Summary

Time-lapse Live beeldvorming en kwantificering van snelle dendritische tak dynamiek bij de ontwikkeling van Drosophila neuronen

Published: September 25, 2019
doi:

Summary

Hier beschrijven we de methode die we hebben gebruikt voorbeeld zeer beweeglijke dendritische filopodia in een live voorbereiding van de hersenen Drosophila larvale, en het protocol dat we hebben ontwikkeld om time-lapse 3D-beeldverwerkings sets voor kwantitatieve beoordelingen van dendriet te kwantificeren dynamiek in het ontwikkelen van neuronen.

Abstract

Zeer beweeglijke dendritische filopodia zijn op grote schaal aanwezig in neuronen in vroege ontwikkelingsstadia. Deze verkennende dynamische takken proeven de omgeving en initiëren contacten met potentiële synaptische partners. Hoewel de verbinding tussen dendritische tak dynamiek en synaptogenese is goed vastgesteld, hoe ontwikkelings-en activiteitsafhankelijke processen reguleren dendritische tak dynamiek is niet goed begrepen. Dit is deels te wijten aan de technische moeilijkheden in verband met de Live beeldvorming en kwantitatieve analyses van deze fijne constructies met behulp van een in vivo systeem. We hebben een methode opgezet om dendriet-dynamiek te bestuderen met behulp van Drosophila larvale ventrale laterale neuronen (Lnv’s), die individueel kunnen worden geëtiketteerd met behulp van genetische benaderingen en toegankelijk zijn voor Live beeldvorming. Door gebruik te maken van dit systeem hebben we protocollen ontwikkeld om de tak dynamiek van de hele dendritische Arbor van één gelabeld LNv te veroveren door middel van time-lapse Live beeldvorming. Vervolgens hebben we nabewerking uitgevoerd om de beeldkwaliteit te verbeteren door middel van drift correctie en deconvolutie, gevolgd door het analyseren van de vertakkings dynamiek op het single-Branch niveau door de ruimtelijke posities van alle filiaal terminals te annoveren. Ten slotte ontwikkelden we R-scripts (aanvullend bestand) en specifieke parameters om de vertakkings dynamiek te kwantificeren met behulp van de coördinaten informatie die wordt gegenereerd door de Terminal tracering. Collectief, dit protocol stelt ons in staat om een gedetailleerde kwantitatieve beschrijving van de tak dynamiek van de neuronale dendritische Arbor met hoge temporele en ruimtelijke resolutie te bereiken. De methoden die we ontwikkelden zijn over het algemeen toepasbaar op dungelabelde neuronen in zowel in vitro als in vivo condities.

Introduction

Dendrites zijn gespecialiseerde neuronale compartimenten die ontvangen en verwerken van sensorische en synaptische input. De complexe en stereotiepe structuur van dendritische Arbors is sinds hun ontdekking intensief onderzocht. Een aantal modelsystemen, waaronder Xenopus optische tectale neuronen, Chick retinale ganglioncellen en dendritische arborization (da) neuronen in het Drosophila systeem, zijn opgericht om de ontwikkeling, verbouwing en plasticiteit van neuronale dendrites1,2,3,4. Drosophila ventrale laterale neuronen (Lnv’s) zijn een groep visuele projectie neuronen die aanvankelijk werden geïdentificeerd voor hun belangrijke functies in de circadiane regulatie van vlieggedrag5. Studies onthulde ook de rol van larvale lnvs als de directe postsynaptische doelstelling van de larvale fotoreceptoren (PRS)6,7. Belangrijk is dat het kweken van larven in verschillende licht regimes sterk van invloed is op de grootte van Lnv’s ‘ dendritische Arbors, die de geschiktheid van LNvs aantonen als een nieuw model voor het bestuderen van dendritische plasticiteit7. Recent werk van onze groep wijst er verder op dat zowel de grootte van de LNV dendriet als het dynamische gedrag van de dendritische takken ervaring-afhankelijke plasticiteit weergeven8,9. Als onderdeel van dit werk ontwikkelden we een nieuw live beeld-en kwantificerings protocol om analyses uit te voeren over de dendriet-dynamiek van Lnv’s van 2ND of 3RD instar larven.

De transparante aard van de hersenen Drosophila larvale maakt het ideaal voor Live beeldvorming. Echter, de dendritische Arbors van lnvs bevinden zich in de dichtbevolkte larvale optische neuropil (LON) in het midden van de larvale hersenen kwab6. Om beelden van fijne dendriet takken en filopodia in het intacte hersenweefsel vast te leggen, gebruiken we twee-photon microscopie, die de diepte van licht penetratie verhoogt en de fototoxiciteit vermindert tijdens Live Imaging experimenten10. Met behulp van deze instellingen hebben we met succes Live Imaging experimenten uitgevoerd op Lnv’s voor meer dan 30 minuten zonder de duidelijke morfologische verslechtering van het neuron te observeren. Bovendien hebben genetische manipulaties met behulp van de flip-out techniek ons in staat om de individuele lnv’s te labelen met een membraan gelabeld GFP, dat ook cruciaal is voor het bewaken van de bewegingen van individuele takken11,12,13 .

Om het dynamische gedrag van alle takken op de LNv dendritische Arbor met optimale optische resolutie vast te leggen, hebben we time-lapse 3D-beeldvorming uitgevoerd op vers ontleed larvale hersen explanten met een hoge ruimtelijke resolutie op 1 min per frame voor 10 tot 30 min. ontwikkelen van LNv dendrites zijn zeer dynamisch, met een groot percentage van de takken weergegeven waarneembare veranderingen binnen de 10 min venster. Dit leidt tot een van de belangrijkste technische uitdagingen bij het bestuderen van dendriet-dynamiek, het kwantificeren van vertakkings gedrag op basis van de 4D-beeldgegevens sets. Eerder vastgestelde methoden hebben verschillende beperkingen, waaronder gebrek aan nauwkeurigheid en buitensporige tijd vereiste. Daarom hebben we een semi-automatische methode ontwikkeld die de nabewerking van afbeeldingen, handmatige markering van de aftakkingen van de filialen en automatische 4D-spot tracering met behulp van een afbeelding aantekening software combineert. We berekenen de bewegingen van de filialen op verschillende tijdstippen op basis van de 3D-coördinaten van de spots. De gegevens worden vervolgens geëxporteerd en geanalyseerd om kwantitatieve metingen van de vertakkings dynamiek te produceren. Deze methode beoordeelt nauwkeurig de duur en omvang van de uitbreiding en terugtrekking gebeurtenissen van bestaande takken, evenals de vorming van nieuwe takken, waardoor we de dendriet dynamiek in een groot aantal neuronen bewaken.

Protocol

Let op: Dit protocol heeft betrekking op het gebruik van klasse IV-lasers en vereist goede opleidings-en veiligheidsrichtlijnen die moeten worden nageleefd. Vermijd blootstelling van ogen of huid aan direct of verstrooid laserlicht.Opmerking: Het protocol bevat zes stappen. De werkstroom wordt weergegeven in afbeelding 1A. 1. labelen van individuele neuronen met behulp van de flip-out techniek <p class="jove…

Representative Results

Met behulp van het hierboven beschreven Live Imaging protocol, leggen we een hoge resolutie beeld stapels vast voor de daaropvolgende analyses en kwantificering. Aanvullende video 1 toont de reeks met maximale intensiteit geprojecteerd (MIP) die is verzameld van een vertegenwoordiger afzonderlijk gelabeld LNV. afbeelding 2B toont de corresponderende montage van acht frames van de beeld reeks. In beide deelvensters markeren pi…

Discussion

Hier beschrijven we een protocol dat we hebben ontwikkeld om het dynamische gedrag van dendritische takken in individueel gelabelde neuronen in Drosophila larvale hersenen op te nemen en te kwantificeren. Met name ons Live Imaging protocol bevat specifieke parameters die ons in staat stellen om het hele dendritische prieel van een larvale LNV vast te leggen en een globaal beeld te bieden van de dynamische toestand van haar dendriet takken. Omdat onze kwantificeringsmethoden echter sterk afhankelijk zijn van de a…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dit werk wordt ondersteund door het intramurale onderzoeksprogramma van het Nationaal Instituut voor neurologische aandoeningen en beroerte, National Institutes of Health. Project nummer 1ZIANS003137.

Materials

Chameleon Vision II multiphoton laser Coherent
high vacuum grease Dow Corning 79751-30
LSM 780 two-photon laser scanning confocal microscope Carl Zeiss upright configuration
Microscope Cover Glass Fisher Scientific 12-544-E
Superfrost Plus Microscope Slides Fisher Scientific 12-550-15
Software
Excel Microsoft for processing .csv files
Huygens Professional Scientific Volume Imaging for drift correction and deconvolution
Imaris Oxford Instruments for 3D visualization and image annotation
Reagents
Glucose
HEPES
KCl
MgCl2
NaCl
NaHCO3
PBS
Sucrose
TES

Referências

  1. Wong, W. T., Wong, R. O. L. Changing specificity of neurotransmitter regulation of rapid dendritic remodeling during synaptogenesis. Nature Neuroscience. 4 (4), 351-352 (2001).
  2. Wu, G. Y., Zou, D. J., Rajan, I., Cline, H. Dendritic Dynamics In Vivo Change during Neuronal Maturation. The Journal of Neuroscience. 19 (11), 4472-4483 (1999).
  3. Jan, Y. N., Jan, L. Y. Branching out: mechanisms of dendritic arborization. Nature Reviews Neuroscience. 11, 316 (2010).
  4. Cline, H., Haas, K. The regulation of dendritic arbor development and plasticity by glutamatergic synaptic input: a review of the synaptotrophic hypothesis. The Journal of Physiology. 586 (6), 1509-1517 (2008).
  5. Helfrich-Forster, C., et al. Development and morphology of the clock-gene-expressing lateral neurons of Drosophila melanogaster. Journal of Comparative Neurology. 500 (1), 47-70 (2007).
  6. Sprecher, S. G., Cardona, A., Hartenstein, V. The Drosophila larval visual system: High-resolution analysis of a simple visual neuropil. Biologia do Desenvolvimento. 358 (1), 33-43 (2011).
  7. Yuan, Q., et al. Light-Induced Structural and Functional Plasticity in Drosophila Larval Visual System. Science. 333 (6048), 1458-1462 (2011).
  8. Sheng, C., et al. Experience-dependent structural plasticity targets dynamic filopodia in regulating dendrite maturation and synaptogenesis. Nature Communications. 9 (1), 3362 (2018).
  9. Yin, J., et al. Transcriptional Regulation of Lipophorin Receptors Supports Neuronal Adaptation to Chronic Elevations of Activity. Cell Reports. 25 (5), 1181-1192 (2018).
  10. Denk, W., Strickler, J., Webb, W. Two-photon laser scanning fluorescence microscopy. Science. 248 (4951), 73-76 (1990).
  11. Golic, K. G., Lindquist, S. The FLP recombinase of yeast catalyzes site-specific recombination in the drosophila genome. Cell. 59 (3), 499-509 (1989).
  12. Harrison, D. A., Perrimon, N. Simple and efficient generation of marked clones in Drosophila. Current Biology. 3 (7), 424-433 (1993).
  13. del Valle Rodríguez, A., Didiano, D., Desplan, C. Power tools for gene expression and clonal analysis in Drosophila. Nature Methods. 9, 47 (2011).
  14. Portera-Cailliau, C., Pan, D. T., Yuste, R. Activity-regulated dynamic behavior of early dendritic protrusions: evidence for different types of dendritic filopodia. Journal of Neuroscience. 23 (18), 7129-7142 (2003).
  15. Niell, C. M., Smith, S. J. Live optical imaging of nervous system development. Annual Review of Physiology. 66, 771-798 (2004).
  16. Barry, D. J., Durkin, C. H., Abella, J. V., Way, M. Open source software for quantification of cell migration, protrusions, and fluorescence intensities. The Journal of Cell Biology. 209 (1), 163-180 (2015).
  17. Hendricusdottir, R., Bergmann, J. H. M. F-dynamics: Automated quantification of dendrite filopodia dynamics in living neurons. Journal of Neuroscience Methods. 236, 148-156 (2014).
  18. Jacquemet, G., et al. FiloQuant reveals increased filopodia density during breast cancer progression. The Journal of Cell Biology. 216 (10), 3387 (2017).
  19. Nilufar, S., Morrow, A. A., Lee, J. M., Perkins, T. J. FiloDetect: automatic detection of filopodia from fluorescence microscopy images. BMC Systems Biology. 7 (1), 66 (2013).
  20. Tsygankov, D., et al. CellGeo: A computational platform for the analysis of shape changes in cells with complex geometries. The Journal of Cell Biology. 204 (3), 443-460 (2014).
  21. Urbančič, V., et al. Filopodyan: An open-source pipeline for the analysis of filopodia. The Journal of Cell Biology. 216 (10), 3405-3422 (2017).
check_url/pt/60287?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Sheng, C., Javed, U., Rosenthal, J., Yin, J., Qin, B., Yuan, Q. Time-lapse Live Imaging and Quantification of Fast Dendritic Branch Dynamics in Developing Drosophila Neurons. J. Vis. Exp. (151), e60287, doi:10.3791/60287 (2019).

View Video