Este video muestra los experimentos con el posterior análisis de las interacciones proteína-proteína mediante el uso de micro-modelado de superficies. El enfoque ofrece la posibilidad de detectar las interacciones de proteínas en las células vivas y combina una alta capacidad de rendimiento con la posibilidad de extraer información cuantitativa.
Desentrañar la red de interacción de las moléculas<em> En-vivo</em> Es clave para entender los mecanismos que regulan la función celular y el metabolismo. Una multitud de opciones metodológicas para abordar las interacciones moleculares en las células se han desarrollado, pero la mayoría de estos métodos sufren de ser más bien indirecta y por lo tanto, no cuantitativa. Por el contrario, algunos de gama alta métodos cuantitativos se han introducido, que sin embargo son difíciles de extender a un alto rendimiento. Para combinar las capacidades de alto rendimiento con la posibilidad de extraer información cuantitativa, hemos desarrollado recientemente un nuevo concepto para la identificación de interacciones proteína-proteína (Schwarzenbacher<em> Et al</em>., 2008). Aquí se describe un protocolo detallado para el diseño y la construcción de este sistema que permite analizar las interacciones entre una proteína marcada con fluoróforo ("presa") y una proteína de membrana ("carnada")<em> En-vivo</em>. Las células se colocan sobre superficies micropatterned funcionalizados con anticuerpos contra el dominio de cebo exoplasmic. Presa de cebo se analizan las interacciones a través de la redistribución de la presa fluorescentes. El método se caracteriza por una alta sensibilidad al nivel de moléculas individuales, la capacidad de detectar las interacciones débiles, y la capacidad de alto rendimiento, por lo que es aplicable como herramienta de detección.
El video que acompaña muestra un método para la detección de interacciones proteína-proteína en la membrana plasmática de las células vivas (Schwarzenbacher et al, 2008;. Brameshuber et al, 2009;.. Weghuber et al, en prensa). En principio, cualquier plataforma microscopía TIRF basado puede ser utilizado como sistema de lectura. Sólo cuando se desea una alta sensibilidad (por ejemplo, para la detección de moléculas individuales), los microscopios avanzados se requerirá. Para obtener los mejores resultados los siguientes puntos críticos durante el proceso de preparación requieren una atención especial:
La técnica de micro-patrones ofrece varias posibilidades para el análisis de las interacciones proteína-proteína. En primer lugar, junto con la cuantificación de los locales, resolución espacial interacciones proteína-proteína también la detección de interacciones débiles o indirecta es posible sin el inconveniente de dar un alto número de falsos positivos o negativos. En segundo lugar, permite al investigador para analizar interacciones proteína-proteína en la membrana plasmática de células vivas, lo cual es difícil de conseguir por métodos bioquímicos como la pantalla de dos híbridos. En tercer lugar el método permite la detección de interacciones presa-cebo que son moduladas por los cambios ambientales como la temperatura, la presencia de diferentes proteínas u otras moléculas o modificaciones posteriores a la traducción. Así, el ensayo permite moduladores de detección de un par de interacción dada en el contexto de las células vivas. Por otra parte, mediante la reducción de la densidad superficial del ligando de captura o el uso de ligandos monovalentes, el análisis del estado de reposo se hace posible. Por último, si suficientes plataformas de exploración se utilizan, el número de células analizadas es lo suficientemente alto como para satisfacer las demandas de alto rendimiento de las compañías farmacéuticas para la detección de drogas (Ramm, 2005).
The authors have nothing to disclose.
Nos gustaría dar las gracias a Quentina Beatty, de la Universidad de Linz, Austria, por su amable ayuda, Katharina Strub, de la Universidad de Ginebra, Suiza, para la construcción de hCD71-GFP, y Daniel Legler, Universidad de Constanza, Suiza, por el GPI-GFP -DAF construir. Este trabajo fue apoyado por el Fondo Científico de Austria (FMF; proyecto Y250-B03) y el proyecto GEN-AU del Ministerio Federal de Ciencia e Investigación.