I denne protokol, beskriver vi to strategier, der samtidig undertrykker to gener (dobbelt gen knockdown) i honningbier. Så præsenterer vi, hvordan du bruger snabel forlængelse respons (PER) assay for at undersøge effekten af dobbelt gen knockdown på honningbi gustatory perception.
Denne video viser nye teknikker til RNA-interferens (RNAi), der nedregulere to gener samtidig i honningbier anvender dobbelt-strenget RNA (dsRNA) injektioner. Det præsenterer også en protokol snabel forlængelse respons (PER) assay til måling gustatory perception.
RNAi-medieret gen knockdown er en effektiv teknik nedregulere målgenekspression. Denne teknik er normalt bruges til enkelt genmanipulation, men det har sine begrænsninger til at opdage interaktioner og fælles effekter mellem gener. I den første del af denne video præsenterer vi to strategier til samtidig vælte to gener (kaldet dobbelt gen knockdown). Vi viser begge strategier er i stand til effektivt at undertrykke to gener, vitellogeninrespons (VG) og ultraspiracle (USP), som er i en regulerende feedback-sløjfe. Denne dobbelte gen knockdown fremgangsmåde kan anvendes til at dissekere sammenhænge mellem gener og kan let anvendes iforskellige insektarter.
Den anden del af denne video er en demonstration af snabel forlængelse respons (PER) assay i honningbier efter behandlingen dobbelt gen knockdown. Den PER-analysen er en standard test for at måle gustatory opfattelsen i honningbier, hvilket er en vigtig prædiktor for, hvor hurtigt en honningbi adfærdsmæssige modning er. Større gustatory opfattelse af reden bier indikerer øget adfærdsmæssig udvikling, som ofte er forbundet med en tidligere alder ved debut af fouragerende og fouragere specialisering i pollen. Desuden kan PER assay anvendes til at identificere metaboliske tilstande af mæthed eller sult i honningbier. Endelig PER assay kombineret med parring forskellige lugt stimuli til konditionering bierne er også almindeligt anvendt til indlæring og hukommelse studier i honningbier.
RNA-interferens (RNAi) er RNA-baseret post-transkriptionel gendæmpning, som forekommer i en lang række eukaryote organismer. Processen med RNAi udløses af endogene eller exogene dobbeltstrengede RNA (dsRNA) forstadier. DsRNA aktiverer ribonuklease protein Dicer, som binder og spalter dsRNA til små fragmenter (20-25 bp). Så de små fragmenter af dsRNA'et guide en anerkendelse og spaltning af komplementære mRNA ved argonaute proteiner, en katalytisk bestanddel af RNA-induceret silencing kompleks (RISC) 1.. I pattedyr aktivere dsRNAs længere end 30 nt, et antiviralt respons (interferon respons, IFN), som fører til ikke-specifik nedbrydning af RNA transkripter 2.. Imidlertid har lange dsRNAs vist sig at være effektiv og specifik i insekter, da der er en mangel på denne IFN 3..
Lange dsRNAs er blevet anvendt til nedregulering af målgener i forskellige insektarter. Honningbier er en af pionEER insekt organismer, hvor funktioner mange vigtige gener i udvikling og adfærd er blevet afsløret ved hjælp af dsRNA 4,5. Adskillige dsRNA levering metoder er blevet udført i honningbier: dsRNA fodring effektivt nedregulerer target genekspression i honningbi larver 6, mens dsRNA injektion er en effektiv metode til gen-knockdown i honningbi embryoner 4 og voksne bier 7,8.
Gene Knockdown effekter udstillet ved anvendelse dsRNA til insekter er forbigående og lokaliseret. Undersøgelser har vist, at begge abdominal dsRNA injektioner og thorax dsRNA injektioner effektivt undertrykke målgenekspression i abdominal fedt kropsceller af insekter 9,10. DsRNA sprøjtes ind mave-og thorax hulrum og fedt kropsceller er i stand til at tage op dsRNA fra hæmolymfe hvor cellerne er badet 10.. Dog kan gener i andre organer, såsom æggestokke og hjerne, ikke målrettes ved entenabdominal eller thorax injektioner. For at målrette gener i honningbi hjerne, har hjerne injektion af dsRNA også blevet udført, hvilket faktisk påvirker målgenekspression i lokale områder i hjernen 11. Her har vi kun dokumentere abdominal dsRNA indsprøjtning, som er mere almindeligt anvendt i voksne honningbier.
RNAi har primært været brugt til at målrette et enkelt gen, og har været et effektivt redskab til at afsløre genfunktionen. Imidlertid helst gen ikke isoleret fra andre, og det er i komplekse regulerende netværk. En nøgle til at forstå en biologisk proces er at dissekere hvordan gener interagerer med hinanden, hvilket kræver samtidige manipulationer af flere gener snarere end et enkelt gen Knockdown. I mammaliacellelinier, har forskerne lykkedes samtidig hæmmer to eller tre gener ved hjælp af doseringssystemer 12 eller flere microRNA (miRNA) hårnål designs 13.. Men i insekter, er flere gen knockdowns stadig uprøvet. Her har vi præsentat forskellige injektionssteder strategier, som kan opnå en dobbelt gen knockdown. Vi målretter to gener: vitellogenin (VG), som koder for en æggeblomme proteinprecursor, og ultraspiracle (USP), der koder for en putativ receptor for juvenil hormon (JH) og kan tjene som en transkriptionsfaktor medierende svar til JH 14 i honningbier. Vg og JH regulere hinanden i en feedback-sløjfe 15 og er involveret i honningbi adfærdsregulering 9.. Brug af dobbelt-genet knockdown, vi forstyrrer både Vg og JH veje, og opdag, hvordan de i fællesskab påvirker honningbi adfærd og fysiologi, og hvordan vg, USP og JH interagere 9..
Gustatory opfattelsen er en adfærdsmæssig indikator for honningbi social adfærd 16. Med hensyn til adfærdsmæssige udvikling, reden bier med høj gustatory opfattelse adfærdsmæssigt modne hurtigt, og normalt foder tidligt i livet og foretrækker at indsamle pollen 16,17. Selvom regulerende mechanisms underliggende gustatory opfattelse er stadig uklart, har undersøgelser vist, at gustatory opfattelse er knyttet til interne energi stofskifte 9, hormonel sekretion 18,19 og biogenetisk amin veje 20. Både Vg og JH er vigtige hormonelle regulatorer modulerende gustatory opfattelse 7,21. I laboratoriet kan en variation af gustatory opfattelse i honningbier blive evalueret ved at teste snabel forlængelse respons (PER) til forskellige rørsukkeropløsning. Hver bi testes ved at røre både hendes antenner med en dråbe vand efterfulgt af en stigende koncentration serie af 0,1, 0,3, 1, 3, 10, 30% saccharose. Et positivt svar er noteret, hvis en bi fuldt udvider hendes snabel, når en dråbe vand eller sucrose er rørt til hver antenne. Baseret på antallet af positive reaktioner på de løsninger, kan smagssansen opfattelse niveauet af enkelte bestemmes 16. Imidlertid er anvendelsen af PER ikke begrænset til måling af gustatory perception. PER er også en effektiv metode til at teste den metaboliske tilstand af bier såsom mæthed vs sult. Bierne med større reaktioner på sucrose er mere sulten i almindelighed (Wang og Amdam, upublicerede data). Endvidere kan PER paradigme også anvendes i associativ indlæring og hukommelse i honningbier. I dette tilfælde bier vil blive uddannet til at associere tilstedeværelsen af saccharose vand med en lugt. Når bierne lærer foreningen kan kun tilstedeværelsen af lugten fremkalde en positiv snabel respons uden at belønne dem med sucrose 22,23. I denne video viser vi, hvordan du udfører PER at evaluere gustatory opfattelse, som har været forbundet med vg og USP dobbelt knockdown i en tidligere undersøgelse 9..
Vores undersøgelse er den første forsøg på at samtidig vælte to gener i voksne insekter. Vores resultater viser, at de to strategier dsRNA injektioner (enkelt injektion og to-dages injektion) er effektive til dobbelt gensuppression, og samtidig gen silencing af vg og USP kan testes 6 dage efter dsRNA injektioner i bier 8,9. Men gen-knockdown effekt varierer i forskellige insektarter afhængigt udskrift niveau af target-genet, protein omsætning satser og dsRNA optagelse effektivitet ved…
The authors have nothing to disclose.
Forfatterne vil gerne takke Erin Fennern for at bistå eksperiment. Dette arbejde blev finansieret af Norges Forskningsråd (180504, 185.306 og 191.699), PEW Charitable Trust, og National Institute on Aging (NIA P01 AG22500).
Name of Reagent/Material | Company | Catalog Number | Comments |
GE Healthcare PCR beads in 96 well plate | GE Healthcare | 27-9557-01 | |
QIAquick PCR purification kit | Qiagen | 28104 | |
RiboMax T7 RNA production system | Promega | P1300 | |
Trizol LS | Invitrogen | 10296028 | |
Chloroform:Isoamyl alcohol 24:1 | Sigma-Aldrich | C0549 | |
isopropyl alcohol | Sigma-Aldrich | I9516 | |
Hamilton micro syringe | Hamilton | 80301 | |
30G BD disposable needles | BD Biosciences | 305106 | |
Sucrose | Sigma-Aldrich | 84097 | |
1 ml Syringe | BD Biosciences | 30960 | |
Stereo dissection microscope | Leica Microsystems | S6D | |
Insect pins | Fine Science Tools | 26000-25 | |
Wax plate |