Modeling human brain development has been hindered due to the unprecedented complexity of neural epithelial tissue. Here, a method for the robust generation of brain organoids to delineate early events of human brain development and to model microcephaly in vitro is described.
The restricted availability of suitable in vitro models that can reliably represent complex human brain development is a significant bottleneck that limits the translation of basic brain research into clinical application. While induced pluripotent stem cells (iPSCs) have replaced the ethically questionable human embryonic stem cells, iPSC-based neuronal differentiation studies remain descriptive at the cellular level but fail to adequately provide the details that could be derived from a complex, 3D human brain tissue.
This gap is now filled through the application of iPSC-derived, 3D brain organoids, “Brains in a dish,” that model many features of complex human brain development. Here, a method for generating iPSC-derived, 3D brain organoids is described. The organoids can help with modeling autosomal recessive primary microcephaly (MCPH), a rare human neurodevelopmental disorder. A widely accepted explanation for the brain malformation in MCPH is a depletion of the neural stem cell pool during the early stages of human brain development, a developmental defect that is difficult to recreate or prove in vitro.
To study MCPH, we generated iPSCs from patient-derived fibroblasts carrying a mutation in the centrosomal protein CPAP. By analyzing the ventricular zone of microcephaly 3D brain organoids, we showed the premature differentiation of neural progenitors. These 3D brain organoids are a powerful in vitro system that will be instrumental in modeling congenital brain disorders induced by neurotoxic chemicals, neurotrophic viral infections, or inherited genetic mutations.
Mänskliga nervsjukdomar, såsom mikrocefali, bara kan vara dåligt studerats i djurmodeller på grund av det faktum att mänskliga hjärnor har en utökad kortikala ytan, en unik funktion som skiljer sig från icke-mänskliga djur.
Denna aspekt gör mänsklig hjärnans utveckling en komplex process som inte i tillräcklig utsträckning kan studeras i en 2D, in vitro cellodlingssystem. Emerging 3D kulturtekniker tillåter generering av vävnadsliknande organoids från inducerade pluripotenta stamceller (iPSCs). In vitro differentiering av pluripotenta stamceller i en 3D-suspensionskultur medger bildning av olika celltyper i tid och region-specifikt sätt, vilket ger upphov till en organiserad, skiktad vävnad 1, 2, 3. Tack vare laboratorier som banade väg 3D odlingstekniker och avmystifierad komplexiteten av organbildning, med utgångspunkt från stamceller,vi utvecklat en robust metod för att generera hjärn organoids att avgränsa tidiga händelser av mänsklig hjärnans utveckling och att modellera mikrocefali in vitro 1, 2, 3. Det är anmärkningsvärt att vi anpassat den ursprungliga metod som utvecklats av Lancaster et al. att generera cerebrala organoids 1. Denna metod modifierades enligt våra experimentella krav.
Syftet med en studie från Gabriel et al. var att analysera de cellulära och molekylära mekanismer för neural stamcell underhåll under hjärnans utveckling. För att göra detta genomfördes en mekanistisk studie utförd genom att analysera neurala progenitorceller (NPC) i 3D hjärn organoids härledda från en mikrocefali patienten 4. Denna patient genom en mutation i CPAP, en konserverad centrosomal protein som krävs för centrosom biogenes 5. En allmänt accepterad hypotes är att mikrocefali är resultatet av en utarmning av NPC pool, och detta kan bero antingen på celldöd eller till för tidig differentiering 1, 6, 7, 8, 9.
Genom att analysera de ventrikulära zoner (VZs) av mikrocefali hjärn organoids, visades det att ett betydande antal NPC genomgå asymmetrisk celldelning, till skillnad från hjärn organoids härledda från en frisk givare 4. Omfattande mikroskopiska och biokemiska analyser av microcephalic hjärn organoids avslöjade en oväntad roll för CPAP i rätt tid cilier demontering 4. Specifikt, är muterad CPAP associerad med retarderad cilium demontering och fördröjd cellcykel återinträde, vilket leder till för tidig differentiering av NPC 4. Dessa resultat tyder på en roll för cilier i mikrocefali och thEIR engagemang under neurogenes och hjärnstorlek kontroll 10.
Den första delen av detta protokoll är en beskrivning av en trestegsmetod för att generera homogena hjärn organoids. Som tidigare nämnts, var den ursprungliga Lancaster protokollet anpassas och modifieras för att passa vårt syfte en. Först, mänskliga iPSCs odlas i ett definierat matare fritt tillstånd på Engelbreth-Holm-Swarm (EHS) matris. Detta steg undviker variationer av matarberoende pluripotenta stamcellkulturer. I detta protokoll för att induktion av neural differentiering bilda neural epitel börjar direkt från iPSCs. Genom att hoppa över embryoid kropp (EB) bildningssteget, de neurala differentieringsfortskrider i en mer kontrollerad och riktad sätt. Detta tillvägagångssätt begränsar spontan och oriktade bildandet av andra könscellsskikt, såsom mesoderm och endoderm. Genom att tillämpa detta protokoll, kan neurosfärer som innehåller neurala rosetter skördas på dag 5 för EHS matris inbäddning och stationär suspensionsodling. Den organoid medium som används för det tredje steget i våra protokoll kompletteras med dorsomorphin och SB431542. Dorsomorphin är en liten-molekyl hämmare av benmorfogent protein (BMP), och SB431542 hämmar TGFp / aktivin / nodal signalväg. Kombinationen av dessa faktorer skulle kunna främja neural differentiering mer effektivt än retinsyra ensam 11, 12, 13, 14.
Helt och hållet, dessa modifieringar möjliggöra reproducerbar alstring av hjärn organoids, med minimala variationer mellan organoids. Viktigare, var detta förfarande appliceras på robust generera microcephalic hjärn organoids från patientens iPSCs, som bär mutationer i gener som påverkar centrosomer och cellcykel dynamik.
Den andra delen av detta protokoll ger instruktioner för att förbereda brain organoids för analys och tolkning av cellulära defekter i mikrocefali. Detta inkluderar fixering, cryosectioning, immunofluorescerande färgning, och konfokal mikroskopanalys. Detta protokoll kommer att ge läsaren en detaljerad beskrivning av de förväntade resultaten och vägledning för tolkning.
MCPH är en komplex human neuroutvecklingsstörning som inte kan rekapituleras i djurmodeller in vivo eller i en enkel human cellkultur närmar in vitro. Den kliniska manifestationen av MCPH börjar dyka upp under den första trimestern, när tidig neurogenes börjar. Således 3D hjärn organoids representerar ett pålitligt experimentellt system för att modellera MCPH utveckling. Dessutom 3D mänsklig hjärn organoids är ett idealiskt tillvägagångssätt eftersom i) de tillåter för anpassning av …
The authors have nothing to disclose.
Detta arbete stöddes av Fritz Thyssen Foundation (Az.10.14.2.152). Vi är tacksamma till vävnaden inbäddning anläggningen och mikroskopet kärnanläggningen i CMMC. Vi är tacksamma för de diskussioner och teknisk support som tillhandahålls av medlemmarna i laboratoriet för centrosom och Cytoskeleton Biology. Vi tackar Li Ming Gooi för korrekturläsning manuskriptet.
Anti-mouse 488 | Invitrogen | A-11001 | Goat anti-Mouse IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 |
Anti-rabbit 647 | Invitrogen | A-21245 | Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 647 |
Arl13b | proteintech | 17711-1-AP | ARL13B rabbit polyclonal antibody |
CELLSPIN system | IBS Integra Bioscience | 183001 | |
DAPI | Sigma-Aldrich, US | 32670 | 4′,6-Diamidino-2-phenylindole dihydrochloride; multiple suppliers |
DMEM/F-12 | Gibco, US | 31331093 | Dulbecco's Modified Eagle Medium: Nutrient Mixture F-12 |
Dorsomorphin | Sigma-Aldrich, US | P5499 | Compound C; multiple suppliers |
Embedding medium | AppliChem | A9011, 0100 | Mowiol; embedding medium; multiple suppliers |
Engelbreth-Holm-Swarm (EHS) matrix | Corning | 354277 | Matrigel hESC-qualified matrix; important: hESC qualified |
Fish gelatin | Sigma-Aldrich, US | G7765-250ML | Gelatin from cold water fish skin; multiple suppliers; autoclave after adding to PBS to dissolve and sterilize, store at 4°C |
Glycine | AppliChem | A1067,1000 | Glycine for molecular biology; multiple suppliers |
Inoculation loop with needle, disposable (1 µl) | Sigma Aldrich, US | BR452201-1000EA | multiple suppliers |
Insulin | Sigma-Aldrich, US | I3536-100MG | multiple suppliers |
L-glutamine | Gibco, US | 25030081 | L-glutamine (200 mM) |
Medium A | Stem cell technologies | #05850 | mTeSR1 (hiPSC medium) |
Medium B | Stem cell technologies | #05835 | Neural induction medium (NIM); neural differentiation medium |
Medium C | Gibco, US | 21103049 | Neural Basal Medium |
MEM | Gibco, US | 11140035 | MEM non-essential amino acids solution (100x) |
MycoAlert Mycoplasma Detection Kit | Lonza, Switzerland | #LT07-218 | Mycoplasma detection kit; multiple suppliers |
Nestin | Novus biologicals | NBP1-92717 | Nestin mouse monoclonal antibody (4D11) |
Paraformaldehyde (PFA) | AppliChem | A3813, 0500 | 4% in PBS, store solution at -20°C; caution: wear skin and eye protection and work under hood |
PBS tablets | Gibco, US | 18912014 | See manufacturer´s instructions; multiple suppliers |
Penicillin-Streptomycin (10.000 U/ml) | Gibco, US | 15140122 | Multiple suppliers |
Poly-L-lysine solution (PLL) | Sigma-Aldrich, US | P8920-100ML | Multiple suppliers |
pVim | MBL | D076-3S | Phospho-Vimentin (Ser55) mAb |
Reagent A | Stem cell technologies | # 05872 | Note to Protocol 1.1.1.2; ReLSR (Enzyme-free human ES and iPS cell selection and passaging reagent); please follow manufactorer´s protocol; alternative products from muliple suppliers available |
Reagent B | Sigma-Aldrich, US | A6964-100ML | Accutase solution is an enzymatic solution for single cell dissociation; multiple suppliers; protocol 1.1.2 "enzymatic cell dissociation solution” |
Research Cryostat Leica CM3050 S | Leica biosystems | CM3050 S | Multiple suppliers |
SB431542 | Selleckchem.com | S1067 | Multiple suppliers |
Spinner flask 250 ml | IBS Integra Bioscience | 182026 | |
Sucrose | AppliChem | A4734, 1000 | Multiple suppliers |
Superfrost ultra plus microscope slides | Thermo scientific, US | J3800AMNZ | Slides should be labeled with a "+" and positively charged |
Supplement 1 | Gibco, US | 17502048 | N-2 supplement (100x) |
Supplement 2 w/o Vitamin A | Gibco, US | 12587010 | B-27 supplement (50x), minus vitamin A; multiple suppliers |
Tissue-Tek Cryomold | Sakura, NL | 4565 | Multiple suppliers |
Tissue-Tek O.C.T. compound | Sakura, NL | 4583 | Multiple suppliers |
Triton X-100 | AppliChem | A1388,0500 | Multiple suppliers multiple suppliers |
TUJ1 | Sigma-Aldrich, US | T2200 | β-Tubulin III (rabbit polyclonal) |
TUNEL assay | Promega, US | G3250 | DeadEnd Fluorometric TUNEL system; multiple suppliers |
Tween 20 for molecular biology | AppliChem | A4974,0500 | Multiple suppliers |
waterproof sheet | BEMIS company, inc. | PM996 | Parafilm “M”; multiple suppliers |
Y-27632 | Selleckchem.com | S1049 | ROCK-inhibitor (Y-27632 2HCL); multiple suppliers |
β-mercaptoethanol | Gibco, US | 31350010 | 2-mercaptoethanol (50 mM); multiple suppliers |