يوفر هذا البروتوكول سير عمل في كيفية الجمع بين تدخل الجيش الملكي النيبالي microRNA بوساطة الاصطناعية مع أوبتوجينيتيكس لحفز على وجه التحديد presynaptic boutons مع انخفاض التعبير عن gene(s) انتقائية داخل الدوائر العصبية سليمة.
والغرض من هذا البروتوكول لوصف تأثير الجينات ضربة قاضية على وظيفة presynaptic داخل الدوائر العصبية سليمة. يمكننا وصف سير عمل في كيفية الجمع بين ميكرورنا الاصطناعية (مير)-تدخل الجيش الملكي النيبالي في أوبتوجينيتيكس لتحقيق التحفيز الانتقائي من boutons بريسينابتيك التلاعب في شرائح الدماغ الحادة بوساطة. النهج التجريبي الذي ينطوي على استخدام تركيبة فيروسية واحد ومروج العصبية محددة واحدة محرك التعبير عن كلا من المسبار أوبتوجينيتيك ومصطنعة miR(s) ضد gene(s) بريسينابتيك. عند حقن ستيريوتاكتيكالي في منطقة الدماغ للفائدة، بناء أعرب يجعل من الممكن لحفز مع الضوء حصرا الخلايا العصبية مع انخفاض التعبير عن gene(s) قيد التحقيق. هذه الاستراتيجية لا يتطلب تطوير وصيانة خطوط الماوس المعدلة وراثيا ويمكن من حيث المبدأ تطبيق للكائنات الحية الأخرى وأي الجينات الخلايا العصبية للاختيار. لقد قدمنا طلبا للتحقيق كيف ينظم ضربة قاضية isoforms الوصلة البديلة لقنوات الكالسيوم الجهد عن طريق بوابة P/Q-نوع بريسينابتيك (فجككس) قصيرة الأجل اللدونة متشابك في CA3 إلى نهايات ضادات CA1 في شرائح هيبوكامبال الحادة مؤخرا. يمكن أيضا استخدامها نهجاً مماثلاً التلاعب والتحقيق في الدوائر العصبية فيفو.
ويصف هذا البروتوكول نهجاً جديداً لوصف تأثير الجينات ضربة قاضية على وظيفة presynaptic داخل الدوائر العصبية سليمة. التحقيق في الدالة بريسينابتيك في الدوائر العصبية سليمة هو التحدي نظراً لأن العديد من بتونس بريسينابتيك صغيرة جداً وبعيدا من سوما للسماح بالجمع بين التدخلات الجزيئية والكهربية. على الرغم من أن تدخل الجيش الملكي النيبالي يوفر وسيلة قوية ومرنة للبروتينات متشابك ضربة قاضية1، هذا النهج قد استخدمت ماما للتحقيق الدالة بريسينابتيك لأنه من الصعب الكشف عن آثار ضربة قاضية باستخدام التقليدية التحفيز الكهربائية، التي لا تميز بين التلاعب والسذاجة boutons بريسينابتيك2. هنا، نحن تصف كيفية الجمع بين ميكرورنا الاصطناعية (مير)-تدخل الجيش الملكي النيبالي مع التكنولوجيا المتقدمة مؤخرا أوبتوجينيتيك لتحقيق التحفيز الانتقائي من boutons بريسينابتيك التلاعب في شرائح الدماغ الحادة بوساطة.
يمكن أيضا استخدام الفئران مشروطة بالضربة القاضية في تركيبة مع الكهربية للتحقيق في وظيفة البروتينات بريسينابتيك3،4، استراتيجيتنا لا يتطلب تطوير وصيانة وراثيا تعديل خطوط الماوس، ويمكن أيضا أن تستخدم بسهولة نهدم isoforms محددة من الجينات. النسبي لأكثر شيوعاً دبوس الشعر القصير المستخدمة الكشف (شرناس)، ميرس الاصطناعية، التي نستخدمها هنا، تقدم المزايا الرئيسية لضربة قاضية في الخلايا العصبية. وخلافا شرناس، يمكن أعربوا تحت سيطرة المروج الثاني بوليميراز1. وهكذا، يمكن استخدام مشجع واحد لمحرك التعبير عن مير وتحقيقا أوبتوجينيتيك، جنبا إلى جنب مع مراسل فلورسنت. وبهذه الطريقة، يمكن الاحتفاظ بحجم بناء المؤتلف فيروسات الغدد المرتبطة (راف، الشكل 1A) في حدود التعبئة والتغليف. أيضا، يقلل استخدام بنية واحدة ومروج واحدة تجريبية تقلب لأنه يسمح للتعبير عن مير والتحقيق أوبتوجينيتيك والمراسل الفلورسنت في نسبة ثابتة.
نحن مؤخرا تطبيق هذه التكنولوجيا دراسة دور isoforms المقسمة كبديل لقنوات الكالسيوم بريسينابتيك في الحصين5. هذه استراتيجية تنطبق بصورة عامة إلى دراسة أهمية الفسيولوجية للبروتينات الأخرى أعربت عن بريسينابتيكالي في أي دائرة الدماغ للفائدة.
التعبير المشارك تحقيقا أوبتوجينيتيك ومير ضد جين presynaptic الاهتمام يقدم نهجاً قويا لوصف تأثير الجينات ضربة قاضية على وظيفة presynaptic داخل الدوائر العصبية سليمة. لهذا النهج التجريبي، من المهم تحديد وتوصيف ميرس ذات كفاءة عالية وانتقائية في إسقاط جينات الاهتمام بنظم الأصلية. إذا كان ذلك ممكناً، ينبغي استخدام ميرس المستقلة اثنين أو أكثر ضد مرناً نفس الاهتمام لمراقبة الآثار خارج الهدف في نهاية المطاف. تجارب الإنقاذ، التي جين مقاوم مير مجددا في النظام، ويمكن استخدامها كعنصر تحكم لخصوصية.
باستخدام نفس بنية للتعبير عن أوبتوجينيتيك التحقيق، ومير يسمح لحفز بصريا فقط presynaptic الخلايا العصبية التي قد تم التلاعب بها. وهذا غير ممكن مع التحفيز الكهربائية نظراً لأنها لا تميز بين الخلايا العصبية المصابة وغير المصابة، وبالتالي نتائج مختلطة والمخفف. لأنه يمكن أن يستحث التحفيز البصرية متعددة إمكانات العمل15، من المهم أن تختار إلا أسرع تحقيقات أوبتوجينيتيك، بين توسيع لوح15،19،،من2021. وبالإضافة إلى ذلك، من الضروري ضمان أن التحفيز البصري الحث على عدم ديبولاريزيشن مباشرة من presynaptic boutons، لتجنب تجاوز بعض الخطوات لانتقال متشابك أحد يرغب في التحقيق في22.
النهج التجريبي الذي يصف لنا هنا، يجعل من الممكن لتقييم بالتوازي مع أهمية الفسيولوجية للجينات بريسينابتيك متعددة للفائدة خلال فترة زمنية محدودة (4 – 6 أشهر). ومع ذلك، من المهم أن نضع في اعتبارنا أن كنوكدوونس نادراً ما تصل إلى 100%. وعلاوة على ذلك، تحتاج رافس يعبر عنه لمدة أسبوعين على الأقل للسماح للتعبير ضربة قاضية وكامل القصوى للتحقيق أوبتوجينيتيك، التي قد تمثل قيداً وقت عند التحقيق في العمليات الإنمائية المبكرة. على الرغم من الفئران خروج المغلوب مضيعة للوقت، والشرطي أكثر محدودة للخلايا العصبية presynaptic، يؤدي عموما في إكمال إزالة الجينات للفائدة ونقدم لذلك اتباع نهج متكاملة صالحة.
ميزة معينة من التكنولوجيا مير أنه يمكن التعبير عن ميرس متعددة من نفس المروج. قد استخدمت هذه الخاصية أساسا لزيادة كفاءة ضربة قاضية بإدراج نسخ متعددة من نفس مير أو ميرس مختلفة ضد نفس الجين المستهدف. ولكن يمكن أن تستخدم أيضا لضربة قاضية جينات متعددة بالإعراب عن ميرس ضد مستهدفة مختلفة الجينات7،23. يمكن استخدام هذه الخاصية لإسكات البروتينات presynaptic متعددة تشريح مسارات إشارات بريسينابتيك.
وهنا جمعنا بين أوبتوجينيتيكس مع ميرس مصطنعة لوصف آثار ضربة قاضية الجينات في الدالة بريسينابتيك في شرائح هيبوكامبال الحاد. يمكن أيضا استخدام نهجاً مماثلاً التلاعب والتحقيق في الدوائر العصبية في فيفو. وباﻹضافة إلى ذلك، الجمع بين ميرس الاصطناعية مع تشيموجينيتيك النهج سيمكن أحد باستجواب الدوائر العصبية على فترات زمنية أطول.
The authors have nothing to disclose.
ونشكر ف. بينفيناتي (معهد Italiano دي تكنولوجيا، IIT) للدعم وحسام فيتالي للمساعدة مع هذه المظاهرة. تم تمويل هذا العمل من IIT ومؤسسة سان باولو (منحة رقم 9734 لأمريكا اللاتينية والكاريبي).
Acrylamide | Sigma | Acrylamide/Bis-acrylamide, 30% solution | Toxic |
Animal Temperature Controller with heat pad | WPI | ATC2000 | |
BCA protein assay kit | ThermoFisher Scientific | 23225 | |
BLOCK-iT Pol II miR RNAi Expression Vector kit | ThermoFisher Scientific | K4936-00 | |
Brain slices Prechamber | Harvard Apparatus | BSC-PC | |
CCD camera-based imager | Bio-Rad | ChemiDoc™ MP | |
Cell Culture reagents | Life Technologies | ||
Chemiluminescent substrate | GE Helthcare | ECL Western Blotting Reagents, RPN2106 | |
Chloroform | Sigma | C2432 | Toxic |
Cytosine β-D-arabinofuranoside | Sigma | C6645 | |
Drill | Foredom | K.1030 | |
EGTA | Sigma | E4378 | |
Gentamicin ointment | Local pharmacy | ||
Glucose | Sigma | G7021 | |
Hepes | Sigma | 54459 | |
Injection micropipettes | Narishige | GD1 | |
Inorganic salts & detergents | Sigma | ||
K2-creatine phosphate | Calbiochem | 237911 | |
KGluconate | Fluka | 60245 | |
Laser | Laserglow Technologies | LRS-0473-GFM-00100-03 | |
Membrane | Amersham | Protran™ 0.2 µm NC | |
MgATP | Sigma | A9187 | |
Micropipette holder | Narishige | IM-H1 | |
Micropipette puller | Narishige | PC-100 | |
Na3GTP | Sigma | G8877 | |
NaPyruvate | Sigma | P5280 | |
Ocular lubricant | Local pharmacy | Lacrigel | |
Phosphate inhibitors | Sigma | P0044, P5726 | |
Protease inhibitors | Sigma | cOmplete™, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail | |
Protein gel electrophoresis and blotting devices | Bio-Rad | Mini-Protean III Cell | |
Providone iodine | Local pharmacy | Betadine | |
Qiazol Lysis Reagent | Qiagen | 79306 | Toxic |
QuantiTect Reverse Transcription Kit |
Qiagen | 205311 | |
RNeasy Micro Kit | Qiagen | 74004 | |
Spectrophotometer | ThermoFisher Scientific | Nanodrop 2000 | |
Stereotactic apparatus | WPI | ||
Tetrodotoxin | Tocris | 1069 | Toxic |
Vibratome | Leica | VT1200S |