We present a protocol to identify protein moieties containing antigens for human and mouse IgM antibodies with specific kappa (Vκ) light chains. This protocol is not limited to IgM class antibodies but applies to all immunoglobulin isotypes that target their antigen with sufficiently high affinity during immunoprecipitations.
Antibodies of the IgM isotype are often neglected as potential therapeutics in human trials, animal models of human diseases as well as detecting agents in standard laboratory techniques. In contrast, several human IgMs demonstrated proof of efficacy in cancer models and models of CNS disorders including multiple sclerosis (MS) and amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Reasons for their lack of consideration include difficulties to express, purify and stabilize IgM antibodies, challenge to identify (non-protein) antigens, low affinity binding and fundamental knowledge gaps in carbohydrate and lipid research.
This manuscript uses HIgM12 as an example to provide a detailed protocol to detect antigens by Western blotting, immunoprecipitations and immunocytochemistry. HIgM12 targets polysialic acid (PSA) attached to the neural cell adhesion molecule (NCAM). Early postnatal mouse brain tissue from wild type (WT) and NCAM knockout (KO) mice lacking the three major central nervous system (CNS) splice variants NCAM180, 140 and 120 was used to evaluate the importance of NCAM for binding to HIgM12. Further enzymatic digestion of CNS tissue and cultured CNS cells using endoneuraminidases led us to identify PSA as the specific binding epitope for HIgM12.
Antikörper vom IgM – Isotyp zeigen großes therapeutisches Potential für die Behandlung von verschiedenen Krankheiten , einschließlich Krebs und Erkrankungen des ZNS 1-7. Die Vollmers 'Gruppe zahlreiche Antikörper bei Krebspatienten für mögliche Verwendung als tumorspezifische Biomarker oder aktiven Therapeutika identifiziert die in der Lage sind bösartige Zellen zu töten , indem sie apoptotische Wege 4,8,9 induzieren. Interessanterweise alle identifizierten Antikörper mit therapeutischem Potential sind der IgM-Isotyp und gehören zur Gruppe der "natürlichen Autoantikörper" (NAbs).
In ähnlicher Weise identifiziert die Rodriguez Gruppe von Maus und Mensch-Antikörper, die Remyelinisierung in chronisch demyelinierten Läsionen des Rückenmarks bei den Modellen der Multiplen Sklerose (MS) zu stimulieren. Identisch mit Antikörpern mit Anti-Krebs – Wirkung, alle Remyelinisierung fördernder Antikörper sind NAbs und der IgM – Isotyp 1,6,7,10. Die genauen Antigene für die meisten identifiziert IgMs sind noch undetermined einschließlich des menschlichen Remyelinisierung fördernden Antikörper rHIgM22, die derzeit in klinischen Phase – I – Studien für MS – Patienten 11. Trotz wiederholter Bemühungen von Experten auf dem Gebiet der Lipid- und Kohlenhydratforschung sowohl im akademischen Umfeld und in Partnerschaft mit der Industrie 11, versucht rHIgM22 das Antigen zu identifizieren , waren nicht erfolgreich. Das Versagen von Standardtechniken verwendeten Antigene von IgG-Antikörpern zu identifizieren, mit IgM-Antikörpern zu arbeiten identifiziert eine kritische Notwendigkeit Methoden zu verfeinern, spezifisch für diesen Antikörper, die wahrscheinlichste Ziel Kohlenhydrat oder Lipid-Antigene.
Der Schwerpunkt dieses Manuskript ist der menschliche regenerative Antikörper HIgM12 und die experimentellen Verfahren verwendet, sein Antigen zu identifizieren. Antikörper HIgM12 wurde von Patienten mit Morbus Waldenström identifiziert, stimuliert das Neuritenwachstum in vitro 12-14 und Ziele Polysialsäure (PSA) , die an das neuronale Zelladhäsionsmolekül (PSA-NCAM) 15,16. HIgM12 verlängert Lebensdauer in einem Mausmodell der ALS 17 und verbessert die funktionelle Ergebnis in Theiler murine Enzephalomyelitis Virus (TMEV) infiziertem Mäuse. Insbesondere stimuliert HIgM12 spontane horizontale und vertikale Bewegungsaktivität in chronisch demyelinierten Mäuse und erhöht Zahl von kleinen und mittleren Durchmesser des Rückenmarks Axone acht Wochen nach einer einzigen, niedrigen Dosis von intraperitoneale 18 Antikörper injiziert.
Das neurale Zelladhäsionsmolekül (NCAM) ist ein Glycoprotein der Immunglobulin (Ig) -Superfamilie auf der Zelloberfläche von Neuronen exprimiert, Glia, Skelettmuskel, und natürliche Killerzellen 19-25. Die drei großen NCAM-Isoformen genannt NCAM180, NCAM140 und NCAM120 sind alternative Splice-Varianten eines primären Transkripts, die nur in ihrer zytoplasmatischen Domäne variieren. Im ZNS ist NCAM die Haupt polysialylierte Molekül (> 95%) mit langen, negativ geladene Sialinsäure-Homopolymere. Polysialinsäuren eincid mit n> 10 wird als PSA aber kürzere oligomere Strukturen existieren, die auch biologisch relevant sind. Andere polysialylierte Proteine im ZNS exprimiert sind SynCAM1 26, Neuropilin-2 (NRP-2) 27,28 und ein Natriumkanal – Untereinheit 25 (für einen Überblick siehe 29).
Die hier beschriebenen Methoden erlauben Antigen Identifikation für die Human- und Maus – Immunglobulinen , die spezifische kappa (V & kgr;) Leichtketten (VκI, VκIII oder VκIV leichten Ketten für menschliche Antikörper und VκI leichten Ketten für Maus – Antikörper) , unabhängig von der Isotyp des Antikörpers (zB IgG, IgM , IgA, IgD oder IgE). Diese Beschränkung beruht auf der Verwendung von Protein L-Agarose für Immunpräzipitationen mit Antikörpern des IgM-Isotyps. Alternative Strategien können Mannose-bindende Lektine und sekundären IgG anti-IgM-Antikörper kovalent an Agarose-Kügelchen, umfassen, die die Anwendbarkeit dieses Verfahrens auf mehr IgM Antikörper erweitern kann incdie mit Lambda (λ) Leichtketten Luding (siehe Diskussion). Die Verhältnisse von Serum V & kgr; leichten Ketten IgM im Vergleich zu leichten Ketten λ IgM von gesunden Individuen abgeleitet sind 1,5: 1 30.
Basierend auf dem chromatographischen Methodik hier verwendet zur Trennung, Anreicherung und immunologisch bestimmte Moleküle 31 erfassen, werden alle Antigene erforderlich , mindestens eine kleine Proteindomäne umfassen. Die spezifische Bindung Epitop des Antikörpers kann (in Glykoproteine, Lipoproteine zB) innerhalb oder außerhalb des Proteindomäne sein. Erste biochemische Schritte verwendet, um das spezifische Antigen für HIgM12, jeweils die Liste der potentiellen Kandidaten einzuengen zu identifizieren, sind die wichtigsten Schritte in diesem Verfahren. Zelltyp-spezifische Präparate und Zellmorphologie Basis Charakterisierungen sind für Gliazellen beschrieben, aber diese Methode extrapoliert werden kann andere Zelltypen innerhalb oder außerhalb des ZNS anzupassen.
Es besteht ein dringendermüssen neue oder modifizierte Techniken anwendbar für die zunehmende Anzahl von IgM-Antikörpern mit therapeutischem Potential für verschiedene menschliche Erkrankungen insbesondere in den Fällen (die meisten IgM-Antigene) entwickeln, in denen die Antikörper-Targets sind Kohlenhydrat- oder Lipidstrukturen.
Natürliche menschliche IgM – Autoantikörper sind ansprechend Kandidaten für Immuntherapien und haben sich für die Behandlung verschiedener Krankheiten einschließlich Krebs und Erkrankungen des ZNS 1-7 therapeutisches Potential nachgewiesen. Vorteilhafterweise werden diese Antikörper keine Immunantwort in dem die Erzeugung von neutralisierenden Antikörpern reduziert wesentlich die wirksame therapeutische Dosis und Wirksamkeit hervorzurufen. Wichtig ist , dass alle Antikörper mit therapeutischem Potential des Isotyps IgM gewesen und gehören zu den NKV Repertoire 3-5,8,9,37,40,42-45. Eine große Hürde für die potentielle klinische Anwendung von IgM-Antikörpern ist die Identifizierung der Antigene, die in vielen Fällen nicht bestimmt werden. Standardtechniken für die IgG-Antikörper eingesetzt werden, sind oft nicht anwendbar, ein IgM des Antigens zu identifizieren.
Dieses Protokoll beschreibt die Identifizierung von PSA-NCAM als Antigen für die regenerative menschlichen IgM-Antikörper HIgM12, wirksam in Tiermodellenvon MS und ALS 15-18. Die angewandte Methodik ist prinzipiell für alle humanen Antikörpern mit spezifischen V & kgr; leichten Ketten VκI, VκIII und VκIV und Maus-Antikörper mit VκI leichten Ketten, unabhängig von der Isotyp des Antikörpers.
Der wichtigste Schritt in diesem Protokoll ist die Verwendung von IgM-Antikörpern bei der Affinitätschromatographie-Anwendungen. Genauer gesagt sind erfolgreiche Antikörper erforderlich als Pull-down-Mittel in Immunpräzipitationen handeln ein Antigen aus komplexen Gewebe- oder Zellkultur-Lysaten zu isolieren oder anzureichern. Angereichert Antigenfraktionen können zu Immunpräzipitationen von Isotypenkontrolle Antikörpern und anschließend analysiert, um Unterschiede durch Massenspektrometrie verglichen werden. Eine wesentliche Anforderung oder die Begrenzung dieses Schrittes ist die Gegenwart des korrekten Antikörpers V & kgr; leichte Kette und Wirt (Mensch, Maus) Antikörperbindung an Protein L-Agarose zu ermöglichen. Die Verwendung von Mannan-bindendes Protein an Agarose gebunden (auch called Mannose-bindendes Lektin) anstelle von Protein L Agarose ist eine mögliche Alternative IgMs ohne spezifische V & kgr; leichten Ketten zu Immunpräzipitation. Jedoch ist , wie von Arnold et al angegeben. 35, Antigen-gebundenen IgM – Antikörper binden nicht an Mannan-bindendes Protein, wie es die Ziel Glykan unzugänglich zu werden scheinen , sobald das IgM an sein Antigen gebunden hat. Basierend auf diesen Ergebnissen Protein Mannan-binding kann nicht als Bindematrix eingesetzt werden IgM zu immunpräzipitieren Antigen-beladenen 35 Molekülen. Andere mögliche Alternativen könnte die Verwendung von sekundären Agarose-gebundenen anti-IgM – Antikörper IgG 46,47 oder die Verwendung von oberflächenaktivierte magnetische Kügelchen 48 sein. IgG-Antikörper gegen IgM konnte chemisch vernetzt werden, um eine oder Agarose G, um an Agarose, das Ausmaß der eluierten Antikörper zusammen mit dem Antigen von Interesse zu reduzieren. Eine richtige Vergleich zwischen verschiedenen Varianten von IgM-Immunpräzipitation in Bezug auf i erfolgreich identifizierten Antigenes schwierig, weil die meisten Immunpräzipitationen durchgeführt wurden, zu isolieren oder IgMs ohne weiteres Interesse an ihre Antigene erschöpfen. Zusätzlich wurden Immunpräzipitationen unter Verwendung IgMs hauptsächlich 49 eine bereits bekannte oder erwartete einzelnes Antigen mit Antikörper Exposition gegenüber gereinigter Antigene zu bestätigen. Nachteilig an Agarose-gekoppelter IgGs gegen menschliche IgMs gerichtet ist , eine sehr geringe Ausbeute (10 bis 15%) der immunpräzipitierten Serummoleküle IgM , wenn dem Ausgangsmaterial 50 verglichen. Im Gegensatz dazu oberflächenaktivierte magnetische Kügelchen wurden erfolgreich an Antikörper verschiedener Isotypen angewendet einschließlich IgM 48 Scrapie-assoziierten Fibrillen Immunpräzipitation. Dieses Verfahren ist nicht auf bestimmte kappa (V & kappa;) oder Lambda (λ) -Ketten oder einen bestimmten Host beschränkt und kann im Wesentlichen das Spektrum der IgM Antikörper in Immunpräzipitationen verwendet verbreitern.
Ein weiterer wichtiger Schritt im Protokoll ist die Fähigkeit des Antikörpers als det zu funktionierenektierender Antikörper (primärer Antikörper) in Western-Blots oder anderen Screening-Plattformen. Erfolgreiche Antikörper müssen ihre Antigen mit ausreichend hoher Affinität Zielantigenbindung in Gegenwart von nichtionischen oder möglicherweise ionische Detergenzien zu ermöglichen. Antikörper mit hoher Affinität sind häufig bei Affinitäts-gereifte IgG-Antikörpern, aber weniger häufig bei Antikörpern vom IgM-Isotyp, der einer der Gründe ist, warum es gibt relativ wenige kommerziell erhältlichen IgM Antikörper als Mittel in biochemischen Einstellungen erfassen. Hochaffine Bindung von Antikörpern ist eine Voraussetzung für Immunpräzipitationen von molekularen Antigenen und zum Western-Blotting. Absenken Detergenzkonzentrationen oder vollständiger Abwesenheit von Detergentien in IP-Puffer und Lysepuffer ermöglicht Antigen durch niederaffinen Antikörpern über ihre Fab-Domäne Targeting. Im Gegensatz dazu wird der Antikörper die Fähigkeit Protein L-Agarose über seinen Fc-Teil zum Ziel nicht wesentlich unter Isotypkontrollen über einen Bereich verschiedener Waschmittel Konzen betroffentrationen. Jedoch Puffer niedriger Waschmittelkonzentration in Lysepuffer und IP verhindert Zellmembran Unterbrechung und Isolierung von spezifischen Molekülen. In ähnlicher Weise eine geringe Detergenskonzentration in Western – Blot – Wasch – Puffer (zB PBS-T) erlaubt Antigenbindung von niederaffinen Antikörpern , aber zur gleichen Zeit erhöht unspezifische Bindung und ist daher nicht in Frage .
Die Anwesenheit eines Antigens Proteinkern ist eine weitere Voraussetzung für diese Methode. Proteinen mit posttranslationalen Modifikationen (zB Glykoproteine, Lipoproteine) und unmodifizierten Proteine, aber nicht alleinige Lipiden oder Kohlenhydraten, sind nachweisbar in Western Blots. Es ist nicht möglich , Lipide zu immunpräzipitieren (beispielsweise um Sphingolipide) aus Gewebe oder Zell – Lysaten in der Gegenwart oder Abwesenheit von Detergenzien. Die physikochemischen Eigenschaften von Detergenzien und Lipide sind zu ähnlich selektive lipid-Antikörper-Wechselwirkungen zu ermöglichen, während gleichzeitig die Detergenzien sind wesentlich zu störenMembranen, um selektive Isolierung von spezifischen Molekülen zu ermöglichen. Nach unserem besten Wissen, Immunpräzipitationen ausschließlich aus Kohlenhydraten besteht, in Abwesenheit eines Proteinkern, sind bisher nicht berichtet worden. Dies wird besonders relevant, da IgM-Antikörper häufig Kohlenhydrate und Glycolipiden Target, die nicht notwendigerweise auf eine Proteineinheit verbunden. Andere chromatographische Techniken sind für die Trennung und immunologische Identifizierung von Lipiden und Kohlenhydraten in Abwesenheit eines Proteinkern erforderlich. Zum Beispiel Dünnschichtchromatographie (TLC) der zellulären Lipiden mit anschließender Antikörper – Nachweis auf der DC – Platte (immuno-TLC) können 51,52 realisiert werden.
Andere anti-PSA-Antikörper wurden in früheren Studien und Ergebnisse im Vergleich mit HIgM12 sowie die im Handel erhältlichen anti-PSA IgM (Klon 2-2B) beschrieben worden. Die am häufigsten verwendeten Antikörper auf dem Gebiet der PSA ist ein IgG-Antikörper (Klon 735), erhältlich als Maus-Mono-Clonal oder Kaninchen polyklonalen Antikörper 53. Diese Anti-PSA – IgG – Antikörper erkennt PSA auf SynCAM und NCAM auf verschiedenen ZNS – Zelltypen , einschließlich Mikroglia – Zellen 41. Im Gegensatz zu dem Antikörper anti-PSA-IgG, Human-IgM-Antikörper HIgM12, HIgM42 und die anti-PSA-Maus IgM (Klon 2-2B) sind nicht in der Lage PSA auf SynCAM Ziel (aber auf NCAM) bei verschiedenen embryonalen und frühen postnatalen Stadien in Mäusen , während nicht-polysialylierte SynCAM ist leicht nachweisbar 15. Die IgM – Antikörper verwendet werden , sind auch nicht in der Lage PSA auf Mikroglia – Zellen nachzuweisen (Figuren 3 + 4). Eine mögliche Erklärung für die Unterschiede zwischen den beobachteten Antikörper-Isotypen können geringe PSA-SynCAM Ebenen im Vergleich zu Mengen an PSA-NCAM mit der potentiell geringere Affinität kombiniert Bindung von IgM-Antikörpern im Vergleich zu dem Anti-PSA-IgG. Um diese Hypothese zu testen, führten wir Immunpräzipitationen in NCAM KO Tiere an embryonalen Stadium E17 mit großen Mengen an SynCAM vorhanden und verwendet HIgM12 als "Pull-Down-Agenten" <sup> 15. In E17 WT littermate steuert HIgM12 immunpräzipitiert PSA-NCAM in einem Ausmaß, die ähnliche Intensitäten von "heruntergezogen" PSA-NCAM zeigte im Vergleich zum IgMs schweren Kette, wie durch Densitometrie in nachfolgenden Western-Blot unter Verwendung von eluierten Antigene nachgewiesen. Dieses Ergebnis schlug mindestens eine ausreichende Affinität von HIgM12 an seine Ziel PSA. Im Gegensatz zu WT littermate steuert HIgM12 nicht PSA SynCAM in NCAM KO Tieren angebracht erkannt hat. Identische Ergebnisse wurden in Immunpräzipitationen unter Verwendung des menschlichen Anti-PSA IgM HIgM42 erhalten. HIgM12 und HIgM42 sowie die Maus-Anti-PSA-IgM (Klon 2-2B) waren nicht in der Lage PSA auf SynCAM in Western-Blots an embryonalen und postnatalen Entwicklungsstadien von WT und NCAM KO Tiere zu zielen. In Anbetracht der geringen Menge an HIgM12 erforderlich (0,1 ug / ml) , um speziell PSA erkennen an NCAM in Western – Blots unter Verwendung von geringen Mengen von ZNS – Gewebe (0,1 ug ZNS – Gewebe pro Vertiefung) 15 scheint es unwahrscheinlich zu sein , dass niedrige Affinitäten alleinverantwortlich für völlige Fehlen von PSA-SynCAM Erkennung von HIgM12 in drei verschiedenen Methoden.
Wir schließen daraus, dass es signifikante Unterschiede zwischen den Anti-PSA-IgM-Antikörper und der häufig veröffentlicht anti-PSA-IgG-Antikörper (Klon 735). Es ist nicht klar, warum handelsüblichen anti-PSA-IgM-Antikörper nicht häufiger in der Vergangenheit verwendet wurden Ergebnisse mit Antikörper antiPSA IgG 735. Dies ist besonders interessant, erhalten, um zu bestätigen, weil HIgM12 bereits Wirksamkeit in verschiedenen Krankheitsmodellen erwiesen hat. Während andere Anti-PSA-IgM-Antikörper ähnliche therapeutische Wirkungen haben können bleibt unklar, ob die Anti-PSA-IgG-Antikörper (Klon 735) eine ähnliche therapeutische Ergebnis in Modellen der MS und ALS hat.
Kurz gesagt, wurden hier in erster Linie zu identifizieren, die das Antigen des Regenerativ-menschlichen Antikörpers HIgM12 unterstützen potentielle klinische Studien für MS und möglicherweise andere neurodegenerative Erkrankungen beschriebenen Verfahren verwendet. Die Identifizierung der Ameiseigens für Antikörper mit der biologischen Aktivität ist, als wesentlichen Schritt ihres Wirkmechanismus zu verstehen. Dies wird besonders relevant im Zusammenhang mit zahlreichen monoklonalen Antikörpern zur Zeit für die Sicherheit und Wirksamkeit in Studien am Menschen getestet. Während die Anzahl der klinisch getestet IgM Antikörper bisher klein ist, die jüngsten Fortschritte in Hybridom – Technologie zusammen mit einer steigenden Anzahl von Studien , die die therapeutische Potential dieses Antikörperklasse Hervorhebung 1-10,37,40,42-45 fordert die Entwicklung neuer oder modifizierte Methoden anwendbar nicht-Protein-IgM-Antigene zu identifizieren.
The authors have nothing to disclose.
Diese Arbeit wurde durch Zuschüsse aus den National Institutes of Health (R01 GM092993, R01 NS048357 und R21 NS073684) unterstützt wurde, der National Science Foundation (Career Award), die Minnesota Partnership Award für Biotechnologie und Medical Genomics, der National Multiple Sclerosis Society (CA1060A) und der Mayo-Klinik Zentrum für Klinische und Translational Science (CCATS). Die Autoren erkennen an Unterstützung von den Applebaum, Hilton, Peterson und Sanford Foundations, dem Mond und Marilyn Park Directorship Fonds und der McNeilus Familie.
DMEM | Fisher Scientific | MT-10-013-CVRF | HIGH GLUCOSE, with glutamine, with sodium pyruvate, 500 ml |
DMEM/F-12, HEPES | Life Technologies | 11330-032 | 500 ml, L-glutamine, sodium pyruvate, high glucose |
Penicillin-Streptomycin | Life Technologies | 15140-122 | 10,000 U/mL, 100 ml |
N-2 Supplement (100X) | Life Technologies | 17502-048 | 5 ml |
B-27 Supplement (50X) | Life Technologies | 17504-044 | serum free, 10 ml |
Fetal Bovine Serum – Optima | Atlanta Biologicals | S12450 | 500 ml |
STERILE WATER FOR IRRIGATION | Baxter Healthcare | #2F7114 | USP-1000 ml, 12/CA |
Poly-D-lysine hydrobromide | Sigma | P7886-50MG | D-Lys-(D-Lys)n-D-Lys · xHBr, Molecular Weight 30,000-70,000 g/mol, 50 mg |
bovine serum albumin fraction V | Sigma | A-3294-100G | heat shock fraction, protease free, pH 7, purity 98%, 100 g |
D-(+)-Glucose | Sigma | G5767-500G | C6H12O6, Molecular Weight: 180.16 g/mol, ACS reagent, 500 g |
Trypsin from bovine pancreas | Sigma | T9935-100mg | essentially salt-free, lyophilized powder, =9,000 BAEE units/mg protein, |
Deoxyribonuclease I from bovine pancreas | Sigma | D5025-150KU | Type IV, lyophilized powder, =2,000 Kunitz units/mg protein |
Recombinant Rat FGF basic Protein | R&D systems | 3339-FB-025 | BSA as a carrier protein, 25 ug, lyophilized, >95%, 16.2 kDa |
Recombinant Rat PDGF-AA Protein | R&D systems | 1055-AA-50 | carrier free, 50 ug, lypphilized, >97%, E.coli-derived, 12.5 kDa |
Neurobasal-A | Life Technologies | 10888-022 | 500 ml, No Glutamine, No Aspartic Acid, No Glutamic Acid |
Paraformaldehyde | Sigma | P6148-1KG | crystalline, 1 kg, reagent grade, Molecular Weight 30.03 g/mol (as monomer) |
Tris[hydroxymethyl]aminomethane (Tris bas | Biorad | #1610719 | 1 kg, 99.8% pure, powder |
Sodium Dodecyl Sulfate (SDS) | Biorad | #1610302 | 1 kg, powder |
Glycine | Fisher Scientific | BP-381-5 | C2H5NO2, Molecular weight: 75.07 g/mol, White crystalline Powder, 5 kg |
Sodium chloride | Sigma | S7653-5KG | NaCl, Molecular Weight: 58.44 g/mol, 5 kg |
Sodium phosphate monobasic | Sigma | S0751-500G | NaH2PO4, Molecular Weight: 119.98 g/mol, 500 g |
Phosphate-buffered Solution 1X (PBS) | Cellgro | MT-21-040-CV | Without Calcium and Magnesium, 6 x 500 ml |
Falcon 60mm TC-Treated Cell Culture Dish | Corning Life Sciences | #353002 | 60 mm Cell Culture Dish, TC-treated polystyrene, 20/pack, sterile |
Falcon 60 mm x 15 mm Petri dish | Corning Life Sciences | #351007 | Not TC-Treated Bacteriological Petri Dish, 20/Pack |
6 well cell culture plates | Corning Costar | CLS3516 | 6 well, flat bottom (Individually wrapped), gamma-irradiated, growth area 9.5 c |
75cm² tissue culture flask | Corning Life Sciences | 430720U | 75cm² U-Shaped Canted Neck Cell Culture Flask with Plug Seal Cap |
Pierce™ Protein L Plus Agarose | ThermoFisher Scientific | #20520 | 2 ml, crosslinked 6% beaded agarose (CL-6B), binding capacity: 10 to 20 mg IgG |
4-20% Mini-PROTEAN TGX Precast Gel | Biorad | 456-1094 | 10-well, 50 µl, for use with Mini-PROTEAN electrophoresis cells |
Immobilon-P Membrane | Millipore | IPVH00010 | PVDF, 0.45 µm, 26.5 cm x 3.75 m roll |
Anti-Polysialic Acid-NCAM Antibody, clone | Millipore | MAB5324 | 50 microliters, Host: mouse, monoclonal IgM |
XT sample buffer (Western blot) | Biorad | #1610791 | 10 ml, 4 x premixed protein sample buffer |
2-mercaptoethanol | Biorad | #1610710 | 25 ml, 98 % pure, 14.2 M |
Endoneuraminidase-N (Endo-N) | ABC Scientific | ABC0020 | 50 microliters, 200 µg/ml, 3500 U/mg |
25 mm glass coverslips | Fisher Scientific | 12-545-102 | Circles No. 1; Thickness: 0.13 to 0.17mm; Size: 25mm |
HEPES buffer solution | ThermoFisher Scientific | 15630-080 | 100 ml, 1M |
Hanks' Balanced Salt Solution 1X (HBSS) | Cellgro | MT-21-022-CV | 500 ml, without Calcium, Magnesium, Phenol Red |
Papain | Worthington Biochemical Cooperation | LS003119 | lyophilized powder, 100 mg |
Magnesiumsulfate | Sigma | M-2643-500G | powder, 500 g |
L-Glutamine | Gibco | #25030-081 | 100 ml, 200 mM |