Een kwantitatieve methode is ontwikkeld om te identificeren en te voorspellen van de acute toxiciteit van chemische stoffen door het automatisch analyseren de fenotypische profilering van Caenorhabditis elegans. Dit protocol wordt beschreven hoe behandelen van wormen met chemicaliën in een 384-well-plate, vastleggen van video’s en kwantificeren van toxicologische verwante fenotypen.
Het toepassen van toxiciteit van chemische stoffen in hogere orde organismen, zoals muizen of ratten, is tijdrovend en duur, als gevolg van hun lange levensduur en onderhoud kwesties. Integendeel, de nematode Caenorhabditis elegans (C. elegans) heeft voordelen zodat het een ideale keuze voor toxiciteitstests: een korte levensduur, gemakkelijke teelt en efficiënte reproductie. Hier beschrijven we een protocol voor de automatische fenotypische profilering van C. elegans in een 384-well-plate. De nematode wormen zijn gekweekt in een 384-well plaat met vloeibare middellange en chemische behandeling en video’s zijn genomen van elk putje te kwantificeren van de chemische invloed op 33 worm functies. Experimentele resultaten aantonen dat de gekwantificeerde fenotype functies kunnen classificeren en voorspellen van de acute toxiciteit voor verschillende chemische verbindingen en een prioriteitenlijst op met voor meer traditionele chemische toxiciteit assessment tests in een knaagdier model stelt.
Samen met de snelle ontwikkeling van chemische verbindingen die zijn toegepast op de industriële productie en het dagelijks leven van mensen, is het belangrijk om te bestuderen van de toxiciteit van de modellen voor de chemische stoffen. In veel gevallen is het knaagdier diermodel aangewend om te evalueren van de potentiële toxiciteit van verschillende chemische stoffen op de gezondheid. In het algemeen, wordt de bepaling van de letale concentratie (dat wil zeggen, de getest 50% letale dosis [LD50] van verschillende chemische stoffen) gebruikt als de traditionele parameter in een in vivo knaagdier (rat/muis)-model dat is tijdrovend en zeer duur. Bovendien, als gevolg van de verminderen, verfijnen of vervangen (3R)-beginsel dat is essentieel voor het welzijn van dieren en ethiek, nieuwe methoden waarmee voor de vervanging van hogere dieren zijn waardevol voor wetenschappelijk onderzoek1,2,3 . C. elegans is een free-living nematode die geïsoleerd uit bodem is. Het heeft grote schaal gebruikt als een organisme onderzoek in het laboratorium vanwege zijn gunstige kenmerken, zoals een korte levensduur, gemakkelijke teelt en efficiënte reproductie. Daarnaast worden vele fundamentele biologische paden, met inbegrip van fundamentele fysiologische processen en stress reacties in C. elegans, bewaard in hogere zoogdieren4,5,6,7 , 8. in een aantal vergelijkingen die wij en anderen hebben gedaan, er is een goede overeenstemming tussen C. elegans toxiciteit en toxiciteit bij knaagdieren9waargenomen. Dit alles maakt C. elegans een goed model voor het testen van de effecten van chemische toxicities in vivo.
Sommige studies gekwantificeerd onlangs, de fenotypische kenmerken van C. elegans. De functies kunnen worden gebruikt om de toxicities van3,10 van de2,van de chemische stoffen en de veroudering van wormen11te analyseren. Ook ontwikkelden we een methode die een vloeibaar worm culturing systeem en een analysesysteem combineert, waarin de wormen gekweekt in een 384-well plaat onder verschillende chemische behandelingen12 zijn. Deze kwantitatieve techniek heeft ontwikkeld om te analyseren automatisch de 33 parameters van C. elegans na 12-24h van chemische behandeling in een 384-well plaat met vloeistof. Een geautomatiseerde Microscoop stadium wordt gebruikt voor experimentele video acquisitie. De video’s worden verwerkt door een speciaal ontworpen programma en 33 kenmerken in verband met de wormen bewegende gedrag worden gekwantificeerd. De methode wordt gebruikt om te kwantificeren van de worm fenotypen onder de behandeling van 10 verbindingen. Uit de resultaten blijkt dat verschillende toxicities als de fenotypen van C. elegans veranderen kunnen. Deze gekwantificeerde fenotypen kunnen worden gebruikt voor het identificeren en voorspellen van de acute toxiciteit van verschillende chemische verbindingen. Het algemene doel van deze methode is de observatie en fenotypische kwantificering van experimenten met C. elegans in een vloeibare cultuur te vergemakkelijken. Deze methode is nuttig voor de toepassing van C. elegans in chemische toxiciteit evaluaties en fenotype ondermeer, die helpen bij het voorspellen van de acute toxiciteit van verschillende chemische verbindingen en stelt een prioriteitenlijst op met voor meer traditionele de tests van de beoordeling van het chemische toxiciteit in een knaagdier model. Bovendien, kan deze methode worden toegepast om de toxiciteit screening en het testen van nieuwe chemische producten of de verbinding als het voedsel additieve agent verontreiniging, pharmacautical verbindingen, milieu exogene stof, enzovoort.
De voordelen van C. elegans hebben geleid tot het toenemende gebruik ervan in de toxicologie9, zowel voor mechanistische studies en high-throughput screening benaderingen. Een grotere rol voor C. elegans in aanvulling op andere modelsystemen in toxicologisch onderzoek is opmerkelijk in de afgelopen jaren, met name voor de beoordeling van de snelle toxiciteit van nieuwe chemicaliën. Dit artikel bevat een nieuwe bepaling van hoge-doorvoer, kwantitatieve screening van worm fenotype…
The authors have nothing to disclose.
De auteurs bedanken CGC kandidatuur verzenden de C. elegans. Dit werk werd gesteund door de nationale sleutel onderzoek en ontwikkeling programma van China (#2018YFC1603102, #2018YFC1602705); Nationale Natural Science Foundation van China Grant (#31401025, #81273108, #81641184), de hoofdstad gezondheidsonderzoek en de ontwikkeling van speciaal Project in Peking (#2011-1013-03), het Fonds van de Opening van de Beijing belangrijkste laboratorium voor milieutoxicologie (# 2015HJDL03), en de Stichting van de natuurwetenschappen van de noordoostelijke provincie Shandong, China (ZR2017BF041).
2-Propanol | Sigma-Aldrich | 59300 | |
384-well plates | Throme | 142761 | |
Agar | Bacto | 214010 | |
Atropine sulfate | Sigma-Aldrich | PHL80892 | |
Bleach buffer | 0.5 mL of 10 M NaOH, 0.5 mL of5% NaClO, 9 mL ofultrapure water | ||
Cadmium chloride | Sigma-Aldrich | 202908 | |
Calcium chloride | Sigma-Aldrich | 21074 | |
CCD camera | Zeiss | AxioCam HRm | Zeiss microscopy GmbH |
Cholesterol | Sigma-Aldrich | C8667 | |
Copper(II) sulfate | Sigma-Aldrich | 451657 | |
Ethanol | Sigma-Aldrich | 24105 | |
Ethylene glycol | Sigma-Aldrich | 324558 | |
Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516 | |
K-Medium | 3.04 g of NaCl and 2.39 g of KCl in 1 L ultrapure water | ||
LB Broth | 10 g/L Tryptone, 5 g/L Yeast Extract, 5 g/L NaCl | ||
Magnesium sulfate heptahydrate | Sigma-Aldrich | 63140 | |
NGM Plate | 3 g ofNaCl, 17 g ofagar, 2.5 g ofpeptone in 1 L of ultrapure water, after autoclave add 1 mL of cholesterol (5 mg/mL in ethanol), 1 mL of MgSO4 (1 M), 1 mL of CaCl2 (1 M), 25 mL of PPB buffer | ||
Peptone | Bacto | 211677 | |
Potassium chloride | Sigma-Aldrich | 60130 | |
Potassium phosphate dibasic | Sigma-Aldrich | 795496 | |
Potassium phosphate monobasic | Sigma-Aldrich | 795488 | |
PPB buffer | 35.6 g of K2HPO4, 108.3 g of KH2PO4 in 1 L ultrapure water | ||
shaker | ZHICHENG | ZWY-200D | |
Sodium chloride | Sigma-Aldrich | 71382 | |
Sodium fluoride | Sigma-Aldrich | s7920 | |
Sodium hydroxide | Sigma-Aldrich | 71690 | |
Sodium hypochlorite solution | Sigma-Aldrich | 239305 | |
The link of program | https://github.com/weiyangc/ImageProcessForWellPlate | ||
Tryptone | Sigma-Aldrich | T7293 | |
Yeast extract | Sigma-Aldrich | Y1625 | |
Zeiss automatic microscope | Zeiss | AXIO Observer.Z1 | Zeiss automatic microsco with peproprietary software Zen2012 and charge coupled device(CCD) camera |