utviklet er generelt gjelder for tynt merket neurons i både in vitro og in vivo forhold.

Introduction

Dendrites er spesialisert neuronal rom som mottar og behandler sensorisk og Synaptic innspill. Den komplekse og stereotype strukturen av dendrittiske arbors har vært under intens etterforskning siden oppdagelsen deres. En rekke modellsystemer, inkludert Xenopus optikk tectal neurons, chick retinal Ganglion celler, og dendrittiske arborization (da) neurons i Drosophila systemet, har blitt etablert for å studere utvikling, remodeling og plastisitet av neuronal dendrites1,2,3,4. Drosophila ventrale lateral neurons (LNvs) er en gruppe av visuell projeksjon neurons utgangspunktet identifisert for deres viktige funksjoner i døgn regulering av fly atferd5. Studier avslørte også rollen som larvestadiet LNvs som direkte postsynaptic målet for larvestadiet fotoreseptorene (PRs)6,7. Viktigere, dyrking utvikle larver i ulike lys regimer sterkt påvirker størrelsen på LNvs ‘ dendrittiske arbors, demonstrere egnetheten av LNvs som en ny modell for å studere dendrittiske plastisitet7. Nyere arbeid fra vår gruppe videre indikerer at både størrelsen på LNv dendrit og den dynamiske atferden til dendrittiske grener displayet Experience-avhengige plastisitet8,9. Som en del av dette arbeidet, utviklet vi en ny Live Imaging og kvantifisering protokoll for å utføre analyser på dendrit dynamikken i LNvs fra 2nd eller 3Rd skikkelsen larver.

Den gjennomsiktige natur Drosophila larvestadiet hjernen gjør det ideelt for Live Imaging. Imidlertid er den dendrittiske arbors av LNvs ligger i tett innervated larvestadiet optikk neuropil (LON) i sentrum av larvestadiet hjerne flik6. For å ta bilder av fine dendrit grener og filopodia i intakt hjernevev, bruker vi to-Foton mikroskopi, noe som øker dybden av lys penetrasjon og reduserer Phototoksisitet under Live Imaging eksperimenter10. Ved hjelp av dette oppsettet, vi vellykket utført Live Imaging eksperimenter på LNvs for over 30 min uten å observere åpenbare morfologiske forverring av Nevron. I tillegg genetisk manipulasjoner ved hjelp av flip-out teknikken gjorde oss i stand til å merke den enkelte LNvs med en membran merket GFP, som også er avgjørende for å overvåke bevegelsene til enkelte grener11,12,13 .

For å fange den dynamiske atferden til alle grener på LNv dendrittiske Arbor med optimal optisk oppløsning, utførte vi time-lapse 3D Imaging på fersk dissekert larvestadiet hjernen explants med en høy romlig oppløsning på 1 min per ramme for 10 til 30 min. utvikle LNv dendrites er svært dynamiske, med en stor prosentandel av grenene som viser merkbare endringer innenfor 10 min vinduet. Dette fører til en av de viktigste tekniske utfordringene i å studere dendrit dynamikk, kvantifisere gren atferd basert på 4D bildedata settene. Tidligere etablerte metoder har ulike begrensninger, inkludert mangel på nøyaktighet og overdreven tid kravet. Derfor har vi utviklet en semi-automatisk metode som kombinerer bilde etterbehandling, manuell merking av grenen terminaler, og automatisk 4D flekk sporing ved hjelp av et bilde merknad programvare. Vi beregner bevegelsene til gren terminaler på forskjellige tidspunkter basert på 3D-koordinatene til flekkene. Dataene eksporteres deretter og analyseres for å gi kvantitative målinger av gren dynamikken. Denne metoden vurderer nøyaktig varigheten og omfanget av forlengelse og tilbaketrekking hendelser av eksisterende grener, samt dannelsen av nye grener, slik at vi kan overvåke dendrit dynamikk i et stort antall neurons.

Protocol

Forsiktig: Denne protokollen innebærer bruk av klasse IV lasere og vil kreve riktig opplæring og sikkerhetsretningslinjer som skal følges. Unngå øye-eller hud eksponering for direkte eller spredt laser lys.Merk: Protokollen inneholder seks trinn. Arbeidsflyten vises i figur 1A. 1. merking individuelle neurons bruke flip-out teknikk Merk: Singelen merking av LNvs …

Representative Results

Ved hjelp av Live Imaging-protokollen beskrevet ovenfor, fanger vi opp bilde stabler med høy oppløsning for de påfølgende analysene og kvantifisering. Supplerende video 1 viser den maksimale intensiteten anslått (MIP) bildeserie Hentet fra en representant individuelt merket LNv. figur 2B viser tilsvarende montasje av åtte bilder i bildeserien. I begge panelene markerer pilspisser for hendelser og Utvidelses hendelser fo…

Discussion

Her beskriver vi en protokoll vi utviklet for å spille inn og kvantifisere den dynamiske atferden til dendrittiske grener i individuelt merket neurons i Drosophila larvestadiet hjerner. Spesielt vår Live Imaging protokollen inneholder spesifikke parametre som gjør oss i stand til å fange hele dendrittiske Arbor av en larvestadiet LNv og gi en global visning av den dynamiske tilstanden til sine dendrit grener. Men, fordi våre kvantifisering metoder tungt avhengige av merknaden om gren terminaler, neurons med…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbeidet er støttet av intramural Research program of National Institute of nevrologiske lidelser og hjerneslag, National Institutes of Health. Prosjektnummer 1ZIANS003137.

Materials

Chameleon Vision II multiphoton laser Coherent
high vacuum grease Dow Corning 79751-30
LSM 780 two-photon laser scanning confocal microscope Carl Zeiss upright configuration
Microscope Cover Glass Fisher Scientific 12-544-E
Superfrost Plus Microscope Slides Fisher Scientific 12-550-15
Software
Excel Microsoft for processing .csv files
Huygens Professional Scientific Volume Imaging for drift correction and deconvolution
Imaris Oxford Instruments for 3D visualization and image annotation
Reagents
Glucose
HEPES
KCl
MgCl2
NaCl
NaHCO3
PBS
Sucrose
TES

Referências

  1. Wong, W. T., Wong, R. O. L. Changing specificity of neurotransmitter regulation of rapid dendritic remodeling during synaptogenesis. Nature Neuroscience. 4 (4), 351-352 (2001).
  2. Wu, G. Y., Zou, D. J., Rajan, I., Cline, H. Dendritic Dynamics In Vivo Change during Neuronal Maturation. The Journal of Neuroscience. 19 (11), 4472-4483 (1999).
  3. Jan, Y. N., Jan, L. Y. Branching out: mechanisms of dendritic arborization. Nature Reviews Neuroscience. 11, 316 (2010).
  4. Cline, H., Haas, K. The regulation of dendritic arbor development and plasticity by glutamatergic synaptic input: a review of the synaptotrophic hypothesis. The Journal of Physiology. 586 (6), 1509-1517 (2008).
  5. Helfrich-Forster, C., et al. Development and morphology of the clock-gene-expressing lateral neurons of Drosophila melanogaster. Journal of Comparative Neurology. 500 (1), 47-70 (2007).
  6. Sprecher, S. G., Cardona, A., Hartenstein, V. The Drosophila larval visual system: High-resolution analysis of a simple visual neuropil. Biologia do Desenvolvimento. 358 (1), 33-43 (2011).
  7. Yuan, Q., et al. Light-Induced Structural and Functional Plasticity in Drosophila Larval Visual System. Science. 333 (6048), 1458-1462 (2011).
  8. Sheng, C., et al. Experience-dependent structural plasticity targets dynamic filopodia in regulating dendrite maturation and synaptogenesis. Nature Communications. 9 (1), 3362 (2018).
  9. Yin, J., et al. Transcriptional Regulation of Lipophorin Receptors Supports Neuronal Adaptation to Chronic Elevations of Activity. Cell Reports. 25 (5), 1181-1192 (2018).
  10. Denk, W., Strickler, J., Webb, W. Two-photon laser scanning fluorescence microscopy. Science. 248 (4951), 73-76 (1990).
  11. Golic, K. G., Lindquist, S. The FLP recombinase of yeast catalyzes site-specific recombination in the drosophila genome. Cell. 59 (3), 499-509 (1989).
  12. Harrison, D. A., Perrimon, N. Simple and efficient generation of marked clones in Drosophila. Current Biology. 3 (7), 424-433 (1993).
  13. del Valle Rodríguez, A., Didiano, D., Desplan, C. Power tools for gene expression and clonal analysis in Drosophila. Nature Methods. 9, 47 (2011).
  14. Portera-Cailliau, C., Pan, D. T., Yuste, R. Activity-regulated dynamic behavior of early dendritic protrusions: evidence for different types of dendritic filopodia. Journal of Neuroscience. 23 (18), 7129-7142 (2003).
  15. Niell, C. M., Smith, S. J. Live optical imaging of nervous system development. Annual Review of Physiology. 66, 771-798 (2004).
  16. Barry, D. J., Durkin, C. H., Abella, J. V., Way, M. Open source software for quantification of cell migration, protrusions, and fluorescence intensities. The Journal of Cell Biology. 209 (1), 163-180 (2015).
  17. Hendricusdottir, R., Bergmann, J. H. M. F-dynamics: Automated quantification of dendrite filopodia dynamics in living neurons. Journal of Neuroscience Methods. 236, 148-156 (2014).
  18. Jacquemet, G., et al. FiloQuant reveals increased filopodia density during breast cancer progression. The Journal of Cell Biology. 216 (10), 3387 (2017).
  19. Nilufar, S., Morrow, A. A., Lee, J. M., Perkins, T. J. FiloDetect: automatic detection of filopodia from fluorescence microscopy images. BMC Systems Biology. 7 (1), 66 (2013).
  20. Tsygankov, D., et al. CellGeo: A computational platform for the analysis of shape changes in cells with complex geometries. The Journal of Cell Biology. 204 (3), 443-460 (2014).
  21. Urbančič, V., et al. Filopodyan: An open-source pipeline for the analysis of filopodia. The Journal of Cell Biology. 216 (10), 3405-3422 (2017).
check_url/pt/60287?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Sheng, C., Javed, U., Rosenthal, J., Yin, J., Qin, B., Yuan, Q. Time-lapse Live Imaging and Quantification of Fast Dendritic Branch Dynamics in Developing Drosophila Neurons. J. Vis. Exp. (151), e60287, doi:10.3791/60287 (2019).

View Video