ללימוד הרכב הסלולר ואת תכונות מורפולוגיות של השחלות יונקים, מדענים לעיתים קרובות לסמוך על ויוו ניסויים ואחריו immunohistological מכתים פרפין מוטבע השחלות. נוסף לאחרונה אף, השחלה כל איבר תרבות הוכיחה להיות חלופה יעילה ללמוד תפקוד השחלות^1,2,3,4 , כי הטכניקה יכולה להיות בשילוב עם כאחראית ו כימות כלים. באופן מסורתי, ניתוח של מורפולוגיה השחלות תלוי בשחזור אדריכלות השחלות תלת מימדי ממקטעים טורי פרפין מוטבע, אבל, בנוסף להיותו מפרך, זמן רב, באופן סדרתי חלוקתה פרפין מוטבע רקמות לא ערובה שחזור נכונה של האיבר, סעיפים לעיתים קרובות אבדו או הורה בזיהוי שגיאות בתהליך.

בנוסף האתגרים הטכניים הקשורים עם חלוקתה טורי, ישנם גם וריאציות של השיטות בשימוש שגרתי לכמת זקיק מספרים לאדם שחלה^5,6. ההשתנות מתודולוגי בשימוש כיום פוגע מטא אנליזה של השחלות מילואים לאורך הלימודים^5,7. לדוגמה, זקיק מספרים מתוך מאמרי מחקר שונים יכול להשתנות על ידי 10-fold או יותר בין הגילאים התפתחותית דומה בתוך זן ספציפי⁶. אלה הבדלים גדולים כימות שדווחה זקיק יכול להוביל לבלבול, יש הפריע קרוס-לימוד השוואות. השפעול, גישות מסורתיות זקיק כימות ממקטעים טורי מבוצעות על ידי ספירת זקיקים של מספר סעיפים מוגדרים מראש (למשל, החלטה, העשירי, או מקטע אחר). השתנות בתוך זקיק ספירות באמצעות גישה זו מתעוררת לא רק בשל את תקופתיות ב אילו מקטעים נספרים אלא גם וריאציות עובי סעיף ב, ניסיון טכני ביצירת המקטעים טורי^5,6. בנוסף ההשתנות שלו, חיסרון נוסף של רקמה מסורתית חלוקתה היא כי חלוקתה של השחלות קטן מבעלי חיים צעירים הוא מאתגר במיוחד, תלויים במידה רבה רקמות התמצאות⁸.

פרוטוקול שלהלן מתאר את טכניקת תרבות¹ שחלה בשימוש שגרתי אך הוא משפר באופן משמעותי על כימות זקיק מסורתי על ידי החלפת חלוקתה פיזי ברקמות ניקוי ואת חלוקתה אופטי באמצעות מיקרוסקופיה קונפוקלית^{8 ,9}. ניקוי באמצעות רקמות טבילה (ללא צורך זלוף טראנס או אלקטרופורזה) ב שתנן בסורביטול מבוססות פתרון (למשל, ScaleS(0)¹⁰) הוכיח תואם immunostaining ואת המותר עבור הפחתת ניקוי זמן מבלי להתפשר על עומק הדמיה. שיטות אחרות (למשל, ScaleA2^8,10, SeeDB¹¹, ClearT¹²ו- ClearT2¹²) הם גם יותר זמן רב או אל תאפשר מעמיק רזולוציה אופטית של המדגם. חלוקתה אופטי הוא יתרון, כי זה פחות עמל רב ומתחזק של האיבר ארכיטקטורה תלת מימדי^7,8. יתרון נוסף של גישה זו היא הכנת הדגימות לא דורשת ריאגנטים יקר כדי לנקות את הרקמה והוא יכול להתבצע בקלות יחסית.

באופן ספציפי, הפרוטוקול המתואר מוטבה עבור העכבר בתרבית השחלות ביום כמחנכת חמש, אבל התנהל על השחלות החל כמחנכת יום 0 – 10. השיטה עושה שימוש במערכת התרבות שחלה בו הרקמה באופן טבעי מייחסת הקרום שעליו זה הוא תרבותי, הקלת איברים טיפול ומניפולציה. מערכת התרבות תיאר יכול לשמש כדי לשמור על השחלות explanted עד 10 ימים, כדי להעריך כמה תנאים ניסיוני עלולים להפריע oocyte הישרדות¹³. ההליך כימות המתואר מתבצע באמצעות התמונה מסחרי עיבוד החבילה פיג’י-ImageJ¹⁴ , יכול להתבצע על רוב המחשבים האישיים. יתר על כן, התמונות המשמשות על כימות יהיה זמין נרחב עבור הקהילה המדעית, ובכך מאפשר עבור העתיד מטא אנליזה.