Aqui, apresentamos um protocolo para tuberculose humana de modelo em um adulto zebrafish usando seu patógeno natural Mycobacterium marinum. Extraído DNA e RNA de órgãos internos de zebrafish infectado podem ser usado para revelar que o total micobacteriana carrega no peixe e as respostas de imune do hospedeiro com qPCR.
Mycobacterium tuberculosis é atualmente o mais mortífero patógeno humano causando infecções 10,4 milhões e 1,7 milhões de mortes todos os anos. Exposição a esta bactéria faz com que um espectro largo de doença em seres humanos, que vão desde uma infecção esterilizada para uma doença mortal ativamente progredindo. A forma mais comum é a tuberculose latente, que é assintomática, mas tem o potencial para reativar a uma doença fulminante. Zebrafish adulto e seu patógeno natural Mycobacterium marinum recentemente provaram para ser um modelo aplicável para estudar o espectro de doença ampla de tuberculose. Importante, espontânea latência e reativação, bem como adaptáveis respostas imunes no contexto da infecção micobacteriana pode ser estudadas neste modelo. Neste artigo, descrevemos os métodos para a infecção experimental de zebrafish adulto, a coleção dos órgãos internos para a extração de ácidos nucleicos para a medição das cargas micobacterianas e acolhimento respostas imunes por PCR quantitativo. O in desenvolvido internamente, M. marinum –ensaio de qPCR específico é mais sensível que os métodos tradicionais de chapeamento como também detecta DNA de micobactérias não-dividindo, dormentes ou recentemente mortas. Como o DNA e o RNA são extraídos do mesmo indivíduo, é possível estudar as relações entre o estado doente e a expressão do gene hospedeiro e patógeno. O modelo adulto zebrafish para tuberculose, portanto, apresenta-se como um sistema altamente aplicável, não-mamíferos na vivo para estudar interações patógeno-hospedeiro.
Peixe-zebra (Danio rerio) é um modelo animal amplamente utilizado na investigação biomédica e é um modelo aceito para a biologia de vertebrados comum. O zebrafish foi adaptada a muitos campos de pesquisa modelagem de doenças humanas e desordens que variam de câncer1 e doença cardíaca2 a infecção e estudos imunológicos de várias bactérias 3 e infecções virais4 , 5. Além disso, o ex utero desenvolvimento de embriões de zebrafish fez o zebrafish um modelo popular em biologia do desenvolvimento-6 e toxicologia7,8.
Em muitos campos de investigação, incluindo a biologia da infecção, as larvas de zebrafish opticamente transparente são comumente usadas. As primeiras células imunes aparecem dentro fertilização post de 24 h (hpf), quando os macrófagos primitivos são detectados9. Os neutrófilos são as células imunitárias próximo a aparecer por volta de 33 hpf10. Zebrafish larvas são, portanto, viáveis para o estudo da fase inicial da infecção e o papel da imunidade inata na ausência de células do sistema imune adaptativo11. No entanto, o zebrafish adulto com seu totalmente funcional sistema imune adaptativo fornece uma camada adicional de complexidade para experimentos de infecção. Células T podem ser detectadas em torno de 3 dias pós fertilização12, e as células B são capazes de produzir anticorpos funcionais por 4 semanas pós fertilização13. O peixe-zebra adulto tem todas as principais contrapartes do mamífero sistema imune inato e adaptativo. As principais diferenças entre o immune systems de peixe e os seres humanos são encontradas no anticorpo isotipos, bem como a anatomia dos tecidos linfoides. O peixe-zebra tem anticorpo apenas três classes14, Considerando que os seres humanos têm cinco15. Na ausência de medula óssea e gânglios linfáticos, os órgãos linfoides primários no peixe são o rim e o Timo16 e o baço, o rim e o intestino servem como órgãos linfoides secundários17. Apesar dessas diferenças, com seu arsenal completo imune das células inatas e adaptativas, o zebrafish adulto é um modelo altamente aplicável, fácil de usar, não-mamíferos para estudos de interação patógeno-hospedeiro.
O zebrafish ultimamente foi estabelecido como um modelo viável de estudar tuberculose18,19,20,21,22. A tuberculose é uma doença no ar, causada pelo Mycobacterium tuberculosis. De acordo com a Organização Mundial de saúde, tuberculose causou1,7 milhões de mortes em 2016 e é a principal causa de morte por um patógeno único no mundo23. Os ratos24,25, coelhos26 e primatas não-humanos27 são que o animal mais conhecido modelos na pesquisa de tuberculose, mas cada rosto suas limitações. O modelo de primatas não humanos de M. tuberculosis infecção da doença humana assemelha-se mais intimamente, mas usar este modelo é limitado devido a considerações éticas graves. Outros modelos animais são prejudicados pela anfitrião-especificidade de M. tuberculosis que afeta a patologia da doença. Provavelmente o maior problema na modelagem de tuberculose é o amplo espectro de infecção e doença resultados na doença humana: a tuberculose é uma doença muito heterogênea, variando de esterilização imunidade a infecção latente, ativa e reativada28 , que pode ser difícil de reproduzir e modelo experimentalmente.
Mycobacterium marinum é um parente próximo do M. tuberculosis com proteínas de ortólogos ~ 3.000 com 85% de identidade de aminoácidos29. M. marinum naturalmente infecta zebrafish produzir granulomas, as principais características da tuberculose, em seus órgãos internos19,30. Ao contrário de outros modelos animais utilizados na pesquisa de tuberculose, zebrafish produz muitos filhos, requer apenas um espaço limitado e importante, neurophysiologically é o modelo de tuberculose vertebrados menos desenvolvido disponível. Além disso, a M. marinum infecção causa infecção latente, doença ativa ou mesmo esterilização da infecção micobacteriana no zebrafish adulto intimamente imitando o espectro dos resultados de doença da tuberculose humana19, 31 , 32. aqui, descrevemos os métodos para o modelo experimental de tuberculose de adultos do zebrafish injetando M. marinum na cavidade abdominal e usando PCR quantitativo para medir a cargas micobacterianas e respostas imunes de zebrafish amostras de tecido.
Aqui nós descrevemos uma aplicação baseada em qPCR para medir micobacterianas cargas de DNA extraído de tecidos de zebrafish adultos infectados experimentalmente. Este aplicativo é baseado em cartilhas projetadas em torno do 16S-23S rRNA espaçador transcrito interno sequência40. A carga total de micobactérias em uma amostra de peixes é estimada usando uma curva padrão preparada a partir de DNA extraído de um número conhecido de micobactérias culturas e assumindo que uma bactéria tem …
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi apoiado pelo finlandês Cultural Foundation (H.L.), Fundação de tuberculose de Tampere (H.L., L.-M.V., M.M.H, M.P.), Fundação da associação finlandesa de antituberculose (Suomen Tuberkuloosin Vastustamisyhdistyksen Säätiö) (H.L., M.M.H, M.P.), Sigrid Jusélius Foundation (P.F.), Emil Aaltonen Foundation (M.M.H), Jane e Aatos Erkko Foundation (P.F.) e Academia da Finlândia (P.F.). Leena Mäkinen, Hanna-Leena Piippo e Jenna Ilomäki são reconhecidos por sua assistência técnica. Os autores reconhecem o laboratório de Zebrafish de Tampere para seu serviço.
Mycobacterium marinum | American Type Culture Collection | ATCC 927 | |
Middlebrock 7H10 agar | BD, Thermo Fisher Scientific | 11799042 | |
Middlebrock OADC enrichment | BD, Thermo Fisher Scientific | 11718173 | |
Middlebrock 7H9 medium | BD, Thermo Fisher Scientific | 11753473 | |
Middlebrock ADC enrichment | BD, Thermo Fisher Scientific | 11718173 | |
Tween 80 | Sigma-Aldrich | P1754 | |
Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516-500ML | |
GENESYS20 Spectrophotometer | Thermo Fisher Scientific | ||
Phosphate buffered saline tablets (PBS) | Sigma-Aldrich | P4417-50TAB | |
Phenol red | Sigma-Aldrich | P3532 | |
27G needle | Henke Sass Wolf | 4710004020 | |
1 ml syringe | Henke Sass Wolf | 4010.200V0 | |
Omnican 100 30G insulin needle | Braun | 9151133 | |
3-aminobenzoic acid ethyl ester (pH 7.0) | Sigma-Aldrich | A5040 | |
1.5 ml homogenization tube | Qiagen | 13119-1000 | |
2.8 mm ceramic beads | Qiagen | 13114-325 | |
Ethanol, ETAX Aa | Altia | ||
2-propanol | Sigma-Aldrich | 278475 | |
Chloroform | VWR | 22711.290 | |
Guanidine thiocyanate | Sigma-Aldrich | G9277 | FW 118.2 g/mol |
Sodium citrate | Sigma-Aldrich | 1613859 | FW 294.1 g/mol |
Tris (free base) | Sigma-Aldrich | TRIS-RO | FW 121.14 g/mol |
TRI reagent | Molecular Research Center | TR118 | Guanidine thiocyanate-phenol solution |
PowerLyzer24 homogenizator | Qiagen | ||
Sonicator m08 | Finnsonic | ||
Nanodrop 2000 | Thermo Fisher Scientific | ||
SENSIFAST No-ROX SYBR, Green Master Mix | Bioline | BIO-98005 | |
qPCR 96-well plate | BioRad | HSP9601 | |
Optically transparent film | BioRad | MSB1001 | |
C1000 Thermal cycler with CFX96 real-time system | BioRad | ||
RNase AWAY | Thermo Fisher Scientific | 10666421 | decontamination reagent eliminating RNases |
DNase I | Thermo Fisher Scientific | EN0525 | |
Reverse Transcription Master Mix | Fluidigm | 100-6298 | |
SsoFast Eva Green master mix | BioRad | 172-5211 |