Vi præsenterer her, en protokol til kultur menneskelige enteroid eller colonoid encellelag, som har intakte barriere funktion at studere epitelial mikrobiota værtssammenspil på det cellulære og biokemiske niveau.
Menneskelige 3-dimensionelle (3D) enteroid eller colonoid kulturer stammer fra krypten base stamceller er i øjeblikket den mest avancerede ex vivo -model af den intestinale epitel. På grund af deres lukkede strukturer og betydelig støtte ekstracellulære matrix er 3D kulturer ikke ideel til vært-patogen undersøgelser. Enteroids eller colonoids kan dyrkes som epitelial encellelag på gennemtrængelig vævskultur membraner til at tillade manipulation af både luminale og basolateral celle overflader og ledsagende væsker. Denne forbedrede luminale overflade tilgængelighed letter modellering bakteriel-epitelial værtssammenspil såsom muligheden for Slim-nedværdigende af enterohemorrhagic E. coli (EHEC) på Colon epitel. En metode til 3D kultur fragmentering, éncellelag såning og transepithelial elektrisk modstand (TER) målinger til at overvåge fremskridt hen imod confluency og differentiering er beskrevet. Colonoid éncellelag differentiering udbytter udskilles slim, der kan studeres ved immunofluorescens eller immunoblotting teknikker. Mere generelt, enteroid eller colonoid encellelag aktiverer en fysiologisk relevante platform til at evaluere bestemte cellepopulationer, der kan blive ramt af patogene eller commensal mikrobiota.
Tarm organoids, enteroids og colonoids har ført til mange fremskridt i forståelsen af stamceller adfærd, intestinal udvikling, Barriere/transport funktion og Celledifferentiering. 1 dog 3D kultur begrænser undersøgelse af vært epitel-patogen interaktion, fordi lumen er ikke direkte tilgængelige for bakterier eller virulens faktorer medmindre de lukkede strukturer udsættes for mikroinjektion. 2 , 3 udskilles desuden materialer såsom små molekyler, proteiner, eller slim nemt kan ikke udtages fra 3D kultur til downstream analyse. Virkningen af patogener på epitel barriere funktion4 og ion transport5 er blevet evalueret i 3D kultur med fluorescerende farvestoffer og time-lapse mikroskopi, men encellelag dyrkes på gennemtrængelig vævskultur understøtter er indstillet til supplerende teknikker som TER måling og Ussing kammer/spænding klemme optagelse. 6 , 7
Talrige publikationer har beskrevet protokoller for 2D eller éncellelag kultur af enteroids/colonoids. Materialer fundet for at fremme epitelcelle udlæg omfatter kollagen hydrogels,8,9 0,1% gelatine,10 tynde lag murine sarkom-afledte basalmembranen matrix (BMM),11,12, 13 og human kollagen IV. 6 , 7 , 14 , 15 , 16 , 17 forhåndsudfyldning tilgange omfatter mekaniske fragmentering af pipettering6,14,15 og/eller dissociation af celle vedhæftning faktorer ved hjælp af trypsin,10,11 dispase,13 eller EDTA. 9 nogle protokoller bruge ikke-porøse væv kultur plasticware for såning, men dette begrænser basolateral adgang, så de fleste programmer afhænger gennemtrængelig vævskultur skær. Dokumentation for stabil sammenflydende éncellelag dannelsen og vedligeholdelse varierer meget blandt publikationerne. Derudover vækst og differentiering media kompositioner for menneskelige kulturer adskiller sig blandt forskellige grupper og fortsætte med at udvikle sig som flere forskere vedtage og justere metoden, der passer til deres anvendelse og tilgængelige ressourcer.
For at løse begrænsningerne af 3D intestinale epitel kultur i vært-patogen interaktion undersøgelser, præsenterer vi en modificeret protokol til konvertering af 3D menneskelige enteroids eller colonoids til en éncellelag. Efter at opnå confluency i en krypt-lignende umoden tilstand, fører tilbagetrækning af vækstfaktorer WNT3A, RSPO1 og hæmmere A-83-01 og SB 202190 til differentiering repræsentant for lille tarm villus eller overflade Colon epitel. Vi beskrive ideelle matrix, human kollagen type IV, at pels indsætter og opnå ensartede enteroid eller colonoid fragmenter for plating. Vi demonstrere, at denne protokol producerer en sammenflydende éncellelag med en høj TER. Colonoid encellelag udskiller en tyk apikale mukuslagets, giver mulighed for ex vivo studier af patogen-Slim interaktion via immunoblotting eller immunfarvning. En modificeret fiksering procedure at bevare Colon mukuslagets for immunfarvning er også beskrevet. Denne metode tager sigte på at give en tractable model for at studere de tidligste intestinal vært-patogen interaktioner ved infektion.
Kritiske parametre for vellykket dannelsen af enteroid/colonoid encellelag omfatter 1) sund, prolifererende 3D kulturer som råvare; 2) belægning celle kultur Indsæt overflade med human kollagen IV inden éncellelag såning; 3) opsplitning af 3D kulturer enten mekanisk eller enzymatisk, men ikke til det enkelte celle niveau.
Under isolation af 3D enteroids/colonoids, kan den optimale ryster hastighed variere afhængigt af den roterende diameter af en given shaker model. Hensigten er at ikke kun agitere plade for en effektiv blanding men også undgå sprøjt cellesuspension på dækslet til pladen eller i tilstødende brønd. Inkubation perioder på < 30 min. kan give resterende BMM klamrer sig til celler, der kan hindre vedhæftet fil og dannelsen af ensartet celle encellelag når belagt på skær. Omfattende inkubation (≥ 1 h) vil give væsentligt nedsat cellernes levedygtighed.
Omfanget af ændring skal adskille 3D enteroids/colonoids kan variere med stempel stivhed og bruger fingerfærdighed. Periodisk gennemgang af godt indholdet på en fase-kontrast lysmikroskop anbefales at bestemme fragment ensartethed under ændring, med et mål på ca. 30 celler pr. fragment. I stedet for eller ud over ændring, kan suspension fordøjes kort med trypsin at opnå mindre ensartet fragmenter. Trypsin digest kan være ønskeligt hvis encellelag indeholder en stor del af 3D-lignende strukturer blandt et ellers enkelt epitel lag. Dissociation til enkelt celler er imidlertid ikke ønskeligt, da dette falder betydeligt cellernes levedygtighed. Et godt af enteroids/colonoids kulturperler i en 35 μL BMM droplet vil generelt være nok til at udfylde 2-3 skær, men denne faktor kan variere afhængigt af antallet og gennemsnitsstørrelsen på enteroids/colonoids.
Colonoid encellelag kan absorbere en betydelig mængde af den apikale medium, som de differentiere. Dette kan omgås ved at anvende yderligere DM øverste Indsæt kammer (150-200 μl), selv om delvis tørring af den øverste kammer ikke synes at påvirke éncellelag levedygtighed eller funktion i downstream assays. Efter ca. 4-5 dage med differentiering udvikle colonoid encellelag ekstracellulære slim, der kan ses som tyk/gelatineagtig materiale på cellens overflade efter grundig aspiration af DM.
Til EHEC samspil med den ydre mukuslagets bruger vi rutinemæssigt bakteriel titer og inkubering perioden som anført i protokollen. Unikke bakteriestammer bør dog i første omgang analyseres på flere koncentrationer og inkubation perioder at fastslå de relevante parametre for den ønskede effekt.
Under Slim fiksering, vil sugning den apikale medium sandsynligvis fjerne de fleste af ekstracellulære løstliggende mukuslagets. Det er derfor vigtigt at omhyggeligt udøse medium. Hvis mediet opbevares i skæret af overfladespænding, bruge hjørne af et foldet laboratorium væv til at bryde overfladespænding og vægen væk de fleste af medium. Efter fiksering og farvning, kan mukuslagets utilsigtet forskubbet eller fladtrykt mens montering et daekglas over Indsæt filter. For at bevare Slim højde, Placer filteret på en dråbe montering medier og omhyggeligt placere daekglas på filteret. Ikke tryk eller tryk ned på daekglas som dette kan betydeligt flade mukuslagets.
For at danne et polariseret éncellelag fra celler i 3D kultur, er det nødvendigt at reproducere samspillet mellem basolateral membran integriner af intestinal epitelceller og ekstracellulære matrix (ECM) proteiner. Laminin, kollagen IV, fibronektin, og en bred vifte af proteoglycaner udgør den intestinale epitel ECM. 21 , 22 vi sammenlignede humane celle-afledte laminin, fibronektin, kollagen IV og murine-afledte BMM som Indsæt belægninger. Kun kollagen IV understøttes oprettelsen af stabile, langsigtede (op til 4 uger) enteroid/colonoid Konfluerende monolag (tallene 1-2). Små lapper af éncellelag-lignende vækst blev indhentet på hver af de øvrige testede matricer, men disse regioner har kunnet udvikle sig til confluency. Brug af human kollagen IV som ECM surrogat har en række fordele. BMM stammer fra Engelbreth-Holm-sværm (EHS) murine sarkom celler ikke der er af menneskelig oprindelse, human kollagen IV er kommercielt tilgængelige og generelt mere omkostningseffektive. Derudover BMM er en kompleks blanding af proteiner med iboende variabilitet, og kan indeholde vækstfaktorer udskilles af sarkom, der påvirker genekspression. 23
Interaktioner mellem tarm epitelceller og den underliggende ECM i tarm epitel tilbagelevering er stadig utilstrækkeligt forstået. Betydningen af kollagen IV, men ikke laminin, som en vedhæftning ligand for menneskelige colonocytes24 og forstærker af intestinal krypt epitelcelle tilbagelevering25 er blevet foreslået af antistoffer mod kollagen IV, der forhindrede vedhæftet fil . Epiteltransport-udtrykt B1-integrin synes at være vigtig for ECM interaktion, et antistof, der er specifikke for B1-integrin betydeligt blokeret vedhæftning af colonocytes til type IV-kollagen. 24 mens kollagen IV giver en pålidelig ECM for enteroid/colonoid éncellelag dannelse på skær, epithelial remodellering af ECM over tid har ikke endnu blevet evalueret i denne model, og heller ikke har indflydelse på mere komplekse og definerede ECM blandinger af kollagen IV, laminin og fibronektin.
Menneskelige enteroids/colonoids i éncellelag format (tallene 1-4) aktiverer manipulationer og prøveudtagning, ville være besværligt eller umuligt at opnå ved hjælp af 3D matrix-embedded kulturer. 3D enteroids/colonoids varierer i størrelse, strukturel kompleksitet og luminale volumen, og dermed mikroinjektion af mikrober eller små molekyler er vanskelige at nøjagtigt kvantificere. Desuden, i modsætning til encellelag (tabel 1) forhindre 3D kulturer direkte adgang til både de luminale og basolateral overflader til at måle ioner, næringsstoffer, cytokiner eller udskilles faktorer i forbindelse med fysiologisk eller patofysiologiske processer . Confluency (tal 1-2) er en af de vigtigste egenskaber af enteroid/colonoid éncellelag nødvendige for oprettelse af ikke blot de fysiologisk forløb af næringsstoffer, ioner, og andre makromolekyler,16 , men også at skabe den rette barriere mellem luminale mikrobiota og sterile mesenchymale/immun celle-befolket serosal miljøer. Disse facetter er vigtigt at overveje for fremtidige undersøgelser, at indarbejde enteroid/colonoid encellelag med mesenchymale, immun eller neuronal celletyper til at bygge mere komplicerede fysiologiske modeller.
Noterede begrænsninger af celle kultur insert model beskrevet her omfatter manglende fysiske kræfter som væske shear stress og mekanisk stræk/kompression (peristaltik), og fraværet af en anaerob apikale miljø normalt opleves af tarm epitheler in vivo. Disse elementer har potentiale til at blive behandlet med mere avancerede microphysiological platforme,26 men de kræver også ekstra udgift, udstyr og ekspertise til at gennemføre. Både 3D og éncellelag kulturer er også uden interaktioner med eller bidrag fra den intestinale microbiome, stromale cellepopulationer og immunsystemet medmindre disse komponenter er målrettet tilføjet.
Fremtidige anvendelser af enteroid/colonoid éncellelag på kollagen IV-belagt celle kultur skær kan omfatte andre undersøgelser af patogene eller commensal mikrobielle interaktion, stof eller næringsstof optagelse, toksicitet, metabolisme, barriere funktion, og funktionelle ekstraudstyr katalyseret af fælles kultur med yderligere intestinal celletyper. Evalueringer kan gøres ikke kun inden for mekanisk påvirkning af raske donorer, men også fra personer med genetiske mutationer eller tarm sygdomme, forudsat den in vivo fænotyper er etableret skal bevares i ex vivo enteroid/colonoid kultur.
The authors have nothing to disclose.
Dette arbejde blev støttet af NIH tilskud P01 AI125181, K01 DK106323 (JGI) og K01 DK113043 (JFA). Vi takke James Kaper (University of Maryland, Baltimore, MD, USA) for at give E. coli stamme HS og EHEC. Vi anerkender også integreret fysiologi og Imaging kerner af Hopkins Conte mave sygdom grundlæggende og Translational forskning Core Center (P30 DK089502) og Johns Hopkins massespektrometri og proteomanalyse kerne.
2-Amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediol | Sigma | T4661 | Tris base, Component of lysis buffer |
A-83-01 | Tocris | 2939 | ALK4/5/7 inhibitor |
Acetic acid, glacial | Fisher Scientific | A38 | |
Advanced DMEM/F12 | Life Technologies | 12634-010 | Component of growth medium |
Alexa Fluor 488 phalloidin | Life Technologies | A12379 | Fluorescent probe for F-actin |
Antibiotic/antimycotic cocktail | Invivogen | ant-pm-2 | Primocin (100x) |
B27, 50x | Life Technologies | 17504-044 | Component of growth medium |
Cell culture inserts | Corning | 3470 | Transwell, PET membrane, 0.4 μm pore, 24-well plate |
CHIR 99021 | Tocris | 4423 | GSK3β inhibitor |
Click-iT Plus EdU Alexa Fluor 594 Imaging Kit | Life Technologies | C10639 | |
Collagen IV, from human placenta | Sigma | C5533 | |
Cultrex Organoid Harvesting Solution | Trevigen | 3700-100-01 | Depolymerizes basement membrane matrix |
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) | Kaper lab, University of Maryland | ||
Epithelial voltohmmeter | World Precision Instruments | EVOM2 | |
Epithelial voltohmmeter electrode | World Precision Instruments | STX3 | |
Escherichia coli strain HS | Kaper lab, University of Maryland | ||
Ethanol, absolute | Pharmco | 111000200 | |
FluorSave mounting medium | Millipore | 345789 | For mounting insert membrane on microscope slide |
GlutaMAX | Life Technologies | 35050-061 | L-alanyl-L-glutamine dipeptide, 200 mM |
HEK293T/Noggin-Fc cell line | van den Brink lab, Tytgat Institute for Liver and Intestinal Research | For production of Noggin conditioned medium | |
HEK293T/RSPO1-Fc-HA cell line | Trevigen | 3710-001-K | For production of Rspondin-1 conditioned medium |
HEPES, 1 M | Life Technologies | 15630-080 | Component of growth medium |
Heraeus Multifuge X1R Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | 75004250 | |
Hoechst 33342 | Life Technologies | H3570 | Fluorescent nuclear dye |
Human epidermal growth factor (EGF) | R&D Systems | 236-EG-01M | Component of growth medium |
IGEPAL CA-630 | Sigma | I8896 | Component of lysis buffer |
Inverted cell culture light microscope | Olympus | CKX51 | |
LB broth | EMD Millipore | 1.10285.0500 | |
L-WNT3A cell line | ATCC | CRL-2647 | For production of Wnt3a conditioned medium |
Matrigel, growth factor reduced | Corning | 356231 | Basement membrane matrix for 3D culture |
Mini cell scraper | United BioSystems | MCS-200 | |
MUC2 antibody, mouse monoclonal | Abcam | ab11197 | Use at 1:100 for immunostaining, 1:500 for immunoblotting |
MUC2 shRNA lentiviral particles | GE Dharmacon | RHS4531 | GIPZ lentiviral shRNA, ID: 4583 |
Orbital shaker | Grant Instruments | PSU-10i | |
Penicillin-streptomycin, 100x | Life Technologies | 15140-122 | Component of growth medium |
Phosphate buffered saline | Corning | 21-031 | |
Probe sonicator with microtip | Branson Ultrasonics | 450 | |
Protease inhibitor cocktail for mammalian cells | Sigma | P8340 | Component of lysis buffer |
SB 202190 | Tocris | 1264 | p38 MAPK inhibitor |
Sodium chloride | Sigma | S3014 | Component of lysis buffer |
Sodium dexoycholate | Sigma | D6750 | Component of lysis buffer |
Sodium dodecyl sulfate | Sigma | L3771 | Component of lysis buffer |
TrypLE Express, 1x | Life Technologies | 12605-010 | Trypsin, for digesting enteroid/colonoid fragments |
Vinculin antibody, rabbit monoclonal | Abcam | ab129002 | Use at 1:1000 for immunoblotting |
Water, tissue culture grade, sterile filtered | Corning | 25-055 | |
Y-27632 | Tocris | 1254 | RhoA/ROCK inhibitor |