Deze methode biedt een kader voor het bestuderen van de opname van exogene vetzuren uit complexe gastheer bronnen in bacteriële membranen, met name Staphylococcus aureus. Om dit te bereiken, protocollen voor de verrijking van lipoproteïne deeltjes uit kip eierdooier en daaropvolgende vetzuur profilering van bacteriële fosfolipiden met behulp van massaspectrometrie worden beschreven.
Staphylococcus aureus en andere gram-positieve pathogenen bevatten vetzuren uit het milieu in membraan fosfolipiden. Tijdens infectie, de meerderheid van exogene vetzuren aanwezig zijn binnen gastheer lipoproteïne deeltjes. Onzekerheid blijft over de reservoirs van gastheer vetzuren en de mechanismen waarmee bacteriën vetzuren uit de lipoproteïne deeltjes halen. In dit werk beschrijven we protocollen voor de verrijking van low-density lipoproteïne (LDL) deeltjes uit kippen eierdooier en bepalen of ldls dienen als vetzuur reservoirs voor S. aureus. Deze methode exploiteert onbevooroordeelde lipidomische analyse en kip LDLs, een effectief en economisch model voor het onderzoek van interacties tussen LDLs en bacteriën. De analyse van S. aureus integratie van exogene vetzuren uit ldls wordt uitgevoerd met behulp van hoge-resolutie/nauwkeurige massaspectrometrie en tandem massaspectrometrie, waardoor de karakterisering van de vetzuur samenstelling van de bacteriële membraan en onbevooroordeelde identificatie van nieuwe combinaties van vetzuren die ontstaan in bacteriële membraan lipiden bij blootstelling aan LDLs. Deze geavanceerde massaspectrometrie technieken bieden een ongeëvenaard perspectief op de opname van vetzuren door het onthullen van de specifieke exogene vetzuren die in de fosfolipiden zijn opgenomen. De hier beschreven methoden zijn aanpasbaar aan de studie van andere bacteriële pathogenen en alternatieve bronnen van complexe vetzuren.
Methicillaire-resistente S. aureus (MRSA) is de belangrijkste oorzaak van de gezondheidszorg-geassocieerde infectie en de bijbehorende antibioticaresistentie is een aanzienlijke klinische uitdaging1,2,3. Daarom is de ontwikkeling van nieuwe therapeutische strategieën een hoge prioriteit. Een veelbelovende behandelingsstrategie voor gram-positieve pathogenen is remming van de vetzuur synthese, een vereiste voor membraan fosfolipide productie die, in S. aureus, omvat dunlaag GLYCEROL (PG), lysyl-PG, en cardiolipine4. Bij bacteriën, vetzuur productie vindt plaats via de vetzuur synthese II Pathway (fasii)5, die aanzienlijk verschilt van de eukaryotische tegenhanger, waardoor fasii een aantrekkelijk doelwit voor de ontwikkeling van antibiotica5,6 . FASII remmers richten voornamelijk op FabI, een enzym vereist voor vetzuur koolstofketen rek7. De Fabi-remmer triclosan wordt in grote lijnen gebruikt in consumenten-en medische goederen8,9. Er worden extra Fabi-remmers ontwikkeld door verschillende farmaceutische bedrijven voor de behandeling van S. aureus -infectie10,11,12,13,14 ,15,16,17,18,19,20,21,22,23 ,24,25,26. Echter, veel gram-positieve pathogenen, waaronder S. aureus, zijn geschikt voor het opruimen van exogene vetzuren voor fosfolipide synthese, omzeilen van fasii remming27,28,29. Zo wordt het klinische potentieel van fasii remmers besproken als gevolg van aanzienlijke lacunes in onze kennis van de bronnen van gastheer vetzuren en de mechanismen waarmee pathogenen vetzuren uit de gastheer27,28extract. Om deze lacunes aan te pakken, ontwikkelden we een onbevooroordeelde lipidomische analysemethode om de opname van exogene vetzuren uit lipoproteïne deeltjes in membraan fosfolipiden van S. aureuste monitoren.
Tijdens sepsis, gastheer lipoproteïne deeltjes vertegenwoordigen een potentiële bron van gastheer-afgeleide vetzuren binnen de vasculatuur, als een meerderheid van de gastheer vetzuren worden geassocieerd met de deeltjes30. Lipoproteïnen bestaan uit een hydrofiele schil bestaande uit fosfolipiden en eiwitten die een hydrofobe kern van triglyceriden en cholesterol esters31omsluiten. Vier belangrijke klassen van lipoproteins-chylomicron, zeer lage dichtheid lipoproteïne, high-density lipoproteïne, en low-density lipoproteïne (LDL) — worden geproduceerd door de gastheer en de functie als lipide vervoer voertuigen, leveren van vetzuren en cholesterol van en naar cellen hosten via de vasculatuur. LDLs zijn overvloedig in veresterd vetzuur, met inbegrip van triglyceriden en cholesterol esters31. We hebben eerder aangetoond dat zeer gezuiverde menselijke Ldl’s een levensvatbare bron van exogene vetzuren voor PG-synthese zijn, waardoor een mechanisme wordt geboden voor de bypass van de FASII-remmer32. Zuiverende menselijke Ldl’s kunnen technisch uitdagend en tijdrovend zijn, terwijl commerciële bronnen van gezuiverde menselijke Ldl’s buitensporig duur zijn om routinematig te gebruiken of grootschalige bacteriële schermen uit te voeren. Om deze beperkingen aan te pakken, hebben we een procedure voor de verrijking van LDLs van kip eierdooier, een rijke bron van lipoproteïne deeltjes33gewijzigd. We hebben met succes ongerichte, hoge-resolutie/nauwkeurige massaspectrometrie en tandem massaspectrometrie gebruikt om de opname van menselijke LDL-afgeleide vetzuren in het membraan van S. aureus32te monitoren. In tegenstelling tot eerder gemelde methoden, deze aanpak kan kwantificeren individuele vetzuur-isomeren voor elk van de drie belangrijkste Staphylococcus fosfolipide typen. Oliezuur (18:1) is een onverzadigd vetzuur aanwezig in alle gastheer lipoproteïne deeltjes die gemakkelijk is opgenomen in S. aureus fosfolipiden29,30,32. S. aureus is niet geschikt voor oliezuur synthese29; Daarom, de hoeveelheid fosfolipide-opgenomen oliezuur stelt de aanwezigheid van gastheer lipoprotein-afgeleide vetzuren binnen de Staphylococcus membraan29. Deze fosfolipide soorten kunnen worden geïdentificeerd door de State-of-the-art massaspectrometrie methode hier beschreven, het aanbieden van een ongekende resolutie van de membraan samenstelling van S. aureus gekweekt in de aanwezigheid van een vetzuur bron het waarschijnlijk ontmoetingen tijdens infectie.
S. aureus bevat exogene vetzuren in zijn membraan fosfolipiden27,32,43. Fosfolipide synthese met behulp van exogene vetzuren omzeilt fasii remming, maar verandert ook de biofysische eigenschappen van het membraan27,32,44. Hoewel de opname van exogene vetzuren in fosfolipiden van gram-positieve pathogenen goed gedocumenteerd is,…
The authors have nothing to disclose.
We danken de leden van het Hammer Laboratory voor hun kritische evaluatie van het manuscript en de ondersteuning van dit werk. Dr. Alex Horswill van de Universiteit van Colorado school of Medicine vriendelijk voorzien AH1263. Dr. Chris Waters Laboratory aan de Michigan State University verstrekt reagentia. Dit werk werd gesteund door de Amerikaanse hart vereniging Grant 16SDG30170026 en start-up fondsen voorzien door Michigan State University.
Ammonium sulfate | Fisher | BP212R-1 | ≥99.5% pure |
Cell culture incubator | Thermo | MaxQ 6000 | |
Centrafuge | Thermo | 75-217-420 | Sorvall Legen XTR, rotor F14-6×250 LE |
Costar assay plate | Corning | 3788 | 96 well |
Filter paper | Schleicher & Schuell | 597 | |
Large chicken egg | N/A | N/A | Common store bought egg |
Microplate spectrophotometer | BioTek | Epoch 2 | |
NaCl | Sigma | S9625 | |
S. aureus strain AH1263 | N/A | N/A | Provided by Alex Horswill of the University of Colorado |
Dialysis tubing | Pierce | 68700 | 7,000 MWCO |
Tryptone | Becton, Dickison and Company | 211705 | |
0.5 mm zirconium oxide beads | Next Advance | ZROB05 | |
Bullet Blender | Next Advance | BBX24B | |
Methanol (LC-MS grade) | Fisher | A4561 | |
Chloroform (reagent grade) | Fisher | MCX10559 | |
Isopropanol (LC-MS grade) | Fisher | A4611 | |
Dimyristoyl phosphatidylcholine | Avanti Polar Lipids | 850345C-25mg | |
Ammonium bicarbonate | Sigma | 9830 | ≥99.5% pure |
Ammonium formate | Sigma | 70221-25G-F | |
Xcalibur software | Thermo Scientific | OPTON-30801 | |
LTQ-Orbitrap Velos mass spectrometer | Thermo Scientific | high resolution/accurate mass MS | |
Agilent 1260 capillary HPLC | Agilent | ||
SpeedVac Vacuum Concentrators | Thermo Scientific |