Четырехмерное (4D) визуализация используется для изучения поведения и взаимодействия между двумя типами эндосомах в живых позвоночных нервные окончания. Движение этих небольших структур характеризуется в трех измерениях, позволяя подтверждение событий, таких как эндосом синтеза и экзоцитоза.
Четырехмерное (4D) свет визуализации была использована для изучения поведения малых структур в двигательных нервных терминалов тонкой поперечная мышца живота Подвязки змеи. Сырье данных содержит покадровой последовательности 3D Z-стеки. Каждый стек содержит 4-20 изображений, полученных с эпифлуоресцентной оптике в фокальных плоскостях, разделенных 400-1,500 нм. Шаги в приобретении стеки, таких как настройка фокуса, переключение длин волн возбуждения, и эксплуатация цифровыми камерами, автоматизированы как можно больше, чтобы максимизировать скорость изображения и уменьшения повреждения тканей от воздействия света. После приобретения, набор изображений стеков deconvolved улучшить пространственное разрешение, преобразуется в нужный формат 3D, и используется для создания 4D "кино", который подходит для разнообразных анализов компьютерных, в зависимости от экспериментальных данных стремились. Одним из применений является исследование динамического поведения двух классов эндосомах найденных в нервных окончаниях-macroendosomes (MES)и кислотные эндосомы (НЯ)-чьи размеры (200-800 нм для обоих типов) находятся на или вблизи дифракционного предела. Доступ к 3D информации в каждый момент времени обеспечивает ряд преимуществ по сравнению с обычными покадровой обработки изображений. В частности, размер и скорость движения структур может быть определена количественно с течением времени без потери фокусе. Примеры данных изображений 4D показывают, что МЭ подход плазматическую мембрану и исчезают, что указывает, что они экзоцитозу, а не просто перемещение в вертикальной плоскости от одной плоскости фокуса. Также выявлено является предполагаемый слияние МЧС и ОПЗ, по визуализации перекрытия между двумя красителей, содержащих структур, как видно на каждых трех ортогональных проекций.
Покадровый визуализации живой ткани обеспечивает визуальный доступ к динамических структурно-функциональных отношений, которые не могут быть оценены в фиксированных или живых препаратов отображаемого в одной точке во времени. Часто, однако, плата за доступ к временной информации является уменьшение оптическим разрешением. Высокие цели масло-погружные числовая апертура непрактичны в живой ткани из-за их узкого круга внимания, оставляя погружение в воду или сухие целей в качестве единственных альтернатив. Кроме того, повышенное разрешение, обеспечиваемая конфокальных оптики не могут быть использованы в некоторых живых препаратов из-за фототоксичности от относительно высоких уровней освещенности, необходимых 1,2. Наконец, в то время как несколько в режиме реального времени или покадровой оптические методы доступны, что предложение улучшенное разрешение, их применимость ограничена препаратов, где структуры интересов могут быть расположены в пределах нескольких сотен нанометров в цели 1. Способ, описанныйиспользует относительно недорогое оборудование, является универсальным, но предлагает улучшенное разрешение по сравнению с более часто используемых методов покадровой. Он предназначен для использования в отдельных лабораторий, а также изображений объектов.
Способ использует обычную эпифлюорисцентной микроскопии, в сочетании с чувствительным цифровой камеры и с средств, предназначенных для быстро приобретать наборы изображений при слегка различных фокальных плоскостях (Z-стеки). Каждый Z-Stack имеет цифровую deconvolved увеличить разрешение. Одной из особенностей 3D покадровой (4D) изображений является точным сопровождение движущихся органеллы или другие структуры. При правильной настройке, распечатанных структуры не идут не в фокусе, и движение во всех трех направлениях можно наблюдать и количественно. Таким образом, невозможно для окрашенных структура исчезнуть в течение одного или нескольких покадровой кадров просто дрейфующими выше или ниже узкой фокальной плоскости. Способ также служит в качестве чувствительного инструмента для оценки взаимодействия и возможного фуСион малых структур. Обычные эпифлуоресцентная или конфокальной образы структур вблизи дифракционного предела (несколько сотен нм) не подтверждают слияние даже если объединены изображения показывают перекрытие их соответствующих этикеток 3. Fusion предлагается, но остается возможность, что объекты разделены горизонтально или вертикально на расстоянии, которая находится ниже дифракционного предела. Три или четыре-мерной визуализации, напротив, допускает просмотр предметов в каждом из трех ортогональных направлений. Появление синтеза во всех трех видах повышает уровень достоверности. И, в некоторых живых препаратов, направленных или броуновское движение предположительно конденсированных объектов предоставляет дополнительные доказательства, когда обе метки двигаться вместе со временем. Конечно, когда рядом с дифракционного предела уровень определенности в требовательных структур из фоне, или показывая, что они содержат две красители (фьюжн), не является абсолютным. Если это применимо, специализированные методы, такие как флуоресценции резонансной передачи энергии (FRET)4, являются более подходящими.
Наиболее важным аспектом визуализации 4D является управление от продолжительности и интенсивности освещенности. Фотообесцвечивание уменьшается соотношение изображения сигнал-шум и может быть проблематичным или нет в зависимости от различных факторов, в том числе выбора флуорофорам…
The authors have nothing to disclose.
Эта работа была поддержана американского Национального института здравоохранения Грант NS-024572 (для RSW).
Name of Material/ Equipment | Company | Catalog Number | Comments |
Reagents: | |||
SGC5 | Biotium [Hayward, CA] | 70057 | Final conc:10 mM |
FM1-43FX | Invitrogen [Carlsbad, CA] | F35335 | Final conc:7 mM |
LysoTracker Red | Invitrogen [Carlsbad, CA] | L7528 | Final conc:0.2 mM |
Solutions: | |||
Reptilian Ringers pH 7.2 | |||
NaCl | 145 mM | ||
KCl | 2.5 mM | ||
CaCl2 | 3.6 mM | ||
MgSO4 | 1.8 mM | ||
KH2PO4 (Dibasic) | 1.0 mM | ||
HEPES | 5.0 mM | ||
High KCL Reptilian Ringers pH 7.2 | |||
NaCl | 86 mM | ||
KCl | 60 mM | ||
CaCl2 | 3.6 mM | ||
MgSO4 | 1.8 mM | ||
KH2PO4 (Dibasic) | 1.0 mM | ||
HEPES | 5.0 mM | ||
High Sucrose Ringers pH 7.2 | |||
NaCl | 145 mM | ||
KCl | 2. 5 mM | ||
CaCl2 | 3.6 mM | ||
MgSO4 | 1.8 mM | ||
KH2PO4 (Dibasic) | 1.0 mM | ||
HEPES | 5.0 mM | ||
Sucrose | 0.5 M (17.1 gm/50 mL) | ||
Equipment: | |||
Name | Company | Comments | Comments(website) |
Axioplan 200 inverted microscope | Carl Zeiss [Thornwood, NY] | www.zeiss.com | |
N-Achroplan 63X water objective; n.a.=0.9; Working distance=2.4mm | Carl Zeiss [Thornwood, NY] | www.zeiss.com | |
DG4 combination light source/excitation filterwheel switcher | Sutter instruments [Novato, CA] | 175W Xenon arc lamp | www.sutter.com |
Lambda 10-2 emission filterwheel switcher | Sutter instruments [Novato, CA] | www.sutter.com | |
Sensicam CCD camera | Cooke Instruments [Tonawanda, NY] | www.cookecorp.com | |
Cascade 512 CCD camera | Photometrics [Tucson, AZ] | www.photometrics.com | |
Imaging dishes- made in-house-11cm dia.; 25 mm dia. #1 coverslip embedded; magnetic pins | |||
Software: | |||
Name | Company | Comments | Comments(website) |
Slidebook 5.0 | Intelligent Imaging Innovations [Denver, CO] | Deconvolution; Drift correction;3D and 4D data presentation | www.intelligent-imaging.com |
IMARIS 7.5.2 | Bitplane [South Windsor, CT] | Drift correction; 3D and 4D data presentation | www.bitplane.com |
AfterEffects CS6 | Adobe [San Jose, CA] | Drift correction | www.adobe.com |
ImageJ 1.46 | National Institutes of Health [Bethesda, MD] | Multiple plugins available;Stereo pair construction | http://rsbweb.nih.gov/ij |
Zeiss LSM | Carl Zeiss [Thornwood, NY] | Stereo pair construction | www.zeiss.com |