Assay агрегации Тау, описанные в этой рукописи имитирует ожидаемых особенностей в vivo сворачиванию Тау и агрегации.
Агрегация белка Тау и формирования винтовой паре нитей является отличительной особенностью болезни Альцгеймера и других tauopathies. По сравнению с другими белками, связанные с нейродегенеративных заболеваний, сообщил в vitro кинетика агрегации для белка Тау менее последовательным, представляя относительно высокой изменчивости. Здесь мы описываем развития в vitro агрегации assay который имитирует ожидаемый шаги, связанные с Тау сворачиванию и агрегации в естественных условиях. Assay использует длинный изоформы Тау (huTau441), который содержит N-терминальный кислой вставок, а также четыре микротрубочек связывания доменов (MBD). Агрегирование в vitro вызвана добавлением гепарина и непрерывно следуют Тиофлавин Т флуоресценции в формате 96 хорошо микроплиты. Assay агрегации Тау высоко воспроизводимых между различными скважин, экспериментальные запуски и пакетов белка. Агрегирование приводит к Тау PHF-как морфология, который является очень эффективным в посева образование de novo фибриллярного структур. В дополнение к его применение в изучении механизма Тау сворачиванию и агрегации текущий анализ является надежным инструментом для скрининга наркотиков, которые могут вмешиваться в патогенезе Тау.
Болезнь Альцгеймера является разрушительным нейродегенеративных расстройств, которая определяется histopathologically накопление внеклеточного старческое бляшек агрегированных амилоид-beta1 и внутриклеточных нейрофибриллярных клубков содержащие агрегированные hyperphosphorylated белка Тау2. Физиологические Тау мономерные и представлены как шесть уникальных изоформ, содержащий 0-2 терминала вставки N и 3 или 4 микротрубочек связывания доменов3,4 вытекающих из альтернативного сплайсинга и в среднем 2-3 phosphorylations. Считается, что hyperphosphorylation, сворачиванию и самостоятельной агрегации в фибриллово структуры являются ключевыми элементами в патогенезе Тау, как патологически начисленных в безумный человек5,6.
Агрегированные Тау нейрофибриллярных клубков являются визитной карточкой не только для объявлений, но и для других tauopathies, включая frontotemporal Лобар дегенерация (FTLD), болезнь пика, прогрессивный Надъядерный Паралич (PSP), лобно височной деменции (FTD) и первичной возрастные Таупатия (часть)2. С биохимической точки зрения, понимание механизма Тау сворачиванию и агрегирование может пролить свет на патологические процессы, связанные с AD и других tauopathies. В дополнение к научным аспектам надежные в vitro статистических анализов являются ценными инструментами для скрининга наркотиков кандидатов7,8,9,10. Считается, что агрегирование Тау следующим нуклеации зависимых полимеризации процесса (НДП)11,12,,1314. Кинетика НДП сигмоид и начинается с шага напористо неблагоприятно нуклеации, последовал процесс быстро, энергично низ агрегации.
В отличие от других amyloidogenic белков, включая прионных белков, бета-амилоида и α-synuclein Тау не спонтанно совокупности в физиологических условиях и даже экстремальные pHs или высоких температур не благоприятную для агрегирования15. Это наиболее вероятно объясняется гидрофильное взаимодействий в интерфейсе агрегации Тау. Однако Тау агрегаты эффективно при физиологических концентрациях при использовании индукторов например гепарина16 или17,другие полианионами18 .
Предыдущие усилия по созданию в vitro Тау статистических анализов пролил некоторый свет на детали Тау сворачиванию и агрегации, но они пришли короткий из имитирует то, что считается кинетики Тау агрегации в естественных условиях . В большинстве случаев кинетика агрегации Тау отсутствует этапа начальной задержки, связанные с Тау зародышеобразования. Это могло быть следствием использования концентрации белка очень высокий Тау, наличие агрегатов в начальной подготовке белка Тау и/или использование Тау фрагментов с гораздо более ярко выраженной склонности агрегации, чем более физиологических полная длина Тау белка19,20,21,22,23. Кроме того предыдущие исследования не рассматривался аспект надежности Тау агрегации кинетики и повторяемость.
Здесь мы описываем надежные в vitro Тау агрегации assay который имитирует основные характеристики нуклеации зависимых полимеризации с этапа первоначального ЛАГ соответствующий Тау нуклеации, следуют фазы экспоненциального роста. Кроме того сгенерированный рекомбинантных Тау агрегатов фибриллярного характер и имеют чрезвычайно высокой потенции посева. Assay высокую воспроизводимость также между сериями Тау и представляет собой ценный инструмент для ингибиторы агрегации.
Несмотря на многочисленные усилия кинетика агрегации Тау в литературе о Дата отсутствия желаемый уровень воспроизводимости и/или некоторые из особенностей нуклеации зависимых полимеризации19,20,21 , 22 , 23 , 25. это часто подчеркивается отсутствие участка запаздывания, неэффективных посева и не фибриллярный природы Тау агрегатов. Причины этих недостатков может меняться и включает в себя субоптимальных Тау качества протеина (фрагментация, наличие агрегатов, низкой чистоты, и т.д.), выбор белка и вызывая реагентов, и или экспериментальных условиях. Еще одним осложняющим фактором являются два хвоща остатки расположенных вокруг Тау агрегации интерфейса, которые можно сформировать внутри – или Интер – молекулярных дисульфидных мостов в зависимости от окружающей среды окислительно-восстановительные и влияют на эффективность Тау агрегации. В большинстве подходов снижения реагенты, такие как DTT или TCEP были использованы для поддержания остатков цистеина в восстановленных форм и таким образом увеличить уровень воспроизводимости25. Кроме того Коэффициент вымирания Тау является очень низким, что приводит к трудностям в точных измерений концентрации белка.
Мы особенно посвящены несколько параметров и атрибуты качества, которые мы рассматривали решающее значение для надежной, воспроизводимые и представитель агрегации профиль белка Тау: исключающий возможность интра – и Интер-молекулярных дисульфида формирования, создание высоко чистый Тау мономера и повышение точности определения концентрации. Все эти реагент связанные вопросы потенциальных точек внимания, которые мы рассматривали решающее значение для оптимальной пробирного развития. Для решения этих вопросов, была выражена полная длина huTau441 с двумя мутации, C291A и C322A и с N – и C-терминала Теги. Мутация остатков цистеина оказывает минимальное влияние на белка Тау устраняя иначе очень трудно контролировать преодоление дисульфида. Выражая белка с относительно коротким N – и C-терминала Теги позволило нам продолжать двухэтапный сродства очищения протокол, который привело к очень высокой чистоты, целостности и мономера контента. Кроме того мы ввели F8W мутации, что увеличился коэффициент вымирания белка и позволили гораздо более точные измерения концентрации24.
Помимо использования высококачественного белка реагентов, другие параметры анализа были также оптимизирован. Оптимальное Тау: гепарин соотношение было определено около 0.5 (М/М), который соответствует ранее опубликованных исследований26. Кроме того механических и оптических инструментальные параметры имеют решающее значение для обеспечения воспроизводимости и оптимальные параметры могут отличаться в некоторой степени в зависимости от производителя.
Агрегирование Тау, описанные в этом assay показывает характеристики, которые связаны с Тау патогенеза в AD и связанных с tauopathies. Этот процесс начинается с этапа первоначального ЛАГ соответствующий формирования высокой энергии ядра и сопровождается фазы быстрого роста, что соответствует росту волосики. Время запаздывания достаточно долго, чтобы открыть окно широкую подробно изучить посевной процесс, охватывающий широкий спектр семян концентрации (.рис. 5) пока еще не слишком долго, чтобы избежать деградации белков и/или неспецифических агрегации (Рисунок 2). Эти вторичные события особенно может произойти когда неразрывно неупорядоченных белков, таких как huTau441 подвергается в течение длительных периодов времени в физиологических условиях. Полученные Тау агрегатов отображения морфология PHFs изолированы от мозг больных ад и являются очень эффективными в плане найма мономерных Тау и преобразования его в de novo генерируется агрегатов, процесс, именуемый посева. Assay высокую воспроизводимость, кинетические кривые, будучи практически неотличимы между скважин, экспериментальные запуски и белка пакетов. Хотя текущий assay фокусируется только на длинный изоформы Тау, huTau441, приложение может быть адаптирована для изучения преобразования других форм Тау (Ameijde et al., Acta Neuropathologica коммуникаций, в печати) Кроме того, он позволяет механистический исследования сосредоточены на взаимодействии изоформ Тау и возможно пролить свет на различия между патогенеза Тау в ад, где 3R и 4R изоформ присутствуют в PHFs и пика болезни или слабоумия Frontotemporal где Тау патологии содержит главным образом 3R и 4R Тау изоформ, соответственно27.
Очень высокая воспроизводимость assay должны позволить читателям его реализации с относительной легкостью в их конкретных лабораторных параметров. Assay имитирует то, что считается в vivo сворачиванию и агрегирования Тау, включение механистический исследования, которые прольют свет на патогенез Тау и он является ценным инструментом для скрининга наркотиков кандидатов и оценивать их вмешательства с различные этапы процесса патогенеза.
The authors have nothing to disclose.
Авторы хотели бы поблагодарить Гектор Quirante для очистки huTau441 и выражение, Hanna Inganäs и Ван Винзен Margot за отличную техническую поддержку и Мартин Koldijk для анализа данных.
Thioflavin T | Sigma-Aldrich | T3516-5G | dry powder (Mw = 318.86 g/mol) |
Heparin | Sigma-Aldrich | H3393-50KU | dry powder (Mw = 17-19 kDa) |
TCEP | Sigma-Aldrich | 75259-1G | dry powder (MW= 286.65 g/mol) |
PBS | Gibco-Life Technologies | 10010-015 | Sterile, pH 7.4 (1X) |
0.22 μm sterile filter | Corning | 431160 | PES membrane |
0.20 μm sterile serynge filter | Corning | 431229 | PES membrane |
96-well microplates | Thermo Scientific | 9502867 | Black, flat botton |
Microplate sealers | R&D Systems | DY992 | Adhesive strips |
Synergy Neo2 Multi-Mode Microplate Reader | Biotek | Synergy Neo2 | Hybrid Technology, Gen5 Software |
Eppendorf Tubes | Eppendorf | 0030 120.086 | 1,5 ml tubes |
Ultrasonics-Branson SFX250 | Branson | 101-063-966R | 1/2" Solid Horn and 1/8" microtip |