Summary

膜分馏和 gtpase-关联免疫吸附法检测小 gtpase 预基化和 gtp 结合

Published: November 11, 2018
doi:

Summary

在这里, 我们描述了一个方案, 以研究前化和鸟苷-5 ‘ 三磷酸 (gtp) 加载的 rho gtpase。该方案由两种详细的方法组成, 即膜分馏和 gtpase 连锁免疫吸附法。该协议可用于测量不同其他小型 gtpase 的预化和 gtp 负载。

Abstract

rho gtpase 家族属于 ras 超级家族, 在人类中包括大约20名成员。rho gtpase 在调节各种细胞功能方面非常重要, 包括细胞骨架动力学、细胞动力、细胞极性、轴突引导、水泡贩运和细胞周期控制。rho gtpase 信号的变化在许多病理条件下发挥着至关重要的调节作用, 如癌症、中枢神经系统疾病和免疫系统依赖性疾病。rho gtpase (甲氧基酯途径中间体的预化) 和 gtp 结合的翻译后修饰是影响该蛋白活化的关键因素。本文提供了两种基本而简单的方法来检测 rho gtpase 的预化和 gtp 结合活性。本手稿对已使用的技术程序的详细情况进行了逐步说明。

Introduction

rho gtpase 是一组小蛋白质 (21-25 kda), 在整个进化过程中得到很好的保存, 并在小 gtpase 的 ras 超级家族中形成一个独特的亚科。在这个超家族中的每个亚科, 都有一个共享的 g 域核心, 参与 gtpase 活性和核苷酸交换1。rho 家族和其他 ras 子家族的区别在于, 在小 gtpase 域2中存在 “rho 插入域 “。

根据最近的分类, rho gtpase 被认为是一个信号蛋白家族, 适合 ras gtpase 超级家族3。mammalian rho gtpases 有22个成员, 根据其具体功能和一般特征4 , 其中除甘酸、r比1和 cdc42 是该组研究最多的成员。rho gtpase通过严格调节的机制与细胞内信号通路相连, 这种机制依赖于分子开关, 通过蛋白质翻译后修饰5。

gtp 负载和水解是小型 rho gtpase 活性失活循环中必不可少的机制,通过gtpas-激活蛋白 (gap) 进行调节。gap 负责 gtp 水解, 并与负责 gtp 加载反应的鸟嘌呤核苷酸交换因子 (gef) 协同工作。rho gdp 离解抑制剂 (gdi)通过结合到结合到结合到 gdp 绑定的 rho gtpases, 提供了小 rho gtpases 的进一步调控。这抑制了 gdp 离解, 并促进了小 rho gtpase 远离活性的细胞膜位点的分离。还进一步调节了 rho gtpase 蛋白, 涉及 gdi 的前化, 它调节核苷酸的水解和交换, 并控制 gdpw gtp 循环1,6,7,8

gtp 负载和 rho gtptase 的前化都参与了 rho gtptase 在细胞溶胶和细胞膜之间的运动, 改变了这些蛋白质 1,9的亲脂性。上述调节剂与 gdp/gtp 交换活性10的细胞膜磷脂和其他调节蛋白相互作用.此外, gdi, 离解抑制剂, 阻止 gtp 水解和 gdp/gtp 交换。gdi 抑制了非活性 rho 蛋白与 gdp 的分离, 因此, 它们与下游效应的相互作用。gdi 还调节细胞中的细胞溶胶和膜之间 gtpase 的循环。rho gtpase 的活动在很大程度上取决于它们对细胞膜的运动;因此, gdi 被认为是关键的调节剂, 可以通过隐藏其疏水区域 11,12来隔离细胞质中的 gtpase。

为了使 rho gtpase 在其活化周期的所有阶段都具有最佳的信号和功能, gtp-boxing/gtp 水解的动态循环至关重要。在这一过程中的任何类型的改变可能会导致随后的变化, 由 rhgtpase 调节的细胞功能, 如细胞极性, 增殖, 形态发生, 细胞分裂, 迁移, 粘附和生存13, 14。

目前的协议为读者提供了一个详细的方法来监测小丙二酸 gtpase 激活通过调查他们的婚前和 gdp/gtp 加载. 该方法也可用于检测各种小 gtpase 的预化和 gtp 结合。gtpase 连锁免疫吸附法可用于测量其他类型 gtpase 的活化水平, 如 rac1、rac2、rac3. h-、k-或 n-ras、arf 和 rho15。药理剂辛伐他汀被用作一个例子, 因为最近有报道称, 它参与了小 rho gtpase 的前化和活性89、14、16的调节

Protocol

1. 用膜细胞分裂法测定红景天的归因 细胞培养和辛伐他汀治疗 种子 50, 000 u251 细胞在100毫米的盘子和培养他们在杜尔贝克的改良鹰的培养基 (dmem) (高葡萄糖, 10% 胎儿牛血清 [fbs])。 当30% 的融合时, 通过去除培养基并加入含有辛伐他汀的培养基 (在二甲基亚硫酸盐 [dmso] 中溶解的辛伐他汀 10μm) 对细胞进行处理, 并在 37°c 8 下孵育 36小时.单独使用…

Representative Results

膜分馏: 采用超离心法制备膜和细胞溶胶成分。如图 1所示, 上清液含有细胞质部分, 颗粒含有膜分数。在辛伐他汀免疫印迹法治疗后, 检测了从 u251 细胞中获得的红景天的丰度。用泛卡粘蛋白和 gapdh 分别测定了膜和细胞溶胶组分的纯度和负载控制。如图 2所示, 辛伐他汀?…

Discussion

在这里, 我们描述了一个准确的方法来测量小 gtpase 前化和 gtp 结合显示为小 gtpase 亚细胞定位 (膜细胞溶胶) 和 rho gtp 负载。小 gtpase 在真核细胞中表达, 在细胞增殖、运动和结构中起着至关重要的作用。前化和 gtp 结合都参与了 gtpase 活性的调节;因此, 评估这些蛋白质的前代化和 gtp 结合是细胞生物学家1,8的重要工具。

根据?…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

saeid ghavami 得到了卫生科学中心业务赠款、chrim 业务赠款和马尼托巴省研究新调查员业务赠款的支持。javad alizadeh 得到了马尼托巴省研究学生的支持。shahla shojaei 得到了卫生科学基金会业务赠款和多边开发协会加快博士后研究金的支持。adel rezaei moghadam 得到了 joseph w. gordon 持有的 nserc 业务补助金的支持。amir a. zeki 得到了 nihsp nhlbi k08 奖 (1k08hl114882-01a1) 的支持。marek j. los 感谢 ncn 赠款 #2016/21 bznzben02812, 该赠款得到了由法国里拉姆大学高级研究所 (法国中央-瓦尔德卢瓦尔河地区) 通过其智能卢瓦尔河谷总方案提供的支持, 并由 marie 共同资助sklolowska-curie 行动, 授予 #665790。西蒙娜·达席尔瓦·罗莎得到了 umgf 学生的支持。

Materials

DMEM high Glucose VWR (Canada) VWRL0101-0500
Fetal Bovine Serum VWR (Canada) CA45001-106
Penicillin/Streptomycin VWR (Canada) 97062-806
EDTA (Ethylenediamine tetraacetic acid) VWR (Canada) CA71007-118
EGTA (Ethylene glycol bis(2-aminoethyl ether)-N,N,N',N'-tetraacetic acid) VWR (Canada) CAAAJ60767-AE
DTT (DL-Dithiothreitol) VWR (Canada) CA97061-340
Ammonium Persulfate VWR (Canada) CABDH9214-500G
Tris-Hydroxymethylaminomethane VWR (Canada) CA71009-186
30% Acrylamide/Bis Solution Biorad (Canada) 1610158
TEMED Biorad (Canada) 1610801
Protease Inhibitor cocktail Sigma/Aldrich (Canada) P8340-5ML 1:75 dilution
Rho-GTPase Antibody Sampler Kit Cell Signaling (Canada) 9968 1:1000 dilution
Pan-Cadherin antibody Cell Signaling (Canada) 4068 1:1000 dilution
GAPDH antibody Santa Cruz Biotechnology (USA) sc-69778 1:3000 dilution
RhoA G-LISA Activation Assay (Luminescence format) Cytoskeleton Inc. (USA) BK121 Cytoskeleton I. G-LISA Activation Assays Technical Guide. 2016.
RhoA Antibody Cell Signaling 2117
ECL Amersham-Pharmacia Biotech RPN2209
Anti-Rabbit IgG (whole molecule) Peroxidase antibody Sigma A6154-1ML
SpectraMax iD5 Multi-Mode Microplate Reader Molecular Devices  1612071A Spectrophotometer
Nonidet P-40 Sigma 11332473001 non-denaturing detergent, octylphenoxypolyethoxyethanol
DMSO Sigma D8418-50ML
PBS Sigma P5493-1L
Phophatase Inhibitor cocktail Sigma P5726-5ML 1:75 Dilution

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Citar este artigo
Alizadeh, J., Shojaei, S., da Silva Rosa, S., Rezaei Moghadam, A., Zeki, A. A., Hashemi, M., Los, M. J., Gordon, J. W., Ghavami, S. Detection of Small GTPase Prenylation and GTP Binding Using Membrane Fractionation and GTPase-linked Immunosorbent Assay. J. Vis. Exp. (141), e57646, doi:10.3791/57646 (2018).

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