Wir beschreiben ein Experiment entwickelt, um die elektronische Schäden in Nanokristalle Buckminsterfulleren (C60) induzierte Sonde durch intensive, Femtosekunden-Impulse von Röntgenstrahlen. Das Experiment festgestellt, dass, überraschend, anstatt stochastische, die x-ray Elektron, die Dynamik in C60 stark korreliert sind, erstreckt sich über Hunderte von Einheit Zellen innerhalb der Kristalle1.
Die genauen Details der Wechselwirkung der intensive Röntgenpulse mit Materie sind ein Thema der intensiven Interesse für Forscher versucht, die Ergebnisse von Femtosekunden Röntgen-freie-Elektronen-Laser (XFEL)-Experimente zu interpretieren. Eine wachsende Zahl von experimentellen Beobachtungen haben gezeigt, dass obwohl nuklearen Bewegung vernachlässigbar sein kann, gegeben eine kurze genug Vorfall Pulsdauer, Bewegung von Elektronen nicht ignoriert werden kann. Die aktuellen und allgemein anerkannter Modelle davon ausgehen, dass obwohl Elektronen Dynamik angetrieben durch Interaktion mit dem Puls unterziehen, ihre Bewegung weitgehend “zufällig” gelten könnten. Dies würde dann den vermeintlich zusammenhanglosen Beitrag aus der Bewegung von Elektronen als eine kontinuierliche Hintergrundsignal behandelt werden lassen und somit ignoriert. Das ursprüngliche Ziel unseres Experimentes war genau messen die Änderung in der Intensität der einzelnen Bragg Gipfel, durch Röntgen elektronische Schäden im Modellsystem, kristalline C60induziert. Im Gegensatz zu dieser Erwartung haben wir beobachtet, dass bei der höchsten Röntgen-Intensitäten, die Elektron-Dynamik in C60 waren in der Tat hoch korreliert, und ausreichend lange übermäßigabstände, dass die Positionen der Bragg Reflexionen deutlich verändert. Dieses Papier beschreibt im Detail die Methoden und Protokolle für diese Experimente, die sowohl bei der Linac kohärentes Licht Quelle (LCLS) sowie das Australische Synchrotron (AS) und die kristallographische Ansätze zur analyse der Daten durchgeführt wurden.
Eines der wichtigsten Ziele der Röntgen-freie-Elektronen-Laser (XFELs) ist ein hoher Durchsatz, hochauflösende Ansatz für molekulare Bildgebung und Dynamik zu entwickeln. Strukturbiologie richtet sich auf atomarer Skala Informationen, traditionell begrenzte Auflösung Röntgenkristallographie Techniken durchgeführt am dritten Generation Synchrotrone zu senken. Lange Belichtungszeiten, die erhebliche Strahlenschäden in Kristallen, verursachen einen großen Einfluss auf die Auflösung erreicht mit traditionellen Techniken. Die Snapshot-Beugung imaging System2,beinhaltet3,4 bei XFELs, beschäftigt Beugung Sammelbilder aus kurzer Impuls Röntgenstrahlen schlagen entweder feste Vorgabe-Proben (die über den Strahl Fokus übersetzt werden) oder Proben in den Pfad des Balkens injiziert.
Die XFEL-Puls-Sample-Interaktion zerstört letztlich die Proben durch das Auftreten von schweren Strahlenschäden. Die Beugung Bilder werden vor dem Beginn dieser Zerstörung durch die Sub-100 fs Pulsdauern gesammelt. Die Möglichkeit, hochauflösende Strukturen von Nanokristallen bestimmen wird zunehmend etabliert. Jedoch können dynamische Prozesse, die auf Femtosekunden Fristen unter Versuchsbedingungen Bildgebung auftreten bieten tiefere Einblicke in Atomphysik und eine makroskopische Wirkung auf Nanokristallen und ihrer Beugung Muster5,6 ,7.
Während katastrophale strukturelle Schäden auf der Femtosekunden-Zeitskala bei dem eine Snapshot Beugung Bild aufgenommen vermieden wird wird, die Leistungsdichte eines XFEL-Impulses kann hoch genug sein, die elektronischen Eigenschaften der Probe mit dem Ändern der Röntgenstrahlen 7,8,9zu interagieren. Eine Auseinandersetzung mit der Physik von der intensiven kohärenten Röntgenpulse Wechselwirkung mit Materie wird ist nicht nur der wissenschaftlichen Interesse, jedoch von entscheidender Bedeutung für die Interpretation der jedes Experiment, in das Licht von einem XFEL Impuls verwendet wird, um zu erkunden Struktur.
In x-ray imaging Experimente auf einzelne Moleküle, kleine Gruppen oder Nanokristalle bestehend aus ein paar Einheit Zellen durchgeführt, zeigt störungstheoretische Analyse, dass man sowohl eine Reduzierung der scheinbaren Kohärenz der verstreuten Signal8beachtet werden sollte, und das Wachstum von einem strukturlosen Hintergrundsignal infolge Ionenwolken Prozesse9. Dieses Experiment versucht zu beurteilen, inwieweit die Dekohärenz durch Ionenwolken Prozesse, tritt in pulverförmigen nanokristallinen C60 durch die Wechselwirkung mit kurzen XFEL Impulsen.
In diesem Artikel stellen wir Details über das experimentelle Verfahren, in denen eine hochgeordnete transiente elektronische Struktur aus C60 Nanokristalle durch Wechselwirkung mit einem XFEL Puls1eingehalten wird. Die Beugungsmuster produziert unter diesen Bedingungen unterscheidet sich deutlich von beobachtet, wenn die gleiche Probe ist durch geringeren Stromverbrauch beleuchtet, aber ansonsten identischen XFEL pulsiert, oder wenn ein Synchrotron-Strahl auf die gleichen Photonenenergie verwendet wird. Dieser Unterschied ist gekennzeichnet durch das Vorhandensein der Bragg-Peaks, die nicht in die beiden Beugung Profile entspricht der Low-Power- und Synchrotron Beugung Bilder gesehen. Wir zeigen unsere Analyse und Modell anliegende Ansatz verwendet, um das Vorhandensein einer dynamischen elektronischen Verzerrung induziert durch XFEL Puls-Nanocrystal Interaktion zu bestätigen.
Kalibrierung von Beugung Datenrahmen.
Die. XTC-Dateien (die die Daten aus einer kompletten Ausführung enthalten) enthalten Kalibrierung Parameter, die die geometrische Anordnung der CSPAD Module (siehe Abb. 2a) definieren während des Experiments. Die richtige Anordnung der Daten auf einzelne Module ist entscheidend für die einzelnen Beugung Daten Bilder bestehend aus Daten, die in jedem Lauf zu montieren. Zum Zeitpunkt, an das Experiment durchgeführt wurde die Lage der Kalibrierung-Datei mit den richtigen Parametern wurde nicht automatisch eingerichtet und manuelle Berechnung wurde vom Team erforderlich, um das Problem zu beheben. Aufgrund die zusätzlichen Zeitaufwand Durchführung Kalibrierung Daten gab es eine Zeitverzögerung zwischen dem ein Snapshot laufen Dataset festlegen und Überprüfen des Erfolgs des Laufes über eine Dunkelfeld und Hintergrund subtrahiert Summierung der Bildrahmen im Dataset.
Kristall-Größen.
In einigen der ursprünglichen XFEL läuft Snapshot, starke Einkristall Bragg Reflexionen wurden in einigen der Bildrahmen sehen. Dies resultierte aus einige der C60 Probe nicht fein genug erdrückt. Beobachtung der optischen Reflexionen aus zerkleinerten Pulver gibt an, dass der Kristall Facetten zu groß sind (entspricht der Wellenlänge des sichtbaren Lichts ~ 400-700 nm). Das Pulver sollte für diese Überlegungen bei der Brechstufe überprüft werden, und wenn Sie stark, Einkristall, die Bragg-Reflexion in den Daten gesehen werden das Pulver muss weiter zerkleinert werden.
Da die Ergebnisse dieses Experiments wurden nicht erwartet oder geplant wurde erfolgreich Pulver Beugung Datenerhebung für die C60 Probe nur bei zwei extreme Intensität Einstellungen (10 % und 100 % Flussmittel) erhalten. Strahlzeit an der Anlage ist begrenzt und daher Set-up, Berechnung oder Probe Verarbeitung Fehler und Probleme haben einen großen Einfluss auf ein Versuchsplan. Die zwei am meisten weit getrennt einfallende Intensität, die Punkte wurden priorisiert und gab es nicht genügend Strahlzeit gesammelten verlässliche Statistiken für alle Zwischenpunkte zur Verfügung. Daher konnten wir nicht experimentell den Triggerpunkt im Hinblick auf die XFEL Flussmittel bewerten diese vorübergehende Phasenänderung an dem Auftritt.
Vorläufige Studien.
Datensammlung Pulver Beugung an das Australische Synchrotron derselben C60 Probe gemessen an der XFEL. Synchrotrone werden routinemäßig verwendet, um Bildschirm für geeignete XFEL26richtet, und im vorliegenden Fall positiv bestätigt, dass bei 10 % XFEL Intensität, die Beugung Daten konsistent mit der Grundzustand FCC-Struktur des C-60war.
Probe und Detektor Dämpfung.
Kalibrierung von den einfallenden Flux durch Anpassung der Silizium-Dämpfungsglieder flussaufwärts war der Probe unerlässlich, zumal die Wirkung untersucht Intensität abhängig war. Bau eine geeignete Aluminium-Dämpfungsglied am Detektor, abgestimmt auf die einfallende Fluss war auch kritisch.
Schlagen die Probe an der Stelle der Strahl Dreh-und Angelpunkt.
Die Lage der Brennfleck der KB in der XFEL war auch wesentlich für das gemeldete Phänomen zu beobachten, da die Flussdichte auf der Probe muss ausreichen, um die Bildung der Dipole in den Kristall zu induzieren. Messung der Größe der Krater durch den XFEL-Strahl in einem YAG-Kristall mit optischen Mikroskopie sowie die Durchführung einer feinen Probe Scan entlang der optischen Achse erstellt und Blick auf die Beugung Intensität wurde zur Bestimmung der Position der Brennebene.
In Zukunft werden Implementierungen dieser Arbeit eine größere Anzahl von Vorfällen Intensitäten sowie Pulsdauern erkundet werden. Diese Arbeit hat potenzielle Auswirkungen auf kommende Experimente die Beugung von Nanokristallen XFEL Quellen gesammelten Daten zu analysieren. Darüber hinaus neue Einblicke in die fundamentale Wechselwirkung von XFELs mit Materie, Hervorhebung, dass XFELs das Potenzial, neue Physik, die nicht innerhalb von konventionellen Kristallographie untergebracht zu erkunden.
The authors have nothing to disclose.
Die Autoren erkennen die Unterstützung der australischen Forschung Rat Centre of Excellence in Advanced molekulare Bildgebung. Teile dieser Forschung wurden bei LCLS, eine nationale Benutzer-Anlage von der Stanford University im Auftrag des U.S. Department of Energy, Büro der grundlegenden Energiewissenschaften Betrieben durchgeführt. Wir anerkennen, dass die Reise Finanzierung durch den internationalen Synchrotron-Access-Programm von der AS und von der australischen Regierung verwaltet. Darüber hinaus einige dieser Forschung wurde durchgeführt, auf der MX1 und MX2 Beamlines bei AS, Victoria, Australien. Beiträge Autor: B.A war verantwortlich für die Planung und Verwaltung von allen experimentellen Aspekten des Projekts. Experimente von B.A., R.A.D, V.S. entworfen wurden, schrieb C.D., und G.J.W. B.A., H.M.Q., K.A.N. und R.A.D der Originalvorschlag LCLS. D.w., R.A.D R.A, A.V.M., E.C. und S.W die Simulation-Arbeiten durchgeführt. B.a., R.A.D, C.D., V.S., M.W.M.J., R.A, n.g., f.h., G.J.W., S.B., M.M., M.M.S., A.G.P., C.T.P., A.V.M. und K.A.N. die experimentellen Daten an die LCLS gesammelt. S.W, V.A.S. und R.A.D experimentelle Daten an das Australische Synchrotron gesammelt. C.T.P. und A.V.M. führten die experimentellen Daten-Konvertierung und Analyse. B.a., C.D., n.g. und e.b. waren verantwortlich für die Sample-Halter-Design und Test. R.A.R, B.A., S.W, A.V.M und H.M.Q schrieb das Manuskript. Die Formulierung der elektronischen Schäden innerhalb von Kohärenz Theorie erfolgt durch H.M.Q. und K.A.N.; R.A.D konzipierte die Idee dieser Formalismus C60 zuweisen.
Macroscopic 99.5+ % pure C60 | SES RESEARCH | ||
Pestle and mortar | Sigma Aldrich | used for crushing C60 powder; | |
Aluminium sheet | used for constructing sample holder | ||
kapton polyimide film | Du Pont | http://www.dupont.com/products-and-services/membranes-films/polyimide-films/brands/kapton-polyimide-film/ | |
CXI beamline | SLAC | http://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?yi5003 | |
safety glasses | |||
biosafety cabinet |