LTR-ретротранспозоны представляют собой мобильные элементы класса I с длинными концевыми повторами, фланкирующими внутреннюю кодирующую область. Эти элементы менее распространены у млекопитающих по сравнению с другими мобильными элементами класса I. Около 8 процентов геномной ДНК человека составляют LTR-ретротранспозоны. Некоторые из типичных примеров LTR-ретротранспозонов – это Ty элементы в дрожжах и Copia элементы у дрозофилы.
Внутренняя кодирующая область LTR-ретротранспозонов и механизм их транспозиции очень напоминает ретровирусный геном. Они могут кодировать ферменты, необходимые для их мобилизации, а также синтезировать структурные белки с образованием вирусоподобной частицы. Но у большинства LTR-ретротранспозонов отсутствуют гены для синтеза вирусной оболочки. Следовательно, в отличие от ретровирусов, которые могут образовывать инфекционные вирионы и перемещаться горизонтально от одной клетки к другой, LTR-ретротранспозоны могут перемещаться только из одного локуса в другой в геноме отдельной клетки.
Однако было обнаружено, что некоторые LTR ретроэлементы имеют дополнительную ОРС в том же положении, что и ген “env”, обнаруженный в геномах ретровирусов, например, gypsy элементов у дрозофилы. Эти элементы могут кодировать три предполагаемых белка, один из которых напоминает белок оболочки ретровируса, что приводит к инфекционной форме элемента.
У людей наиболее распространенные LTR-ретротранспозоны называются эндогенными ретровирусами, или ЭРВ. Эти ЭРВ являются продуктами экзогенных вирусных инфекций в клетках зародышевой линии предков, что привело к их вертикальной передаче у людей. Однако из-за совместной эволюции, охватывающей миллионы лет, эти ЭРВ теперь играют важную роль в физиологии человека, включая поддержание определенных регуляторных сетей.
