Den meksikanske tetra, Astyanax mexicanus (egentlige beinfisker: Characidae), er unik blant fisk for å ha to radikalt forskjellige alternativ morphs – en seende, overflate-bolig morph og en blind, hule-bolig morph består av flere forskjellige bestander¹. Men forskjellige i morfologi og fysiologi, er de fortsatt interfertile^2,3. Disse interfertile morphs synes å ha utviklet seg raskt (~ 20.000 år)⁴, noe som gjør dem en ideell modellsystem for studiet av rask tilpasning. Cavefish er kjent for å ha en rekke forskjellige morfologiske og atferdsmessige egenskaper inkludert økt tetthet smak knopper, økt antall mechanosensors, foraging atferd innstilt til en bestemt frekvens av en vibrerende stimulans, hyperaktivitet, og søvnløshet. Mange av disse virkemåtene trolig utviklet seg samtidig, noe som har blitt foreslått for å være fordelaktig i mørke huler foraging⁵ og Strømsparing i mørke og mat-sparsom^6,7.

I mange evolusjonære modellsystemer er det vanskelig å skaffe integrert kunnskap om hvordan dyr morfologi og atferd endre svar for miljøet fordi de fleste arter er fordelt på en kontinuerlig forløpning i komplekse miljøer. Imidlertid har sterk kontrast mellom den hule og overflate morph Astyanax som utviklet seg i svært ulike miljøer som er preget av en skarp ecotone ført til Astyanax fremstår som en utmerket modell å forstå dyr evolusjon. Dette gjør det mulig å koble lettere gener og utviklingsprosesser adaptive trekk og utvalg i miljøet. Videre siste biomedisinsk undersøkelser av disse trekkene i Astyanax har vist at disse trekkene kan parallell menneskelige symptomer^8,9,10. For eksempel er tap av sosialitet og søvn, og få hyperaktivitet, repeterende atferd og kortisol-nivået lik hva er observert hos mennesker med autisme spektrum lidelse⁸.

For å løse komplekse samtidig evolusjon av mange atferd og morfologiske egenskaper, er det fordelaktig å analysen mange av dem til å markere underliggende genetiske og molekylære trasé. Presenteres her er metoder for karakteriserer graden av hule-type atferdsmessige fenotyper av overflaten, hulen og hybrid morphs av Astyanax. Fokal atferd analysert betegner fenotypen er hule-tilpasset foraging atferd (vibrasjon attraksjon atferd, referert til heretter som VAB) og hyperaktivitet/hvile varigheten^11,12. Også presentert er en bildebehandling metode for sensorisk systemet knyttet VAB¹³. Nylig mange åpen kildekode sporingsprogramvare for å kjøre atferdsmessige analyser har blitt tilgjengelig^14,15. Disse fungerer godt for korte videoer, mindre enn 10 minutter. Det blir imidlertid problematisk Hvis videoen er lengre på grunn av intens beregning/sporing tid. Dugelig kommersielt tilgjengelig programvare kan være dyrt. Metodene presentert hovedsaklig freeware og derfor anses kostnadseffektivt og høy gjennomstrømming. Også inkludert er representativt resultater basert på disse metodene.