Het protocol voorziet in een methodologie om aëroob korrelslib oplosbaar te maken met het oog op alginaat-achtige extracellulaire polymeren (ALE) uit te pakken.
To evaluate and develop methodologies for the extraction of gel-forming extracellular polymeric substances (EPS), EPS from aerobic granular sludge (AGS) was extracted using six different methods (centrifugation, sonication, ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA), formamide with sodium hydroxide (NaOH), formaldehyde with NaOH and sodium carbonate (Na2CO3) with heat and constant mixing). AGS was collected from a pilot wastewater treatment reactor. The ionic gel-forming property of the extracted EPS of the six different extraction methods was tested with calcium ions (Ca2+). From the six extraction methods used, only the Na2CO3 extraction could solubilize the hydrogel matrix of AGS. The alginate-like extracellular polymers (ALE) recovered with this method formed ionic gel beads with Ca2+. The Ca2+-ALE beads were stable in EDTA, formamide with NaOH and formaldehyde with NaOH, indicating that ALE are one part of the structural polymers in EPS. It is recommended to use an extraction method that combines physical and chemical treatment to solubilize AGS and extract structural EPS.
In de afgelopen jaren heeft het aërobe korrelslib (AGS) proces een populaire biologische afvalwaterzuivering proces, met succes toegepast bij verschillende full-scale waterzuiveringsinstallaties 1 geworden. In tegenstelling tot de conventionele actiefslibproces, in de AGS werkwijze de microorganismen vormen granules plaats van vlokken 2. Deze korrels hebben een betere bezinkbaarheid, zijn in staat om een hogere organische belastingen te weerstaan, en hebben een hogere tolerantie voor toxiciteit dan actief slib vlokken 3.
In tegenstelling tot de biofilms, wordt AGS gevormd spontaan, zonder betrokkenheid van elke dragermateriaal 4. In AGS, zoals in biofilms, microörganismen produceren een aanzienlijke hoeveelheid sterk gehydrateerde extracellulaire polymere stoffen (EPS) 5 een hydrogel matrix waarin ze zichzelf geïmmobiliseerde vorm 4 – 6. EPS is een complex mengsel, bestaande uit polysacchariden, proteïnen, nucleïnezuren, (Phospho) lipiden, humusstoffen en enkele intercellulaire polymeren 5,7,8. Deze polymere stoffen met elkaar door middel van elektrostatische krachten, waterstofbindingen, ionische aantrekkelijke krachten en / of biochemische reacties, enz. 5, die een dichte en compacte tertiaire netwerkstructuur. De EPS polymeren die in staat zijn hydrogels 4,9 en draagt bij tot de vorming van de tertiaire netwerkstructuur zijn in dit opzicht beschouwd als structurele EPS, een subset van de totale EPS.
EPS zijn verantwoordelijk voor de chemische structuur en fysische eigenschappen van granules 5. Daarom is het essentieel om de functie van elk EPS verbinding begrijpen. Verschillende benaderingen worden toegepast voor extractie EPS 10-15. Vanwege hun extreme complexiteit, is het bijna onmogelijk om alle componenten EPS het extraheren van een enkele methode. Tot op heden is er geen "one size fits all" methode voor het EPS-extractie. De keuze van de extractiewerkwijze beïnvloedt niet alleen de totale hoeveelheid, maar ook de samenstelling van de teruggewonnen polymeren 13,16 – 20. Afhankelijk van het type van slib en de EPS plaats verschillende methoden nodig.
Extraheren gelvormende polymeren, karakteriseren de eigenschappen en het onderzoeken van hun interactie met elkaar en met niet-gelvormende EPS helpt om de rol van EPS in aërobe korrelslib voor vorming. Bovendien is de gelvormende polymeren zijn ook nuttig in industriële toepassingen biopolymeren. Een mogelijke toepassing is reeds aangetoond met gelvormende polymeren uit AGS als bekledingsmateriaal waterbestendigheid papier 21 te verhogen.
Daarom worden extractiemethoden, specifiek voor gelvormende EPS nodig. Het doel van deze studie is om een methodologie om gel-vormende EPS extraheren uit AGS ontwikkelen. Zes extractiemethodes 10-15,22, die vaak worden gebruikt in de literatuur, werden geselecteerd om EPS te extraheren uit AGS. Het totale bedrag en de gel vormende eigenschappen van de geëxtraheerde EPS werden vergeleken voor elke methode.
Aanwijzingen voor de sectie protocol
De winning van EPS / ALE beschreven voor een volume van 50 ml en 3 g granulaat. Deze waarden zijn bedoeld als richtlijnen. Extracties met hogere concentraties granule kan de opbrengst van de geëxtraheerde EPS verlagen. Tijdens de extractie van ALE gelijkblijvende temperatuur gedurende 30 minuten worden bewaard bij 80 ° C. De tijd die het mengsel te verwarmen (ongeveer 5 minuten) is opgenomen in het protocol. Bovendien wordt de extractie efficiëntie verbeterd door gebruik van een magnetische roerstaaf van dezelfde grootte als de diameter van de bodem kolf. Dit zal resulteren in goede menging eigenschappen en effecten frezen, bevorderen de winning van EPS.
Later in het gedeelte protocol, TS en VS opbrengsten van alle extracties (supernatant verzameld in stappen 1.1-1.6) bepaald. Dialyse moet worden uitgevoerd voorafgaand aan TS en VS meting mogelijke fouten door de aanwezigheid van chemische stoffen die voor extracties verminderen. EENMWCO van 3500 Da wordt aanbevolen om deze stoffen te verwijderen met behoud van de EPS macromoleculen binnen de dialyse zak. De dialyse zak moet een groter volume dan het volume van het extract zijn. Dit is nodig omdat de volume van het extract zal verhogen tijdens de dialyse (bijvoorbeeld voor extractie EDTA tot 40% volumetoename). De mate van chemische verwijdering door dialyse kan worden bepaald door meting van de pH in het monster voor en na dialyse. Als alternatief, geleidbaarheid metingen van de dialyse water geven de omvang van de ionen te verwijderen.
Om ALE krijgen van het totaal geëxtraheerde EPS (stap 1,6 en 2) de dialyse is optioneel. Niettemin dialyse drie voordelen: het vermindert de hoeveelheid HCl nodig voor het neerslaan, verbetert het zuur stofoverdracht in het extract afneemt en het asgehalte van het verkregen ALE. Voor de precipitatie van ALE wordt aanbevolen een glazen beker gebruiken met een veel groter volume dan de winningt. Na 2 CO 3 wordt normaal overdosis bij de extractie. De toegevoegde HCl eerst reageren met de Na 2 CO 3 links in het extract, als gevolg de vorming van kooldioxide en, indien het monster niet eerder werd gedialyseerd in schuimen. Tijdens de toevoeging van HCl, moet het extract langzaam geroerd met een magnetische roerstaaf van dezelfde grootte als de bodem van het bekerglas. Een roerstaaf van deze omvang en langzaam roeren zal resulteren in nog mengen zonder de structuur van het neerslag. Als zure gel klontjes gevormd in het extract, moet de beker iets worden gedraaid met de hand. De precipitatie wordt uitgevoerd met een zuur concentratie van 1 M tot een grote volumetoename van het extract vermijden terwijl toch een homogene verdeling van het zuur in het monster wordt verkregen. Hogere concentraties zuur kan resulteren in een regionaal pH daling en zure gel klonten vormen. Een pH hoger dan 2,0 vermindert de hoeveelheid ALE die kunnen worden hersteld, waarschijnlijk door structurele veranderingenvan de polymeren bij lagere pH. Het is daarom belangrijk om de uiteindelijke pH op 2,20 ± 0,05 te houden.
beperkingen
De ALE extractiemethode op structurele wijze extracellulaire polymeren van het EPS van AGS of biofilms in het algemeen extraheren en is niet bedoeld om alle aanwezige EPS extraheren. Alle EPS extract, een combinatie van meerdere extractiemethode noodzakelijk. Zoals getoond met de toename van de opbrengst VS EPS door een dubbele en viervoudige extractie, één extractie niet pak het structurele EPS. ALE-extractie is een harde EPS extractie methode, een combinatie van constant mengen met warmte en alkalische omstandigheden. Daarom is het mogelijk dat sommige intracellulair materiaal samen wordt geëxtraheerd met EPS. Hoewel cellysis kan worden veroorzaakt door fysische en chemische extractietechnieken (sonicatie 31,32, 31,32 NaOH, 11,32 EDTA, CER 32, 32 warmte en hoge afschuifsnelheden door mixing 19), de aanwezigheid van intracellulair materiaal teruggewonnen EPS moet nog worden geverifieerd. De ionische gelvormende eigenschap van het gewonnen EPS is de belangrijkste focus van dit onderzoek of de herstelde EPS bevat intracellulaire materiaal werd niet geanalyseerd. Toekomstig onderzoek zal zich richten op het identificeren van intracellulaire materiaal in de uitgepakte EPS.
Oplossen van de hydrogel matrix van AGS cruciaal structurele EPS extraheren
EPS vormt een dichte en compacte hydrogel matrix AGS. Hoewel EPS bevat verschillende klassen van organische macromoleculen zoals polysacchariden, eiwitten, nucleïnezuren, (fosfo) lipide, humusstoffen en sommige polymeren intercellulaire 7,5,8, niet allemaal een gel vormen. Alleen die gelvormende polymeren worden hier beschouwd als structurele polymeren EPS.
Doel van EPS extracties is om eerst oplosbaar EPS en vervolgens de opgeloste EPS verzamelen. Als de structurele EPS (dat wil zeggen, thij EPS vormen van een hydrogel) is het doel van de extractie, de gelmatrix van AGS moet eerst worden opgelost. Alleen methoden die de gelmatrix kunnen oplosbaar zijn kunnen extraheren structurele EPS. In dit onderzoek, een aantal veel gebruikte EPS extractiemethodes zoals centrifugeren 10-15, sonicatie 10,14,15, EDTA 10 – 12,14,15, formaldehyde + NaOH 10-15 en formamide + NaOH 13 kon niet op efficiënte wijze de structurele isoleren EPS. Dit komt door het feit dat de hydrogel matrix van de aërobe granules niet werd opgelost met deze werkwijzen. Om deze reden werden de stabiliteit testen in hoofdstuk 4 alleen uitgevoerd met voorwaarden aanwezig in EDTA, formamide + NaOH en formaldehyde + NaOH extractie. Deze drie extracties waren niet in staat isoleren structurele EPS, maar verkregen de hoogste VS EPS opbrengst naast de Na 2 CO 3 extractie. voorwaarden of de Na 2 CO 3-extractie werden niet toegepast als deze extractie methode duidelijk oplosbaar de AGS matrix. Vandaar dat de toegepaste omstandigheden tijdens de stabiliteit proef representatief geacht.
Extractie met kationuitwisselingshars (CER), een andere veelgebruikte EPS extractiemethode, werd niet in aanmerking voor deze vergelijking, zoals eerdere studies over EPS extractie met CER geen betere resultaten dan de chemische extracties hier gebruikt opleverde.
Gel-vormende EPS in AGS
Gelvormende EPS worden beschouwd als structurele EPS in de hydrogel matrix van AGS. Het is de moeite waard erop te wijzen dat er verschillende soorten hydrogels zoals ionische gels, temperatuur geïnduceerde gels en pH geïnduceerde gels. Dit onderzoek richt zich alleen op EPS dat ionische gels vormen. Wat de grote fractie structurele gelmateriaal geëxtraheerd, dit wordt waarschijnlijk het overheersende structurele EPS. Er zijn zeker mogelijkheden die andere vormen van EPSdie vorm verschillende hydrogels (bijvoorbeeld pH geïnduceerde gel 28) bestaan in dezelfde of andere soort van aërobe granules. Niettemin, het maakt niet uit wat voor soort hydrogel is gericht, oplossen van de EPS gelmatrix is de belangrijkste stap om gelvormende EPS halen.
Op dit moment is er weinig onderzoek gedaan naar structurele winst per aandeel van korrelslib. De ALE extractie beschreven in dit protocol kan extraheren gelvormende EPS van AGS en worden gebruikt in toekomstige studies structurele EPS karakteriseren. Meer onderzoek moet worden gedaan op de AGS, structurele EPS en niet-structurele EPS om beter te begrijpen van het proces en de functie van granulatie en EPS. Vooral de volgende drie punten moeten worden onderzocht waarom micro- organismen een grote hoeveelheid EPS, wat de exacte samenstelling van EPS en hoe de samenstelling van EPS bijgesteld worden op omgevingsveranderingen produceren. Detecteren en analyseren van alle betrokken verbindingen en hun interactions zal helpen om biofilms en hoe ze te gebruiken in ons voordeel te begrijpen.
The authors have nothing to disclose.
This research was financially supported by the SIAM Gravitation Grant 024.002.002, the Netherlands Organization for Scientific Research and by the Dutch Technology Foundation (STW – Simon Stevin Meester 2013). The authors want to thank Mario Pronk for providing the granular sludge samples.
250 ml baffled flask | Kimble | 25630-250 | |
1000 ml glass beaker | VWR | 213-1128 | |
RCT basic, magnetic stirrer with thermometer | IKA | 3810000 | |
sodium carbonate decahydrate | Merck KGaA | 1063911000 | |
50 ml centrifugation tubes | greiner bio-one | 227261 | |
Multifuge 1 S-R, centrifuge | Heraeus/Thermo Scientific | – | |
hydrochloric acid, 37 % | Sigma-Aldrich | 30721-1L-GL-D | |
250 ml glass beaker | VWR | 213-1124 | |
calcium chloride dihydrate | Merck KGaA | 1023821000 | |
1 ml Pasteur Pipette | Copan | 201C |