La proyección de imagen molecular con láser asistida por matriz basada en desorción/ionización de espectrometría de masas (MALDI-IMS) permite la asignación simultánea de múltiples analitos en muestras biológicas. Aquí, presentamos un protocolo para la detección y visualización de la proteína β amiloide en los tejidos cerebrales de la enfermedad de Alzheimer y las muestras de la Angiopatía amiloide cerebral usando MALDI-IMS.
La neuropatología de la enfermedad de Alzheimer (EA) se caracteriza por la acumulación y agregación de los péptidos β amiloide (Aß) en placas extracelulares del cerebro. Los péptidos Aß, compuestos de 40 aminoácidos, se generan a partir de proteínas precursoras del amiloide (APP) por β – y γ-secretases. Aβ se deposita no sólo en el parénquima cerebral, sino también en leptomeningeal y paredes de los vasos cerebrales, conocidas como angiopathy amiloideo cerebral (CAA). Mientras que se identificaron una gran variedad de péptidos Aβ, detallada de la producción y distribución de los péptidos Aβ en tejidos patológicos de la EA y CAA no han sido totalmente abordadas. Aquí, desarrollamos un protocolo de láser asistida por matriz desorción/ionización-basado proyección de imagen espectrometría de masas (MALDI-IMS) en tejidos de cerebro humano autopsia para obtener cartografía de proteína completa. Para este propósito, se obtuvieron especímenes humanos corticales desde el Banco de cerebros en el Instituto Metropolitano de Gerontología de Tokio. Cryosections congelados se cortan y transferidos al óxido de estaño indio (ITO)-cubierto de laminas de vidrio. Espectros son adquiridos mediante el sistema MALDI con una resolución espacial de hasta 20 μm. ácido Sinapinic (SA) es uniformemente depositada en la diapositiva usando un rociador manual o automático. Con las ventajas técnicas actuales de MALDI-IMS, se puede obtener un conjunto de datos típico de varias especies de Aß en las mismas secciones de cerebros autopsied humanos sin sondas específicas. Además, alta resolución (20 μm) proyección de imagen de un cerebro de AD y severa muestra de CAA muestra claramente que Aβ1-36 Aβ1-41 fueron depositados en los vasos de leptomeningeal, mientras Aβ1-42 y Aβ1-43 fueron depositados en el parénquima cerebral como la placa senil (SP). Es factible adoptar un enfoque estándar en combinación con observaciones clínicas, genéticas y patológicas en la comprensión de la patología de la EA, CAA, MALDI-IMS y otras enfermedades neurológicas basan en la estrategia actual.
Para hacer el diagnóstico y entender la patogenesia de desórdenes neurodegenerativos, identificación molecular precisa de depósitos patológicos es esencial1. En el curso de AD, Aβ se produce para hacer SPs en el parénquima cerebral y depositado en los recipientes antes de la enfermedad Inicio2,3,4,5,6. Mientras Aβ1-42 es el péptido predominante en el SP de cerebros AD, otras variantes Aβ, como N-terminal o c-terminal truncarán o modificación Aβs, también se identifican en afectados AD cerebros7,8,9, 10. Un cuadro completo de las especies de amplia gama de Aß en el cerebro humano, especialmente con el anuncio y cerebral angiopathy amiloideo (CAA)11, ayudará a los científicos entender producción de Aß, metabolismo y depósito.
Como el enfoque clásico de la neuropatología, inmunohistoquímica (IHQ) ha sido el método más concluyente para determinar la ubicación de Aβs en el cerebro tejidos12,13,14,15. En general, IHC no puede distinguir moléculas cuando varios epitopos coexisten simultáneamente. Por el contrario, un análisis proteómico basados en espectrometría de masa emergente es un enfoque valioso especialmente para el análisis de una variedad de especies de Aß en los tejidos del cerebro, que no pueden ser distinguidos con anticuerpos16,17. El análisis convencional basada en espectrometría de masa de muestras de inmuno-precipitado y lisados cerebro es incapaz de detectar pequeños péptidos Aβ y pierde información de distribución de Aβ en el tejido cerebral.
En trabajos anteriores, ha tenido éxito usando un modelo animal transgénico de AD, como APP23 visualización de depósitos Aβ en el cerebro de ratón. Sin embargo, este proceso queda por los adelantos técnicos para comparar IMS e IHC con respecto a la sensibilidad y resolución18,19,20. Neuropatología del anuncio debe ser estudiado en cerebros humanos, y utilizamos tecnología MALDI-IMS en los tejidos del cerebro humano autopsia para obtener proteína completa cartografía21. Para ello, hemos desarrollado un protocolo para un tipo avanzado de espectrometría de masas que tiene ventajas en su rapidez, sensibilidad y reproducibilidad.
Aquí demostramos un protocolo detallado y los resultados de la visualización de Aβ y de sus isoformas de varios cerebros autopsied con AD y CAA con MALDI-IMS. El perfil de la deposición de Aβs fue cambiado drásticamente de Aβ1-42 a sus variaciones de N y C terminal. Aβ1-41 fue primero identificado y visualizado en los cerebros humanos con el protocolo actual y además se validó con IHC21. Teniendo en cuenta que la morfología de Aβ depositado por IMS con un análisis de alta resolución (20 μm) debe ser en acuerdo con IHC, IMS e IHC igualmente contribuyan a distinguir los depósitos Aβ, por su ubicación y contenido de proteína, así como por su morfología. Como todo el experimento descrito aquí se llevó a cabo en la corteza occipital, estudiando la localización de diferentes especies de beta-amiloide en todas las regiones del cerebro se puede generalizarse con futuros experimentos usando el protocolo actual.
Pasos críticos en el protocolo son los pasos de preparación del tejido para obtener una ionización efectiva de proteínas agregadas en los tejidos del cerebro humano. Una capa de matriz es necesaria para absorber la energía del láser e inducir la desorción y la ionización de los analitos. En este proceso, una sección de tejido entero es homogéneamente recubierta de pequeños cristales. Cocrystallization homogénea del analito con la matriz es crucial para la proyección de imagen de alta sensibilidad y libre de artefactos. Cada uno de los métodos de tres aspersión tiene sus propias ventajas. Capa de aerosol manual es uno de los métodos más frecuentemente utilizados. Un aerógrafo es conveniente; sin embargo, requiere operación experta. Como precisa y reproducible técnica experimental es esencial, utilizando un atomizador ultrasónico o un rociador automático como se describe en los protocolos actuales se recomienda. Con respecto a un atomizador ultrasónico, no se verá afectado por la humedad y la temperatura de la habitación porque se rocía en una cámara. Mientras tanto, con un rociador automático, se obtiene resolución espacial relativamente conservada con buena reproducibilidad. Generalmente, la resolución espacial obtenida con el aumento de tres métodos en el orden 1) aerógrafo, 2) automático y rociador 3) ultrasónico.
Lo más importante, este protocolo fue originalmente generado para detectar y visualizar Aβs en muestras de cerebro humano autopsied. La visualización de Aβs con MALDI-IMS para los ratones de APP23, que se genera como un modelo animal de anuncio basado en la mutación de tipo sueco de aplicación humana, se ha reportado anteriormente por otros con un método existente18,19. Sin embargo, el protocolo anterior aplicado a APP23 no fue suficiente para visualizar Aß en su resolución lateral y sensibilidad. Trabajos anteriores discuten que altas concentraciones de Aβ fuera de los límites de tejido claramente son artefactos en APP23 proyección de imagen con su protocolo18,19. Eso significa que el supuesto ‘blur’ entre SPs real y IMS imágenes por el paso de extracción de la matriz era inevitable con la proyección de imagen de tipo MALDI. Sin embargo, en el protocolo actual, el desenfoque desapareció y cada espectro había representado cada SP único en el parénquima cerebral.
Como se muestra aquí, podemos rastrear Aβ1-41 por primera vez en anuncio y CAA con MALDI-IMS, así como con IHC, con un anticuerpo específico de nuestra propia generación21. Según el modelo de procesamiento de Aβ, Aβ1-38 deriva Aβ1-45 via Aβ1-42, mientras que la Aβ1-41 deriva de Aβ1-45 por la γ-secretasa escote paso a paso27,28,29,30,31 . Esto significa que el protocolo actual es compatible con este modelo. En cuanto a las limitaciones de esta técnica, debemos tener en cuenta la heterogeneidad de las muestras de cerebro humano autopsia. El paso más crítico, en cierto sentido, es evaluar la autopsia calificado tejido cerebral con la prueba ética. Con el protocolo actual en los tejidos de cerebro autopsia calificado, MALDI-IMS puede seguir individualmente la entera distribución de las moléculas complejas con múltiples modificaciones, así como desconocido factor regula la patogenia de la EA, que están aún por ser define. Además, en la comprensión de la patogenia general de neuropatología diferentes en los cerebros humanos envejecidos, debe ser factible de adoptar MALDI-IMS como un enfoque estándar, en combinación con observaciones clínicas, genéticas y patológicas en enfermedades neurológicas .
Otro paso importante de MALDI-IMS es el proceso de minería de datos desde el conjunto de datos obtenido, que siempre es mucho tiempo. Minería de datos manual de cada distribución pico requiere de los usuarios hacer clic en cada imagen y las distribuciones que se pueden correlacionar a la morfología de la muestra analizada. Segmentación espacial automática puede utilizarse como un primer paso de la minería de datos, proporcionando una visión general del conjunto de datos y permitiendo la rápida detección de características prominentes. En este enfoque, las similitudes entre los espectros de una región dada se determinan estadísticamente y espectros similares se agrupan en un cluster. Todos los píxeles están codificados por colores según su asignación de racimo (figura 5). En el presente estudio de AD/CAA, el área de interés es el espacio de los depósitos de Aβ en placa parenquimal y las estructuras vasculares parenquimatosas y subaracnoideas. Los dos picos distintivos que más validaron con IHC fueron los valores de m/z de Aβ1-40 y Aβ1-4221. Por lo tanto, es fácil encontrar m/z colocalized con Aβ1-40 y Aβ1-42, que ya estaba anotada al N – y c-terminal truncado Aβ, así como péptidos desconocidos, para su posterior análisis.
Weller y sus colegas han reportado que la Aβ se acumula en las paredes de los vasos, más alrededor de las arterias que en venas21. Por otra parte, se ha propuesto que el líquido intersticial (ISF) incluye Aβs excretadas el parénquima cerebral a del nodo de linfa vía un perivasculario drenaje vía22,23,24,25 ,26. El protocolo actual para generar un mapa de segmentación basado en un conjunto de datos de MALDI-IMS en una 20 μm de resolución admite la posible existencia de vías de drenaje perivascularia del cerebro (figura 5), que contribuyen significativamente a la CAA en el anuncio21 , 32. Además, podemos descubrir proteínas marcadoras colocalized con placa y vasculatura subaracnoidea mediante el cálculo de la correlación de los valores de cada m/z. En la comprensión de la patogenia general de neuropatología diferentes en los cerebros humanos envejecidos, debe ser factible adoptar MALDI-IMS como un enfoque de gran alcance en combinación con datos IHC establecidos de clínicos, genéticos y observaciones patológicas neurológicas enfermedades.
The authors have nothing to disclose.
Este trabajo fue apoyado en parte por las subvenciones para la investigación científica en áreas innovadoras (proteína cerebral envejecimiento y demencia Control 26117004; M.I. y T.M.). Esta investigación fue parcialmente financiada por el programa estratégico de investigación para las Ciencias del cerebro de la Agencia Japonesa para la investigación médica y desarrollo (AMED). Todos los experimentos se llevaron a cabo cumpliendo con las directrices de llegar.
Cryostat | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
Indium tin oxide (ITO)-coated microscope glass slide | Bruker Daltonics | #237001 | |
Blade (disposable) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
O.C.T. Compound | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
Scanner | EPSON | GT-980 | |
Air-Brush | GSI Creos | PS274 | |
Compressor | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
Ultrasonic sprayer | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
Automatic sprayer | HTX Technologies | TM Sprayer | |
Confocal-laser-scanning-microscope | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
Ultra high speed MALDI instrument | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
MALDI control software | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
Data analysis software | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
Molecular histology software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Statistical software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Sinapinic acid (SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid (CHCA) | Wako | 037-19261 | |
Calibration standard | Bruker Daltonics | ||
Biotinylated anti-mouse IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Biotinylated anti-rabbit IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Avidin and biotinylated HRP complex. | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
3,3-diaminobenzidine (DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |