Questo metodo fornisce un quadro per studiare l’incorporazione di acidi grassi esogeni da sorgenti ospiti complesse in membrane batteriche, in particolare Staphylococcus aureus. Per raggiungere questo obiettivo, vengono descritti i protocolli per l’arricchimento delle particelle di lipoproteina dal tuorlo di uova di gallina e la successiva profilazione dell’acido grasso di fosfatidi batterici che utilizzano la spettrometria di massa.
Lo stafilococco aureus e altri patogeni positivi al Gram incorporano acidi grassi dall’ambiente nei fosfolipidi della membrana. Durante l’infezione, la maggior parte degli acidi grassi esogeni sono presenti all’interno delle particelle di lipoproteina dell’ospite. Permangono incertezze per quanto riguarda i serbatoi di acidi grassi ospiti e i meccanismi con cui i batteri estraggono gli acidi grassi dalle particelle di lipoproteina. In questo lavoro, descriviamo protocolli per l’arricchimento di particelle di lipoproteina a bassa densità (LDL) dal tuorlo d’uovo di gallina e determinando se i LDL fungono da serbatoi di acido grasso per S. aureus. Questo metodo sfrutta l’analisi lipidomica imparziale e gli LDL di pollo, un modello efficace ed economico per l’esplorazione delle interazioni tra LL e batteri. L’analisi dell’integrazione di S. aureus degli acidi grassi esogeni da LDL viene eseguita utilizzando spettrometria di massa ad alta risoluzione/accurata e spettrometria di massa tandem, consentendo la caratterizzazione della composizione dell’acido grasso del batterio identificazione imparziale e di nuove combinazioni di acidi grassi che sorgono nei lipidi della membrana batterica dopo l’esposizione a l’LDL. Queste tecniche avanzate di spettrometria di massa offrono una prospettiva senza precedenti di incorporazione di acidi grassi rivelando gli acidi grassi esogeni specifici incorporati nei fosforidi. I metodi qui descritti sono adattabili allo studio di altri patogeni batterici e fonti alternative di acidi grassi complessi.
S. aureus resistente alla meticolina (MRSA) è la causa principale dell’infezione associata all’assistenza sanitaria e la resistenza agli antibiotici associata è una sfida clinica considerevole1,2,3. Pertanto, lo sviluppo di nuove strategie terapeutiche è una priorità assoluta. Una promettente strategia di trattamento per gli agenti patogeni Gram-positivi sta inibendo la sintesi degli acidi grassi, un requisito per la produzione di fosforidi di membrana che, in S. aureus, include fosfatidylglycerol (PG), lysyl-PG e cardiolipina4. Nei batteri, la produzione di acidi grassi avviene attraverso la via di sintesi degli acidi grassi II (FASII)5, che è notevolmente diversa dalla controparte eucatriste, rendendoI un obiettivo attraente per lo sviluppo antibiotico5,6 . Gli inibitori del FASII si rivolgono principalmente a FabI, un enzima necessario per l’allungamento della catena del carbonio dell’acido grasso7. L’inibitore FabI triclosan è ampiamente utilizzato nei beni di consumo e medici8,9. Ulteriori inibitori FabI sono in fase di sviluppo da diverse aziende farmaceutiche per il trattamento di S. aureus infezione10,11,12,13,14 ,15,16,17,18,19,20,21,22,23 ,24,25,26. Tuttavia, molti patogeni Gram-positivi, tra cui S. aureus, sono in grado di raccogliere acidi grassi esogeni per la sintesi fosforolipidi, bypassando l’inibizione del FASII27,28,29. Così, il potenziale clinico degli inibitori del FASII è discusso a causa di notevoli lacune nella nostra conoscenza delle fonti di acidi grassi ospiti e dei meccanismi con cui gli agenti patogeni estraggono gli acidi grassi dall’ospite27,28. Per colmare queste lacune, abbiamo sviluppato un metodo di analisi lipidomica imparziale per monitorare l’incorporazione di acido grasso esogeno dalle particelle di lipoproteina in fosfolipidi della membrana di S. aureus.
Durante la sepsi, le particelle di lipoproteina ospite rappresentano una potenziale fonte di acidi grassi derivati dall’ospite all’interno della vascolatura, poiché la maggior parte degli acidi grassi ospiti sono associati alle particelle30. Le lipoproteine sono costituite da un guscio idrofilo composto da fosfolipidi e proteine che racchiudono un nucleo idrofobico di trigliceridi e esteri di colesterolo31. Quattro classi principali di lipoproteine – chylomicron, lipoproteina a bassissima densità, lipoproteina ad alta densità e lipoproteina a bassa densità (LDL) – sono prodotte dall’ospite e funzionano come veicoli di trasporto lipidico, fornendo acidi grassi e colesterolo da e verso cellule ospiti attraverso la vascolatura. I LDL sono abbondanti in acidi grassi esterificati tra cui trigliceridi e tende di colesterolo31 . Abbiamo già dimostrato che gli LDL umani altamente purificati sono una fonte vitale di acidi grassi esogeni per la sintesi di PG, fornendo così un meccanismo per il bypass dell’inibitore di FASII32. Purificanti LDL umani può essere tecnicamente impegnativo e richiede molto tempo, mentre le fonti commerciali di LDL umani purificati sono proibitivi da utilizzare su base di routine o per eseguire schermi batterici su larga scala. Per affrontare queste limitazioni, abbiamo modificato una procedura per l’arricchimento dei LDL dal tuorlo d’uovo di gallina, una ricca fonte di particelle di lipoproteina33. Abbiamo utilizzato con successo spettrometria di massa ad alta risoluzione, ad alta risoluzione/accurata e spettrometria di massa tandem per monitorare l’incorporazione di acidi grassi derivati da LDL umani nella membrana di S. aureus32. A differenza dei metodi precedentemente riportati, questo approccio può quantificare i singoli isomeri di acidi grassi per ciascuno dei tre principali tipi di fosfolipidi stafilocchidi. L’acido oleico (18:1) è un acido grasso insaturi presente all’interno di tutte le particelle di lipoproteina ospite che è prontamente incorporato nei fosfolipidi S. aureus 29,30,32. S. aureus non è in grado di sintesi di acido oleico29; pertanto, la quantità di acido oleico incorporato al fosfolipidi desta la presenza di acidi grassi di origine lipoproteina ospite all’interno della membrana stafilocca29. Queste specie di fosfolipidi possono essere identificate con il metodo di spettrometria di massa all’avanguardia descritto qui, offrendo una risoluzione senza precedenti della composizione della membrana di S. aureus coltivata in presenza di una fonte di acido grasso che probabilmente durante l’infezione.
S. aureus incorpora acidi grassi esogeni nei suoi fosfolipidi di membrana27,32,43. La sintesi fosforalipidea utilizzando acidi grassi esogeni bypassa l’inibizione fasiLi ma altera anche le proprietà biofisiche della membrana27,32,44. Mentre l’incorporazione di acidi grassi esogeni nei fosfolipidi di patogeni Gram-positivi è b…
The authors have nothing to disclose.
Ringraziamo i membri del laboratorio Hammer per la loro valutazione critica del manoscritto e il sostegno di questo lavoro. Il Dr. Alex Horswill della University of Colorado School of Medicine gentilmente fornito AH1263. Il laboratorio Dr. Chris Waters della Michigan State University ha fornito reagenti. Questo lavoro è stato sostenuto dalla sovvenzione 16SDG30170026 dell’American Heart Association e dai fondi di start-up forniti dalla Michigan State University.
Ammonium sulfate | Fisher | BP212R-1 | ≥99.5% pure |
Cell culture incubator | Thermo | MaxQ 6000 | |
Centrafuge | Thermo | 75-217-420 | Sorvall Legen XTR, rotor F14-6×250 LE |
Costar assay plate | Corning | 3788 | 96 well |
Filter paper | Schleicher & Schuell | 597 | |
Large chicken egg | N/A | N/A | Common store bought egg |
Microplate spectrophotometer | BioTek | Epoch 2 | |
NaCl | Sigma | S9625 | |
S. aureus strain AH1263 | N/A | N/A | Provided by Alex Horswill of the University of Colorado |
Dialysis tubing | Pierce | 68700 | 7,000 MWCO |
Tryptone | Becton, Dickison and Company | 211705 | |
0.5 mm zirconium oxide beads | Next Advance | ZROB05 | |
Bullet Blender | Next Advance | BBX24B | |
Methanol (LC-MS grade) | Fisher | A4561 | |
Chloroform (reagent grade) | Fisher | MCX10559 | |
Isopropanol (LC-MS grade) | Fisher | A4611 | |
Dimyristoyl phosphatidylcholine | Avanti Polar Lipids | 850345C-25mg | |
Ammonium bicarbonate | Sigma | 9830 | ≥99.5% pure |
Ammonium formate | Sigma | 70221-25G-F | |
Xcalibur software | Thermo Scientific | OPTON-30801 | |
LTQ-Orbitrap Velos mass spectrometer | Thermo Scientific | high resolution/accurate mass MS | |
Agilent 1260 capillary HPLC | Agilent | ||
SpeedVac Vacuum Concentrators | Thermo Scientific |