Summary

ゼブラフィッシュ胚の安定した、動的、および初期の微小管を分析する反応の利用

Published: September 20, 2017
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Summary

ここでは、他の組織に広く適用される、ゼブラフィッシュ脳の発達における微小管の異なる集団を分析するメソッドについて反応について説明します。最初のプロトコルでは、反応の安定性と動的微小管の最適化手法について説明します。第二議定書は、画像し、初期微小管を具体的に数値化する方法を提供します。

Abstract

微小管 (MTs) は、イメージ体内、特に脊椎動物の胚に挑戦して、ダイナミックで壊れやすい構造です。反応メソッドは、ゼブラフィッシュの胚の成長の神経管の MTs の異なる集団を分析するためここで記述されます。神経組織にフォーカスがある、この方法論は他の組織に広く適用されます。手順は、早くに半ば形成段階の胚 (12 体節に 1 体節)、しかし彼らに適応できる一連の比較的マイナーな調整と他のステージのために最適化されています。最初のプロトコルは、安定性と動的な MTs の空間分布を把握し、画像処理ソフトウェアでこれらの集団の定量的分析を行うメソッドを提供します。このアプローチは、既存のツールにリアルタイムを使用して形質転換線のタグ構造体の一過性の発現分布と画像微小管動態を補完します。確かに、このようなツールは、ダイナミックで安定した MTs とは容易に区別しないしかし、非常に便利。イメージを作成し、これらの異なる微小管集団を分析することで、細胞の極性形成と形態形成メカニズムの理解のための重要な含意。2 番目のプロトコルでは、新生 MTs を具体的に明らかにする手法について説明します。これは、次の薬ノコダゾールと薬物ウォッシュ後の回復期の微小管脱重合時間をかけて、MTs のde novoの成長特性をキャプチャで。この手法は、MTs のゼブラフィッシュ胚におけるにまだ適用されていない、微小管重合に関与する蛋白質の生体内機能を調査するための貴重なアッセイをします。

Introduction

微小管 (MTs) は、ポリマーの α- および β-チューブリン線形原繊維、いくつかを組み合わせて、中空の管1,2を形成にまとめることです。MTs は、終了プラス成長著しい中心体または他の微小管重合のセンター (脂質)3で固定終了マイナス成長が遅いとの偏波構造です。De novoMT 形成は (γ-テュルク) に複雑な γ-チューブリン環核 MT アセンブリ4のテンプレートを提供するによって開始されます。任意の指定されたセルに MTs の二集団区別できるそのターン以上異なるレートで。動的 MTs は、成長の段階と動的不安定5として知られているプロセスの収縮の間の切り替えによって、細胞環境を探る。動的 MTs とは異なり安定した MTs 非成長しているし、動的 MTs6より長い半減期があります。

細胞生物学の研究の十年は MT の構造と機能を研究するためのツールの高度な配列を提供、これらの細胞骨格要素に関する知識の大きいボディの結果します。例えば、MTs は確立と維持だけでなく安定動的 MTs7,対の差動細胞内分布にも、本質的な極性に起因する細胞極性の中心的な役割を再生8. 対照的に、まで以下について理解される MT アーキテクチャと脊椎動物の胚などのより複雑な三次元 (3 D) 環境で機能の一部高解像度で MT 骨格のイメージングへの挑戦のため。この制限にもかかわらず gfp 発現するトランスジェニックの最近の生成は行ラベル MTs または MT マーカーの蛍光タグの一過性の発現は、MTs を受けるダイナミックな変化と自分の携帯電話の私達の理解を増加しているとゼブラフィッシュ胚の発達の役割。どちらかは、ラベル付きの9またはチューブリンのポリマーは、直接 MT 関連タンパク質を使用してを分類しているが直接のチューブリンの形質転換線で視覚化される MT ネットワーク全体 Doublecortin ようなキナーゼ (Dclk) または Ensconsin (EMTB)10 11。他の線 (および構造体) 生成されている MT プラス終了の具体的分類によって MT 本質的な極性の評価を有効にするまたは終了11,12,13,マイナス中心体固定14です。 これらのツールの力を成長の有機体ライブ、MT のダイナミクスを学習する能力であります。このような研究は明らかに、たとえば、特定の細胞集団に MTs の空間と動的配布、形態形成 (細胞分裂面のインジケーター) を受けている組織で細胞分裂の方向のスピンドルは、MT ポリマーの極性細胞の伸長など、移行プロセスに関連と MT 成長率彗星速度9,13,15によって決まります。これらのツールの制限は、彼らが容易に安定性と動的 MT 集団間に行いません。 ことです。

豊富な細胞生物学文献からの描画、反応メソッド ゼブラフィッシュ胚における安定性と動的な MTs のイメージを説明ここでは、形質転換線の使用を補完するものであります。ゼブラフィッシュのような反応方法の普及はやや固定プロシージャ中に MT の整合性を維持する難しさによって妨げられています。プロトコル 1の反応の合計、ダイナミックな最適化手法の概要を説明し、発展途上のゼブラフィッシュ脳の断面積で安定した Mt。さらに、商業的に使用する直接的な方法利用可能なソフトウェアは、これらの MT 集団を定量化に記載されます。安定した MTs は、α-チューブリンのアセチル化、detyrosination、時間16,17をかけて安定した MTs の蓄積などのいくつかの翻訳後修飾に基づく動的 MTs と区別されます。ゼブラフィッシュの胚のアセチル化は、毛様体と軸索の MTs の安定した界面 MTs18、安定した MTs のサブセットにこのマーカーの有用性を制限することではなく、発生します。対照的に、detyrosination は、ゼブラフィッシュ胚18のすべての安定した MTs で発生するが表示されます。この翻訳後修飾は、α-チューブリン (tubulin detyrosinated)18のカルボキシ末端のグルタミン酸を公開し、抗グルタミン酸チューブリン19を使用して検出することができます。Detyrosination は、安定した MTs に優先的に発生しますが、実験的証拠は MT 安定16の原因ではなく結果、この翻訳後修飾であることを示します。、抗-Tyr-チューブリン, α-チューブリン19の tyrosinated フォームを特異的に認識する抗体を用いた動的な MTs の構成相互の MT の人口は区別されます。次のこれらのマーカーと共焦点レーザー顕微鏡の反応、MTs (長さ、番号、および相対的な豊かさ) の定量分析は成長の神経管の定義された領域で実行できます。合理化されたメソッドは、3次元画像処理ソフトウェアを使用して分析を実行するためここで提供されます。このメソッドは、形態形成や設立成熟細胞極性20の質問はアドレスに適用できます。確かに、安定した MTs の偏光配列の精緻化に伴う光受容形態21、開発途上神経管18と軸索形成の8細胞の上皮化を含む多くの発達的イベント。

プロトコル 2では、そのアセンブリ フェーズ (アンカレッジ/核生成と成長)22,23中 MTs を分析する細胞生物学試験の生体の適応について説明します。新生 MTs は中心体を核、その後母中心小体23の subdistal 肢に固定します。次の解重合初期の MT 再生を分析する方法を説明します。このプロトコルは、MTs、薬物のウォッシュ アウト プロシージャおよび治療後の回復期間を耳下腺ノコダゾール処理に関する詳細を提供します。MT の再成長が一定間隔で監視します。合計 MTs のためのマーカーとの反応によって s post ウォッシュ アウト (抗 β-チューブリン) 中心体のマーカーと一緒に (抗 γ-チューブリン) と核 (4′, 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI))、プロトコル 1で説明する一般的な手順によると。De novo MT の評価ではなく既存の MTs の拡張が可能、このプロトコルの MT 解重合ステップは欠かせません。この手法は結合タンパク質 3 チャンに示すように、緑色蛍光タンパク質 (EB3 GFP) に融合エンドなどプラスのヒント マーカーを使用して、(解重合の不在) の MT の成長率を測定するためその他のパブリッシュされた手順とは異なるため201211。この試金は胚・ デ ・ ノボMT アセンブリの欠陥を分析する場合に役立ちますまた、不完全なものに終って中心体には γ-チューブリンの募集が障害者である以前に報告したNEDD1変異など神経管形成と神経欠陥24

Protocol

倫理ステートメント: 手順は下記に従って大学メリーランド州ボルチモア郡動物診療ガイドラインの。 1 です安定解析と動的 MTs を使用して反応 (プロトコル 1) 固定する前に胚のマニュアル dechorionation 取得新鮮なシステムが余分な水を注ぐことによって胚を生み出したと。プラスチック シャーレに残りの胚を収集 (材料の表 を参照…

Representative Results

反応を使用して安定性と動的な MTs の解析プロトコル 1, Glu チューブリンと Tyr チューブリン マーカーとして使用する安定性と動的な MTs のそれぞれ初期 (神経キール) 中に MT のサブ集団の分布と神経管の開発の後期 (神経ロッド) が明らかに。動的な MTs 一世を風靡菱脳神経キール ステージ (4-5 体節) で (図 2A ~ D<…

Discussion

現在多くの方法がありますゼブラフィッシュ胚における MT 動態をイメージングしてタグ付き分子ライブ イメージングからの反応に至るまで固定組織11,12,13,14。単一のセルに MTs は、動的または安定した状態で存在できますが、上皮化は、MTs は徐々 に時間をかけて安定化プロセスです。安定性と?…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

共焦点顕微鏡はから、米国国立科学財団 (NSF)、補助金 #DBI 0722569 資金で購入しました。研究によって、米国国家機関の健康/国立医学研究所の一般的な (NIH/日の出) グラント #GM085290 および米国国防総省 (DOD) グラント #W81XWH-16-1-0466 r. m. ブリュー スターに授与を受けました。E. バイタルは UMBC に前の大学と学部科学教育プログラムを通じてハワード ヒューズ医学研究所からの助成金によって支えられた、#52008090 を付与します。S. p. ブラウンは奨学金教育 GAANN によって米国部のサポートされていた、メイヤーホフ大学院フェローシップ NIH/日の出の補助金によって資金を供給 #GM055036、および資金によって、米国の国防総省グラント #W81XWH-16-1-0466 研究させて。

Materials

Low Melting Point Agarose IBI scientific IB70050 Only used for embedding.

Prepare 4% LMP agarose
by heating a solution of  4 grams LMP agarose per 100 ml 1X TBS in a microwave
until polymerized. Keep warm on a 50 ˚C hot plate with the cap secured
Agarose Used to treat petridishes.   Prepare 1% agarose
by heating a solution of  1 gram agarose per 100 ml 1X embryo medium in a microwave
until polymerized. 
Nocodazole Sigma 487928-10MG Make stock by dissolving entire bottle of powder in distilled water and aliquoting into 500ul aliquots.  Store at -20 ˚C.
8% Formaldehyde Electron Microscopy Sciences 157-8-100 Aliquot and store at -20 ˚C.
Kpipes Sigma P7643
NaCl Sigma S7653
Tris-HCl Sigma T3253-500G
KCl Sigma P9333-500G
CaCl2·2H2O Sigma C5080
NP-40 American Bioanalyticals AB01424
EGTA Sigma E3889-25G
MgCl2 Sigma M2670-500G
Normal Goat Serum Millipore S26-100ml Aliquot and store at -20 ˚C.
Bovine serum albumin (BSA) Fisher BP1605
Triton-x American Bioanalyticals AB02025
Pronase E (non-specific Protease from Streptomyces griseus) Sigma P5147-1G make stock solution by diluting 10mg per ml of ddH2O. Aliquot in 1ml aliquots and store at -20 ˚C.
Anti-Fade mounting medium Invitrogen P10144
DAPI Invitrogen D1306 Prepare 50 ml DAPI solution by first combining 1 µl DAPI stock  with 1 ml sterile water and then adding the DAPI/water mix to 49 ml 1X TBS; store in foil at 4 ˚C for months.
Mouse anti-β-tubulin Developmental studies Hybridoma Bank E7 1/200
Rabbit anti-γ-tubulin Genetex GTX113286 1/500
Rabbit anti-α-tubulin Genetex GTX108784 1/1000*
Rabbit anti-detyrosinated-tubulin Millipore AB3201 1/200-1/1000*  Titrate antibody with first use of new lot.
Rabbit anti-tyrosinated-tubulin Millipore ABT171 1/500
Mouse anti-centrin Millipore 04-1624 1/1000
Goat 488 anti-rabbit Thermofisher A11008 1/500
Goat 594 anti-rabbit Thermofisher A11012 1/500
Goat 594 anti-mouse Thermofisher A11005 1/500
Goat 488 anti-mouse Thermofisher A11001 1/500
Vibratome Vibratome 1500
Forceps World Precision Instruments 555227F
100 mm petri dish Cell treat 229693
35 mm petri dish Cell treat 229638
50 ml falcon tube Fisher 14-432-22
Woven nylon mesh 70 um Amazon.com B0043D1SZG 
Micropipette Gilson F123602
Glass pipette Fisher NC-999363-9
Aquarium sealant Amazon.com, by MarineLand Silicone Sealer 1 oz (Tube) 
Ring stand Fisher 14-675BO
Microbore PTFE Tubing, 0.022"ID Cole-Parmer WU-06417-21
Modeling clay Amazon.com Sargent Art 22-4000 Any wax or oil based non-toxic modeling clay will suffice
Clamp Fisher 02-215-466
60ml syringe Fisher 14-820-11
Embryo medium (E3) 34.8 g NaCl
1.6 g KCl
5.8 g CaCl2·2H2O
9.78 g MgCl2·6H2O

To prepare a 60X stock, dissolve the ingredients in H2O, to a final volume of 2 L. Adjust the pH to 7.2 with NaOH. Autoclave. To prepare 1X medium, dilute 16.5 mL of the 60X stock to 1 L. 
Blocking Solution 50 ml TBS-NP-40
2.5 ml normal goat serum
1 g BSA
625 µl Triton-X
TBS-NP-40 (pH 7.6) 155 mM NaCl
10 mM Tris HCl
0.1% NP-40
2x MAB (pH6.4) 160 mM KPIPES
10 mM EGTA
2 mM MgCl2
Commercial 3-D Image processing Software PerkinElmer Volocity (V 6.2)
Dry block heater  VWR 12621-108 Used as a hot plate to melt agarose in Protocol 1.
Dissecting Microscope Leica MZ12
Confocal Microscope Leica SP5
Flat embedding mold emsdiasum.com BEEM 70904-01
Public domain image processing software NIH ImageJ (V 1.5)
* Success varies by lot number

Referências

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check_url/pt/55792?article_type=t

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Citar este artigo
McFarland, R. J., Brown, S. P., Vital, E., Werner, J. M., Brewster, R. M. Use of Immunolabeling to Analyze Stable, Dynamic, and Nascent Microtubules in the Zebrafish Embryo. J. Vis. Exp. (127), e55792, doi:10.3791/55792 (2017).

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