Imagem molecular com laser assistida por matriz baseada em ionização/dessorção de imagem espectrometria de massa (MALDI-IMS) permite o mapeamento simultâneo de vários analitos em amostras biológicas. Aqui, apresentamos um protocolo para a detecção e visualização da proteína β amiloide nos tecidos do cérebro de doença de Alzheimer e amostras de Angiopatia amiloide cerebral usando MALDI-IMS.
A neuropatologia da doença de Alzheimer (AD) é caracterizada pelo acúmulo e agregação de peptídeos β amiloide (Aβ) em placas extracelulares do cérebro. Os peptídeos Aβ, compostos de 40 aminoácidos, gerados a partir de proteínas precursora amiloide (APP) por β e γ-secretases. Aβ é depositado não só no parênquima cerebral, mas também em leptomeníngeo e paredes dos vasos cerebrais, conhecidas como Angiopatia amiloide cerebral (CAA). Enquanto uma variedade de peptídeos Aβ foram identificados, detalhados de produção e distribuição de peptídeos Aβ individuais em tecidos patológicos do AD e CAA não tenha sido totalmente respondida. Aqui, nós desenvolvemos um protocolo do laser assistida por matriz baseada em dessorção/ionização imagem espectrometria de massa (MALDI-IMS) em tecidos de cérebro humano autópsia para obter o mapeamento abrangente da proteína. Para este efeito, espécimes humanos corticais foram obtidos pelo banco cérebro o Tokyo Metropolitan Institute of Gerontology. Cryosections congelados são cortados e transferidos para óxido-índio-estanho (ITO)-revestido de lâminas de vidro. Espectros são adquiridos usando o sistema MALDI com uma resolução espacial até 20 µm. ácido sinapínico (SA) uniformemente é depositado no slide usando um pulverizador manual ou automático. Com as vantagens técnicas atuais de MALDI-IMS, um conjunto de dados típico de várias espécies Aβ dentro as mesmas seções de cérebros autopsiados humanos podem ser obtido sem sondas específicas. Além disso, de alta resolução (20 µm) imagens de um cérebro de AD e amostra de CAA grave mostram claramente que Aβ1-36 para Aβ1-41 foram depositados nos vasos leptomeníngeo, enquanto Aβ1-42 e Aβ1-43 foram depositados no parênquima cerebral como placa senil (SP). É possível adotar MALDI-IMS, como uma abordagem padrão em combinação com observações clínicas, genéticas e patológicas em compreender a patologia do AD, CAA, e outras doenças neurológicas, baseados na estratégia atual.
Para fazer o diagnóstico e para compreender a patogênese de doenças neurodegenerativas, identificação molecular precisa de depósitos patológicos é essencial1. No curso de AD, Aβ é produzido para fazer SPs no parênquima cerebral e depositado em vasos muito antes da doença início2,3,4,5,6. Enquanto Aβ1-42 é o peptídeo predominante no SP de cérebros de AD, outras variantes Aβ, tais como N-terminal ou C-terminal truncado ou modificado Aβs, também são identificados em afetados AD cérebros7,8,9, 10. Uma imagem completa das espécies de ampla gama de Aβ no cérebro humano, especialmente com AD e cerebral Angiopatia amiloide (CAA)11, ajudará os cientistas entender a produção de Aβ, metabolismo e deposição.
Como a abordagem clássica de neuropatologia, imuno-histoquímica (IHC) tem sido o método mais conclusivo para determinar a localização de Aβs no cérebro tecidos12,13,14,15. Em geral, IHC não consegue distinguir as moléculas quando vários epítopos coexistirem simultaneamente. Por outro lado, uma análise de espectrometria de massa-baseado proteomic emergentes é uma abordagem valiosa especialmente para a análise de uma variedade de espécies Aβ em tecidos cerebrais, que não podem ser diferenciados com anticorpos16,17. A análise de espectrometria de massa base convencional de lysates do cérebro e imuno-precipitado amostras falha detectar pequenos peptídeos Aβ e perde informações de distribuição de Aβ no tecido cerebral.
Em obras anteriores, Visualizar os depósitos Aβ em cérebro de rato tem sido bem sucedido usando um modelo animal transgénico do anúncio, tais como APP23. No entanto, esse processo ainda precisa de avanços técnicos para comparar IMS e IHC com relação a resolução e sensibilidade de19,18,20. Neuropatologia AD deve ser estudada no cérebro humano, e usamos tecnologia MALDI-IMS em tecidos cerebrais de autópsia humana para obter proteína abrangente mapeamento21. Para este fim, nós desenvolvemos um protocolo para um tipo avançado de espectrometria de massa que tem vantagens em sua rapidez, sensibilidade e reprodutibilidade.
Aqui temos demonstrado um protocolo detalhado e resultados da visualização de Aβ e suas isoformas de vários cérebros autopsiados com AD e CAA com MALDI-IMS. O perfil de deposição de Aβs foi drasticamente alterado de Aβ1-42 para suas variações N – e C-terminal. Aβ1-41 foi primeiro identificado e visualizado no cérebro humano, com o atual protocolo e ainda mais foi validado com IHC21. Considerando que a morfologia de Aβ depositado pelo IMS com uma análise de alta resolução (20 μm) deve estar em bom acordo com IHC, IMS e IHC igualmente contribuam à distinção entre depósitos Aβ, pela sua localização e conteúdo de proteína, bem como pela sua morfologia. Como todo o experimento aqui descrito foi realizado no córtex occipital, estudando a localização das diferentes espécies de beta-amiloide em todas as regiões do cérebro vai ser generalizada com futuros experimentos usando o protocolo atual.
Passos críticos dentro do protocolo são etapas de preparação do tecido para obter uma eficaz ionização de agregados proteínas nos tecidos do cérebro humano. Uma camada de matriz é necessário para absorver a energia do laser e induzir a ionização de analitos e dessorção. Neste processo, uma secção de tecido inteiro homogênea é revestida com pequenos cristais. Cocrystallization homogênea da substância a analisar com a matriz é crucial para a imagem latente de alta sensibilidade e livre de artefato. Cada um dos métodos de três pulverização tem suas próprias vantagens. Revestimento de pulverizador manual é um dos métodos mais frequentemente utilizados. Um aerógrafo é conveniente; no entanto, requer operação hábil. Como precisa e reprodutível técnica experimental é essencial, usar um pulverizador Ultrassônico e/ou um pulverizador automático conforme descrito nos protocolos atuais é recomendado. No que diz respeito um equipamento ultra-sônico, é não ser influenciada pela umidade e a temperatura da sala porque ele é pulverizado em uma câmara. Entretanto, com um pulverizador automático, resolução espacial relativamente preservada com boa reprodutibilidade é obtida. Geralmente, a resolução espacial obtida com o aumento de três métodos na ordem de 1) aerógrafo, dispositivo 2) automático e pulverizador 3) ultra-sônico.
Mais importante ainda, este protocolo foi originalmente gerado para detectar e Visualizar Aβs em amostras de cérebro humano autopsiados. A visualização de Aβs com MALDI-IMS para ratos de APP23, que é gerada como um modelo animal de AD baseada a mutação Sueco-tipo de APP humano, tem sido relatada anteriormente por outros com método existente18,19. No entanto, o protocolo antigo aplicado a APP23 não foi suficiente para visualizar Aβ na sua resolução lateral e sensibilidade. Obras anteriores discutiram que altas concentrações de Aβ fora do limite de tecido são claramente artefatos em APP23 de imagem com seu protocolo18,19. Isso significa que os chamados ‘borrão’ entre reais SPs e IMS imagens devido a etapa de extração da matriz era inevitável com imagem MALDI-tipo. No entanto, no actual protocolo, o Borrão desapareceu e cada espectro representado cada SP único no parênquima cerebral.
Como mostrado aqui, poderemos rastrear Aβ1-41 pela primeira vez no anúncio e cérebros de CAA MALDI-IMS, bem como com o IHC, com um anticorpo específico por nossa própria geração21. De acordo com o modelo de processamento de Aβ, Aβ1-38 deriva Aβ1-45 através de Aβ1-42, enquanto Aβ1-41 deriva Aβ1-45 por γ-secretase gradual clivagem27,28,29,30,31 . Isto significa que o protocolo atual oferece suporte a este modelo. Quanto as limitações desta técnica, temos de considerar a heterogeneidade das amostras de cérebro humano autópsia. O passo mais crítico, em certo sentido, é avaliar o tecido cerebral de autópsia qualificado com prova de ética. Com o atual protocolo sobre os tecidos cerebrais de autópsia qualificado, MALDI-IMS individualmente pode acompanhar a toda distribuição das moléculas complexas tendo várias modificações, bem como factor desconhecido regulamenta a patogênese do anúncio, que ainda estão para ser definido. Além disso, no entendimento geral patogênese de várias neuropatologia no cérebro humano envelhecido, deve ser viável adotar MALDI-IMS, como uma abordagem padrão, em combinação com observações clínicas, genéticas e patológicas em doenças neurológicas .
Outro passo crítico de MALDI-IMS é o processo de mineração de dados do conjunto de dados obtido, que sempre é demorado. Mineração de dados manual de cada distribuição de pico exige que os usuários a clicar em cada imagem e procure por distribuições que podem correlacionar a morfologia da amostra analisada. Segmentação espacial automática pode ser usada como o primeiro passo de dados mineração, fornecendo uma visão geral do conjunto de dados e permitindo a rápida detecção de características proeminentes. Nesta abordagem, semelhanças entre os espectros de uma dada região são determinadas estatisticamente, e espectros similares são agrupados em um cluster. Todos os pixels são codificados por cores de acordo com sua atribuição de cluster (Figura 5). No presente estudo AD/CAA, a área de interesse é o espaço de depoimentos de Aβ na placa parenquimatosa e as estruturas vasculares subaracnoide e parenquimatosas. Os dois picos distintos que mais foram validados com IHC foram os valores de m/z de Aβ1-40 e Aβ1-4221. Assim, é fácil encontrar colocalized m/z com Aβ1-40 e Aβ1-42, que já foi anotado para N – e C-terminal truncado Aβ, bem como peptídeos desconhecidos, para posterior análise.
Weller e colegas relataram que Aβ se acumula nas paredes dos vasos, mais próximo de artérias do que ao redor das veias21. Além disso, foi proposto que o fluido intersticial (ISF) inclui Aβs excretados do parênquima cerebral para o linfonodo através um perivascular drenagem via22,23,24,25 ,26. O protocolo atual para gerar um mapa de segmentação com base em um conjunto de dados MALDI-IMS na resolução 20 µm suporta a possível existência de vias de drenagem perivascular do cérebro (Figura 5), que contribuem significativamente para o CAA em AD21 , 32. Além disso, podemos descobrir proteínas marcador colocalized com placa e vasculatura subaracnoidea, calculando-se a correlação de cada valores m/z. Na compreensão geral patogênese de várias neuropatologia no cérebro humano envelhecido, deve ser viável a adotar MALDI-IMS, como uma poderosa abordagem em combinação com dados IHC estabelecidas de clínica, genética e observações patológicas em neurológica doenças.
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi financiado em parte pelo subsídio para a investigação científica em áreas inovadoras (cérebro proteína envelhecimento e demência controle 26117004; para mi e T.M.). Esta pesquisa foi parcialmente financiada pelo programa de investigação estratégica para Ciências do cérebro da Agência de Japão para pesquisa médica e desenvolvimento (AMED). Todos os experimentos foram conduzidos em conformidade com as diretrizes de chegada.
Cryostat | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
Indium tin oxide (ITO)-coated microscope glass slide | Bruker Daltonics | #237001 | |
Blade (disposable) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
O.C.T. Compound | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
Scanner | EPSON | GT-980 | |
Air-Brush | GSI Creos | PS274 | |
Compressor | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
Ultrasonic sprayer | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
Automatic sprayer | HTX Technologies | TM Sprayer | |
Confocal-laser-scanning-microscope | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
Ultra high speed MALDI instrument | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
MALDI control software | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
Data analysis software | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
Molecular histology software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Statistical software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Sinapinic acid (SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid (CHCA) | Wako | 037-19261 | |
Calibration standard | Bruker Daltonics | ||
Biotinylated anti-mouse IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Biotinylated anti-rabbit IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Avidin and biotinylated HRP complex. | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
3,3-diaminobenzidine (DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |