我々は、高解像度腺鏡検査法を用いたデジタルボリュームデータの生成を可能にするために、様々な種の生検材料、生物医学モデル生物の胚および他の有機組織の試料を処理するための簡単で堅牢なプロトコルを提供する。
我々は、高分解能肛門鏡検査(HREM)法を用いてデジタルボリュームデータを生成するための簡単なプロトコルを提供する。 HREMは、1 x 1 x 1と5 x 5 x 5μm3の間の典型的な数値分解能で最大5 x 5 x 7 mm 3までの体積の有機材料を画像化することができます。標本はメタクリレート樹脂に包埋され、ミクロトーム上で切片化される。各セクションの後に、ブロック表面の画像が複合型顕微鏡ヘッドに接続された光電管上に置かれたデジタルビデオカメラで取り込まれる。光軸は、緑色蛍光タンパク質(GFP)フィルターキューブを通過し、各セクション後にボックホルダーアームが静止する位置に位置合わせされる。このようにして、後続のブロック表面を表示する一連の固有に整列されたデジタル画像が生成される。このような画像シリーズを3次元(3D)視覚化ソフトウェアにロードすることにより、デジタルボリュームデータへの即座の変換が容易になり、仮想データさまざまな直交平面および斜めの平面での動作、およびボリュームおよび表面レンダリングされたコンピュータモデルの作成。我々は、マウス、ニワトリ、ウズラ、カエルおよびゼブラフィッシュの胚、ヒト生検材料、コーティングされていない紙および皮膚代替材料を含む様々な有機体標本を処理するための3つの簡単で組織特異的なプロトコルを提示する。
有機および無機材料の構造解析は、その物理的性質および機能を理解するための第一歩である。そのような分析の基礎は、組織構造、細胞形態およびトポロジー、分子組成および生体力学的特性の詳細を抽出する、様々な単純で洗練された画像化方法を用いて、組織学的セクションを注意深く観察することによって得られる二次元(2D) 2,3 。しかしながら、2D情報は、空間的に複雑な配置を研究するのには適していない。したがって、デジタルボリュームデータの生成を可能にする生体 内および生体外の方法の数が過去数十年に確立され、さらに多くが開発中である。
大部分のボリュームデータ生成方法の原理的な原理は、仮想スタックの生成であるオブジェクトの仮想または物理的な区切りによって得られたセクションを表示するデジタル画像のことである。セクションイメージが適切に整列されている場合は、仮想断面平面で再分割するか、3Dサーフェスおよびボリュームレンダリングモデルを作成するためにボリュームを作成します。人間とより大きな生物学的試料を可視化するための一般的な技術は、磁気共鳴断層撮影(MRT)、コンピュータ断層撮影(CT)、陽電子放射断層撮影(PET)および単一光子放出コンピュータ断層撮影(SPECT)である。小さな検体は、通常、マイクロ磁気共鳴イメージング(μMRI)、光学投影トモグラフィー(OPT)、光干渉断層撮影(OCT)、光音響トモグラフィー(PAT)、組織学的断面化法、共焦点顕微鏡法、および電子断層撮影法を用いて視覚化される。 、 7,8,9,10 <sup>、 11,12,13,14,15,16,17 。
小標本および組織学的組織サンプルのデジタルデータを生成する比較的新しいボリュームデータ生成技術は、Tim Mohun 18,19と密接に協力して開発されたHREM法です。これは、ミクロトーム上で切片化された樹脂埋め込み材料からデジタルボリュームデータを生成する、単純な顕微鏡ベースの技術である。このデータは、組織構造および細胞分布の詳細な分析ならびに中間の光学顕微鏡レベルでの小さな特徴のメトリック分析を容易にする。
HREMは、eからキャプチャしたように見える、本質的に整列したデジタル画像のスタックを生成しますosinで染色された組織切片。視野に関する組織コントラストおよびデータ解像度は、μCT、μMRI、およびOPTで生成されるデータのそれを上回るが、共焦点、光シートおよび電子顕微鏡で得られるデータよりも低い20 。しかし、後者とは対照的に、HREMは、5×5×7mm 3までの比較的大きな体積の組織標本を組織学的品質で視覚化することができる。最近のいくつかの研究では、単一イメージング技術の長所と短所の詳細な特徴付けと比較が行われており、客観性のために、それらの限界と応用分野4,21,22,23,24,26,27,28,29,27,28,29 、 24 。
本研究では、HREMイメージング法に焦点を当て、広いスペクトルの有機材料のHREMデータを生成するための非常に簡単なプロトコルと、その応用の例。 HREMデータを作成するワークフローは簡単で、メタクリレート樹脂に埋め込むことができるすべての材料に適用されます( 図1 )。しかし、試料調製には組織特異的な違いがあり、考慮する必要があります。したがって、我々は様々な試料を調製するための3つの標準的なプロトコルを提供する。埋め込みとデータ生成プロトコルの手順は、すべて同じです。
HREMは、生物医学および産業分野で使用される広範囲の有機材料を視覚化するのに理想的な、非常に堅牢な顕微鏡法である18,21,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37 、 38,39,40 。それは、発達障害メカニズム(DMDD)プログラム41,42によって現在使用されているように、独占イメージングモダリティとして使用することができる<sup>、 43,44またはマルチモーダルイメージングパイプライン45の統合部分として使用することができる。
完全に機能するHREMデータ生成装置は、従来の実験室構成要素から組み立てることができ、電動ミクロトーム、顕微鏡、電動クロステーブル、および適切なソフトウェア25を備えたコンピュータを含む。定義された位置で各セクションの後に再現可能に停止するブロックホルダーと、光路内のGFPフィルターキューブを備えたミクロトームを使用することが重要です。ただし、完全に機能するオールインクルーシブソリューションは、Indigo Scientificなどの企業から購入できます。
HREMは、切片作成または切片マウント中にアーチファクトが導入されないことを除いて、すべての組織学的技術と同じ制限に直面する。しかし、切片化する前に標本を染色する必要性から生じる制限があります。埋め込み材料の特性から決定する。十分な組織のコントラストを得るためには、標本全体を通してのエオシンの浸透が必要である。脂肪組織および無機物質は、エオシンの浸透を効果的に妨げ、この結果、物体の中心に染色されていない組織が生じる。特別な固定剤を使用すると、皮膚の標本を汚すのに役立ちますが、問題を完全に解決するための適切な方法はまだありません。もう1つの制限は、2cmよりも高くブロックする樹脂が切断中に破損する傾向があることである。これは、試料と加工部品を別々に切断することによって部分的に回避することができます。
埋め込みの間に金型内の不規則な表面を有する小さなサンプルまたはサンプルの正しい位置決めが問題となることが多い。アガロースでサンプルをカバーし、プロトコルに記載されているようにアガロースブロックを処理すると、通常この問題が解決されます19 。別の方法は、ブロックが部門間に壊れた場合に役立ちます既に硬化したブロックをそのホルダーから取り外し、前述の埋め込み手順に従って新たに埋め込むことである。
典型的なHREMデータセットは、500から3,000の単一画像を含む。その数値分解能は、連続画像間の距離( すなわち 、断面厚さ)、カメラターゲットの特性、および利用される光学系の特性によって決定される。提示されたプロトコールはアーチファクト20,46からの輝きを完全に排除するものではないが、1μm〜5μmの断面厚さを使用し、良好な結果を達成した。これらのアーチファクトは、ブロック内部の深部に位置する激しく染色された組織によって引き起こされ、その結果ブロック表面上の組織情報のぼけが生じる。
カメラの目標寸法は、2,560×1,920ピクセル2,2048×2,048ピクセル2,4,096×4,096ピクセル2であり、コンビネーション1.25倍、2.5倍、5倍、10倍、20倍の対物レンズを搭載しています。これは、0.18×0.18μm2と5.92×5.92μm2の間の数値ピクセルサイズをもたらし、これは、組織構造および細胞形状の3D解析、ならびに核の視覚化に十分であることが判明した。高い数値分解能が与えられれば、他の細胞オルガネラも同様に可視であるべきである。単純なエオシン染色のためにコントラストが不十分であり、目的物の光学特性が構造を識別する可能性を劇的に低下させる。開口数を考慮したHREMデータの最大真の空間分解能はおよそ1 x 1 x 1μm3であるため、およそ3 x 3 x 3μm3を超える構造の有効な識別が可能になります。
すべてのデジタル画像技術に共通する問題は、視野の大きさと、表示可能な標本の部分を定義するカメラターゲット上のd、および画像の数値解像度。視野が広いほど、可能な限り最大の数値分解能が得られます46 。ここで使用するHREM設定では、0.18 x 0.18μm2および12.12 x 12.12 mm 2 (1.25X対物レンズ)の数値分解能で表示された0.74 x 0.74 mm 2 (20X対物レンズ) 2.96×2.96μm2の数値分解能。代替の商業化されたセットアップは、より大きな視野を提供することができますが、真の解決を犠牲にします。それにもかかわらず、DMDDプログラム47のホームページに表示されるデータから明らかなように、優れた結果を提供する。
The authors have nothing to disclose.
著者はTim Mohunに、サンプルを提供するためのHREMとPetra Heffeterの開発に貢献してくれたことに感謝します。
JB-4 Plus Embedding Kit | Polysciences Europe GmbH | 18570-1 | includes Benzoyl Peroxide, Plasticized (Catalyst) and Solution A+B |
Polyethylene Molding Cup Trays, 6x8x5mm hexagon (9 cavities) | Polysciences Europe GmbH | 17177A-3 | |
Polyethylene Molding Cup Trays, 13x19x5mm (9 cavities) | Polysciences Europe GmbH | 17177C-3 | |
JB-4 Plastic Block Holders | Polysciences Europe GmbH | 15899-50 | |
Eosin | Waldeck GmbH & Co. KG, Division Chroma | 1A-196 | |
Microtec CUT 4060E | rotary microtome | ||
Leica DM LM, fluorescence compound microscope | Leica Mikrosysteme Handelges.m.b.H | ||
GFP filter set | Leica Mikrosysteme Handelges.m.b.H | 11090937180000 | |
Motorised cross table | Walter Uhl, technische Mikroskopie GmbH & CO. KG | KT5-LSMA | |
Digital video camera SPOT-FLEX | Visitron Systems GmbH. | ||
precisExcite High-Power LED | Visitron Systems GmbH. | light source | |
VisiView 2.1.4 | Visitron Systems GmbH. | Image capturing software | |
Hard metal knife (tungsten carbide), profile D | Leica Mikrosysteme Handelges.m.b.H | ||
KL 2500 LCD | Schott AG | light source |