我々は、ポリエチレングリコール(PEG)を用いてガラス表面を不動態化するための方法を記載している。このプロトコルは、表面洗浄、表面機能化、およびPEGコーティングをカバーしています。私たちは、既存の方法に比べて不動態の優れた品質が得られ2回のラウンドでのPEG分子で表面を処理するための新たな戦略を、ご紹介します。
単一分子蛍光分光法は、ナノスケールでの生物学的現象の広い範囲を理解する上で器械であることが証明された。この技術は生物科学にもたらすことができるものの重要な例は、タンパク質 – タンパク質及びタンパク質 – 核酸相互作用メカニズムの洞察である。タンパク質の相互作用は、単一分子レベルでプローブされる場合、タンパク質またはそれらの基質は、しばしば長期の観察を可能にするガラス表面上に固定化される。この固定化スキームは、望ましくない表面アーティファクトを導入することができる。したがって、それが不活性にするガラス表面を不動態化することが不可欠である。ポリエチレングリコール(PEG)を用いた表面コーティングは、非特異的にガラス表面と相互作用するタンパク質を防止する上で高いパフォーマンスを得るために際立っている。しかしながら、ポリマーコーティング手順は、表面には表面処理を必要とする一連の厳しい要件から生じる合併症のために、困難である手順の最後に任意の蛍光分子を含まない。ここでは、ステップ·バイ·ステップの手順で堅牢なプロトコルを提供する。これは、ピラニアエッチング、アミン基を有する表面官能化、および最終的にPEGのコーティングを含む表面洗浄を覆っている。 PEG層の高密度化を得るために、我々は、著しく不動態化の品質を向上させる二回にわたってPEG分子で表面を処理する新たな戦略を紹介する。誰もが高品質な表面パッシベーションを達成できるように、私たちは、代表的な結果だけでなく、それぞれの重要なステップのための実践的なアドバイスを提供します。
単一分子タンパク質の研究を行う際には、実験は、任意の表面に誘導されるタンパク質の機能不全又は変性1,2から自由になるように表面パッシベーションの高品質を達成するために不可欠である。例えば、ウシ血清アルブミンなどの界面活性剤で処理されたガラス表面は、一般に単一分子核酸試験3のために使用されているが、その不動態化の程度は、タンパク質の研究のために十分に高くない。ポリマー(ポリエチレングリコール、PEG)でコーティングされたガラス表面は、パッシベーション性能4-6に優れている。これにより、それは、単一分子蛍光研究7月10日に導入されて以来、単一分子タンパク質研究のための普遍的に使用されるようになった。ポリマーコーティング手順は、複数の表面処理7,11,12を必要とする。したがって、詳細な指示なしで全体の手順に従うことは困難である。多くの場合、表面保護の程度は、どのプロトコルIに依存して変化するSが続いた。ここでは、単一分子、タンパク質研究の主要なボトルネックの1が削除され、ステップ·バイ·ステップの手順、堅牢なプロトコルを提示する。概要については図1を参照してください。
このプロトコルの中の重要なステップ
これは、アミノ – シラン化反応の前に表面を親水性にすることが不可欠である。これは、ガラス/石英表面上の遊離ヒドロキシル基を生成するピラニアエッチングによって達成された。表面の親水性は徐々にダウンしたので、それが長期間にわたって、H 2 Oまたは空気のいずれかにさらさピラニアエッチングされた表面を維持しないことをお勧めします。
NHS-エステルPEG分子が反応性である。それは、-20ºCで一定分量を行い、窒素下でそれらを格納することをお勧めします室温でAPTES化学物質の貯蔵寿命が短い。これは、毎月新しいものと交換することをお勧めします。
このプロトコルの改変
何か実用的な理由でピラニアエッチングを使用できない場合には、長時間のKOHを用いてエッチング( 例えば Overnight)、ヒドロキシル基を露出させるであろう。この代替アプローチの落とし穴は、スライドが深刻な傷が原因、数リサイクルの後に使用できなくなることである。
これは、しばしば蛍光性有機材料7を除去するのに有効であるプロパントーチを使用して、ガラス/石英表面を焼くために実施される。それはピラニアエッチングに冗長であるため、この手順は、このプロトコルには含まれていませんでした。この手順は、潜在的にヒドロキシル基の酸化につながることに注意してください。表面はKOHまたはピラニア溶液を用いてエッチングした後そのため、この手順が行われるべきではない。
7未満のpHを有する緩衝液は、単一分子イメージングのために使用される場合、PEGのコンフォメーションは、不動態化の程度を減少させる「ブラシ」と「マッシュルーム」から変化する。 7.0より低いpHが使用される場合、したがって、それはさらにジスクシンイミジル酒石酸を用いて表面を不動態化することが推奨される<SUP> 7。
展望
この作品は、高品質な表面パッシベーションを達成するための堅牢なプロトコルを提供してきました。このプロトコルは、タンパク質14、ならびに細胞抽出物および免疫沈降物15内でのタンパク質複合体に関与している単一分子蛍光研究のために有用であろう。これは、広くそのような力分光法とトルク分光16のような他の単一分子技術に使用される。また、表面17に吸着するから細胞を予防するために有用であろう。
この作品では提供されたプロトコルは、多段階の手順については、要求している。脂質-PEG 8およびポリリジン、PEG 9を用いた表面パッシベーションは、別のアプローチとして使用できます。日時は、それは実装が容易である任意の化学反応を必要としない。しかしながら、不動態化の程度は、化学MODIFを介して達成されるほど高くはない表面のication。
The authors have nothing to disclose.
SDC、ACH、そしてCJは、欧州研究評議会を通じて補助金(ERC-STG-2012から309509)を起動した状態でのサポートされていました。 J.-MNは、韓国国立研究財団(NRF)(2011から0018198)によってサポートされていました。パイオニア研究センタープログラム(2012-009586)韓国NRFを通して科学省、ICT、および将来の計画(MSIP)によって資金を供給。この作品は、グローバルフロンティアプロジェクト(H-GUARD_2013-M3A6B2078947)、韓国のMSIPによって資金を供給BioNanoヘルスガードセンターによってサポートされていました。 YKLとJ.-HHはソウル市、韓国のソウル科学フェローシッププログラムによってサポートされていました。ラベルされたRepタンパク質は、博士スアミョンからの寛大な贈り物だった。
1. Slide preparation and cleaning | |||
Acetone | Sigma | 32201 | 1 L |
Coverslips | VWR | 631-0136 631-0144 631-0147 | 24x32mm2, 22x40mm2, 24x50mm2 (No.1½, Rectangular) |
Diamond drill bits | MTN-Giethoorn, The Netherlands | LA-0564-00DB | 3/4 mm |
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
Glass staining dishes | Fisher Scientific | 300101 | |
H2O2 | Boom | 6233905 | Opened bottles should be stored at 4 °C. 1 L, hydrogen peroxide 30% |
H2SO4 | Boom | 80900627.9010 | Sulfuric acid 95-98% |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
Quartz slides | Finkenbeiner | 1” x 3”, 1 mm thick | |
2. Coverslip cleaning | |||
Duran slide holder | LGS, The Netherlands | 213170003 | |
KOH | Sigma | 30603 | Potassium hydroxide |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
3. Amino-silanization of slides and coverslips | |||
Acetic acid | Sigma | 320099-500ML | Acetic acid, glacial |
APTES | Sigma-Aldrich | 281778-100ML | Store at the room temperature under N2 . Replace once in a month. 3-aminopropyl trimethoxysilane |
Flask (200mL) | VWR | Flask (200 mL) | Have one flask dedicated for aminosilanization. Pyrex flask |
Methanol | Sigma | 32213 | 1 L |
Sonicator | Branson | Tabletop ultrasonic cleaner, 3510 | |
4. Surface passivation using polymer (the first round) | |||
Biotin-mPEG | Laysan Bio | Biotin-PEG-SVA-5000-100mg | Store aliquots of 1-2 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. Biotin-PEG-SVA, MW 5,000 Da |
mPEG | Laysan Bio | MPEG-SVA-5000-1g | Store aliquots of 80 mg (enough for 10 slides) at -20 °C under N2. mPEG-succinimidyl valerate (SVA), MW 5,000 Da |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
6. Surface passivation (the second round) | |||
DMSO | Sigma-Aldrich | D8418-100ML | Dimethyl sulfoxide BioReagent, for molecular biology, ≥99.9% |
DST | Pierce | 20589 | Disuccinimidyl tartarate |
MS4-PEG | Pierce | 22341 | Dissolve 100 mg MS4-PEG in 1.1 mL DMSO. Store 20 mL aliquots at -20 °C. Short NHS-ester PEG, MW 333 Da |
Sodium bicarbonate | Sigma | S6014-500G | |
7. Assembling a microfluidic chamber | |||
Double sticky tape | Scotch | 10mm wide | |
Epoxy | Thorlabs | G14250 | Devcon 5 minute epoxy |
NaCl | Sigma-Aldrich | S9888-1 KG | Sodium chloride |
Neutravidin | Pierce | 31000 | Stock in 5 mg/mL in H2O at 4 °C. ImmunoPure NeutrAvidin Biotin-Binding protein |
Streptavidin | Invitrogen | S-888 | Stock 5 mg/mL in H2O or T50 at 4 °C. |
Trizma base | Sigma-Aldrich | T1503-1 KG | Tris |