여기 우리는 vivo에서높은 spatio 시간적 해상도에서 라이브 이미징 상처 복구와 관련 된 염증 반응에 대 한 프로토콜을 제시. 이 메서드는 초파리 개발 장기 이미징 및 시간이 지남에 따라 특정 세포 인구의 추적을 가능 하 게 하의 번데기 단계를 활용 하 고 효율적인 RNAi 중재 유전자 비활성화와 호환 됩니다.
조직 손상에 급속 한 염증 반응, 동안 타고 난 면역 계통의 세포는 부상 사이트에 신속 하 게 보충 된다. 일단 상처에 타고 난 면역 세포 감염을 싸우는, 회 저 성 파편, 지우기 및 매트릭스 증 착을 자극 같은 필수적인 기능을 수행 합니다. 완전히이 면역 반응을 조절 하는 다양 한 신호 이벤트 이해, 그것은의 복잡 한 행동 (와 사이 발생 하는 상호 작용)을 관찰 하는 중요 한 여러 세포 계보는 vivo에서, 그리고 실시간으로 높은 spatio 시간적 해상도입니다. 광학 투명와 초파리 배아의 유전자 추적성 라이브 이미지에 귀중 한 모델 초파리 를 설립의 메커니즘을 포함 한 염증 성 세포의 근본적인 측면을 해 부 발달 분산, apoptotic 시체 및 미생물 병원 체, 그리고 상처에 채용의 그러나, 최근 작업 이제 보여주었다는 다양 한 향상 된 RNAi 효율성, 더 긴 기간, 이미징 등 뚜렷한 장점 제공- 초파리 번데기- 초파리 수명 주기에서 훨씬 나중의 단계를 사용 하 고 상당히 큰 면역 세포 숫자입니다. 여기 우리가 영상 상처 복구에 대 한 프로토콜 및 라이브 초파리 번데기에서 높은 spatio 시간적 해상도 관련된 염증 반응을 설명합니다. 다시 epithelialization와 염증의 역학 관계에 따라, 우리는 상피와 타고 난 면역 세포에 대 한 특정 vivo에서 형광 마커 수를 사용 합니다. 우리는 또한 부상 사이트에서 사진 컨버터블 fluorophores, 단풍나무, 등 그들은 이주 하는으로 그들의 행동을 추적 하는 특정 면역 세포 하위 집합을 다음에 대 한 해결의 효과 보여줍니다.
효율적이 고 효과적인 선 동적인 응답은 감염을 싸울, 파편, 분명 부상된 조직1의 복구를 조정 하는 어떤 유기 체에 대 한. 비록이 응답은 대부분 조직 손상의 피할 수 없는 결과, 염증 필요 합니다 엄격한 규제를 때문에 부적절 한 염증 반응 (만성 비 치유, 상처를 포함 한 다른 인간의 질병의 다양 한에 연결 되었습니다. 과도 한 흉터와 암에 타고 났다)1,2,3. 이 임상 관련성을 감안할 때, 그것은 새로운 예 후 지표 및 다양 한 만성 염증 치료 하는 전략을 개발 하기 위해 염증 반응을 운전 분자 및 세포 메커니즘의 더 상세한 이해를 얻기 위해 중요 한 조건 연장 하 고 불필요 한 염증에서 조직 복구를 보호할 수 있습니다.
최근 몇 년 동안, 초파리 해 부 인간4,5곤충에서 보존 하는 염증 반응의 기본 기능을 잘 설립 하 고 귀중 한 모델 시스템 되고있다. 현재, 초파리 (예: 마우스 또는 zebrafish), 다른 실험 모델에서 현재 가능한 것 보다 훨씬 더 큰 유전 추적성 제공 vivo에서 정확한 spatio 시간적 유전자 조작 허용 (비활성화 하려면 또는 -정의 된 개발 시간 지점에서 특정 세포 유형 내의 관심사의 어떤 유전자 표현)와 게놈 넓은의 용이성 화면6,7. 전통적으로, 상처 치유와 초파리 에 염증의 대부분의 라이브 이미징 연구 수행 되었습니다 배아 단계에서 배아는 ( 초파리 애벌레 또는 성인)과 달리 움직이지과 광학 반투명 수 있습니다. 비교할 수 없는 높은 해상도 vivo에서 이미징8. 이 응답 배아 상피9, 기계 또는 레이저 유도 부상으로 상처 사이트에 초파리 타고 난 면역 세포 (hemocytes)의 신속 하 고 강력한 모집을 시각화 하는 연구자를 수 있다 10 , 11 , 12 , 13 , 14. 유전자 조작으로 이러한 라이브 이미징 연구를 결합 하 여 연구에 초파리 태아 염증 성 세포 행동 비보를 제어 하는 많은 중요 한 면역 세포 단백질 발견. 예를 들어 CED 1 체 드레이퍼 (는 ITAM 도메인에 포함 된 단백질) 발견 되었습니다는 중요 한 ‘손상 수용 체’로 H2O2의 모집 초파리 면역 세포 중재-의 사이트에 의존 방식으로 15를 손상. 면역 세포 내에서 레벨을 드레이퍼 칼슘 유도 설립 신호 및 다운스트림 apoptotic 시체 통풍 관12의 상승에 의해 차례 차례로 통제 된다. Hemocyte 운동 더 복잡 한 cytoskeletal 변경 상처 향해 감독된 마이그레이션 조정 요구 하 고이 걸 묶는 단백질 Fascin16 등 작은 Rho 가족 cytoskeletal 레 귤 레이 터의 활동에 따라 달라 집니다. GTPases Rac와로9.
초파리 는 embryogenesis, 성인17를 도달 하기 전에 다음과 같은 추가 애벌레 및 번데기 단계를 통해가 holometabolous 곤충. 비-침략 적 라이브 이미징 발달 셀 마이그레이션18,19세포 분열, 세포 성장20및 근육을 포함 한 동적 셀룰러 이벤트의 다양 한에 대 한 추가 모델 초파리 번데기 개발 되었습니다. 수축21. 최근에, 그것은 상처 수리 및 염증 vivo에서22,23의 역학을 공부 하는 새로운 모델로 설립 되었습니다.
그냥 배아 단계, 초파리 번데기가 움직이지 하 고 광학 반투명 그들의 불투명 번데기 경우18주의 절 개 후 합니다. 이 광학 투명도 이용 하 여 하나 번데기 날개22같은 초파리 번데기 조직 내에서 조직 손상에 대 한 응답에 타고 난 면역 세포 (hemocytes)의 생체 내에서 동작을 따를 수 있다. 번데기 날개 날개 주위; 연결 된 두 개의 대형 평면 상피 시트의 구성 된 간단한 bilayered 구조 존재 이 두 상피 층 사이의 세포 외 공간 운동 hemocytes24의 hemolymph (곤충 혈액) 및 많은 가득 합니다. 배아, 마찬가지로 날개 상피에 기계적 또는 레이저 유도 부상 부상 사이트23hemocytes의 급속 한 채용을 트리거합니다. 그러나,이 번데기 단계 배아 단계 이전에 영상에 대 한 몇 가지 뚜렷한 장점을 제공합니다. 부상된 pupae (적어도 5 h)에 대 한 훨씬 더 긴 기간 동안 군데 수, 더 많은 조직 영역 (예: 여러 상처의 발생) 실험 섭 동에 사용할 수 있으며 hemocytes이 단계 (에 존재의 상당히 큰 숫자 제공 하 고 더 이상 거리에서 더 많은 셀 궤도 향상 된 통계적 인 힘에 대 한 수학적 분석 중). 또한, RNAi 중재 유전자 비활성화의 효율 될 ‘ 노크-아래 ‘에 조직 또는 배아의 전체 돌연변이 더 전통적인 접근에 비해 시간 특정 방식으로 많은 유전자를 허용 하는 번데기 단계에서 상당히 향상 됩니다.
상처 다시 epithelialization와이 새로운 번데기 모델 내에서 동반 염증 반응의 역학을 수행 하기 위해 두 개의 서로 다른 세포 인구를 표시 해야 합니다: 번데기 상피와 타고 난 면역 세포 (초파리 hemocytes)입니다. 이 두 개의 서로 다른 세포 인구를 사용할 다른 마커 (자료 테이블)의 수 있습니다-공부 하는 특정 프로세스에 따라 마커 선택. 번데기 상피, 초파리 줄 중 하나를 표시 하는 편 표현된 GFP 태그 전자-cadherin (그 레이블 외화 접합)은 셀 여백, 또는 양자 택일로,는 GFP-태그의 위치를 나타내기 위해 정기적으로 활용 Moesin (그 걸 골격 레이블)의 걸 바인딩 도메인 상처 가장자리 수축 말라 반지 및 앞 가장자리 돌출을 시각화. 레이블을 초파리 hemocytes, hemocyte 전용 srp Gal425 (핵 추적)에 대 한 RFP를 핵, 세포질 GFP 또는 GFP 태그 Moesin (각각 세포질 또는 말라 골격 라벨)의 드라이브 식 또는 (가) 같은 photoconvertible fluorophore 사용 됩니다. 사실, 그것은 종종 조합, 여러 면역 세포 마커를 사용 하 여 핵 운동과 셀 형태학 (대표 결과 참조)의 동시 분석에 유리. 그러나, 때문에이 프로토콜 초파리 번데기의 사용을 포함, 유전자 표시의 조합만은 가능한 중반 번데기 단계를 활용할 수 있는 때까지. 또한, 배아 치명적인 주식 적합 되지 않습니다. 이것은 영상 제어 문제가 될 가능성 (또는 야생-타입) pupae 하지만 유전자 뜨 있을 때 고려 하는 것이 중요 하다 또는 overexpressed 상처 폐쇄 나 염증에 미치는 영향을 평가 하기 위해. Gal80ts 유전자 최저 (또는 overexpression)에 의해 발생 하는 초기 치의 경우 구문을 사용할 수 있습니다 Gal4 기반 최저 나중에 개발을 유도 하는 것 (내용 참조).
우리의 최근 연구에서 번데기 단계로 이동 활성화 우리가 차례로 우리는 상처의 소설 내용을 추론할 수 있다 정교한 수학적 모델링을 사용 하 여 염증 성 동작 분석에 충분 한 면역 세포 궤적 데이터를 수집 하 염증 성 유인23신호. 예를 들어이 접근 방식을 밝혀 상처 chemoattractant 200 μ m2/min, ATP와 같은 작은 후보 분자 이전 제안 보다 훨씬 느린 속도에서 염증된 조직을 통해 천천히 확산 또는 H2O2 를 보고는 26,27,,2829; 확산 이 작은 “손상” 분자 대신 허용 신호 역할 가능성이 있다. 또한, 그들은 초기 상처에서 해결 하 고 두 번째 (첫 번째 이후 다양 한 timepoints에서 만든)에 노출 되는 타고 난 면역 세포의 장기 행동에 따라, 우리를 발견는 면역 세포 중 임시 ‘둔감’ 기간 이후 부상23장 님입니다. 초파리의 유전 추적성, 함께 번데기 모델의 장기 이미징 잠재력을 이용 하 여 하나에서 특정 면역 세포 인구 (만 그 면역 세포 상처 사이트에 모집) 등의 행동을 따를 수 있다 면역 세포 계보23내 독점적으로 표현 될 수 있는 photoconvertible fluorophore30 을 사용 하 여 후속 모욕에 응답.
우리가 상처 수리 및 높은 spatio 시간적 해상도 생활을 사용 하 여 관련 된 염증 반응의 역학을 시각화 하는 프로토콜을 설명 하는 여기 초파리 번데기. 자세한 방법론 (해 부 및 장착) 초기 pupae 준비와 후속 레이저 중재 부상 및 시간 경과 영상에 필요한 단계를 제공 합니다. 우리는 또한 특정 면역 세포 하위 집합에서 vivo에서의 라벨을 허용 하도록 사진 컨버터블 fluorophores의 사용을 설명 합니다. 장기, 우리는이 새로운 초파리 번데기 모델 기본 조직 손상으로 염증 반응을 복잡 한 신호 역학을 해 부에 대 한 흥미 진 진한 가능성을 열 것 이다 구상. 더 정교한 통계 분석을 적용 하 여 하나 그렇지 않으면 남아 있다 실험적으로 접근 하기 어려운, 효율 향상된 RNAi 게놈 넓은 검사 내에서 응용 프로그램에 자체를 빌려 수 하는 동안 응답의 기능을 밝히기 수 있습니다. 면역 세포에서 vivo에서 면역 세포 행동을 통제 하는 새로운 플레이어를 식별 하기 위해.
조직 손상으로 급성 염증 반응이 부상된 조직, 회 저 성 파편과 감염에 대 한 싸움의 클리어런스를 포함 하 여의 복구를 조정 필수적입니다 복잡 하 고 매우 역동적인 과정 이다. 완벽 하 게 이해 하 고이 응답의 근본적인 측면을 풀 다, 그것은 연구 수행 비보에 정확한 동작을 위해서 3 차원 생활 샘플에는 및 상호 작용의 다양 한 세포 계보에 따라 관련 된 중요 한 시간 동안 정확 하 게. 이러한 세포 역학의 실시간 분석 정적 한 시간-포인트 클래식 immunohistochemistry 기술을 사용 하 여 고정된 샘플에서 돌연변이 고기의 자세한 특성을 수 있습니다. 전통적으로, 대부분의 라이브 이미징 연구 유전자 온순한 초파리 모델을 사용 하 여 광학 반투명 및 부동 나중 발달 단계4 에 비해 fruitfly 개발의 배아 단계 사용 , 그러나 5., 최근 우리의 그룹 및 다른 개발 초파리 번데기 높은 해상도 동시에 상처 수리 및 염증의 장기 이미징 수행을 새로운 모델로 vivo에서8,22 ,23. 이 새로운 접근 염증 세포 행동의 분열 근본적인 측면에 대 한 흥미로운 장기 잠재력을 제공 하 고 추가 조사 (예: 초파리 adipocytes 다른 세포 계보의 동적 동작을 적용할 수 있습니다. 38) 조직 상해를 따르는.
준비 및 위에서 설명한 이미징 결과의 품질을 결정 하는 부상된 초파리 번데기의 이미징 동안 중요 한 요인이 있다. 틀림 없이 설명된 프로토콜의 가장 어려운 단계는 주의 해 부와 부상 및 이미징 전에 번데기의 정확한 위치입니다. 이 발달 단계에서 번데기는 충격에 약 하 고 준비 단계 동안 번데기에 사소한 실수로 손상을 크게 실험; 저하 됩니다. 이 손상에 다른 선 동적인 세포 행동에 더 넓은 확산 (또는 심지어 조직) 효과로 이어질 수 그것의 자신의 염증 반응을 활성화할 수 있기 때문에 의도 하지 않은 피해를 입은 수 있습니다 어떤 pupae 실험에서 폐기 해야 번데기입니다. (어떤 중요 한 조직 재배열 성인 조직 준비 중인)이이 실험에 활용 하는 번데기의 지속적인 개발으로 인해 때때로 pupae 이미징 과정 이동 합니다. 그러나 번데기 롤링은,, 번데기가 되어 올바르게 마운트하지 않으면 날개 (또는 이미지 수를 다른 조직)의 평평한 표면 coverglass;와 직접 접촉에서 하는 경우 발생할 가능성이 더 커버 유리에 pupae 안정 헵 접착제의 사용이 바람직하지 않은 움직임을 최소화 해야 합니다. 이러한 이유로, 큰 주의 해야 합니다 또한 현미경; 사이 샘플을 이동할 때 그들의 신중 하 게 정렬 된 위치에서 번데기를 dislodging 피하려고 이상적으로, 부상 레이저 후속 시간 경과 영상 및 사진 변환에 사용할 동일한 현미경에 연결 됩니다.
번데기 해 부 및 장착 단계의 능력 뿐만 아니라 사용 초파리 번데기의 정확한 유전자 생성 된 영상 데이터의 품질에 큰 영향을 해야한다. 예를 들어 Gal4 드라이버 및 개별 번데기 유전자 내에서 UAS 구문 (예: UAS-GFP 또는 UAS가)의 사본의 수 후속 이미징 동안 신호 대 잡음 비율을 결정 합니다. 일반적으로 Gal4 또는 UAS 의 더 많은 복사본에는 현재, 더 큰 조직 내의 형광 성 단백질 (예: GFP 또는 장난)의 총 수준을 구성합니다. 그러나 형광 단백질의 최적 수준을,, 될 충분히 고품질 이미징 (낮은 레이저 힘, photobleaching에 감소의 사용과 오랜된 시간 동안 이미징 수 있도록 높이기 조직 형광 사이 주의 균형 기간) 하지만 fluorophore 유도 세포 독성; 발생 하지 않고 각 실험에 Gal4 및 UAS 구문 최적의 수 fluorophores 사용 되 고 특정 드라이버에 따라 달라 집니다. Gal4 UAS 시스템 민감한 온도 낮은 온도31에 효과가 있을 것입니다 때문에 25 ° C에서 (또는 최대 29 ° C 이상) 번데기를 주의 한다. 달성 하기 위하여 조직 제어 레벨 또는 Gal4-식 구동 시간-특이성, Gal4 UAS 시스템 진압 Gal80 번데기 유전자 형39에 포함 될 수 있습니다. Gal80 특정 조직 (를 사용 하 여 조직 관련 Gal80) 내에서 또는 특정 시간에 Gal4 활동을 억 누르기 위해 사용 되거나 수 (온도 사용 하 여 민감한 Gal80). Gal4 UAS 시스템 추가와 결합 될 수 다른 독립적인 바이너리 시스템 (LexA-lexAop 및 QF-QUAS 시스템) 초파리 는 여러 구문 (예: fluorophores, RNAi 라인을 생성 하 또는 다른 유전 구조) 다른 조직39의 범위에 동시에 표현.
사용이 새로운 초파리 번데기 모델의 장점이 더 전통적인 태아 접근을 제공합니다. (최대 3 h) 단기 영상에 비해 무대 15 배아 (무대는 대부분 배아 연구 부상에서 수행 됩니다)에서 사용할 수 있는 pupae 시간 (주 후 번데기 개발의 96 h 성인 기까지 상당히 긴 기간 동안 군데 수 ). 또한, hemocytes (초파리 타고 난 면역 세포)의 훨씬 더 큰 숫자는 번데기 조직 내의 존재 (이미징에 사용할 수 있는)에 비해 태아 내의 더 제한 된 수 및이 수집 하기 위해 우리 수 있다 훨씬 더 많은 이미지의 표본 같은 총 수를 사용 하 여 hemocyte 동작에 대 한 데이터입니다. 결정적으로,이, 차례로 있게 hemocytes 동작을 분석 하 고 상처 attractants와 달리 실험적으로 남아 있을 것 이다 염증 반응의 비 발한 특징을 추출 하는 보다 정교한 수학적 모델링을 적용 액세스할 수23. 다른 번데기 모델의 장점은 그 RNAi 중재 유전자 최저 보다 훨씬 효율적 이전 배아 단계에서 조직 또는 시간 특정 유전자 비활성화 Gal4 UAS 시스템 바이너리 시스템을 사용 하 여 향상 된 분석을 수 39.이 단계에서 RNAi의 효율성 따라서 대규모 (또는 심지어 편견된 게놈 넓은) 수행 가능성이 열립니다 RNAi 상처 복구 또는 염증 성 셀 동작에 관련 된 새로운 선수에 대 한 검색 화면.
그러나, 초파리 번데기 명확 하 게 사용할 수 있는 배아는 유전 돌연변이에서 발생 하는 고기를 공부 하 치명적인; 배아 발달에 필수적인 유전자의 기능과 라이브 이미징 연구에 시간 또는 조직의 특정 방식으로 RNAi 중재 유전자 최저 허용 번데기 단계를 통해 발생 하는 개발 하지 않는 한 배아에 따라서 여전히 수행 합니다. 태아는 공부를 선택 하 고 라이브 이미지의 모델에 또한 남아 있다 그들의 근원에서 면역 세포의 발달 분산, 연락처-운동의 억제, apoptotic 시체의 식 균 작용을 포함 하 여 면역 세포의 특정 기능 개발 조직 번데기 모델에서 관찰 하지 아직5,8 조각 중에 생성. 비록 상처 수리 및 염증40,41,,4243, 를 기본 메커니즘에 대 한 중요 한 통찰력을 제공 하는 초파리 애벌레 및 성인 연구 이 단계에서 44 라이브 이미징 연구 샘플의 본질적으로 모바일 특성상 어려운 입증 했다. 애벌레는 라이브 이미징의 짧은 기간 동안 수 있도록 취 수 있습니다., 하는 동안 마 취의 임시 특성상 라이브 상처의 짧은 스냅만 수리 또는 염증 반응이 시각된45수 있습니다. 최근 연구는 지금 준비 및 아직도 이미징 배아 또는 번데기 보다 상당히 더 많은 도전 남아 있지만 애벌레 부상46, 치료의 장기적인 이미지를 허용 하는 향상 된 프로토콜을 개발 했다. 장기, 우리 구상 하는 각 특정 질문,이 단계의 다른 초파리 -성인 기 (각각에 애벌레 및 번데기 기간을 통해 배아에서 모든 4에서 연구에 가장 적절 한 발달 단계를 이용 하 여 그들의 자신의 독특한 장점과 한계)-상처 복구와 염증 분자 및 세포 메커니즘으로 상호 보완적인 통찰력을 제공할 것입니다.
미래에 부상 및 초파리 번데기의 장기 이미징이이 프로토콜 염증 관련 현상의 범위를 공부 쉽게 적용할 수 있으며 염증 성 상처 응답의 잠복 새로운 기능에 대 한 광범위 한 가능성. Photoconvertible fluorophores (단풍나무), 등의 응용 프로그램과 함께 장기 영상의 조합 타고 난 면역 세포 행동의 역학을 이해 하기 위한 훌륭한 가치 이며 특히, 멀리 더 적은 이해의 확인 단계 상처 염증 반응입니다. 구체적으로 개인 또는 (같은 상처를 그 모집) 면역 세포의 부분 모집단의 라벨 가능할 것 이다 (와 같은 시체 또는 부상) 한 환경 큐에 노출 나중에 면역 세포의 후속 반응에 미치는 영향을 분석 하 큐입니다. 초파리 hemocytes의 선 동적인 행동은 이전 경험에 의해 변경 될 수 있습니다-예를 들어 그들은 개발12 동안 apoptotic 시체의 이전 먹어서 여 조직 부상에 대응 하 액은 그러나 그것 볼 수 있다 여부를 다른 환경 신호 유도 비슷한 못쓰게 이벤트. 번데기 상처 지금까지 연구는 타고 난 염증 반응에 초점을 맞추고 있다, 있지만 번데기 날개 모델 모두 라이브 이미지 하는 이상적인 기회를 제공 하 고 상피 상처 복구 기본 메커니즘을 해 부. 또한,이 번데기 이미징 방법 또한 다른 세포 계보 조직 손상38, 번데기 날개 자체 또는 다른 쉽게 접근할 수 있는 번데기 조직 (예: 눈, 다리 또는 흉부)에 대 한 응답의 동적 동작을 조사 하기 위해 적응 수 있습니다. 마지막으로, 장기 번데기 이미징의 용이성과 함께 초파리 의 유전 추적성을 결합 하 여 새로운 상피 수리 또는 염증 성 레 귤 레이 터 수 편견된 게놈 넓은 눕의 응용 프로그램을 통해 대상 접근 한다.
The authors have nothing to disclose.
우리는 마틴, Nobes, 리처드슨과 도움이 토론을 위한 나무 연구소의 구성원에 게 감사 하 고 싶습니다. 우리는 또한 울프 Bioimaging 시설 (브리스톨 대학, 영국), 블루밍턴 증권 센터 (인디애나 대학, 미국)와 비엔나 초파리 리소스 센터 ( 초파리 주식) 및 Flybase (최신 초파리에 대 한 감사 유전자 주석). 이 작업 시 MRC 프로젝트 교부 금에 의해 지원 되었다와 트 면 (MR/J002577/1), 트 면에 Wellcome 트러스트 수석 장학금 및 오후 Wellcome 신뢰 조사 상.
Drosophila stocks | |||
ubiquitous GFP-tagged E-cadherin ;Ubi-p63E-shg.GFP; (chrII) |
Kyoto Stock Center, DGRC | #109007 | Ubi-p63E promoter sequences drive expression of Drosophila E-cadherin (shotgun) tagged at the C-terminal end with GFP. |
ubiquitous GFP-tagged E-cadherin ;;Ubi-p63E-shg.GFP (III) |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #58742 | Ubi-p63E promoter sequences drive expression of Drosophila E-cadherin (shotgun) tagged at the C-terminal end with GFP. |
ubiquitous GFP-tagged Moesin P{sGMCA}3.1 |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #59023 | The ubiquitously expressed sqh promoter/enhancer drives expression of a fragment of Moesin (that includes the actin binding sequences) tagged with GFPS65T. |
hemocyte specific serpent-Gal4 driver ;srp-Gal4; |
Generated by Katja Bruckner | Generated by Katja Bruckner | Expression of ScerGAL4 fused to a polyA tail is under the control of 2 genomic sequences from upstream of Drosophila serpent. Ref: Brückner, K., Kockel, L., Duchek, P., Luque, C.M., Rørth, P., Perrimon, N. The PDGF/VEGF receptor controls blood cell survival in Drosophila. Dev Cell. 7 (1), 73–84, doi: 10.1016/j.devcel.2004.06.007 (2004). |
UAS-nuclearRFP w1118;;P{UAS-RedStinger}6 |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #8545 or #8547 | UAS regulatory sequences drive expression of the DsRed.T4 form of RFP which is tagged at the C-terminal end with a nuclear localisation signal |
UAS-cytoplasmicGFP ;;P{UAS-GFP.S65T} |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | Multiple stocks available (e.g. #1522) | Expression of the S65T version of GFP by UAS regulatory sequences; the S65T variant exhibits increased brightness. |
UAS-photoconvertibleKaede w1118;; P{UAS-Kaede.A}3 |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #26161 | Kaede protein emits bright green fluorescence after synthesis, but changes efficiently to a bright stable red fluorescence on irradiation with UV. |
GFP-tagged spaghetti squash w1118;;P{sqh-GFP.RLC} |
Bloomington Drosophila Stock Centre (Indiana University) | #57145 | The sqh coding region, which is tagged at the C-terminal end with a T:AvicGFPS65T tag, is expressed under the control of the natural sqh promoter. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Ingredients for fly food media | Fly food media is made according to standard procedures (see Greenspan, R. 1997. Fly Pushing: The Theory and Practice of Drosophila Genetics. Cold Spring Harbor Press. 1-191 pp.) | ||
maize | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
soya flour | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
malt extract | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
molasses | Wild Oats, Bristol, UK (or equivalent supplier) | Contact supplier direct | organic |
Difco agar | BD Biosciences, Fisher Scientific | DF0142-15-2 | For preparation of fly food |
Propionic acid | Sigma | 402907 | For preparation of fly food |
Nipagen | Sigma | 79721 | For preparation of fly food |
Dried baker's yeast | Redstar, Dutscher Scientific, UK LTD | Redstar, Dutscher Scientific, UK LTD | For preparation of fly food |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Sample preparation and mounting | |||
Parafilm | Sigma | P7793-1EA | For preparation of heptane glue |
Fine sable paintbrush | Daler-Rowney (or equivalent) | #0 or 1 | |
Forceps | Fisher Scientific (or Fine Science Tools) | NC9404145 | Dumont #5 |
Glass bottomed dishes for imaging | MatTek | P35G-0-10-C | We suggest using 35mm petri dishes, with at least a 10mm Microwell, 0.085-0.13mm cover glass, uncoated. Dishes with larger microwells will enable increasing numbers of pupae to be mounted and imaged in a single experiment. |
Heptane | Sigma | 51730-5ML | For preparation of heptane glue |
Double sided sticky tape (e.g. Scotch) | Agar Scientific | AGG263 | For preparation of heptane glue |
50ml tube (for heptane glue) | Falcon tubes from Fisher Scientific | 14-432-22 | For preparation of heptane glue |
Glass microscope slides | Agar Scientific | AGL4244 | For dissection of Drosophila pupae |
Dissecting stereo microscope with brightfield | Leica (or equivalent) | M50 | For dissection of Drosophila pupae |
Microscissors | John Weiss International | 103123 | Miniature Research Scissors (straight) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Laser ablation and imaging | |||
Nitogen ablation laser | Spectra-Physics (or Andor equivalent) | Model VSL-337ND-S | For wounding, this should be attached to a widefield imaging system |
Multilaser confocal laser-scanning microscope (CLSM) | Leica (or equivalent) | TCS AOBS SP8 or SP5-II attached to a Leica DMi8 inverted epifluorescence microscope (or equivalent) | Ideally including a motorised stage for multi-site and 'mosaic' scanning, plus ‘hybrid’ GaAsP detectors (that offer much greater sensitivity and boosting of low signal) |
Environmental chamber | Life Imaging Services (or equivalent) | "Microscope Temperature Control System" | Attached to Confocal microscope for temperature control during imaging |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Image Analysis Software | |||
FRAP software module | Leica (or equivalent) | CLSM FRAP software module | For performing photoconversion of photoconvertible fluorophores such as Kaede |
ImageJ (image analysis software) | National Institutes of Health (NIH) | https://imagej.nih.gov/ij/ | Schneider, C.A., Rasband, W.S., Eliceiri, K.W. "NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis". Nature Methods 9, 671-675, 2012. |
ImageJ plugin "Manual Tracking" | National Institutes of Health (NIH) | https://imagej.net/Manual_Tracking | |
ImageJ plugin "TrackMate" | ImageJ, NIH | https://imagej.net/TrackMate | Tinevez, JY.; Perry, N. & Schindelin, J. et al. (2016), "TrackMate: An open and extensible platform for single-particle tracking.", Methods 115: 80-90, PMID 27713081 |
Volocity (high performance 3D imaging software) | Perkin Elmer | Volocity 6.3 | For image analysis |
IMARIS (image analysis software) | Bitplane | IMARIS for Cell Biologists | For image analysis |