Qui, presentiamo un protocollo per una tecnica di etichettatura mosaico che permette la visualizzazione dei neuroni derivati da una cellula progenitrice comune in due colori distinti. Questo facilita l'analisi lignaggio neurale con la capacità di singoli neuroni nascita aggiornamento e la funzione del gene studiando negli stessi neuroni di diversi individui.
M osaic un nalisi con una r epressible c ell m Arker (MARCM) è un sistema di etichettatura mosaico positivo che è stato ampiamente applicato in Drosophila studi neurobiologici per descrivere morfologie intricate e di manipolare la funzione dei geni in sottoinsiemi di neuroni all'interno altrimenti non marcato e imperturbabile organismi. mosaici genetici generati nel sistema MARCM sono mediati attraverso la ricombinazione sito-specifica tra cromosomi omologhi all'interno di divisione delle cellule precursori per la produzione di entrambi marcati (cloni marcm) e cellule figlie non marcate durante la mitosi. Una estensione del metodo MARCM, chiamato twin-spot MARCM (tsMARCM), etichette sia delle cellule gemelle derivate da un progenitore comune con due colori distinti. Questa tecnica è stata sviluppata per consentire il reperimento di informazioni utili da entrambe le emi-linee. Con completo Analizzando diverse coppie di cloni tsMARCM, il sistema consente di tsMARCM ad alta risoluzione neurale lignaggio Mapping di rivelare l'esatto nascita ordine dei neuroni marcati prodotte dalle cellule progenitrici comuni. Inoltre, il sistema tsMARCM estende anche studi di funzione genica consentendo l'analisi fenotipica dei neuroni identici di diversi animali. Qui, descriviamo come applicare il sistema tsMARCM per facilitare gli studi di sviluppo neurale in Drosophila.
Il cervello, costituito da un vasto numero e diversi tipi di neuroni, dota gli animali con la capacità di percepire, di processo e rispondere alle sfide provenienti dal mondo esterno. I neuroni dell'adulto Drosophila cervello centrale sono derivati da un numero limitato di cellule staminali neurali, chiamati neuroblasti (NBS), durante lo sviluppo 1, 2. La maggior parte di NBS partecipare a neurogenesi cerebrale in Drosophila sottoposti divisione asimmetrica per generare NBs auto-rinnovamento e cellule madri gangliari (GMC), e le GMCs poi passare attraverso un altro giro di divisione per la produzione di due cellule figlie che si differenziano in neuroni 3 (Figura 1A ). A causa della complessità della morfologia neuronale e le sfide connesse con l'identificazione neuroni specifici, una tecnologia positiva etichettatura mosaico, analisi mosaico con un marker delle cellule reprimibile (MARCM), è stato inventato per consentire la visualizatione di un singolo neurone o un piccolo sottoinsieme di neuroni dalla popolazione di neuroni circostanti, senza etichetta 4.
MARCM utilizza il sistema / target riconoscimento FLP (FRT) mediare ricombinazione sito-specifica tra cromosomi omologhi all'interno di una cella di divisione precursore portando un allele eterozigote di un gene repressore, la cui espressione normalmente inibisce l'espressione di un gene reporter 4 flippase (FLP). Dopo la divisione mitotica, i cromosomi ricombinanti sono segregati in cellule gemelle, tale che una cella contiene alleli omozigoti del gene repressore e l'altra cella ha repressore gene-espressione del reporter in quella cella (ei suoi discendenti) non è più bloccato 4. Tre modelli clonali si trovano di solito in un esperimento MARCM quando FLP è stocasticamente indotta in NBs o GMCs: unicellulari e due celle-GMC cloni, che raffigurano la morfologia dei neuroni a resolutio cella singolan, e multi-cellulare-NB cloni, che rivelano interi modelli morfologici di neuroni derivati da una NB comune (Figura 1B). La tecnica MARCM è stato ampiamente applicato in Drosophila studi neurobiologici, compresa l'identificazione di tipo neuronale per ricostruire le reti di cablaggio in tutto il cervello, neurali lignaggio analisi per rivelare la storia dello sviluppo dei neuroni, la caratterizzazione fenotipica delle funzioni dei geni coinvolti nella determinazione del fato cellulare, e la morfogenesi neuronale e differenziazione studia 5, 6, 7, 8, 9, 10. Poiché MARCM convenzionale etichetta solo una delle due cellule figlie (e linee) dopo l'evento di ricombinazione mitotica indotta, informazioni potenzialmente utili dal lato marcato viene persa. Questa limitazione osta all'applicazione della base MSistema ARCM a ad alta risoluzione le analisi di molti lignaggi neuronali che si attivano destino delle cellule in tempo veloce o per la precisione di analisi delle funzioni dei geni nei neuroni identici di diversi animali 11, 12.
Twin-loco MARCM (tsMARCM) è un sistema avanzato che etichette neuroni derivati da un progenitore comune con due colori distinti, che permette il recupero delle informazioni utili da entrambi i lati delle celle gemelle, superando la limitazione del sistema MARCM originale 11 ( Figura 2A – 2C). Nel sistema tsMARCM, due interferenza RNA (RNAi) a base di soppressori sono situati trans siti di cromosomi omologhi all'interno di una cellula precursore, e l'espressione di tali soppressori inibiscono in maniera indipendente l'espressione dei rispettivi reporter (Figura 2B). A seguito di site-specific ricombinazione mitotica mediata attraverso il sistema FLP / FRT, la TWsoppressori o basati RNAi diventare segregati in cellule gemelle per consentire l'espressione del reporter distinti (Figura 2B). Due modelli clonali, cella singola associata con cloni unicellulari e due celle-GMC associati con cloni multi-cellulari-NB, sono in genere visti in un esperimento tsMARCM (Figura 2C). Informazioni derivato da un lato delle celle singoli possono essere utilizzati come riferimento per l'altro lato, consentendo ad alta risoluzione analizza neurale lineage, come nascita-incontra i neuroni marcati, e fenotipica analisi dei neuroni identici in diversi animali per l'indagine precisa della funzione del gene neurale 11, 12. Qui, vi presentiamo un protocollo passo-passo che descrive come condurre un esperimento tsMARCM, che può essere utilizzato da altri laboratori per ampliare gli studi di sviluppo neurale (nonché lo sviluppo di altri tessuti, se del caso) in Drosophila.
I passaggi critici all'interno del protocollo
I passi 1.1.1, 1.2.1, 2.3, 2.5 e 3.2 sono fondamentali per ottenere buoni risultati tsMARCM. Driver -GAL4 tessuto-specifica che non esprimono GAL4 in progenitori neurali sono preferiti per passi 1.1.1 e 1.2.1. Evitare di sovraffollamento gli animali cresciuti in fiale fly-alimentari nella fase 2.3. Poiché la latenza di induzione, il livello di espressione di FLP upon heat-shock, e il tempo medio di divisione dei progenitori neurali <em…
The authors have nothing to disclose.
Questo lavoro è stato sostenuto dal Ministero della Scienza e della Tecnologia (MOST 104-2311-B-001-034) e l'Istituto di Biologia Cellulare e organismica, Academia Sinica, Taiwan.
Carbon dioxide (CO2) | Local vendor | n.a. | Anesthetize flies |
CO2 pad | Local vendor | n.a. | Sort, cross and transfer flies |
10x PBS pH 7.4 | Uniregion Bio-Tech (or other vendors) | PBS001 | Dissect, rinse, wash and immunostain fly brains |
Formaldehyde | Sigma-Aldrich | 252549 | Fix fly brains |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | Rinse, wash and immunostain fly brains |
Normal goat | Jackson ImmunoResearch | 005-000-121 | Immunostain fly brains |
serum | |||
Rat anti-mouse CD8 antibody | Invitrogen | MCD0800 | Immunostain fly brains |
Rabbit anti-DsRed antibody | Clonetech | 632496 | Immunostain fly brains |
Mouse anti-Brp antibody | Developmental Studies Hybridoma Bank | nc82 | Immunostain fly brains |
Goat anti-rat IgG antibody conjugated with Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11006 | Immunostain fly brains |
Goat anti-rabbit IgG antibody conjugated with Alexa Fluor 546 | Invitrogen | A11035 | Immunostain fly brains |
Goat anti-mouse IgG antibody conjugated with Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21236 | Immunostain fly brains |
SlowFade gold antifade reagent | Molecular Probes | S36936 | Mount fly brains and protect quenching of fluorescence |
PYREX 9 depression glass spot plate | Corning | 7220-85 | Dissect, rinse, wash and immunostain fly brains |
Sylgard 184 silicone elastomer kit | World Precision Instruments | SYLG184 | Make black Sylgard dishes to protect forceps during brain dissection |
Activated charcoal | Sigma-Aldrich | 242276-250G | Make black Sylgard dishes |
Dumont #5 forceps | Fine Science Tools | 11252-30 | Dissect and mount fly brains |
Micro slide | Corning | 2948-75×25 | Mount fly brains |
Micro cover glass No.1.5 | VWR International | 48366-205 | Mount fly brains |
Nail polish | Local vendor | not available | Seal micro cover glass on micro slides |
Incubator | Kansin Instruments | LTI603 | culture flies at 25°C |
(or other vendors) | |||
Water bath | Kansin Instruments | WB212-B2 | Induce heat-shock in flies at 37°C |
(or other vendors) | |||
Orbital shaker | Kansin Instruments | OS701 | Wash and immunostain fly brains |
(or other vendors) | |||
Dissection microscope | Leica | EZ4 | Sort, cross and transfer flies; Dissect, rinse, wash and immunostain fly brains |
Confocal microscope | Zeiss (or other vendors) | LSM 700 (or other models) | Image tsMARCM clones |
image-processing software 1 (e.g., Zeiss LSM image browser) |
Zeiss | not available | Project stacks of confocal images |
image-processing software 2 (e.g., Image-J) |
not available | not available | Count cell number of tsMARCM clones |