Mouse embryonic fibroblast can be reprogrammed into induced pluripotent stem cells at low efficiency by the forced expression of transcription factors Oct-4, Sox-2, Klf-4, c-Myc. The rare intermediates of the reprogramming reaction are FACS isolated via labeling with antibodies against cell surface makers Thy-1.2, Ssea-1, and Epcam.
Mature cells can be reprogrammed to a pluripotent state. These so called induced pluripotent stem (iPS) cells are able to give rise to all cell types of the body and consequently have vast potential for regenerative medicine applications. Traditionally iPS cells are generated by viral introduction of transcription factors Oct-4, Klf-4, Sox-2, and c-Myc (OKSM) into fibroblasts. However, reprogramming is an inefficient process with only 0.1-1% of cells reverting towards a pluripotent state, making it difficult to study the reprogramming mechanism. A proven methodology that has allowed the study of the reprogramming process is to separate the rare intermediates of the reaction from the refractory bulk population. In the case of mouse embryonic fibroblasts (MEFs), we and others have previously shown that reprogramming cells undergo a distinct series of changes in the expression profile of cell surface markers which can be used for the separation of these cells. During the early stages of OKSM expression successfully reprogramming cells lose fibroblast identity marker Thy-1.2 and up-regulate pluripotency associated marker Ssea-1. The final transition of a subset of Ssea-1 positive cells towards the pluripotent state is marked by the expression of Epcam during the late stages of reprogramming. Here we provide a detailed description of the methodology used to isolate reprogramming intermediates from cultures of reprogramming MEFs. In order to increase experimental reproducibility we use a reprogrammable mouse strain that has been engineered to express a transcriptional transactivator (m2rtTA) under control of the Rosa26 locus and OKSM under control of a doxycycline responsive promoter. Cells isolated from these mice are isogenic and express OKSM homogenously upon addition of doxycycline. We describe in detail the establishment of the reprogrammable mice, the derivation of MEFs, and the subsequent isolation of intermediates during reprogramming into iPS cells via fluorescent activated cells sorting (FACS).
תאי גזע עוברי (ES) נגזרים ממסת התאים הפנימית של עובר ב1 שלב הבלסטוציסט. בתנאים מתאימים תרבות הם עצמי לחדש ולהישאר pluripotent. בשנת 2006 יאמאנאקה ועמיתים הראו שתאים בוגרים ניתן לתכנות מחדש לתאים שנקרא גזע pluripotent המושרה (iPS) על ידי ביטוי בכפייה של שעתוק גורמי אוקטובר -4, KLF-4, סוקס-2, c-Myc (OKSM) 2. תאי iPS, כמו תאי גזע עובריים, יכולים להצמיח את כל סוגי התאים בגוף, לעומת זאת, הם חופשיים מהמגבלות האתיות המקיפות את הדור של תאי גזע עובריים 3. יתר על כן, תאי iPS לשאת את ההבטחה של רפואת רגנרטיבית אישית ולהחזיק פוטנציאל עצום עבור יישומים כמו דוגמנות מחלה ובתרופת מבחנה הקרנת 4,5. על מנת שתכנות מחדש בטכנולוגיה כדי לממש את הפוטנציאל הזה, המנגנון הבסיסי של תכנות מחדש גרעיני צריך להיות מובן במלואו. עם זאת, מאמצים לנתח את טפיחת תכנות מחדשhway כבר הקשתה על ידי העובדה שרק מספר קטן מאוד של תאים לתכנת מחדש (0.1-1%). פיברובלסטים בהצלחה תכנות מחדש כבר דיווחו לעבור סדרה שונה של אירועים כולל mesenchymal למעבר אפיתל 6-10 ו, בשלבים הסופיים של תכנות מחדש, פעילות ברשת pluripotency ליבת אנדוגני 11-14. אנו ואחרים 12,13,15-17 לאחרונה זיהינו קבוצה של סמנים על פני התא ומאפשרת להפרדת ביניים נדירים מהאוכלוסייה בתפזורת עקשן. fibroblasts עכבר תכנות מחדש העוברי (MEFs) עובר שינויים בביטוי של Thy-1.2, Ssea1 וEpCAM (בין יתר) בתהליך תכנות מחדש 2 שבועות הארוך 15. מוקדם במהלך תכנות מחדש משנה של MEFs להסדיר את הביטוי של סמן זהות פיברובלסטים (Thy-1.2) ולאחר מכן להתחיל להביע את הסמן הקשורים pluripotency SSEA-1 12. בשלבים הסופיים של תאי Ssea1 החיוביים תכנות מחדש reactivאכלתי גני pluripotency אנדוגני כגון אוקטובר -4 10-13,15. המעבר אחרון זה מסומן על פני התא על ידי ביטוי לגילוי של EpCAM (ראה איור 1) או בשלב מאוחר יותר 15 PECAM. לאחרונה, אומאלי et al. דיווח על השימוש בCD44 וiCAM1 כחלופות או משלים לThy-1.2 וSSEA-1 לזיהוי ביניים תכנות מחדש. יש לנו בעבר FACS חילוץ ביניים תכנות מחדש מיום 0, יום 3, יום 6, תרבויות יום 9 ויום 12 תכנות מחדש, כמו גם משורות תאי iPS הוקמו על בסיס סמנים פני תא אלה 15,18. למערכת תכנות מחדש מתואר להלן ותנאים שהראינו ברמת התא הבודד, שלמרות שהאוכלוסיות שקטות הומוגנית, יש מידה מסוימת של הטרוגניות באוכלוסיות ביניים זוהו. יש לציין כי רק קבוצת משנה של תאים בתוך אוכלוסיות אלה יוכלו להתקדם לsta הבא המתאיםGE של תהליך תכנות מחדש ולהצמיח מושבות תאי iPS ביעילות שונה, שאופיין בהרחבה בעבר 15,19. יתר על כן, יעילות תכנות מחדש של אוכלוסיות אלה תהיה תלוי, כמו גם על התנאים מחדש ציפוי והתרבות. כדי להגדיל את שחזור ניסוי אנו משתמשים זן עכבר אפשר לתכנתו שתוכנן כדי להביע transactivator תעתיק (m2rtTA) תחת שליטה של מוקד Rosa26 וקלטת OKSM polycistronic תחת שליטה של אמרגן תגובה דוקסיציקלין 20,21. שימוש במודל עכבר זה עוקף את תופעות לוואי בלתי רצויה של שיטות נגיפיות מסורתיות של דור iPS תא, כלומר, אוכלוסייה הטרוגנית התחלה עם תא לשונות תא במספר והמיקום של אתרי אינטגרציה של מוסיף ויראלי. שני זני עכבר מהונדסים (OKSM, m2rtTA), זמין כחיות מייסד הומוזיגוטים במעבדה ג'קסון, יש לי להיות חצו כדי להקים reprograמודל עכבר mmable (ראה איור 2). בכתב יד זה אנו מתארים בפירוט כיצד להפיק MEFs, ליצור תאי iPS, ולבודד את תשומות תכנות מחדש בשלבים שונים של תהליך הגיור על ידי FACS.
על מנת לתכנת מחדש בהצלחה MEFs לתאי iPS ולטהר ביניים תכנות מחדש בכמות גבוהה זה הכרחי להיות מודע לגורמים שיש להם השפעה על היעילות הכוללת. בפרט אצווה של FBS משמש כדי להשלים את תקשורת iPS יכול להיות השפעה מזיקה. בחוויות חיוביות כלליות נעשו עם הגזע עוברי FBS המוסמך תא (ES), אך בדיקת אצווה של סרה ממגוון רחב של ספקים עלולים לזהות חלופה זולה יותר.
גורם נוסף שמשפיע על יעילות תכנות מחדש הוא גנוטיפ של MEFs 15,20. למרות MEFs נגזר מהטרוזיגוטיים עכברים (ח) לשני OKSM ומוקד m2rtTA אל לתכנת מחדש, homozygousity באחת או בשני תוצאות הלוקוסים ביעילות תכנות מחדש גבוהה יותר. ואכן, MEFs נגזר מהצאצאים של צלבי OKSM וm2rtTA להראות עלייה ביעילות תכנות מחדש לפי הסדר הבא (OKSM / m2rtTA): ח / ח <הומו / ח <ח / הומו <הומו /הומו (שים לב שהמספרים הניתנים בטבלה 1 הם לבעלי החיים ח / ח). בהזדמנות נדירה של בעלי חיים הומו / הומו גברי מזוהה, הרמון הזדווגות עם נקבות m2rtTA מרובות ניתן להגדיר. כל הצאצאים מצלבים אלה "מדוכאת" / הומו לOKSM / לוקוסי m2rtTA, בהתאמה. בנוסף, גנוטיפ המהיר של המלטות מומלץ כהמלטות גדולות יותר מתקבלות כאשר משתמשים בעכברים צעירים לרבייה (6-15 שבועות של גיל).
יתר על כן, השימוש בMEFs מעבר הנמוך לתכנות מחדש יודגש 23. אם MEFs נגזרו והרחיב בתרבית רקמת חממת normoxic אנו ממליצים בחום להשתמש רק תאים אלה עד למעבר .2 עם זאת, אם יש לו את הניסוי גישה לחממת חמצן נמוך (חמצן 5%) לגזירה והרחבת MEFs, מספרי מעבר גבוהים ככל 3 עדיין להניב תוצאות טובות 23.
במקרה הנסיין נתקל בבעיות הקשורות לתכנות מחדש, כפי שתואר, סביר להניח שההסברים הם מספרי מעבר גבוהים בזמן בנוסף DOX, גנוטיפ לא נכון של העכברים או השימוש בFBS שהוא לא תורם ליצירת תאי iPS. עם זאת, במקרים נדירים אנחנו ציינו כי MEFs לא הצליחו לתכנת מחדש גם בתנאים אידיאליים. במקרים אלה מחיקה ספונטנית דה נובו בתוך מסגרת הקריאה הפתוחה של m2rtTA זוהתה כסיבה הבסיסית.
מתודולוגיה זו הותאמה בהצלחה לחלץ SSEA-1 + ביניים באמצעות בידוד מגנטי תא (MACS). יש יתרון ברור בזמן באמצעות MACS, לעומת זאת, טוהר SSEA-1 + "אוכלוסיות תאים מצטמצם 80-90%, ולא יותר מ 95%, אשר תלוי בסוג של ניסוי בתאים מיועדים לעלולים להוות בעיה. לפיכך, אפשרות היא להשתמש MACS להעשיר לSSEA-1 + תאים ואחריו FACS להגדיל טוהר ו / או החלק ל+ / תאי Epcam- SSEA-1 + / EpCAM + וSSEA-1.
"> בעוד תאי iPS המיוצרים על ידי הפרוטוקול שתואר ומודל עכבר הוכחו להיות pluripotent וביעילות לתרום לכל הרקמות של בעלי החיים chimeric 15,20, קיבולת מופחתת כדי לייצר עוברים לחלוטין מורכבים מתאי iPS אלה באמצעות שלמת tetraploid כבר הפגין 24. דפוסי מתילציה Aberrant באשכול גני DLK-Dio3 זוהו כגורם הבסיסי 24. עם זאת, תוספת של חומצה אסקורבית בריכוז של 50 מיקרוגרם / מ"ל לתקשורת במהלך תכנות מחדש תהיה לייצר תאי iPS המוסמך שלמת tetraploid 24. לידיעתך מודל עכבר אפשר לתכנת חלופי שהונדס גורמי תכנות מחדש בstoichiometry שונה יכול לייצר תאי iPS המוסמך tetraploid גם בהעדרו של טיפול בחומצה אסקורבית 25. עם זאת, בתאים את ידינו מלתכנת מחדש את המתח הזה באופן משמעותי תדירות נמוכה יותר בהשוואה למצב עכבר במסמך זה משמשl.המתודולוגיה שתוארה בכתב היד הזה מאפשרת הפרדת ביניים תכנות מחדש מהכמויות הגדולות עקשן של האוכלוסייה ויש לראותו ככלי רב ערך כדי לנתח ולהבין את תהליך תכנות מחדש, הסרת המגבלות הקודמות של צורך להשתמש באוכלוסיית unfractioned לפרופיל (לדוגמא, רעש גבוה אות מהתאים עקשן). שילוב הנוגדן המתואר כאן מאפשר בידוד של חומרי ביניים מתאי עכבר בטוהר גבוה, אולם יתכן כי סמנים פני תא נוספים להיחשף בעתיד שיאפשר להשיג ביניים בטוהר גבוה אף יותר. שים לב שהביטוי SSEA-1 הוא לא סימן היכר של תאי גזע pluripotent האנושיים מושרה וכפרוטוקול כזה זה לא יכול להיות בשימוש על תכנות מחדש של תאים ממקור אנושי. לסיכום, ביניים תכנות מחדש מבודדים פעם אחת עם השיטה המתוארת יכולים לשמש לניתוחים מולקולריים כוללים profilin ביטויg, immunoprecipitation הכרומטין, methylome ניתוח, וחלבון מבחני.
The authors have nothing to disclose.
ברצוננו להכיר את התמיכה הכספית מתכנית Larkins מונש, כמו גם מCDF NHMRC ומענק פרויקט NHMRC. יתר על כן, ברצוננו להודות לי סו מיי Lim להצעותיה המועילות, אדווינה McGlinn לתמיכתה וצוות מונאש Flowcore (בפרט האדם Dinsdale) על עזרתם בהפקת הווידאו.
Anti-mouse CD90.2 (Thy1.2) Pacific Blue | eBioscience | 48-0902-82 | |
Anti-Human/Mouse SSEA-1 Biotin | eBioscience | 13-8813 | |
Streptavidin PE-Cy 7 | eBioscience | 25-4317-82 | |
Anti- Mouse CD326(Epcam) Fitc | eBioscience | 48-5791-82 | |
Sodium pyruvate | Life Technologies | 11360-070 | |
MEM Non-Essential Amino Acids (NEAA) | Life Technologies | 11140-050 | |
Embryonic Stem Cell qualified Foetal Bovine Serum (FBS) | Life Technologies | 10439024 | |
Trypsin-EDTA (0.25%) | Life Technologies | 25200-056 | |
GlutaMAX | Life Technologies | 35050-070 | |
β-Mercaptoethanol | Life Technologies | 21985-023 | |
DMSO (Dimethyl Sulfoxide) | Sigma-Aldrich | D8418 | |
Penicillin/streptomycin | Life Technologies | 15140 | |
Propidium Iodide solution (PI) | Sigma-Aldrich | P4864-10ML | |
Gelatine from porcine skin | Sigma-Aldrich | G1890 | |
Doxycyclin hyclate | Sigma-Aldrich | 33429-100MG-R | |
Leukemia Inhibitory Factor (LIF) | Millipore | ESG1107 | |
DMEM High Glucose | Life Technologies | 11960-044 | |
DPBS (Dulbecco s phosphate buffer saline) | Life Technologies | 14190-144 | |
KnockOut DMEM | Life Technologies | 10829-018 | |
Irradiated MEFs | Life Technologies | S1520-100 | |
75-cm2 Tissue culture flasks | Corning/BD Bioscience | 430641 | |
15-ml centrifuge tubes | Corning/BD Bioscience | 430791 | |
50-ml centrifuge tubes | Corning/BD Bioscience | 430829 | |
Disposable surgical blades | Disposable surgical blades | 201 | |
Cryogenic vials | Corning/BD Bioscience | 430487 | |
70 µm Cell strainer | BD Bioscience | 352340 | |
Taq DNA Polymerase | Life Technologies | 10342-020 |