Summary

Luz Folha com base em microscopia de fluorescência de Vida ou fixados e corados<em> Tribolium castaneum</em> Os embriões

Published: April 28, 2017
doi:

Summary

Imagiologia da morfogénese de embriões de insectos com microscopia de fluorescência com base em folha de luz tornou-se o estado da arte. Este protocolo descreve e compara três técnicas de montagem apropriadas para os embriões Tribolium castaneum, introduz dois novos feitos sob linhagens transgênicas bem adequado para imagens ao vivo, discute controles essenciais de qualidade e indica limitações experimentais atuais.

Abstract

A farinha vermelho besouro Tribolium castaneum tornou-se um importante organismo modelo inseto em genética do desenvolvimento e biologia evolutiva do desenvolvimento. A observação dos embriões Tribolium com microscopia de fluorescência com base em folha de luz tem várias vantagens sobre widefield convencional e microscopia de fluorescência confocal. Devido às propriedades únicas de um microscópio com base em folha de luz, imagens em três dimensões de espécimes vivos podem ser gravados com altas relações de sinal-para-ruído e reduzida significativamente foto-branqueamento, bem como foto-toxicidade ao longo de várias direcções ao longo de períodos que duram várias dias. Com mais de quatro anos de desenvolvimento metodológico e um aumento contínuo de dados, o tempo parece adequado estabelecer procedimentos operacionais padrão para o uso da tecnologia folha de luz na comunidade Tribolium, bem como na comunidade de insetos em geral. Este protocolo descreve três técnicas de montagem adequados fou finalidades diferentes, apresenta dois novos transgênicos linhas Tribolium feitos sob medida adequada para imagens ao vivo de longo prazo, sugere cinco corantes fluorescentes para rotular estruturas intracelulares de embriões fixos e fornece informações sobre o pós-processamento de dados para a avaliação atempada dos dados gravados. Os resultados representativos concentrar em imagens ao vivo a longo prazo, de corte tico e a observação do mesmo embrião ao longo de várias direcções. Os respectivos conjuntos de dados são fornecidos como um recurso para download. Finalmente, o protocolo discute controlos de qualidade para os ensaios de imagens ao vivo, as actuais limitações e a aplicabilidade dos procedimentos descritos para outras espécies de insectos.

Este protocolo destina-se principalmente para os biólogos do desenvolvimento que buscam soluções de imagem que superam equipamentos de laboratório padrão. Ela promove a tentativa contínua para fechar o intervalo entre os laboratórios tecnicamente orientadas / comunidades, que se desenvolvem e refinar microscopiar metodologicamente, e os laboratórios de ciências da vida / comunidades, que exigem soluções 'plug-and-play' para os desafios técnicos. Além disso, ele suporta uma abordagem axiomático que move as questões biológicas para o centro das atenções.

Introduction

A farinha besouro Tribolium castaneum vermelho, que pertence à grande família de escaravelhos pretos (Tenebrionidae), tem uma longa história no âmbito das ciências agrícolas e de vida e é o segundo mais bem estudada organismo modelo inseto modelo após a mosca da fruta Drosophila melanogaster. Durante as últimas quatro décadas, tornou-se um poderoso e popular organismo inseto modelo em genética do desenvolvimento, em biologia evolutiva do desenvolvimento e, durante os últimos vinte anos, na morfogênese embrionária para uma variedade de razões:

Drosophila e Tribolium ambos pertencem ao Holometabola, mas divergiram aproximadamente 300 milhões de anos atrás, 1, 2, 3, 4. Embora o desenvolvimento embrionário de Drosophila é vulgarmente considerado como altamente derivados, Tribolium mostra um modo mais ancestral da mentomento que é encontrado numa proporção consideravelmente maior de espécies de insectos 5, 6, 7, 8, 9. Em primeiro lugar, Tribolium exibe desenvolvimento cabeça não-involuído, ou seja, as suas partes bucais e antenas já surgem durante a embriogénese 10, 11, 12, 13, 14, 15. Em segundo lugar, Tribolium segue os princípios do desenvolvimento de curto germe, ou seja, segmentos abdominais são adicionados sequencialmente a partir de uma zona de crescimento posterior durante o alongamento germband 16, 17, 18, 19. Em terceiro lugar, Tribolium desenvolve e degrada posterioresduas membranas extra-embrionárias ou seja, o âmnio, o qual abrange o embrião única ventralmente, e a serosa, o qual envolve completamente o embrião 20, 21, 22. Ambas as membranas desempenham um morfogenética cruciais 23, bem como papel de proteção contra microorganismos 24, 25 e dessecação 26. Em quarto lugar, as pernas embrionariamente em desenvolvimento são totalmente funcionais durante a fase de vida das larvas e servir como o primórdio para as pernas adulto durante a metamorfose de pupa 27, 28, 29, 30, 31.

Devido ao seu tamanho e modestos pequenas demandas, cultivo de Tribolium em laboratório é bastante simples. As culturas de tipo selvagem (WT) estirpes ou linhas transgénicas consistem tipicamente de cerca de 100-300 adultos e pode ser mantido dentro de garrafas de um litro de vidro (80 cm pegada 2) cheios de três a quatro centímetros de altura (cerca de 50 g) com meio de crescimento que é constituída por grãos de trigo completo farinha suplementado com levedura seca inactivo. Um fornecimento de água não é necessária. Isto permite que mesmo pequenos laboratórios para manter dezenas de culturas besouro dentro de pequenas ou médias incubadoras de insecto comercialmente disponíveis. Fases posteriores de desenvolvimento de Tribolium (larvas após aproximadamente o quarto instar, pupas e adultos) são facilmente separados a partir do meio de crescimento por peneiração. embriões sincronizados são obtidos por incubação de adultos para curtos períodos em forma de postura de ovos. Para o desenvolvimento rápido, culturas besouro são mantidos a 32 ° C (cerca de quatro semanas por geração), mantendo estoque é tipicamente realizada a 22-25 ° C (cerca de 10 semanas por geração).

Na última década, muitos tec padrãohniques foram gradualmente adaptada e optimizado para Tribolium, como resumido nos livros Emerging modelo Organismos 32. De grande importância são avançados métodos genéticos, tais como embrionário 33, larval 34, 35 ou parental 36, 37 de ARN baseada em interferência silenciamento de genes, transformação da linha germinativa com quer o piggyBac 38, 39 ou o sistema de transposase Minos 40 e CRISPR / genoma baseados em cas9 engenharia 41. Além disso, o genoma Tribolium foi sequenciado cerca de uma década atrás 42, e está agora na terceira ronda de genoma conjunto de libertação 43, o qual permite a identificação eficiente e de todo o genoma e a análise sistemática de genes 44 </saté> ou outros elementos genéticos 45, 46. Além disso, os genomas de outros quatro espécies de coleópteros está disponível para abordagens genéticas comparativos 47, 48, 49, 50. Em associação com o genoma sequenciado, duas análises genéticas em larga escala têm sido efectuada, isto é um ecrã de mutagénese de inserção 51 e um gene knockdown tela à base de interferência de ARN sistemática 52, 53.

Fluorescência de imagens ao vivo com widefield, confocal ou microscopia de luz com base em folha (LSFM) permite observar a morfologia embrionária de Tribolium como uma função do tempo (isto é, a morfogénese) num contexto de multi-dimensional (Tabela 1). Na microscopia de campo amplo e fluorescência confocal, o excitção e emissão de luz é guiado através da mesma lente objetiva. Em ambas as abordagens, toda a amostra é iluminada por cada plano bidimensional gravado. Assim, as amostras são sujeitas a níveis muito altos de energia. Em LSFM, apenas os fluoroforos no plano focal está animado devido a uma dissociação de iluminação e detecção por meio de duas lentes objectivas dispostas perpendicularmente (Figura 1). LSFM vem em duas implementações canónicos – o único plano iluminação microscópio (SPIM) e a luz do laser digitalizada à base de folha de microscópio de fluorescência digitais (DSLM, Figura 2) – e oferece várias vantagens importantes em relação às abordagens tradicionais: (i) capacidade de corte óptico intrínseca, (ii) resolução boa axial, (iii) fortemente reduzido nível de foto-branqueamento, (iv) muito baixo foto-toxicidade, (v) relação elevada sinal-para-ruído, (vi) relativamente elevada velocidade de aquisição, (vii) imagiologia ao longo de várias direcções e (viii) penetração mais profunda do tecido devido ao uso de baixo numérica abertura iluminação lentes objectivas 54, 55, 56.

LSFM já foi aplicada com êxito em Tribolium para documentar quase toda a morfogénese embrionária 57 e para analisar os princípios da ruptura da membrana extra-embrionária, no início do fecho dorsal 23. Para aumentar a atratividade de LSFM na comunidade Tribolium e para a ciência de insetos em geral, é de grande importância para estabelecer procedimentos operacionais padrão e melhorar os métodos, protocolos e o conjunto de recursos para um nível onde o microscópio torna-se uma facilidade de -Use ferramenta padrão em laboratórios de biologia do desenvolvimento, e as questões biológicas ficar no centro das atenções.

Este protocolo começa com as noções básicas de Tribolium </ em> cultivo, ou seja, manutenção, reprodução e colheita de embriões. Em seguida, duas estratégias experimentais encontram-se ilustrados: (i) imagens ao vivo de linhas transgénicas feitos por medida e (ii) imagiologia de embriões fixos que foram coradas com corantes fluorescentes (Tabela 2). Subsequentemente, três técnicas de montagem com fins ligeiramente diferentes são explicados em detalhe (Figura 3 e Tabela 3): (i) a coluna de agarose, (ii) o hemisfério de agarose e (iii) o titular da teia romance. O protocolo, em seguida, explica o procedimento de aquisição de dados com LSFM. modalidades de imagem e considerações importantes são delineadas. Finalmente, a recuperação embrião é explicado e sugestões para processamento de dados básicos são fornecidos. Nos resultados representativos, os dados de imagem ao vivo de dois novos feito por encomenda e as 58 linhas transgénicas glia-azul são mostrados e os respectivos conjuntos de dados de imagem são fornecidos como um recurso para download. Além disso, a imagemdados de embriões fixos que foram coradas com uma variedade de corantes de fluorescência são apresentados. A discussão centra-se em controle de qualidade, as actuais limitações da abordagem imagens ao vivo e a adaptação do protocolo para outras espécies.

O protocolo é escrito para microscópios de fluorescência baseado em folha de luz, que estão equipados com uma câmara de amostras e um mecanismo de fixação pode rodar para suportes normalizados de amostra 54, 59, 60, que são tipicamente elementos em forma de cilindros feitos de metal, de plástico ou de vidro com um diâmetro na gama de milímetros. O protocolo também é adequado para ambas as implementações canónicos, ou seja SPIM e DSLM, bem como para as configurações com duas ou mais de iluminação e de detecção de braços 61, 62, 63. Os resultados representativos mostram dados em dois canais espectrais, verde (ILluminação com um laser de 488 nm, detecção por meio de um filtro passa banda 525/50) e vermelho (iluminação com um laser de 561 nm, detecção por meio de um filtro passa banda 607/70), mas o protocolo pode ser expandido para três ou quatro canais espectrais.

Protocol

1. Criação de Culturas Tribolium NOTA: As condições padrão são definidas como uma temperatura de incubação de 25 ° C e 70% de humidade relativa dentro de 12 h / 12 h brilhantes ciclo escuro. Para mais informações sobre Tribolium criação, respectivas diretrizes estão disponíveis 64. Este protocolo requer dois meios diferentes à base de farinha, que podem ser preparados em quantidades kg e armazenados durante vários meses. A…

Representative Results

Este protocolo descreve um modelo experimental para imagiologia por fluoresccia de vida ou embriões Tribolium fixadas e coradas com LSFM. Devido aos baixos níveis de foto-branqueamento e foto-toxicidade, uma consequência directa da sua capacidade de seccionamento óptico, LSFM é particularmente bem adequado para imagens ao vivo a longo prazo. O novo AGOC {ATub'H2B-mEmerald} # 1 linha transgénica expressa uma …

Discussion

Controle de qualidade

Em ensaios de imagens ao vivo, o processo de preparação e de gravação deve ser não-invasivo, isto é, nem a mecânica e de manuseamento de produtos químicos (recolha, dechorionation, de montagem no suporte da amostra) nem a carga de energia integrada durante a observação deve afectar a viabilidade do espécime. Para estudos que caracterizam o desenvolvimento WT, recomenda-se usar dados apenas a partir de experimentos em que o embrião s…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Agradecemos Sven Plath para suporte técnico. A linhagem transgênica Glia-azul era um presente amável de Gregor Bucher (Göttingen, Alemanha). A pesquisa foi financiada pelo Cluster de Excelência Frankfurt am Main para Complexos Macromoleculares (CEF-MC, EXC 115, orador Volker Dötsch) concedido em parte para EHKS no Instituto Buchmann Molecular Ciências da Vida (BMLS, diretor Enrico Schleiff) no Goethe Universität Frankfurt am Main pelo Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG).

Materials

full grain wheat flour Demeter e.V. 1.13E+08 US: whole wheat flour, UK: whole meal flour
405 fine wheat flour Demeter e.V. 1.13E+08 US: pastry flour, UK: soft flour
inactive dry yeast Flystuff / Genesee Scientific 62-106
phosphate-buffered saline (PBS), pH 7.4 Thermo Fisher Scientific 10010-023
sodium hypochlorite, ~12% active Cl Sigma Aldrich 425044-250ML Caution: sodium hypochlorite is corrosive
low-melt agarose Carl Roth 6351.2
6-well plate Orange Scientific 4430500
24-well plate Orange Scientific 4430300
glass capillaries, internal Ø 0.46 mm Brand GmbH + Co KG 7087 09
SYTOX Green Thermo Fisher Scientific 57020 Staining solution preparation is explained in Table 2
YOYO-1 Iodide Thermo Fisher Scientific Y3601 Staining solution preparation is explained in Table 2
BOBO-3 Iodide Thermo Fisher Scientific B3586 Staining solution preparation is explained in Table 2
Alexa Fluor 488 Phalloidin Thermo Fisher Scientific A12379 Staining solution preparation is explained in Table 2
Alexa Fluor 546 Phalloidin Thermo Fisher Scientific A22283 Staining solution preparation is explained in Table 2
sieve, 800 µm mesh size VWR International 200.025.222-051
sieve, 710 µm mesh size VWR International 200.025.222-050 for growth medium preparation (step 1.1)
sieve, 300 µm mesh size VWR International 200.025.222-040
sieve, 250 µm mesh size VWR International 200.025.222-038 for egg laying medium preparation (step 1.2)
glass dish, Ø 100 mm × 20 mm Sigma Aldrich CLS70165102
cell strainer, 100 µm mesh size BD Biosciences 352360
paint brush, head Ø 2 mm VWR International 149-2121
syringe, 1.0 ml B. Braun Medical AG 9166017V
scintillation vials Sigma Aldrich M1152-1000EA
paraformaldehyde Sigma Aldrich 158127 Caution: paraformaldehyde is toxic and corrosive
n-heptane ≥ 99% Carl Roth 8654.1 Caution: n-heptane is flammable and toxic
Triton X-100 Sigma Aldrich X100-100ML Caution: Trition X-100 is corrosive

Referências

  1. Brown, S. J., Denell, R. E., Beeman, R. W. Beetling around the genome. Genet. Res. 82, 155-161 (2003).
  2. Misof, B., et al. Phylogenomics resolves the timing and pattern of insect evolution. Science. 346, 763-767 (2014).
  3. Tong, K. J., Duchêne, S., Ho, S. Y. W., Lo, N. INSECT PHYLOGENOMICS. Comment on “Phylogenomics resolves the timing and pattern of insect evolution. Science. 349, 487 (2015).
  4. Kjer, K. M., et al. INSECT PHYLOGENOMICS. Response to Comment on “Phylogenomics resolves the timing and pattern of insect evolution. Science. 349, 487 (2015).
  5. Klingler, M. Tribolium. Curr Biol. 14, 639-640 (2004).
  6. Savard, J., Marques-Souza, H., Aranda, M., Tautz, D. A segmentation gene in tribolium produces a polycistronic mRNA that codes for multiple conserved peptides. Cell. 126, 559-569 (2006).
  7. Yang, X., Zarinkamar, N., Bao, R., Friedrich, M. Probing the Drosophila retinal determination gene network in Tribolium (I): The early retinal genes dachshund, eyes absent and sine oculis. Dev. Biol. 333, 202-214 (2009).
  8. Peel, A. D. Forward genetics in Tribolium castaneum: opening new avenues of research in arthropod biology. J. Biol. 8, 106 (2009).
  9. Lynch, J. A., El-Sherif, E., Brown, S. J. Comparisons of the embryonic development of Drosophila, Nasonia, and Tribolium. Wiley Interdiscip. Rev. Dev. Biol. 1, 16-39 (2012).
  10. Schröder, R., Jay, D. G., Tautz, D. Elimination of EVE protein by CALI in the short germ band insect Tribolium suggests a conserved pair-rule function for even skipped. Mech. Dev. 80, 191-195 (1999).
  11. Posnien, N., Schinko, J. B., Kittelmann, S., Bucher, G. Genetics, development and composition of the insect head–a beetle’s view. Arthropod Struct. Dev. 39, 399-410 (2010).
  12. Posnien, N., Koniszewski, N. D. B., Hein, H. J., Bucher, G. Candidate gene screen in the red flour beetle Tribolium reveals six3 as ancient regulator of anterior median head and central complex development. PLoS Genet. 7, 1002416 (2011).
  13. Angelini, D. R., Smith, F. W., Aspiras, A. C., Kikuchi, M., Jockusch, E. L. Patterning of the adult mandibulate mouthparts in the red flour beetle, Tribolium castaneum. Genética. 190, 639-654 (2012).
  14. Coulcher, J. F., Telford, M. J. Cap’n’collar differentiates the mandible from the maxilla in the beetle Tribolium castaneum. Evodevo. 3, 25 (2012).
  15. Peel, A. D., et al. Tc-knirps plays different roles in the specification of antennal and mandibular parasegment boundaries and is regulated by a pair-rule gene in the beetle Tribolium castaneum. BMC Dev. Biol. 13, 25 (2013).
  16. Bucher, G., Klingler, M. Divergent segmentation mechanism in the short germ insect Tribolium revealed by giant expression and function. Development. 131, 1729-1740 (2004).
  17. Handel, K., Basal, A., Fan, X., Roth, S. Tribolium castaneum twist: gastrulation and mesoderm formation in a short-germ beetle. Dev. Genes Evol. 215, 13-31 (2005).
  18. Roth, S., Hartenstein, V. Development of Tribolium castaneum. Development Genes and Evolution. 218, 115-118 (2008).
  19. Schröder, R., Beermann, A., Wittkopp, N., Lutz, R. From development to biodiversity–Tribolium castaneum, an insect model organism for short germband development. Dev. Genes Evol. 218, 119-126 (2008).
  20. Sharma, R., Beermann, A., Schröder, R. The dynamic expression of extraembryonic marker genes in the beetle Tribolium castaneum reveals the complexity of serosa and amnion formation in a short germ insect. Gene Expr. Patterns. 13, 362-371 (2013).
  21. Benton, M. A., Pavlopoulos, A. Tribolium embryo morphogenesis: may the force be with you. Bioarchitecture. 4, 16-21 (2014).
  22. Horn, T., Hilbrant, M., Panfilio, K. A. Evolution of epithelial morphogenesis: phenotypic integration across multiple levels of biological organization. Front. Genet. 6, 303 (2015).
  23. Hilbrant, M., Horn, T., Koelzer, S., Panfilio, K. A. The beetle amnion and serosa functionally interact as apposed epithelia. Elife. 5, (2016).
  24. Jacobs, C. G. C. C., vander Zee, M. Immune competence in insect eggs depends on the extraembryonic serosa. Dev. Comp. Immunol. 41, 263-269 (2013).
  25. Jacobs, C. G. C., Spaink, H. P., vander Zee, M. The extraembryonic serosa is a frontier epithelium providing the insect egg with a full-range innate immune response. Elife. 3, (2014).
  26. Jacobs, C. G. C., Rezende, G. L., Lamers, G. E. M., vander Zee, M. The extraembryonic serosa protects the insect egg against desiccation. Proc. Biol. Sci. 280, 20131082 (2013).
  27. Lewis, D. L., DeCamillis, M., Bennett, R. L. Distinct roles of the homeotic genes Ubx and abd-A in beetle embryonic abdominal appendage development. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 97, 4504-4509 (2000).
  28. Beermann, A., et al. The Short antennae gene of Tribolium is required for limb development and encodes the orthologue of the Drosophila Distal-less protein. Development. , 287-297 (2001).
  29. Grossmann, D., Scholten, J., Prpic, N. -. M. Separable functions of wingless in distal and ventral patterning of the Tribolium leg. Dev. Genes Evol. 219, 469-479 (2009).
  30. Angelini, D. R., Smith, F. W., Jockusch, E. L. Extent With Modification: Leg Patterning in the Beetle Tribolium castaneum and the Evolution of Serial Homologs. G3. 2, 235-248 (2012).
  31. Grossmann, D., Prpic, N. -. M. Egfr signaling regulates distal as well as medial fate in the embryonic leg of Tribolium castaneum. Dev. Biol. 370, 264-272 (2012).
  32. . . Emerging Model Organisms: A Laboratory Manual, Volume 2. , (2010).
  33. Brown, S. J., Mahaffey, J. P., Lorenzen, M. D., Denell, R. E., Mahaffey, J. W. Using RNAi to investigate orthologous homeotic gene function during development of distantly related insects. Evol. Dev. 1, 11-15 (1999).
  34. Tomoyasu, Y., Denell, R. E. Larval RNAi in Tribolium (Coleoptera) for analyzing adult development. Dev. Genes Evol. 214, 575-578 (2004).
  35. Linz, D. M., Clark-Hachtel, C. M., Borràs-Castells, F., Tomoyasu, Y. Larval RNA interference in the red flour beetle, Tribolium castaneum. J. Vis. Exp. , e52059 (2014).
  36. Bucher, G., Scholten, J., Klingler, M. Parental RNAi in Tribolium (Coleoptera). Curr. Biol. 12, 85-86 (2002).
  37. Posnien, N., et al. RNAi in the red flour beetle (Tribolium). Cold Spring Harb. Protoc. 2009, (2009).
  38. Lorenzen, M. D., et al. piggyBac-mediated germline transformation in the beetle Tribolium castaneum. Insect Mol. Biol. 12, 433-440 (2003).
  39. Berghammer, A. J., Weber, M., Trauner, J., Klingler, M. Red flour beetle (Tribolium) germline transformation and insertional mutagenesis. Cold Spring Harb. Protoc. 2009, (2009).
  40. Pavlopoulos, A., Berghammer, A. J., Averof, M., Klingler, M. Efficient transformation of the beetle Tribolium castaneum using the Minos transposable element: quantitative and qualitative analysis of genomic integration events. Genética. 167, 737-746 (2004).
  41. Gilles, A. F., Schinko, J. B., Averof, M. Efficient CRISPR-mediated gene targeting and transgene replacement in the beetle Tribolium castaneum. Development. 142, 2832-2839 (2015).
  42. Richards, S., et al. The genome of the model beetle and pest Tribolium castaneum. Nature. 452, 949-955 (2008).
  43. Kim, H. S., et al. BeetleBase in 2010: revisions to provide comprehensive genomic information for Tribolium castaneum. Nucleic Acids Res. 38, 437-442 (2010).
  44. Stappert, D., Frey, N., von Levetzow, C., Roth, S. Genome-wide identification of Tribolium dorsoventral patterning genes. Development. 143, 2443-2454 (2016).
  45. Pavlek, M., Gelfand, Y., Plohl, M., Meštrović, N. Genome-wide analysis of tandem repeats in Tribolium castaneum genome reveals abundant and highly dynamic tandem repeat families with satellite DNA features in euchromatic chromosomal arms. DNA Res. 22, 387-401 (2015).
  46. Vlahović, I., Glunčić, M., Rosandić, M., Ugarković, &. #. 2. 7. 2. ;., Paar, V. Regular higher order repeat structures in beetle Tribolium castaneum genome. Genome Biol. Evol. , (2016).
  47. Keeling, C. I., et al. Draft genome of the mountain pine beetle, Dendroctonus ponderosae Hopkins, a major forest pest. Genome Biol. 14, 27 (2013).
  48. Vega, F. E., et al. Draft genome of the most devastating insect pest of coffee worldwide: the coffee berry borer, Hypothenemus hampei. Sci. Rep. 5, 12525 (2015).
  49. Cunningham, C. B., et al. The Genome and Methylome of a Beetle with Complex Social Behavior, Nicrophorus vespilloides (Coleoptera: Silphidae). Genome Biol. Evol. 7, 3383-3396 (2015).
  50. Meyer, J. M., et al. Draft Genome of the Scarab Beetle Oryctes borbonicus on La Réunion Island. Genome Biol. Evol. 8, 2093-2105 (2016).
  51. Trauner, J., et al. Large-scale insertional mutagenesis of a coleopteran stored grain pest, the red flour beetle Tribolium castaneum, identifies embryonic lethal mutations and enhancer traps. BMC Biol. 7, 73 (2009).
  52. Schmitt-Engel, C., et al. The iBeetle large-scale RNAi screen reveals gene functions for insect development and physiology. Nat. Commun. 6, 7822 (2015).
  53. Dönitz, J., et al. iBeetle-Base: a database for RNAi phenotypes in the red flour beetle Tribolium castaneum. Nucleic Acids Res. 43, 720-725 (2015).
  54. Keller, P. J., Stelzer, E. H. K. Digital scanned laser light sheet fluorescence microscopy. Cold Spring Harb. Protoc. 2010, (2010).
  55. Weber, M., Huisken, J. Light sheet microscopy for real-time developmental biology. Curr. Opin. Genet. Dev. 21, 566-572 (2011).
  56. Stelzer, E. H. K. Light-sheet fluorescence microscopy for quantitative biology. Nat. Methods. 12, 23-26 (2015).
  57. Strobl, F., Stelzer, E. H. K. Non-invasive long-term fluorescence live imaging of Tribolium castaneum embryos. Development. , 1-8 (2014).
  58. Koniszewski, N. D. B., et al. The insect central complex as model for heterochronic brain development-background, concepts, and tools. Dev. Genes Evol. , (2016).
  59. Gualda, E. J., et al. OpenSpinMicroscopy: an open-source integrated microscopy platform. Nat. Methods. 10, 599-600 (2013).
  60. Pitrone, P. G., et al. OpenSPIM: an open-access light-sheet microscopy platform. Nat. Methods. 10, 598-599 (2013).
  61. Tomer, R., Khairy, K., Amat, F., Keller, P. J. Quantitative high-speed imaging of entire developing embryos with simultaneous multiview light-sheet microscopy. Nat. Methods. 9, 755-763 (2012).
  62. Krzic, U., Gunther, S., Saunders, T. E., Streichan, S. J., Hufnagel, L. Multiview light-sheet microscope for rapid in toto imaging. Nat. Methods. 9, 730-733 (2012).
  63. Chhetri, R. K., et al. Whole-animal functional and developmental imaging with isotropic spatial resolution. Nat. Methods. 12, 1171-1178 (2015).
  64. Brown, S. J., et al. The red flour beetle, Tribolium castaneum (Coleoptera): a model for studies of development and pest biology. Cold Spring Harb. Protoc. 2009, (2009).
  65. Strobl, F., Schmitz, A., Stelzer, E. H. K. Live imaging of Tribolium castaneum embryonic development using light-sheet-based fluorescence microscopy. Nat. Protoc. 10, 1486-1507 (2015).
  66. Engelbrecht, C. J., Stelzer, E. H. Resolution enhancement in a light-sheet-based microscope (SPIM). Opt. Lett. 31, 1477-1479 (2006).
  67. Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. Nat. Methods. 9, 671-675 (2012).
  68. Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat. Methods. 9, 676-682 (2012).
  69. Pietzsch, T., Saalfeld, S., Preibisch, S., Tomancak, P. BigDataViewer: visualization and processing for large image data sets. Nat. Methods. 12, 481-483 (2015).
  70. Preibisch, S., Saalfeld, S., Schindelin, J., Tomancak, P. Software for bead-based registration of selective plane illumination microscopy data. Nat. Methods. 7, 418-419 (2010).
  71. Preibisch, S., et al. Efficient Bayesian-based multiview deconvolution. Nat. Methods. 11, 645-648 (2014).
  72. Amat, F., et al. Fast, accurate reconstruction of cell lineages from large-scale fluorescence microscopy data. Nat. Methods. 11, 951-958 (2014).
  73. Stegmaier, J., et al. Real-Time Three-Dimensional Cell Segmentation in Large-Scale Microscopy Data of Developing Embryos. Dev. Cell. 36, 225-240 (2016).
  74. Siebert, K. S., Lorenzen, M. D., Brown, S. J., Park, Y., Beeman, R. W. Tubulin superfamily genes in Tribolium castaneum and the use of a Tubulin promoter to drive transgene expression. Insect Biochem. Mol. Biol. 38, 749-755 (2008).
  75. Greger, K., Swoger, J., Stelzer, E. H. K. Basic building units and properties of a fluorescence single plane illumination microscope. Rev. Sci. Instrum. 78, 23705 (2007).
  76. El-Sherif, E., Averof, M., Brown, S. J. A segmentation clock operating in blastoderm and germband stages of Tribolium development. Development. , (2012).
  77. Panfilio, K. a., Oberhofer, G., Roth, S. High plasticity in epithelial morphogenesis during insect dorsal closure. Biol. Open. 2, 1108-1118 (2013).
  78. Koelzer, S., Kölsch, Y., Panfilio, K. A. Visualizing late insect embryogenesis: extraembryonic and mesodermal enhancer trap expression in the beetle Tribolium castaneum. PLoS One. 9, 103967 (2014).
  79. Nakamoto, A., et al. Changing cell behaviours during beetle embryogenesis correlates with slowing of segmentation. Nat. Commun. 6, 6635 (2015).
  80. Horn, T., Panfilio, K. A. Novel functions for Dorsocross in epithelial morphogenesis in the beetle Tribolium castaneum. Development. 143, 3002-3011 (2016).
  81. Benton, M. A., Akam, M., Pavlopoulos, A. Cell and tissue dynamics during Tribolium embryogenesis revealed by versatile fluorescence labeling approaches. Development. 140, 3210-3220 (2013).
  82. van der Zee, M., et al. Innexin7a forms junctions that stabilize the basal membrane during cellularization of the blastoderm in Tribolium castaneum. Development. 142, 2173-2183 (2015).
  83. Macaya, C. C., Saavedra, P. E., Cepeda, R. E., Nuñez, V. A., Sarrazin, A. F. A Tribolium castaneum whole-embryo culture protocol for studying the molecular mechanisms and morphogenetic movements involved in insect development. Dev. Genes Evol. 226, 53-61 (2016).
  84. Sarrazin, A. F., Peel, A. D., Averof, M. A Segmentation Clock with Two-Segment Periodicity in Insects. Science. 336, 338-341 (2012).
  85. Nollmann, F. I., et al. A photorhabdus natural product inhibits insect juvenile hormone epoxide hydrolase. Chembiochem. 16, 766-771 (2015).
  86. Strobl, F., Stelzer, E. H. Long-term fluorescence live imaging of Tribolium castaneum embryos: principles, resources, scientific challenges and the comparative approach. Curr. Opin. Insect Sci. 18, 17-26 (2016).
  87. Keller, P. J., Schmidt, A. D., Wittbrodt, J., Stelzer, E. H. K. Digital scanned laser light-sheet fluorescence microscopy (DSLM) of zebrafish and Drosophila embryonic development. Cold Spring Harb. Protoc. 2011, 1235-1243 (2011).
  88. Reynaud, E. G., Peychl, J., Huisken, J., Tomancak, P. Guide to light-sheet microscopy for adventurous biologists. Nat. Methods. 12, 30-34 (2015).
  89. Cerny, A. C., Bucher, G., Schröder, R., Klingler, M. Breakdown of abdominal patterning in the Tribolium Krüppel mutant jaws. Development. 132, (2005).
  90. Keller, P. J., Schmidt, A. D., Wittbrodt, J., Stelzer, E. H. K. Reconstruction of zebrafish early embryonic development by scanned light sheet microscopy. Science. 322, 1065-1069 (2008).
  91. Sulston, I. A., Anderson, K. V. Embryonic patterning mutants of Tribolium castaneum. Development. 122, (1996).
  92. Berghammer, A., Bucher, G., Maderspacher, F., Klingler, M. A system to efficiently maintain embryonic lethal mutations in the flour beetle Tribolium castaneum. Dev. Genes Evol. 209, 382-389 (1999).
  93. Brown, S., et al. Implications of the Tribolium Deformed mutant phenotype for the evolution of Hox gene function. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 97, 4510 (2000).
  94. Wu, Y., et al. Inverted selective plane illumination microscopy (iSPIM) enables coupled cell identity lineaging and neurodevelopmental imaging in Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Acad. Sci. 108, 17708-17713 (2011).
  95. Kumar, A., et al. Dual-view plane illumination microscopy for rapid and spatially isotropic imaging. Nat. Protoc. 9, 2555 (2014).
  96. McGorty, R., et al. Open-top selective plane illumination microscope for conventionally mounted specimens. Opt. Express. 23, 16142-16153 (2015).
  97. Amat, F., et al. Efficient processing and analysis of large-scale light-sheet microscopy data. Nat. Protoc. 10, 1679-1696 (2015).
  98. Shcherbakova, D. M., Verkhusha, V. V. Near-infrared fluorescent proteins for multicolor in vivo imaging. Nat. Methods. 10, 751-754 (2013).
  99. Supatto, W., McMahon, A., Fraser, S. E., Stathopoulos, A. Quantitative imaging of collective cell migration during Drosophila gastrulation: multiphoton microscopy and computational analysis. Nat. Protoc. 4, 1397-1412 (2009).
  100. Royer, L. A., et al. Adaptive light-sheet microscopy for long-term, high-resolution imaging in living organisms. Nat. Biotechnol. , (2016).
  101. Keller, P. J., et al. Fast, high-contrast imaging of animal development with scanned light sheet-based structured-illumination microscopy. Nat. Methods. 7, 637-642 (2010).
  102. Caroti, F., Urbansky, S., Wosch, M., Lemke, S. Germ line transformation and in vivo labeling of nuclei in Diptera: report on Megaselia abdita (Phoridae) and Chironomus riparius (Chironomidae). Dev. Genes Evol. 225, 179-186 (2015).
  103. Handler, A. M. Use of the piggyBac transposon for germ-line transformation of insects. Insect Biochem. Mol. Biol. 32, 1211-1220 (2002).
  104. Schulte, C., Theilenberg, E., Müller-Borg, M., Gempe, T., Beye, M. Highly efficient integration and expression of piggyBac-derived cassettes in the honeybee (Apis mellifera). Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 111, 9003-9008 (2014).
  105. Tamura, T., et al. Germline transformation of the silkworm Bombyx mori L. using a piggyBac transposon-derived vector. Nat. Biotechnol. 18, 81-84 (2000).
  106. Marcus, J. M., Ramos, D. M., Monteiro, A. Germline transformation of the butterfly Bicyclus anynana. Proc. R. Soc. B Biol. Sci. 271, 263-265 (2004).
  107. Catteruccia, F., et al. Stable germline transformation of the malaria mosquito Anopheles stephensi. Nature. 405, 959-962 (2000).
  108. Grossman, G. L., et al. Germline transformation of the malaria vector, Anopheles gambiae, with the piggyBac transposable element. Insect Mol. Biol. 10, 597-604 (2001).
  109. Labbé, G. M. C., Nimmo, D. D., Alphey, L. piggybac- and PhiC31-mediated genetic transformation of the Asian tiger mosquito Aedes albopictus (Skuse). PLoS Negl. Trop. Dis. 4, 788 (2010).
  110. Patel, N. H. It’s a bug’s life. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 97, 4442-4444 (2000).

Play Video

Citar este artigo
Strobl, F., Klees, S., Stelzer, E. H. K. Light Sheet-based Fluorescence Microscopy of Living or Fixed and Stained Tribolium castaneum Embryos. J. Vis. Exp. (122), e55629, doi:10.3791/55629 (2017).

View Video