아미노산은 펩티드 결합을 통해 서로 공유결합합니다. 펩티드 결합은 한 아미노산의 카르복실기를 다른 아미노산의 아미노기에 결합합니다. 펩티드는 2부터 50개의 단량체 범위에 이르는 작은 아미노산 사슬입니다.펩티드 결합은 물 분자를 방출하는 축합 반응을 통해 형성됩니다. 아미노기와 카르복실기가 결합하면 아마이드기가 형성됩니다. 펩티드 결합은 단단한 평면 구조를 가지고 있으며 이중 결합의 일부 특성을 보여줍니다.이것은 카르보닐의 이중 결합이 탄소 질소 펩티드 결합과 함께 공명 구조로 작용할 수 있기 때문입니다. 이 공명은 단일 결합의 길이를 감소시키고 이중 결합의 길이를 증가시키며 펩티드 결합 주위의 그룹의 회전을 억제합니다. 펩티드 결합은 시스 및 트랜스 형태로 존재할 수 있습니다.시스 형태에서 알파 탄소는 펩티드 결합의 같은 쪽에 있고 트랜스 형태에서는 결합의 반대쪽에 있습니다. 펩티드 결합은 프롤린이 결합 형성에 아미노기를 기여하는 경우를 제외하고는 대부분 트랜스 형태에서 발생합니다. 펩티드 결합을 통해 결합된 아미노산에는 N-말단과 C-말단이 있습니다.N-말단은 아미노기가 펩티드 결합 형성에 관여하지 않는 끝이고 C-말단은 카르복실기가 펩티드 결합 형성에 관여하지 않는 끝입니다. 펩티드 또는 단백질의 아미노산 서열은 항상 N-말단에서 시작하여 C-말단으로 끝납니다. 두 개의 아미노산이 펩티드 결합을 통해 결합되면 디펩티드라고 합니다.3개 및 4개의 아미노산이 펩티드 결합을 통해 서로 결합할 때 각각 트리펩티드, 테트라펩티드라고 합니다. 여러 아미노산이 펩티드 결합을 통해 서로 결합될 때 이를 폴리펩티드라고 합니다. 펩티드 결합은 산 또는 프로테아제로 알려진 효소와 같은 화학적 촉매를 이용한 가수분해를 통해 빠르게 분해될 수 있습니다.펩티드 결합을 끊는 데 물 분자가 참가합니다. 또는 이러한 결합은 물이 있으면 느리게 저절로 끊어질 수 있습니다.