该视频显示与后续分析使用微图案的表面蛋白质相互作用的实验。该方法提供了检测在活细胞内蛋白质相互作用的可能性,并结合在一起的可能性高吞吐能力,提取定量信息。
揭开分子间的相互作用网络<em>在体内</em关键是理解细胞功能和代谢的机制,规范。已开发多种解决在细胞内的分子间的相互作用的方法选择,但这些方法大多患有而间接的,因此难以量化。相反,一些高端的定量方法进行了介绍,但都难以延伸到高吞吐量。为了提取定量信息的可能性相结合的高吞吐能力,我们最近开发出一种用于确定蛋白质 – 蛋白质相互作用的新概念(Schwarzenbacher<em>等</em>,2008年)。在这里,我们描述了这个系统的设计和建设,允许一个荧光基团标记的蛋白(“猎物”)和膜蛋白之间的相互作用分析(“诱饵”)的详细协议<em>在体内</em>。镀micropatterned表面官能诱饵exoplasmic域抗体的细胞。诱猎物相互作用检测通过再分配的荧光的猎物。该方法的特点是单分子水平的高灵敏度,探测能力弱相互作用,和高吞吐能力,使其作为筛检工具适用。
附带的视频演示了用于检测活细胞质膜(Schwarzenbacher 等 ,2008; Brameshuber 等 ,2009; Weghuber 等 , 出版中 )的蛋白质-蛋白质相互作用的方法。原则,任何TIRF显微镜平台可用于读出系统。只有当需要高灵敏度的(例如,单分子探测),将需要先进的显微镜。为达到最佳效果,在编写过程中的下列关键点需要特别注意的:
微图形技术提供的蛋白质相互作用的分析了几种可能性。首先,伴随着地方,空间分辨的蛋白质 – 蛋白质相互作用的定量检测弱或间接的相互作用可能没有给予大量的误报或底片的缺点。其次,它使研究人员分析的活细胞质膜,这是难以实现通过生物化学方法,如2个杂交屏幕的蛋白 – 蛋白相互作用。第三,方法允许为诱饵捕食的相互作用,环境的变化,如温度,不同的蛋白质或其他分子或翻译后修饰的存在调制检测。因此,实验可以在活细胞中的相互作用对筛选调制。此外,通过减少捕获配体或使用单价配体的表面密度,静止状态的分析成为可能。最后,如果有足够的扫描平台,分析细胞的数量是不够高,与制药公司的高通量药物筛选的要求(2005年Ramm,)。
The authors have nothing to disclose.
我们想感谢她的帮助,卡塔琳娜Strub,瑞士日内瓦大学,奥地利林茨大学,Quentina比蒂,hCD71 – GFP的构建,和丹尼尔Legler,康斯坦茨大学,瑞士GPI – GFP, – DAF的构造。这项工作是由奥地利科学基金会(FWF项目Y250 – B03)和奥地利联邦科学与研究部的创盟项目支持。