X-ışınları yoğun, femtosecond darbeleri tarafından Bukminsterfuleren (C60) nanocrystals içinde indüklenen elektronik hasar soruşturma için tasarlanmış bir deney tarif. Doğal olarak, Stokastik olmak yerine, röntgen dynamics C60 yılında son derece correlated, elektron kristalleri1birim hücrenin yüzlerce üzerinde uzanan indüklenen, deneme bulundu.
Kesin yoğun X-ray bakliyat etkileşim madde ile yoğun ilgi femtosecond X-ray serbest elektron lazer (XFEL) deneylerin sonuçlarını yorumlamaya çalışan araştırmacılar için bir konu ayrıntılardır. Deneysel gözlemler giderek artan sayıda nükleer hareket önemsiz olabilir, ancak yeterli olay darbe süresi kısa bir verilen elektronik hareket göz ardı edilemez olduğunu göstermiştir. Geçerli ve yaygın olarak kabul edilen modelleri elektron darbe ile etkileşim tarafından tahrik dynamics geçmesi rağmen onların hareket büyük ölçüde ‘random’ olarak kabul edilebilir olduğunu varsayalım. Bu daha sonra sürekli arka plan sinyali olarak tedavi olmak için elektronik hareket gelen sözde tutarsız katkı sağlayacak ve böylece göz ardı. Deneyimiz özgün amacı değişikliği yoğunluğu nedeniyle X-ray bireysel Bragg zirvesinin tam ölçü birimi için bir model sisteminde, kristal C60elektronik zarar indüklenen oldu. Bu beklenti aksine, biz en yüksek x-ışını yoğunluklarını, electron dynamics C60 yılında aslında yüksek korelasyon ve yeterince uzun mesafelerde Bragg yansımaları pozisyonları önemli ölçüde vardır değişmiş gözlenen. Bu kağıt hem Linac tutarlı ışık kaynağı (LCLS) ve Avustralya Synchrotron (AS) hem de verileri analiz etmek için kullanılan crystallographic yaklaşımlar yapılmıştır bu deneyler için kullanılan iletişim kuralları ve yöntemleri ayrıntılı olarak açıklar.
X-ışını serbest elektron lazerler (XFELs) önemli amaçlarından biri yüksek işlem hacmi, moleküler görüntüleme ve dinamikleri yüksek çözünürlüklü yaklaşım geliştirmektir. Yapısal Biyoloji atomik bilgi, çözümleme x-ışını kristalografisi teknikleri üçüncü nesil synchrotrons gerçekleştirilen düşürmek için geleneksel olarak sınırlı bağlıdır. Önemli radyasyon zarar kristaller, uzun pozlama süreleri büyük ölçüde geleneksel yöntemlerle elde çözünürlük etkiler. Düzenini2,Imaging anlık görüntü kırınım3,XFELs, istihdam4 üzerinden (ki ışın odak çevrilir) ya da sabit hedef örnekleri isabet kısa darbe x-ışınları Difraksiyon görüntüleri toplama içerir ya da ışın yolu içine enjekte örnekleri.
XFEL darbe-örnek etkileşim sonuçta örnekleri, ağır radyasyon hasarı başlangıçlı nedeniyle yok eder. Kırınım görüntüleri alt-100 fs darbe süreleri nedeniyle bu imha başlangıcı önce toplanır. Nanocrystals yüksek çözünürlüklü yapıları belirlemek için yeteneği hızla iyi kurulmuş gelmektedir. Ancak, dinamik oluşum hangi femtosecond timescales deneysel görüntüleme koşullarında ortaya atom fiziği içine daha derin anlayışlar teklif ve nanocrystals ve onların kırınım desen5,6 makroskopik bir etkisi olabilir ,7.
Felaket yapısal hasar sırasında anlık görüntü kırınım görüntü kaydedilen femtosecond ölçeğinde önlenmiş olur iken, bir XFEL darbe güç yoğunluğu ile hangi örnek elektronik özelliklerini değiştirmek için yüksek olabilir x-ışınları 7,8,9etkileşim. Fizik madde ile yoğun tutarlı X-ray bakliyat etkileşimin bir keşif içsel bilimsel ilgi değil, ancak bir XFEL üzerinden hangi ışıkta darbe keşfetmek için kullanılan herhangi bir deneme yorumu için önemli olacak yapısı.
Görüntüleme deneyler tek molekülleri, küçük kümeleri veya birkaç birim hücreleri oluşur nanocrystals gerçekleştirilen X-ray, bunu her iki bir azaltma içinde dağınık sinyal8tutarlılık belirgin dikkat etmelisiniz perturbative analiz gösterir, ve electrodynamical bir sonucu olarak structureless arka plan sinyal büyüme9işler. Bu deney değerlendirmek için aranan hangi dereceye eşevresizlik electrodynamical işlemler nedeniyle toz nanocrystalline C60 kısa XFEL darbeleri ile etkileşim nedeniyle oluşur.
Bu makalede, biz hangi bir XFEL darbe1ile etkileşim nedeniyle bir çok sipariş edilen geçici elektronik yapısı C60 nanocrystals görülmektedir deneysel bir işlem ile ilgili ayrıntılar sağlar. Bu koşullar altında üretilen kırınım deseni ne zaman aynı örnek daha düşük güç tarafından aydınlatılmış, ama aksi takdirde aynı XFEL bakliyat veya bir sinkrotron ışın aynı foton enerji kullanıldığında gözlenen bundan önemli ölçüde farklıdır. Bu fark düşük güç ve sinkrotron kırınım resimlere karşılık gelen iki kırınım profilleri görülmez Bragg doruklarına varlığı ile işaretlenir. Biz bizim analiz ve dinamik bir elektronik bozulma XFEL darbe-nanocrystal etkileşim tarafından indüklenen varlığını doğrulamak için kullanılan modeli uygun yaklaşım göstermektedir.
Kırınım veri çerçevesi kalibrasyonu.
. (Hangi bir tam çalışma verileri içerir) XTC dosyaları deneme sırasında CSPAD modülleri ( şekil 2agösterildiği) geometrik düzenleme tanımlayan kalibrasyon parametreleri içerir. Adet bireysel modülleri kaydı doğru düzenlenmesi her vadede kaydedilen veri oluşan bireysel kırınım veri yansımaları montajı çok önemlidir. Deneme gerçekleştirildi zaman doğru parametreleri içeren kalibrasyon dosyanın konumunu otomatik olarak ayarlanmış durumda değil ve el ile hesaplama ekibi tarafından bu sorunu çözmek için gerekli oldu. Ekstra zaman geçirdim performans gösteren kalibrasyon çalıştırmak anlık görüntü veri kümesi ayarlama ve kontrol belgili tanımlık koşmak yolu ile darkfield ve arka plan başarı arasında bir zaman farkı olduğunu veri nedeniyle veri kümesi görüntü kareleri toplamı çıkartılır.
Kristal boyutları.
İlk XFEL bazılarında anlık görüntü çalışır, güçlü tek kristal Bragg yansımaları görüntü kareleri bazılarında görüldü. Bu yeterince ince ezilmiş değil C60 örnek bazıları sonuçlandı. Ezilmiş toz optik yansımaları gözlemleyerek gösterir kristal esaslarını çok büyük (görünür ışığın dalga boyu karşılık ~ 400-700 nm). Toz bu yansımalar için kırma aşamada kontrol edilmelidir ve güçlü, Bragg yansımaları verilerde görülür tek kristal toz daha da ezilmiş gerekir.
Bu denemenin sonuçları değil beklenen veya planlanan beri başarılı toz Difraksiyon veri toplama C60 örnek için yalnızca iki aşırı yoğunluk değerlerinde (% 10 ve % 100 akı) elde edildi. Işın zamanı fabrikasında sınırlıdır ve bu nedenle herhangi bir ayarı, hesaplama veya örnek işleme hataları ve sorunları bir büyük etkiye sahip bir deneysel planı. İki en yaygın olay yoğunluğu Puan öncelik ayrılmış ve ara herhangi bir puan için toplanan güvenilir istatistikler mevcut yetersiz ışın zaman vardı. Bu nedenle, biz tetik nokta bu geçici faz değişikliği gerçekleştiği XFEL akı açısından deneysel olarak değerlendirmek mümkün değildi.
Ön çalışmalar.
XFEL, ölçülen aynı C60 örnekten Avustralya Synchrotron, toz Difraksiyon verilerin toplanması. Synchrotrons uygun XFEL26hedefler için ekran ve şimdiki zamanda olumlu durum için rutin olarak kullanılan % 10 XFEL yoğunlukta kırınım veri C60zemin durumu FCC yapısı ile tutarlı olduğunu doğruladı.
Örnek ve Dedektör zayıflama.
Kalibrasyon silikon attenuators akıntıya karşı düzeltilmesi ile olay akı özellikle okudu etkisi yoğunluk bağımlı olduğu örnek gerekliydi. Uygun alüminyum zayıflatıcı, olay akı eşleşen dedektörü, inşaatı da son derece önemliydi.
Işın odak noktasında örnek isabet.
XFEL KB odak noktada konumunu da örnek üzerinde akı yoğunluğu dipoller boyunca kristal oluşumu ikna etmek yeterli olması gerektiğinden bildirilen olgu gözlemlemek için gerekli oldu. Optik eksen boyunca iyi örnek tarama performansı yanı sıra optik mikroskobu kullanılarak bir YAG kristal XFEL ışın tarafından kraterler boyutunu ölçmek oluşturulur ve kırınım yoğunlukta seyir odak düzlemi konumunu belirlemek için kullanılır.
Bu eser olay yoğunluklarda yanı sıra darbe süreleri daha çok sayıda uygulamaları gelecekte incelenecek. Bu eser yaklaşan deneyler nanocrystals XFEL kaynakları itibariyle toplanan kırınım veri analizi için potansiyel etkileri vardır. XFELs yeni fizik içinde geleneksel kristalografisi ağırladı değil keşfetmek potansiyeline sahip vurgulayarak sorun ile XFELs temel etkileşim yeni görüşler de sağlar.
The authors have nothing to disclose.
Yazarlar Avustralya Araştırma Konseyi mükemmellik merkezi gelişmiş moleküler görüntüleme içinde destek kabul etmiş oluyorsunuz. Bu araştırma bazı bölümleri, LCLS, ABD Enerji Bakanlığı adına, temel Enerji Bilimler Office Stanford Üniversitesi tarafından işletilen bir ulusal kullanıcı tesisi yapılmıştır. Seyahat uluslararası sinkrotron erişim programı tarafından sağlanan finansman AS ve Avustralya hükümeti tarafından yönetilen anıyoruz. Buna ek olarak, bazı bu araştırma üstlenilen MX1 ve MX2 beamlines AS, Victoria, Avustralya, üzerinde. Yazar katkıları: B.A. planlamak ve tümüyle deneysel proje yönetmek için sorumlu. Deneyler B.A., R.A.D., vs tarafından tasarlanmış, C.D. ve G.J.W. ba, H.M.Q., K.A.N. ve R.A.D. özgün LCLS teklifi yazdı. D.W., R.A.D., R.A.R., AVM, AK ve S.W. simülasyon iş dışarı taşıdı. B.A., R.A.D., C.D., vs, M.W.M.J., R.A.R., N.G., F.H., G.J.W., SB, mm, M.M.S., A.G.P., C.T.P., AVM ve K.A.N. toplanan LCLS deneysel verilere. Avustralya sinkrotron deneysel veri toplanan S.W., V.A.S. ve R.A.D. C.T.P. ve AVM deneysel veri dönüştürme ve analiz yol açtı. B.A., C.D., N.G. ve E.B. örnek tutucu tasarımı sorumlu ve test edildi. R.A.R, B.A., S.W., A.V.M ve H.M.Q bu makale yazdı. Tutarlılık kuramı içinde elektronik hasar formülasyonu H.M.Q. ve K.A.N. tarafından gerçekleştirilir; R.A.D. bu Biçimcilik C60 için uygulamak için fikir gebe.
Macroscopic 99.5+ % pure C60 | SES RESEARCH | ||
Pestle and mortar | Sigma Aldrich | used for crushing C60 powder; | |
Aluminium sheet | used for constructing sample holder | ||
kapton polyimide film | Du Pont | http://www.dupont.com/products-and-services/membranes-films/polyimide-films/brands/kapton-polyimide-film/ | |
CXI beamline | SLAC | http://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?yi5003 | |
safety glasses | |||
biosafety cabinet |